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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
25/07/2018 |
Data da última atualização: |
25/07/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, F. F.; JEREZ, E. A. Z.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S.; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; NASCIMENTO, M.; LIMA, R. O. de; GUIMARÃES, S. E. F. |
Afiliação: |
Fabyano Fonseca Silva, UFV; Elcer Albenis Zamora Jerez, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; José Marcelo Soriano Viana, UFV; Camila Ferreira Azevedo, UFV; Paulo Sávio Lopes, UFV; Moysés Nascimento, UFV; Rodrigo Oliveira de Lima, UFV; Simone Eliza Facioni Guimarães, UFV. |
Título: |
Bayesian model combining linkage and linkage disequilibrium analysis for low density-based genomic selection in animal breeding. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Applied Animal Research, v. 46, n. 1, p. 873-878, 2018. |
DOI: |
10.1080/09712119.2017.1415903 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
We combined linkage (LA) and linkage disequilibrium (LDA) analyses (emerging the term ?LALDA?) for genomic selection (GS) purposes. The models were fitted to a simulated dataset and to a real data of feed conversion ratio in pigs. Firstly, the significant QTLs (quantitative trait locus) were identified through LA-based mixed models considering the QTL-genotypes as random effects by means of genotypic identity by descent matrix. This matrix was calculated at the positions of significant QTLs (based on LA) allowing to include the QTL-genotype effects additionally to SNP (single nucleotide polymorphism) markers (based on LDA) and additive polygenic effects in several GS models (Bayesian Ridge Regression ? BRR; Bayes A ? BA; Bayes B ? BB; Bayes C ? BC and Bayesian LASSO ? BL). These models combing all mentioned effects were denominated LALDA. Goodness-of-fit and predictive ability analyses were performed to evaluate the efficiency of these models. For the real data, although slightly, the superiority of the LALDA models was verified in comparison to traditional LDA models for GS. For the simulated dataset, the models presented similar results. For both LDA and LALDA frameworks, BA showed the best fitting through Deviance Information Criterion and higher predictive ability in the simulated and real datasets. |
Palavras-Chave: |
x. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180314/1/2018-M.Deon-JAAQR-Bayesian.pdf
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Marc: |
LEADER 02093naa a2200241 a 4500 001 2093541 005 2018-07-25 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1080/09712119.2017.1415903$2DOI 100 1 $aSILVA, F. F. 245 $aBayesian model combining linkage and linkage disequilibrium analysis for low density-based genomic selection in animal breeding.$h[electronic resource] 260 $c2018 520 $aWe combined linkage (LA) and linkage disequilibrium (LDA) analyses (emerging the term ?LALDA?) for genomic selection (GS) purposes. The models were fitted to a simulated dataset and to a real data of feed conversion ratio in pigs. Firstly, the significant QTLs (quantitative trait locus) were identified through LA-based mixed models considering the QTL-genotypes as random effects by means of genotypic identity by descent matrix. This matrix was calculated at the positions of significant QTLs (based on LA) allowing to include the QTL-genotype effects additionally to SNP (single nucleotide polymorphism) markers (based on LDA) and additive polygenic effects in several GS models (Bayesian Ridge Regression ? BRR; Bayes A ? BA; Bayes B ? BB; Bayes C ? BC and Bayesian LASSO ? BL). These models combing all mentioned effects were denominated LALDA. Goodness-of-fit and predictive ability analyses were performed to evaluate the efficiency of these models. For the real data, although slightly, the superiority of the LALDA models was verified in comparison to traditional LDA models for GS. For the simulated dataset, the models presented similar results. For both LDA and LALDA frameworks, BA showed the best fitting through Deviance Information Criterion and higher predictive ability in the simulated and real datasets. 653 $ax 700 1 $aJEREZ, E. A. Z. 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aVIANA, J. M. S. 700 1 $aAZEVEDO, C. F. 700 1 $aLOPES, P. S. 700 1 $aNASCIMENTO, M. 700 1 $aLIMA, R. O. de 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 773 $tJournal of Applied Animal Research$gv. 46, n. 1, p. 873-878, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrossilvipastoril. |
Data corrente: |
06/03/2017 |
Data da última atualização: |
13/04/2017 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
RODRIGUES, D. S.; ARAUJO, R. N.; BASTIANETTO, E.; LOPES, L. B.; KLAFKE, G. M.; FREITAS, C. M. V. de; MARTINS, J. R.; LEITE, R. C. |
Afiliação: |
DANIEL SOBREIRA RODRIGUES, EPAMIG; RICARDO NASCIMENTO ARAUJO, UFMG; EDUARDO BASTIANETTO, UFMG; LUCIANO BASTOS LOPES, CPAMT; GUILHERME MARCONDES KLAFKE, FEPAGRO-ELDORADO DO SUL; CAROLINA MARIA VIANNA DE FREITAS, UNIBH; JOÃO RICARDO MARTINS, FEPAGRO; ROMÁRIO CERQUEIRA LEITE, UFMG. |
Título: |
Acaricide susceptibility of rhipicephalus (boophilus) microplus (canestrini, 1888) parasitic stages. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 19.; NOVEL APPROACHES TO THE CONTROL OF HELMINTH PARASITES OF LIVESTOCK, 8., 2016, Belém, PA. Anais... Jaboticabal: CBPV, 2016. Não paginado. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Até a década de 70, acreditava-se que os estádios de metalarva e metaninfa eram ?formas de resistência? de R.(B) microplus. Após uma publicação em que o efeito não foi visualizado, o assunto perdeu relevância. Recentemente, demonstrou-se mais uma vez, que estádios parasitáriosapresentam diferentes padrões de susceptibilidade quando expostos a acaricidas específicos. Isso motivou a condução deste estudo para a avaliação do fenômeno. Em dois bovinos, foram fixadas quatro câmaras com quatro cm de diâmetro, na região do períneo, nas quais foram realizadas infestações com 600 larvas de 60 dias de idade. Nos dias 07, 11 e 16 após a infestação, os carrapatos foram aspergidos nas câmaras 01, 02 e 03, respectivamente, com solução de cipermetrina 0,01%, em associação com clorpirifós a 0,083%. As câmaras de número 04 formaram o grupo controle, e foram aspergidas com água no dia 07. O interior das câmaras foi fotografado por meio de macrofotografia digital, e as imagens, analisadas para a quantificação dos indivíduos antes e após os tratamentos. Os valores observados foram utilizados para cálculo dos índices de mortalidade e aplicação do teste de hipótese de proporções. Os índices obtidos, de 83%, 29%, 90% e 8%, representaram as mortalidades para ninfas não ingurgitadas, ninfas ingurgitadas, adultos não ingurgitados e grupo controle. Foram observadas diferenças significativas entre os grupos avaliados (p<0,0001), com exceção entre os grupos de ninfas não ingurgitadas e de adultos. Os resultados confirmaram que as diferenças de susceptibilidade entre os estádios ocorrem, e demonstraram que essas não estão relacionadas apenas à presença da epicutícula, como se acreditava no passado. Este estudo explica, em parte, porque os resultados de testes de eficácia em laboratório e de tratamentos em condições de campo apresentam diferentes magnitudes, abrindo caminho para uma melhor compreensão do comportamento dos estádios parasitários. MenosAté a década de 70, acreditava-se que os estádios de metalarva e metaninfa eram ?formas de resistência? de R.(B) microplus. Após uma publicação em que o efeito não foi visualizado, o assunto perdeu relevância. Recentemente, demonstrou-se mais uma vez, que estádios parasitáriosapresentam diferentes padrões de susceptibilidade quando expostos a acaricidas específicos. Isso motivou a condução deste estudo para a avaliação do fenômeno. Em dois bovinos, foram fixadas quatro câmaras com quatro cm de diâmetro, na região do períneo, nas quais foram realizadas infestações com 600 larvas de 60 dias de idade. Nos dias 07, 11 e 16 após a infestação, os carrapatos foram aspergidos nas câmaras 01, 02 e 03, respectivamente, com solução de cipermetrina 0,01%, em associação com clorpirifós a 0,083%. As câmaras de número 04 formaram o grupo controle, e foram aspergidas com água no dia 07. O interior das câmaras foi fotografado por meio de macrofotografia digital, e as imagens, analisadas para a quantificação dos indivíduos antes e após os tratamentos. Os valores observados foram utilizados para cálculo dos índices de mortalidade e aplicação do teste de hipótese de proporções. Os índices obtidos, de 83%, 29%, 90% e 8%, representaram as mortalidades para ninfas não ingurgitadas, ninfas ingurgitadas, adultos não ingurgitados e grupo controle. Foram observadas diferenças significativas entre os grupos avaliados (p<0,0001), com exceção entre os grupos de ninfas não ingurgitadas e de adultos. Os re... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Estádios parasitários. |
Thesagro: |
Resistência. |
Thesaurus NAL: |
Rhipicephalus microplus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02879nam a2200229 a 4500 001 2066338 005 2017-04-13 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aRODRIGUES, D. S. 245 $aAcaricide susceptibility of rhipicephalus (boophilus) microplus (canestrini, 1888) parasitic stages.$h[electronic resource] 260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 19.; NOVEL APPROACHES TO THE CONTROL OF HELMINTH PARASITES OF LIVESTOCK, 8., 2016, Belém, PA. Anais... Jaboticabal: CBPV, 2016. Não paginado.$c2016 520 $aAté a década de 70, acreditava-se que os estádios de metalarva e metaninfa eram ?formas de resistência? de R.(B) microplus. Após uma publicação em que o efeito não foi visualizado, o assunto perdeu relevância. Recentemente, demonstrou-se mais uma vez, que estádios parasitáriosapresentam diferentes padrões de susceptibilidade quando expostos a acaricidas específicos. Isso motivou a condução deste estudo para a avaliação do fenômeno. Em dois bovinos, foram fixadas quatro câmaras com quatro cm de diâmetro, na região do períneo, nas quais foram realizadas infestações com 600 larvas de 60 dias de idade. Nos dias 07, 11 e 16 após a infestação, os carrapatos foram aspergidos nas câmaras 01, 02 e 03, respectivamente, com solução de cipermetrina 0,01%, em associação com clorpirifós a 0,083%. As câmaras de número 04 formaram o grupo controle, e foram aspergidas com água no dia 07. O interior das câmaras foi fotografado por meio de macrofotografia digital, e as imagens, analisadas para a quantificação dos indivíduos antes e após os tratamentos. Os valores observados foram utilizados para cálculo dos índices de mortalidade e aplicação do teste de hipótese de proporções. Os índices obtidos, de 83%, 29%, 90% e 8%, representaram as mortalidades para ninfas não ingurgitadas, ninfas ingurgitadas, adultos não ingurgitados e grupo controle. Foram observadas diferenças significativas entre os grupos avaliados (p<0,0001), com exceção entre os grupos de ninfas não ingurgitadas e de adultos. Os resultados confirmaram que as diferenças de susceptibilidade entre os estádios ocorrem, e demonstraram que essas não estão relacionadas apenas à presença da epicutícula, como se acreditava no passado. Este estudo explica, em parte, porque os resultados de testes de eficácia em laboratório e de tratamentos em condições de campo apresentam diferentes magnitudes, abrindo caminho para uma melhor compreensão do comportamento dos estádios parasitários. 650 $aRhipicephalus microplus 650 $aResistência 653 $aEstádios parasitários 700 1 $aARAUJO, R. N. 700 1 $aBASTIANETTO, E. 700 1 $aLOPES, L. B. 700 1 $aKLAFKE, G. M. 700 1 $aFREITAS, C. M. V. de 700 1 $aMARTINS, J. R. 700 1 $aLEITE, R. C.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Agrossilvipastoril (CPAMT) |
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