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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
07/08/2020 |
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Data da última atualização: |
27/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PINHEIRO, D. H.; MOREIRA, R. O.; LEITE, N. A.; REDOAN, A. C.; XAVIER, A. da S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P. |
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Afiliação: |
Daniele Heloisa Pinheiro; Raquel Oliveira Moreira, UNESP; Natalia Alves Leite, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Ana Carolina Redoan; Andre da Silva Xavier, Universidade Federal do Espírito Santo; BEATRIZ DE ALMEIDA BARROS, CNPMS; NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS. |
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Título: |
Suitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera: Pentatomidae). |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4989-5000, 2020. |
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DOI: |
10.1007/s11033-020-05550-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. MenosThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the develop... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Gene; Inseto; Percevejo; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 61 | |
| 41. |  | LEITE, N. S.; LIMA, A. A. B.; SANTANA, J. C. C.; LOPES, F. L. G.; LEDO, A. da S.; TAMBOURGIM, E. B.; SOUZA, R. R. de. Determination of optimal condition to obtain the bromelain from pineapple plants produced by micropropagation. Brazilian Archives of Biology and Technology, v. 55, n. 5, p. 647-652, set./out. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 42. | | BORGES, V.; SOARES, A. A.; REIS, M. S.; RESENDE, M. D. V. de; CORNÉLIO, V. M. O.; LEITE, N. A.; VIEIRA, A. R. Desempenho genotípico de linhagens de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos. Bragantia, Campinas, v. 69, n. 4, p. 833-842, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 43. | | LEITE, N. S.; BARBOZA, S. B. S. C.; SOUZA, R. R.; COPATI, L. A. S.; SANTOS, M. da C.; LÉDO, A. da S. Efeito da individualização de nós de segmentos caulinares estiolados de Ananas comosus na proliferação de brotos in vitro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 16.; SIMPÓSIO DE PLANTAS ORNAMENTAIS NATIVAS, 1.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 3., 2007, Goiânia. [Resumos...]. Goiânia: Revista Brasileira de Horticultura Ornamental, 2007. 1 CD-ROM. p. 1129.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 44. | | LEITE, N. S.; FERNANDES, R. P. M.; BARBOZA, S. B. S. C.; LÉDO, A. da S.; SANTOS, A. F.; ALVES, R. S. Efeito de diferentes tratamentos hidropônicos na atividade da enzima bromelina de abacaxizeiro. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 4., 2008, São Cristóvão. Anais... São Cristóvão: UFS, 2008. Biotecnologia. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 45. | | LEITE, N. A.; MENDES, S. M.; SANTOS-AMAYA, O. F.; SANTOS, C. A.; TEIXEIRA, T. P. M.; GUEDES, R. N. C.; PEREIRA, E. J. G. Rapid selection and characterization of Cry1F resistance in a Brazilian strain of fall armyworm. Entomologia Experimentalis et Applicata, Dordrecht, v. 158, p. 236-247, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 46. | | BORGES, V.; SOARES, A. A.; RESENDE, M. D. V. de; REIS, M. de S.; CORNELIO, V. M. de O.; LEITE, N. A.; VIEIRA, A. R. Progresso genotípico do arroz de terras altas em Minas Gerais no período de 1997 a 2008, estimado por modelo misto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: SBMP: Incaper, 2009. 4 p. CD-ROM. (INCAPER. Documentos, 11).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 48. | | FRANÇA, L. F. T.; SILVA, D. M.; MANTOVANI, M. A. M.; STECCA, S. C.; LEITE, N.; BUENO, A. F.; MOSCARDI, F. Preferência de oviposição de Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: noctuidae) em diferentes plantas hospedeiras. JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 7., 2012, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2012. p. 115-118. (Embrapa Soja. Documentos, 333). Editado por Paula Gerón Saiz de Mello. Disponível em: .| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 49. | | MANTOVANI, M. A. M.; STECCA, S. C.; FRANÇA, L. F. T.; ZIRONDI, D.; SILVA, D. M.; LEITE, N.; BUENO, A. F.; PASINI, A. Seletividade de inseticidas a adultos de Podisus nigrispinus em condições de laboratório. JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 7., 2012, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2012. p. 119-123. (Embrapa Soja. Documentos, 333). Editado por Paula Gerón Saiz de Mello. Disponível em: .| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 50. | | PINHEIRO, D. H.; MOREIRA, R. O.; LEITE, N. A.; REDOAN, A. C.; XAVIER, A. da S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P. Suitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera: Pentatomidae). Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4989-5000, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 51. | | NAZARET, A. M.; HEBACH, F. C.; MENDES, S. M.; DIAS, A. S.; SANTOS, C. A. dos; ARAUJO, O. G.; BARBOSA, T. A. N.; LEITE, N. A.; MARUCCI, R. C. Aspectos biológicos de Rhopalosiphum maidis (Fitch, 1856) (Hemiptera: Aphididae) em diferentes hospedeiros. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 928-934. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 52. | | VILANOVA, NETA, J. L.; LEDO, A. da S.; LIMA, A. A. B.; SANTANA, J. C. C.; LEITE, N. S.; RUZENE, D. S.; SILVA, D. P.; SOUZA, R. R. de. Bromelain enzyme from pineapple: in vitro activity study under different micropropagation conditions. Applied Biochemistry Biotechnology, v. 168, p. 234-246, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 53. | | SOARES, A. A.; REIS, M. de S.; CORNÉLIO, V. M. de O.; SOARES, P. C.; COSTA JÚNIOR, G. T.; GUEDES, J. M.; LEITE, N. A.; SOUZA, M. A. de; DIAS, F. P. BRSMG Caravera: cultivar de arroz para terras altas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 7, p. 937-940, jul. 2008. Título em inglês: BRSMG Caravera: upland rice cultivar.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 54. | | AMORIM, L. L. B.; LEITE, N. G. A.; ONOFRE, A. V. C.; COSTA, A. F.; DAMASCENO-SILVA, K. J.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Genetic diversity among cowpea cultivars as revealed by ISSR and DAF markers. In: FERIA CONGRESO LATINOAMERICANO DE BIOTECNOLOGIA, 9.; CONGRESO ARGENTINO DE BIOTECNOLOGIA, 4., 2010, Buenos Aires. Bioeconomia e innovación: un nuevo desafio. Buenos Aires, Argentina: FAB: FELAEB, 2010. p. 11. BIOLATINA 2010. Autoria: DAMASCENO-SILVA, K. J. [i.e. SILVA, K. J. D. e].| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 55. | | MACARIO, C. G. do N.; SENRA, R. D. A.; MEDEIROS, C. B.; LAMPARELLI, R. A. C.; ZULLO JUNIOR, J.; ROCHA, J. V.; MADEIRA, E. R. M.; MARTINS, E.; BARANAUSKAS, M. C. C.; LEITE, N. J.; TORRES, R. da S. Monitoramento de safras via Web: um caso de sucesso em pesquisa multidisciplinar. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 6., 2007, São Pedro, SP. Anais... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 326-330. SBIAgro 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 56. | | BUENO, A. F.; LEITE, N.; FRANÇA, L. F. T.; MANTOVANI, M. A. M.; ALMEIDA, N. C. S.; SILVA, G. V.; FRUGERI, A. P.; SILVA, D. M.; BORTOLOTTO, O. C. Repostas de cultivares de soja de hábito determinado e indeterminado à diferentes intensidades de desfolha. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 50, res. 66.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 57. | | BUENO, A. F.; LEITE, N.; FRANÇA, L. F. T.; MANTOVANI, M. A. M.; ALMEIDA, N. C. S.; SILVA, G. V.; FRUGERI, A. P.; SILVA, D. M.; BORTOLOTTO, O. C. Repostas de cultivares de soja de hábito determinado e indeterminado à diferentes intensidades de desfolha. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 58. | | BUENO, A. F.; LEITE, N.; FRANÇA, L. F. T.; MANTOVANI, M. A. M.; ALMEIDA, N. C. S.; SILVA, G. V.; FRUGERI, A. P.; SILVA, D. M.; BORTOLOTTO, O. C. Repostas de cultivares de soja de hábito determinado e indeterminado à injúrias na fase inicial do desenvolvimento das plantas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 49, res. 65.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 59. | | BUENO, A. F.; LEITE, N.; FRANÇA, L. F. T.; MANTOVANI, M. A. M.; ALMEIDA, N. C. S.; SILVA, G. V.; FRUGERI, A. P.; SILVA, D. M.; BORTOLOTTO, O. C. Repostas de cultivares de soja de hábito determinado e indeterminado à injúrias na fase inicial do desenvolvimento das plantas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 60. | | BORGES, V.; SOARES, A. A.; RESENDE, M. D. V. de; REIS, M. de S.; CORNELIO, V. M. de O.; LEITE, N. A.; SOARES, P. C.; COSTA JÚNIOR, G. T. Value for cultivation and use of upland rice cultivars tested in multi-environments. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, MG, v. 12, n. 1, p. 25-33, Mar. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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