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Biblioteca(s):  Embrapa Meio Ambiente.
Data corrente:  31/08/2023
Data da última atualização:  01/09/2023
Tipo da produção científica:  Nota Técnica/Nota Científica
Autoria:  BRAGA, L. P.; TANENTZAP, A. J.; LEE, B.; TSAI, S. M.; RAAIJMAKERS, J. M.; MENDES, R.; MENDES, L. W.
Afiliação:  LUCAS P.P. BRAGA, UNIVERSITY OF CAMBRIDGE; ANDREW J. TANENTZAP, UNIVERSITY OF CAMBRIDGE; BENJAMIN LEE, NATIONAL INSTITUTES OF HEALTH; SIU MUI TSAI, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; JOS M. RAAIJMAKERS, NETHERLANDS INSTITUTE OF ECOLOGY; RODRIGO MENDES, CNPMA; LUCAS WILLIAM MENDES, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO.
Título:  Diversity of viruses and viroids in the rhizosphere of common bean cultivars differing in resistance to the fungal root pathogen Fusarium oxysporum.
Ano de publicação:  2023
Fonte/Imprenta:  Applied Soil Ecology, v. 190, article 105018, 2023.
ISSN:  0929-1393
DOI:  10.1016/j.apsoil.2023.105018
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Abstract: The rhizosphere microbiome plays a key role in plant protection against soil-borne pathogens. Plant breeding for resistance against soil-borne pathogens can alter the rhizosphere microbiome. However, most studies have focused on bacterial and fungal communities, leaving the role of the virus and viroids unassessed. Here, we tested the influence of resistance breeding on the composition of rhizosphere viruses and viroids. By analyzing metatranscriptomes from the rhizosphere of common bean (Phaseolus vulgaris) cultivars with varying resistance to the soil-borne pathogen Fusarium oxysporum, we recovered sequences representing 78 and 23 novel populations of viruses and viroids, respectively. We compared the abundances of these infectious agents across the different cultivars and found that the Fusarium-resistant cultivar harbored >1.2 times more viroids and a more different composition of viroids and viruses than less resistant plants. Given their role in interfering with host metabolism and their potential influence on plant-fungi associations, our study suggests that changes in the rhizosphere infectome are an important consideration in breeding for resistance against soil-borne pathogens.
Palavras-Chave:  Infectome; Plant-microbe interactions.
Thesagro:  Doença de Planta; Feijão; Resistência; Rizosfera; Vírus.
Thesaurus Nal:  Beans; Food security; Microbiome; Soil-plant interactions; Viruses.
Categoria do assunto:  S Ciências Biológicas
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1156276/1/Mendes-Diversity-viruses-2023.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Meio Ambiente (CNPMA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
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1.Imagem marcado/desmarcadoBRAGA, L. P.; TANENTZAP, A. J.; LEE, B.; TSAI, S. M.; RAAIJMAKERS, J. M.; MENDES, R.; MENDES, L. W. Diversity of viruses and viroids in the rhizosphere of common bean cultivars differing in resistance to the fungal root pathogen Fusarium oxysporum. Applied Soil Ecology, v. 190, article 105018, 2023.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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2.Imagem marcado/desmarcadoHERRERO, M.; THORNTON, P. K.; MASON-D'CROZ, D.; PALMER, J.; BENTON, T. G.; BODIRSKY, B. L.; BOGARD, J. R.; HALL, A.; LEE, B.; NYBORG, K.; PRADHAN, P.; BONNETT, G. D.; BRYAN, B. A.; CAMPBELL, B. M.; CHRISTENSEN, S.; CLARK, M.; COOK, M. T.; BOER, I. J. M. de; DOWNS, C.; DIZYEE, K.; FOLBERTH, C.; GODDE, C. M.; GERBER, J. S.; GRUNDY, M.; HAVLIK, P.; JARVIS, A.; KING, R.; LOBOGUERRERO, A. M.; LOPES, M. A.; MCLNTYRE, C. L.; NAYLOR, R.; NAVARRO, J.; OBERSTEINER, M.; PARODI, A.; PEOPLES, M. B.; PIKAAR, I.; POPP, A.; ROCKSTROM, J.; ROBERTSON, M. J.; SMITH, P.; STEHFEST, E.; SWAIN, S. M.; VALIN, H.; VAN WIJK, M.; VAN ZANTEN, H. H. E.; VERMEULEN, S.; VERVOORT, J.; WEST, P. C. Innovation can accelerate the transition towards a sustainable food system. Nature Food, v. 1, p. 266-272, May 2020. Perspective.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoMAES, P.; AMARASINGHE, G. K.; AYLLÓN, M. A.; BASLER, C. F.; SINA, B.; BLASDELL, K. R.; BRIESE, T.; BROWN, P. A.; BUKREYEV, A.; BALKEMA-BUSCHMANN, A.; BUCHHOLZ, U. J.; CHANDRAN, K.; CROZIER, I.; SWART, R. de; DIETZGEN, R. G.; DOLNIK, O.; DOMIER, L. L.; DREXLER, J. F.; DÜRRWALD, R.; DUNDON, W. G.; DUPREX, W. P.; DYE, J. M.; EASTON, A. J.; FOOKS, A. R.; FORMENTY, P. B. H.; FOUCHIER, R. A. M.; ASTUA, J. de F.; GHEDIN, E.; GRIFFITHS, A.; HEWSON, R.; HORIE, M.; HURWITZ, J. L.; HYNDMAN, T. H.; JIANG, D.; KOBINGER, G. P.; KONDO, H.; KURATH, G.; KUZMIN, I. V.; LAMB, R. T A.; LEE, B.; LEROY, E. M.; LI, J.; MARZANO, S. L.; MUHLBERGER, E.; NETESOV, S.; NETESOV, S. V.; PALACIOS, G.; PÁLYI, B.; PAWESKA, J. T.; PAYNE, S. L.; RIMA, B. K.; ROTA, P.; RUBBENSTROTH, D.; SIMMONDS, P.; SMITHER, S. J.; SONG, Q.; SONG, T.; SPANN, K.; STENGLEIN, M. D.; STONE, D. M.; TAKADA, A.; TESH, R. T B.; TOMONAGA, K.; TORDO, N.; TOWNER, J. S.; VAN DEN HOOGEN, B.; VASILAKIS, N.; WAHL, V.; WALKER, P. J.; WANG, D.; WANG, L.-F.; WHITFIELD, A. E.; WILLIAMS, J. V.; YE, G.; ZERBINI, F. M.; ZHANG, Y.-Z.; KUHN, J. H. Taxonomy of the order Mononegavirales: second update 2018. Archives of Virology, p.1-12, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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4.Imagem marcado/desmarcadoAMARASINGHE, G. K.; AYLLÓN, M. A.; BÀO, Y.; BASLER, C. F.; BAVARI, S.; BLASDELL, K. R.; BRIESE, T.; BROWN, P. A.; BUKREYEV, A.; BUSCHMANN, A. B.; BUCHHOLZ, U. J.; JESUS, C. C.; CHANDRAN, K.; CHIAPPONI, C.; CROZIER, I.; SWART, R. L. de; DIETZGEN, R. G.; DOLNIK, O.; DREXLER, J. F.; DÜRRWALD, R.; DUNDON, W. G.; DUPREX, W. P.; DYE, J. M.; EASTON, A. J.; FOOKS, A. R.; FORMENTY, P. B. H; FOUCHIER, R. A. M; ASTUA, J. de F.; GRIFFITHS, A.; HEWSON, R.; HORIE, M.; HYNDMAN, T. H.; JIÃNG, D.; KITAJIMA, E. W.; KOBINGER. G. P.; KONDÕ, H.; KURATH, G.; KUZMIN, I. V.; LAMB, R. A.; LAVAZZA, A.; LEE, B.; LELLI, D.; LEROY, E. M.; LI, J.; MAES, P.; MARZANO, S. L.; MORENO, A.; MÜHLBERGER, E.; NETESOV, S. V.; NOWOTNY, N.; NYLUND, A.; ØKLAND, A. L.; PALACIOS, G.; Pályi, B.; PAW?SKA, J. T.; PAYNE, S. L.; PROSPERI, A.; GONZALEZ, P. L. R.; RIMA, B. K.; ROTA, P.; RUBBENSTROTH, D.; SH?, M.; SIMMONDS, P.; SMITHER, S. J.; SOZZI, E.; SPANN, K.; STENGLEIN, M. D.; STONE, D. M.; TAKADA, A.; TESH, R. B.; TOMONAGA, K.; TORDO, N.; TOWNER, J. S.; HOOGEN, B. V. D.; VASILAKIS, N.; WAHL, V.; WALKER, P. J.; WANG, L.; WHITFIELD, A. E.; WILLIAMS, J. V.; ZERBINI, F. M.; ZH?NG, T.; ZHANG, Y. Z.; KUHN, J. H. Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2019. Archives of Virology, v.164, p.1967-1980, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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5.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, J. H.; ADKINS, S.; ALIOTO, D.; ALKHOVSKY, S. V.; AMARASINGHE, G. K.; AVSIC-ZUPANC, T.; AYLLÓN, M. A.; BAHL, J.; BALKEMA-BUSCHMANN, A.; BALLINGER, M. J.; BARTONICKA, T.; BASLER, C.; BAVARI, S.; BEER, M.; BENTE, D. A.; BERGERON, É.; BIRD, B. H.; BLAIR, C.; BLASDELL, K. R.; BRADFUTE, S. B.; BREYTA, R.; BRIESE, T.; BROWN, P. A.; BUCHHOL, U. J.; BUCHMEIER, M. J.; BUKREYEV, A.; BURT, F.; BUZKAN, N.; CALISHER, C. H.; CAO, M.; CASAS, I.; CHAMBERLAIN, O.; CHANDRAN, K.; CHARREL, R. N.; CHEN, B.; CHIUMENTI, M.; CHO, IL-R.; CLEGG, J. C. S.; CROZIER, I.; GRAÇA, J. V. da; BÓ, E. D.; DÁVILA, A. M. R.; LA TORRE, J. C. de; LAMBALLERIE, X. de; SWART, R. L. de; DI BELLO, P. L.; DI PAOLA, N.; DI SERIO, F.; DIETZGEN, R. G.; DIGIARO, M.; DOLJA, V. V.; DOLNIK, O.; DREBOT, M. A.; DREXLER, J. F.; DÜRRWALD, R.; DUFKOVA, L.; DUNDON, W. G.; DUPREX, W. P.; DYE, J. M.; EASTON, A. J.; EBIHARA, H.; ELBEAINO, T.; ERGÜNAY, K.; FERNANDES, J.; FOOK, A. R.; FORMENT, P. B. H.; FORTH, L. F.; FOUCHIER, R. A. M.; ASTUA, J. de F.; GAGO-ZACHERT, S.; GÃO, G. F.; GARCÍA, M. L.; GARCÍA-SASTRE, A.; GARRISON, A. R.; GBAKIMA, A.; GOLDSTEIN, T.; GONZALEZ, J. P. J.; GRIFFITHS, A.; GROSCHUP, M. H.; GÜNTHER, S.; GUTERRES, A.; HALL, R. A.; HAMMOND, J.; HASSAN, M.; HEPOJOKI, J.; HEPOJOKI, S.; HETZEL, U.; HEWSON, R.; HOFFMANN, B.; HONGO, S.; HÖPER, D.; HORIE, M.; HUGHES, H. R.; HYNDMAN, T. H.; JAMBAI, A.; JARDIM, R.; JIANG, D.; JIN, Q.; JONSON, G. B.; JUNGLEN, S.; KARADAG, S.; KELLER, K. E.; KLEMPA, B.; KLINGSTRÖM, J.; KOBINGER, G.; KONDO, H.; KOONIN, E. V.; KRUPOVIC, M.; KURATH, G.; KUZMIN, I. V.; LAENEN, L.; LAMB, R. T A.; LAMBERT, A. J.; LANGEVIN, S. L.; LEE, B.; LEMOS, E. R. S.; LEROY, E. M.; LI, D.; Li, J.; LIANG, M.; LIÚ, W.; LIÚ, Y.; LUKASHEVICH, I. S.; MAES, P.; SOUZA, W. M. de; MARKLEWITZ, M.; MARSHALL, S. H.; MARTELLI, G. P.; MARTIN, R. R.; MARZANO, S.-L.; MASSART, S.; MCCAULEY, J. W.; MIELKE-EHRET, N.; MINAFRA, A.; MINUTOLO, M.; MIRAZIMI, A.; MÜHLBACH, H.-P.; MÜHLBERGER, E.; NAIDU, R.; NATSUAKI, T.; NAVARRO, B.; NAVARRO, J. A.; NETESOV, S. V.; NEUMANN, G.; NOWOTNY, N.; NUNES, M. R. T.; NYLUND, A.; ØKLAND, A. L.; OLIVEIRA, R. C.; PALACIOS, G.; PALLAS, V.; PÁLYI, B.; PAPA, A.; PARRISH, C. R.; PAUVOLID-CORRÊA, A.; PAWESKA, J. T.; PAYNE, S.; PÉREZ, D. R.; PFAFF, F.; RADOSHITZKY, S. R.; RAHMAN, A.; RAMOS-GONZÁLEZ, P. L.; RESENDE, R. O.; REYES, C. A.; RIMA, B. K.; ROMANOWSKI, VÍCTOR; LUNA, G. R.; ROTA, P.; RUBBENSTROTH, D.; RUNSTADLER, J. A.; RUZEK, D.; SABANADZOVIC, S.; SALÁT, J.; SALL, A. A.; SALVATO, M. S.; SARPKAYA, K.; SASAYA, T.; SCHWEMMLE, M.; SHABBIR, M. Z.; SHÍ, X.; SHÍ, Z.; SHIRAKO, Y.; SIMMONDS, P.; SIRMAROVÁ, J. 2020 taxonomic update for phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirales. Archives of Virology, September, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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6.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, J.; ADKINS, S.; AGWANDA, B. R.; KUBRUSLI, R. A.; ALKHOVSKY, S. V.; AMARASINGHE, G. K.; TATJANA, A.-Z.; AYLLÓN, M. A.; BAHL, J.; BALKEMA BUSCHMANN, A.; BALLINGER, M. J.; BASLER, C. F.; BAVARI, S.; BEER, M.; BEJERMAN, N.; BENNETT, A. J.; DBENTE, D. A.; BERGERON, É.; BIRD, B. H.; BLAIR, C. D.; BLASDELL, K. R.; BLYSTAD, D. R.; BOJKO, J.; BORTH, W. B.; BRADFUTE, S.; BREYTA, R.; BRIESE, T.; BROWN, P. A.; BROWN, J. K.; BUCHHOLZ, U. J.; BUCHMEIER, M. J.; ABUKREYEV, A.; BURT, F.; BÜTTNER, C.; CALISHER, C. H.; CAO, M.; CASAS, I.; CHANDRAN, K.; CHARREL, R. N.; CHENG, Q.; CHIAKI, Y.; CHIAPELLO, M.; CHOI, I. R.; CIUFO, M.; CLEGG, J. C. S.; CROZIER, I.; BÓ, E. D.; DE LA TORRE, J. C.; LAMBALLERIE, X. de; SWART, R. L. de; DEBAT, H.; DHEILLY, N. M.; DI CICCO, E.; DI PAOLA, N.; DI SERIO, F.; DIETZGEN, R. G.; DIGIARO, M.; DOLNIK, O.; DREBOT, M. A.; DREXLER, J. F.; DUNDON, W. G.; DUPREX, W. P.; DÜRRWALD, R.; DYE, J. M.; EASTON, A. J.; EBIHARA, H.; ELBEAINO, T.; ERGÜNAY, K.; FERGUSON, H. W.; FOOKS, A. R.; FORGIA, M.; FORMENTY, P. B. H.; FRÁNOVÁ, J.; ASTUA, J. de F.; FU, J.; FÜRL, S.; ZACHERT, S. G.; GĀO, G. F.; GARCÍA, M. L.; SASTRE, A. G.; GARRISON, A. R.; GASKIN, T.; GONZALE, J. P. J.; GRIFTHS, A.; GOLDBERG, T. L.; GROSCHUP, M. H.; GÜNTHER, S.; HALL, R. A.; HAMMOND, J.; HAN, O.; HEPOJOKI, J.; HEWSON, R.; HONG, J.; HONG, N.; HORIE, M.; HU, J. S.; HU, T.; HUGHES, H. R.; HÜTTNER, F.; HYNDMAN, T. H.; ILYAS, M.; JALKANEN, R.; JIĀNG, D.; JONSON, G. J.; JUNGLEN, S.; KADONO, F.; KAUKINEN, K. H.; KAWATE, M.; KLEMPA, B.; KLINGSTRÖM, J.; KOBINGER, G.; KOLONIUK, I.; KONDŌ, H.; KOONIN, V.; KRUPOVIC, M.; KUBOTA, K.; KURATH, G.; LAENEN, L.; LAMBERT, A. J.; LANGEVIN, S. L.; LEE, B.; LEFKOWITZ, E. J.; LI, L.; LEROY, E. M.; LI, S.; LÍ, J.; LIU, H.; LUKASHEVICH, I. S.; MAES, P.; SOUZA, W. M. de; MARKLEWITZ, M.; MARSHALL, S. H.; MARZANO, S. L.; MASSART, S.; MCCAULEY, J. W.; MELZER, M.; MILLER, K. M.; MING, T. J.; MIRAZIMI, A.; MORDECAI, G. J.; MÜHLBACH, H. P.; MÜHLBERGER, E.; NAIDU, R.; NATSUAKI, T.; NAVARRO, J. A.; NETESOV, S. Y V.; NEUMANN, G.; NOWOTNY, N.; NUNES, M. R. T.; VELARDE, A. O.; PALACIOS, G.; PALLÁS, V.; PÁLYI, B.; PAPA, A.; PARASKEVOPOULOU, S.; PARK, A. C.; PARRISH, C. R.; PATTERSON, D. A.; CORRÊA, A. P.; PAWESKA, J. T.; PAYNE, S.; PERACCHIO, C.; PÉREZ, D. R.; POSTLER, T. S.; QI, L.; RADOSHITZKY, S. R.; RESENDE, R. O.; REYES, C. A.; RIMA, B. K.; LUNA, G. R.; ROMANOWSKI, V.; ROTA, P.; RUBBENSTROTH, D.; RUBINO, L.; RUNSTADLER, J. A.; SABANADZOVIC, S.; SALL, A. A.; SALVATO, M. S.; SANG, R.; SASAYA, T.; SCHULZE, A. D.; SCHWEMMLE, M.; SHI, M.; SHÍ, X.; SHIMOMOTO, Y.; SHIRAKO, Y.; SIDDELL, S. G.; SIMMONDS, P.; SIRONI, M.; SMAGGHE, G.; SMITHER, S.; SONG, J. W.; SPANN, K.; SPENGLER, J. R.; STENGLEIN, M. D.; STONE, D. M.; SUGANO, J.; TABATA, A.; TAKADA, A.; TAKEUCHI, S.; TCHOUASSI, D. P.; TEFER, A.; TESH, R. B.; THORNBURG, N. J.; TOMITAKA, Y.; TOMONAGA, K.; TORDO, N.; TORTO, B.; TOWNER, J. S.; TSUDA, S.; TU, C.; TURINA, M.; TZANETAKIS, I. E.; UCHIDA, J.; USUGI, T.; VAIRA, A. M.; VALLINO, M.; VAN DEN HOOGEN, B.; VARSANI, A.; VASILAKIS, N.; VERBEEK, M.; BARGEN, S. V.; WADA, J.; WAHL, V.; WALKER, P. J.; WANG, L. F.; WANG, G.; WANG, Y.; WANG, Y.; WAQAS, M.; WÈI, T.; WEN, S.; WHITFELD, A. E.; WILLIAMS, J. V.; WOLF, Y. I.; WU, J.; XU, L.; YANAGISAWA, H.; YANG, C.; YANG, Z.; ZERBINI, F. M.; ZHAI, L.; ZHANG, Y. Z.; ZHANG, O.; ZHANG, J.; ZHANG, Z.; ZHOU, X. 2021 Taxonomic update of phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirale. Archives of Virology, August, 2021.
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