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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
12/09/2003 |
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Data da última atualização: |
28/04/2006 |
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Autoria: |
NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E. G. M.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; BASSOI, M. C.; ALMEIDA, A. M. R.; MORALES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; MOLINA, J. C.; WENDLAND, A. |
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Título: |
Genômica funcional em plantas de soja submetidas a estresses bióticos e abióticos. |
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Ano de publicação: |
2003 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 25., 2003, Uberaba. Resumos... Londrina: Embrapa Soja: EPAMIG: Fundação Triângulo, 2003. |
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Páginas: |
p. 113-114. |
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Série: |
(Embrapa Soja. Documentos, 209). |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Boas de Campos Leite. |
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Conteúdo: |
Estima-se que plantas superiores como a soja tenham entre 80.000 a 100.000 genes. Compreender como e quando esses genes são expressos, são os principais objetivos da Genômica Funcional. Na Genômica Funcional, bibliotecas de DNA complementar (cDNA) são construídas e representam uma coleção de genes expressos em determinada situação. Genes expressos codificam proteínas com funções estruturais, enzimáticas, de regulação ou de armazenamento. Num contexto mais amplo de desenvolvimento do organismo e interagindo com outras moléculas, esses genes participam de processos fisiológicos que desencadeiam, ao final, determinadas respostas biológicas. Entretanto, não é a expressão de um ou dois genes, mas a co-expressão de dezenas ou centenas de genes que normalmente diferencia uma resposta biológica de outra. Os recentes avanços têm permitido analisar milhares de genes, expressos em um mesmo momento. Entre as metodologias que mais se destacam, hoje, estão Differential Display (DD), Macro e Microarranjos de DNA, e SAGE. A Embrapa Soja vem focalizando seus estudos nas respostas da soja ao ataque de nematóides (Meloidogyne javanica) e na tolerância à seca. Atualmente, estão sendo geradas informações, através do seqüenciamento massal de bibliotecas de cDNA obtido de raízes de plantas de soja, submetidas às duas situações de estresse. Mais de 7500 clones já foram seqüenciados e analisados em termos de similaridade com outros genes. Também estão sendo armazenados em freezers para utilização posterior em sistemas de análise de expressão gênica, por Microarranjos de DNA e DD. Os estudos com Microarranjos de DNA estão sendo feitos em parceria com a UNESP. Objetiva-se com o projeto o desenvolvimento de um banco de genes in vivo e in vitro e a sua gradual disponibilização (in silico), podendo ser hoje acessado no endereço www.cnpso.embrapa.br/bioinformatica. O rápido acesso aos dados poderá beneficiar programas de melhoramento genético por transgenia, ou assistido por marcadores moleculares, assim como permitirá que se tenha melhor compreensão dos mecanismos fisiológicos e moleculares de defesa da soja contra estresses. MenosEstima-se que plantas superiores como a soja tenham entre 80.000 a 100.000 genes. Compreender como e quando esses genes são expressos, são os principais objetivos da Genômica Funcional. Na Genômica Funcional, bibliotecas de DNA complementar (cDNA) são construídas e representam uma coleção de genes expressos em determinada situação. Genes expressos codificam proteínas com funções estruturais, enzimáticas, de regulação ou de armazenamento. Num contexto mais amplo de desenvolvimento do organismo e interagindo com outras moléculas, esses genes participam de processos fisiológicos que desencadeiam, ao final, determinadas respostas biológicas. Entretanto, não é a expressão de um ou dois genes, mas a co-expressão de dezenas ou centenas de genes que normalmente diferencia uma resposta biológica de outra. Os recentes avanços têm permitido analisar milhares de genes, expressos em um mesmo momento. Entre as metodologias que mais se destacam, hoje, estão Differential Display (DD), Macro e Microarranjos de DNA, e SAGE. A Embrapa Soja vem focalizando seus estudos nas respostas da soja ao ataque de nematóides (Meloidogyne javanica) e na tolerância à seca. Atualmente, estão sendo geradas informações, através do seqüenciamento massal de bibliotecas de cDNA obtido de raízes de plantas de soja, submetidas às duas situações de estresse. Mais de 7500 clones já foram seqüenciados e analisados em termos de similaridade com outros genes. Também estão sendo armazenados em freezers para utilização po... Mostrar Tudo |
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Categoria do assunto: |
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520 $aEstima-se que plantas superiores como a soja tenham entre 80.000 a 100.000 genes. Compreender como e quando esses genes são expressos, são os principais objetivos da Genômica Funcional. Na Genômica Funcional, bibliotecas de DNA complementar (cDNA) são construídas e representam uma coleção de genes expressos em determinada situação. Genes expressos codificam proteínas com funções estruturais, enzimáticas, de regulação ou de armazenamento. Num contexto mais amplo de desenvolvimento do organismo e interagindo com outras moléculas, esses genes participam de processos fisiológicos que desencadeiam, ao final, determinadas respostas biológicas. Entretanto, não é a expressão de um ou dois genes, mas a co-expressão de dezenas ou centenas de genes que normalmente diferencia uma resposta biológica de outra. Os recentes avanços têm permitido analisar milhares de genes, expressos em um mesmo momento. Entre as metodologias que mais se destacam, hoje, estão Differential Display (DD), Macro e Microarranjos de DNA, e SAGE. A Embrapa Soja vem focalizando seus estudos nas respostas da soja ao ataque de nematóides (Meloidogyne javanica) e na tolerância à seca. Atualmente, estão sendo geradas informações, através do seqüenciamento massal de bibliotecas de cDNA obtido de raízes de plantas de soja, submetidas às duas situações de estresse. Mais de 7500 clones já foram seqüenciados e analisados em termos de similaridade com outros genes. Também estão sendo armazenados em freezers para utilização posterior em sistemas de análise de expressão gênica, por Microarranjos de DNA e DD. Os estudos com Microarranjos de DNA estão sendo feitos em parceria com a UNESP. Objetiva-se com o projeto o desenvolvimento de um banco de genes in vivo e in vitro e a sua gradual disponibilização (in silico), podendo ser hoje acessado no endereço www.cnpso.embrapa.br/bioinformatica. O rápido acesso aos dados poderá beneficiar programas de melhoramento genético por transgenia, ou assistido por marcadores moleculares, assim como permitirá que se tenha melhor compreensão dos mecanismos fisiológicos e moleculares de defesa da soja contra estresses.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Meio Ambiente. Para informações adicionais entre em contato com cnpma.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
19/04/2021 |
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Data da última atualização: |
12/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
PARADA-PINILLA, M. P.; FERREIRA, M. A.; RONCALLO, J. C.; SANTOS, S. N.; MELO, I. S. de; ASSEF, A. N. B.; WILKE, D. V.; SILVA, L. F.; GARRIDO, L. M.; ARAUJO, W. L.; PADILLA, G. |
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Afiliação: |
MARIA PAULA PARADA-PINILLA, ICB-USP; MARIA ALEJANDRA FERREIRA, ICB-UDP; JUAN CAMILO RONCALLO, ICB-USP; SUIKINAI NOBRE SANTOS; ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA; ALEXIA NATHÁLIA BRÍGIDO ASSEF, UFC; DIEGO VERAS WILKE, UFC; LUIZIANA F SILVA, ICB-USP; LEANDRO MAZA GARRIDO, ICB-USP; WELINGTON LUIUZ ARAÚJO, ICB-USP; GABRIEL PADILLA, ICB-USP. |
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Título: |
Biopolymer production by halotolerant bacteria isolated from Caatinga biome. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, v. 52, n. 2, p. 547-559, 2021. |
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ISSN: |
1678-4405 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s42770-021-00426-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Saline environments are extreme habitats with a high diversity of microorganisms source of a myriad of biomolecules. These microorganisms are assigned as extremophiles recognized to be producers of new natural compounds, which can be synthesized by helping to survive under harshness and extreme conditions. In Brazil, in the saline and semi-arid region of Areia Branca (Caatinga biome), halotolerant bacteria (able to growth at high NaCl concentrations) were isolated from rhizosphere of native plants Blutaparon portulacoides and Spergularia sp. and their biopolymer production was studied. A total of 25 bacterial isolates were identified at genus level based on 16S rRNA gene sequence analysis. Isolates were mainly Gram-positive bacteria from Bacillaceae, Staphylococcaceae, Microbacteriaceae, and Bacillales XII incertae sedis families, affiliates to Bacillus, Staphylococcus, Curtobacterium, and Exiguobacterium genera, respectively. One of the Gram-negative isolates was identified as member of the Pseudomonadaceae family, genus Pseudomonas. All the identified strains were halotolerant bacteria with optimum growth at 0.6-2.0 M salt concentrations. Assays for biopolymer production showed that the halotolerant strains are a rich source of compounds as polyhydroxyalkanoates (PHA), biodegradable biopolymer, such as poly(3-hydroxybutyrate) (PHB) produced from low-cost substrates, and exopolysaccharides (EPS), such as hyaluronic acid (HA), metabolite of great interest to the cosmetic and pharmaceutical industry. Also, eight bacterial EPS extracts showed immunostimulatory activity, promising results that can be used in biomedical applications. Overall, our findings demonstrate that these biomolecules can be produced in culture medium with 0.6-2.0 M NaCl concentrations, relevant feature to avoid costly production processes. This is the first report of biopolymer-producing bacteria from a saline region of Caatinga biome that showed important biological activities. MenosAbstract: Saline environments are extreme habitats with a high diversity of microorganisms source of a myriad of biomolecules. These microorganisms are assigned as extremophiles recognized to be producers of new natural compounds, which can be synthesized by helping to survive under harshness and extreme conditions. In Brazil, in the saline and semi-arid region of Areia Branca (Caatinga biome), halotolerant bacteria (able to growth at high NaCl concentrations) were isolated from rhizosphere of native plants Blutaparon portulacoides and Spergularia sp. and their biopolymer production was studied. A total of 25 bacterial isolates were identified at genus level based on 16S rRNA gene sequence analysis. Isolates were mainly Gram-positive bacteria from Bacillaceae, Staphylococcaceae, Microbacteriaceae, and Bacillales XII incertae sedis families, affiliates to Bacillus, Staphylococcus, Curtobacterium, and Exiguobacterium genera, respectively. One of the Gram-negative isolates was identified as member of the Pseudomonadaceae family, genus Pseudomonas. All the identified strains were halotolerant bacteria with optimum growth at 0.6-2.0 M salt concentrations. Assays for biopolymer production showed that the halotolerant strains are a rich source of compounds as polyhydroxyalkanoates (PHA), biodegradable biopolymer, such as poly(3-hydroxybutyrate) (PHB) produced from low-cost substrates, and exopolysaccharides (EPS), such as hyaluronic acid (HA), metabolite of great interest to the co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Caatinga biome; Halotolerant microorganisms; Immunostimulatory activity. |
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Thesagro: |
Bactéria; Caatinga. |
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Thesaurus NAL: |
Biopolymers; Exopolysaccharides; Hyaluronic acid; Immunostimulation (physiological); Polyhydroxyalkanoates. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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001 2131360
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520 $aAbstract: Saline environments are extreme habitats with a high diversity of microorganisms source of a myriad of biomolecules. These microorganisms are assigned as extremophiles recognized to be producers of new natural compounds, which can be synthesized by helping to survive under harshness and extreme conditions. In Brazil, in the saline and semi-arid region of Areia Branca (Caatinga biome), halotolerant bacteria (able to growth at high NaCl concentrations) were isolated from rhizosphere of native plants Blutaparon portulacoides and Spergularia sp. and their biopolymer production was studied. A total of 25 bacterial isolates were identified at genus level based on 16S rRNA gene sequence analysis. Isolates were mainly Gram-positive bacteria from Bacillaceae, Staphylococcaceae, Microbacteriaceae, and Bacillales XII incertae sedis families, affiliates to Bacillus, Staphylococcus, Curtobacterium, and Exiguobacterium genera, respectively. One of the Gram-negative isolates was identified as member of the Pseudomonadaceae family, genus Pseudomonas. All the identified strains were halotolerant bacteria with optimum growth at 0.6-2.0 M salt concentrations. Assays for biopolymer production showed that the halotolerant strains are a rich source of compounds as polyhydroxyalkanoates (PHA), biodegradable biopolymer, such as poly(3-hydroxybutyrate) (PHB) produced from low-cost substrates, and exopolysaccharides (EPS), such as hyaluronic acid (HA), metabolite of great interest to the cosmetic and pharmaceutical industry. Also, eight bacterial EPS extracts showed immunostimulatory activity, promising results that can be used in biomedical applications. Overall, our findings demonstrate that these biomolecules can be produced in culture medium with 0.6-2.0 M NaCl concentrations, relevant feature to avoid costly production processes. This is the first report of biopolymer-producing bacteria from a saline region of Caatinga biome that showed important biological activities.
650 $aBiopolymers
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650 $aImmunostimulation (physiological)
650 $aPolyhydroxyalkanoates
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653 $aHalotolerant microorganisms
653 $aImmunostimulatory activity
700 1 $aFERREIRA, M. A.
700 1 $aRONCALLO, J. C.
700 1 $aSANTOS, S. N.
700 1 $aMELO, I. S. de
700 1 $aASSEF, A. N. B.
700 1 $aWILKE, D. V.
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700 1 $aGARRIDO, L. M.
700 1 $aARAUJO, W. L.
700 1 $aPADILLA, G.
773 $tBrazilian Journal of Microbiology$gv. 52, n. 2, p. 547-559, 2021.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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