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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
02/12/2020 |
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Data da última atualização: |
11/01/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
Valquíria Martins Pereira, Universidade Federal de Lavras; Jaire Alves Ferreira Filho, Universidade Federal de Lavras; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; Luiz Henrique Galli Vargas, Universidade Federal de Lavras; Marcelo Picanço de Farias, Universidade Federal de Lavras; SARA DE ALMEIDA RIOS, CNPMS; RAIMUNDO NONATO VIEIRA DA CUNHA, CPAA; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; ALEXANDRE ALONSO ALVES, CNPAE; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
American oil palm from Brazil: Genetic diversity, population structure, and core collection. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 60, p. 3212-3227, Nov./Dec. 2020. |
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Descrição Física: |
il. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1002/csc2.20276 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate degree, and probably only a small portion of the species diversity is represented in the collection. The possible reason for that is the collecting strategy used, which collected subsamples only around the most prominent watercourses in the region. The average degree of genetic differentiation among subsamples is very high, indicating the presence of high interpopulation differentiation. The collection showed a low level of endogamy. The low average gene flow found indicates that genetic isolation caused by drift is occurring, and there is a need to review the conservation strategy. A set of 245 SNPs distributed throughout all 16 chromosomes was used to design CC based on maximizing the strategy of diversity. The optimal adjustment of the validated parameters, maintained while taking fewest subsamples, led to the choice of a model containing 20% of the entire collection as the ideal to form the CC. MenosThe American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate degree, and probably only a small portion of the species diversity is represented in the collection. The possible reason for that is the collecting strategy used, which collected subsamples only around the most prominent watercourses in the region. The average degree of genetic differentiation among subsamples is very high, indicating the presence of high interpopulation differentiation. The collection showed a low level of endogamy. The low average gene flow found indicates that genetic isolation caused by drift is occurring, and there is a need to review the conservation strategy. A set of 245 SNPs distributed throughout all 16 chromosomes was used to design CC based on maximizing the strategy of diversity. The optimal adjustm... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
American oil palm; Brazilian Elaeis oleifera; Diversidade genética. |
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Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Dendê; Melhoramento Genético Vegetal; Óleo. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding and Genetic Improvement; Genetic improvement. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/220143/1/American-oil-palm-2020.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225602/1/American-oil.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 50 | |
| 4. |  | MARQUES, H. P.; SIQUEIRA, F. G. de; LEAO, A. P.; SOUZA JUNIOR, M. T. Otimização de métodos de extração de DNA genômico dos basidiomicetos Panus lecomtei CC40 e Pleurotus pulmonarius EF88. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 4.,2017, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 33-38.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 5. | | ROSADO, T. B.; LEAO, A. P.; SANTOS, R. F. dos; LAVIOLA, B. G.; GRATTAPAGLIA, D. Taxa de cruzamento em pinhão manso estimada por meio de marcadores RAPD. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 7., 2010, Belo Horizonte. Biodiesel: inovação tecnológica e qualidade: anais. Lavras: UFLA, 2010. v. 1 p. 127-128.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 6. | | ALVES, A. A.; PEREIRA, V. M.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Advancing palm genomics by developing a high-density battery of molecular markers for Elaeis oleifera for future downstream applications. In: CONGRESS OF THE BRAZILIAN OF BIOTECHNOLOGY, 5., 2013, Florianópolis, SC. Abstracts... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 7. | | MORAIS, P. B.; CAPDEVILLE, G. de; FARIAS, M. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FALCÃO, R.; LEAO, A. P. Estudo do desenvolvimento meiótico de cromossomos em microsporócitos coletados de inflorencências de Elaeis oleifera subamostra coari. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 118-120| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 8. | | NASCIMENTO, M. S.; SOUZA, R. A. V.; CAMILLO, J.; LEAO, A. P.; LAVIOLA, B. G.; SOUZA JUNIOR, M. T. Enraizamento e aclimatização de plantas de pinhão-manso oriundas da organogenese a partir de discos cotiledonares. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA EM PINHÃO-MANSO, 2., 2011, Brasília, DF. Pinhão-manso: focando em soluções sustentáveis para produção de biocombustíveis: anais. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia: ABPPM, 2011. 1 CD-ROM. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 005). Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 11. | | ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAMILLO. J.; LEAO, A. P.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Revisiting an Unfinished Business: the Genome Content of Elaeis guineensis, E. oleifera and its Inter-specific Hybrid. In: INTERNATIONAL PLANT AND ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego, USA. Anais... Wuerselen: Lemna Tec GmbH, 2012. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 12. | | NASCIMENTO, M. S.; SOUZA, R. A. V.; CAMILLO, J.; LEAO, A. P.; LAVIOLA, B. G.; SOUZA JUNIOR, M. T. Multiplicação de plantas de pinhão manso via organogênese a partir de discos cotiledonares. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA EM PINHÃO-MANSO, 2., 2011, Brasília, DF. Pinhão-manso: focando em soluções sustentáveis para produção de biocombustíveis: anais. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia: ABPPM, 2011. 1 CD-ROM. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 005). Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 14. | | FERREIRA, T. M. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Structural and functional analysis of stress-resonsive genes and their selected promoters from young oil palm (ELAEIS GUINEENSIS) under two abiotic stresses. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal, RN. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 320| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 16. | | SOUZA JUNIOR, M. T.; CAPDEVILLE, G. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMILLO, J.; ALVES, A. A.; LEAO, A. P. Whole Genome Sequencing of the E. oleifera South-American Wild Oil Palm. In: INTERNATIONAL PLANT AND ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego, USA. Anais... Wuerselen: Lemna Tec GmbH, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 17. | | VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FARIAS. P. de F.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Avaliação da fragmentação do DNA genômico de Elaeis guineensis Jacq e Elaeis oleífera (Kunth) Corté por meio de ondas sonoras de alta frequência e autoclavagem. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 18. | | FARIAS, M. P.; VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Determinação de estádios meióticos em elaeis oleifera (kunth) cortés. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FARIAS, M. P.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Estabelecimento de um protocolo eficiente para extração de rna a partir de folhas jovens de elaeis guineensis jacq. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. Estabelecimento de coleção nuclear da Palma de Óleo Americana [Elaeis oleifera (Kunth) Cortés]. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 5., 2018, Fortaleza, Ceará. Resumos ... Brasília, DF: SBRG, 2018. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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