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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
18/12/2018 |
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Data da última atualização: |
24/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ZANELLA, R.; LAGO, L. V.; SILVA, A. N. da; PÉRTILLE, F.; CARVALHO, N. S. de; PANETTO, J. C. do C.; ZANELLA, G. C.; FACIOLI, F. L.; SILVA, M. V. G. B. |
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Afiliação: |
RICARDO ZANELLA, Universidade de Passo Fundo; LUÍSA V. LAGO, Universidade de Passo Fundo; ARTHUR N. DA SILVA, Universidade de Passo Fundo; FÁBIO PÉRTILLE, ESALQ/USP; NATHÃ S. de CARVALHO, UFRGS; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; GIOVANA C. ZANELLA, Universidade de Passo Fundo; FERNANDA L. FACIOLI, Universidade de Passo Fundo; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Genetic characterization of Indubrasil cattle breed population. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Veterinary Sciences, v. 5, n. 4, 2018. |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
10.3390/vetsci5040098 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract The Indubrasil breed was developed in the Brazilian region called Triângulo Mineiro as a result of a cross between zebu cattle. Initially, it was used as a terminal cross and currently it represents approximately 4.45% of all the Brazilian zebu cattle. Studies were conducted to estimate genetic parameters in the Indubrasil using pedigree information, however, until now, no study has been developed using large-scale genomic markers in this breed. Pedigree information are widely used to investigate population parameters; however, they can neglect some estimates when compared to the use of genomic markers. Therefore, the objective of this study was to investigate the population structure and the genetic diversity of Indubrasil cattle using a high-density Single Nucleotide Polymorphism (SNP) panel (Illumina BovineHD BeadChip 700k). Levels of genomic homozygosity were evaluated using three different approaches: Runs of homozygosity (FROH), % of homozygosis (FSNP), and inbreeding coefficient (Fx). Further, Runs of Homozygosity (ROH) segments conserved among the animals were investigated to identify possible regions associated with the breed characteristics. Our results indicate that even the Indubrasil breed having a small effective population size, the levels of homozygosity (FROH = 0.046) are still small. This was possibly caused by the cross conducted among different breeds for its development. It suggests no immediate risks associated with loss of genetic variation. This information might be used in breeding programs, for the breed conservation and for the expansion of the Indubrasil breed. MenosAbstract The Indubrasil breed was developed in the Brazilian region called Triângulo Mineiro as a result of a cross between zebu cattle. Initially, it was used as a terminal cross and currently it represents approximately 4.45% of all the Brazilian zebu cattle. Studies were conducted to estimate genetic parameters in the Indubrasil using pedigree information, however, until now, no study has been developed using large-scale genomic markers in this breed. Pedigree information are widely used to investigate population parameters; however, they can neglect some estimates when compared to the use of genomic markers. Therefore, the objective of this study was to investigate the population structure and the genetic diversity of Indubrasil cattle using a high-density Single Nucleotide Polymorphism (SNP) panel (Illumina BovineHD BeadChip 700k). Levels of genomic homozygosity were evaluated using three different approaches: Runs of homozygosity (FROH), % of homozygosis (FSNP), and inbreeding coefficient (Fx). Further, Runs of Homozygosity (ROH) segments conserved among the animals were investigated to identify possible regions associated with the breed characteristics. Our results indicate that even the Indubrasil breed having a small effective population size, the levels of homozygosity (FROH = 0.046) are still small. This was possibly caused by the cross conducted among different breeds for its development. It suggests no immediate risks associated with loss of genetic variation. T... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genetic diversity; Indubrasil; SNPs. |
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Thesaurus Nal: |
Inbreeding; Pedigree. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188795/1/Artigo-VetSciences-Panetto-Genetic.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 14 | |
| 1. |  | ROSA, T. C. Da; BORTOLINI, F.; LOPES, L. V.; PAGNUSSATT, A. L.; MITTELMANN, A. Avaliação de híbridos experimentais de sorgo silageiro em solos hidromórficos na safra agrícola 2014/2015 In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 6., 2016, Pelotas. Ciência: Empreendedorismo e inovação: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 271-273| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Gado de Leite. |
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| 2. | | LOPES, L. V.; ROSA, T. C. da; SILVEIRA, T. S.; MACHADO, M. A. S.; BORTOLINI, F. Análise descritiva em populações de Vicia angustifolia. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 26.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 19.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 3., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 4. | | BORTOLINI, F.; ROSA, T. C. da; MITTELMANN, A.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Desempenho de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 57.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 40., 2012, Porto Alegre. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2012. p. 34.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | SILVEIRA, T. S.; LOPES, L. V.; ROSA, T. C. da; MAXIMINO, J. V. de O.; BORTOLINI, F. Caracterização morfoagrônomica de duas populações de Macroptilium lathyroides. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 26.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 19.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 3., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | PINHEIRO, E. da C.; MITTELMANN, A.; BORTOLINI, F.; ROSA, T. C. da; BARBOZA, K. dos S.; PIRES, E. da S. Produtividade de forragem de quatro populações de ervilhaca. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 5., 2014, Pelotas. Qual o papel da ciência na agricultura familiar?: anais. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2015. 120 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. | | SANTOS, H. S. dos; HALFEN, A.; ROSA, T. C. da; MITTELMANN, A.; PIRES, E. da S.; BORTOLINI, F. Velocidade de estabelecimento em plantas de trevo-persa. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 15., 2013, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | ROSA, T. C. DA; BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; SILVA, J. L. S. da; PIRES, E. DA S.; PINHEIRO, E. DA C. Avaliação de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos. In: Congresso Internacional do Leite, 11.; Workshop de Políticas Públicas, 11.; Simpósio de Sustentabilidade da Atividade Leiteira, 12., 2012, Goiânia. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | MARCHI, P. M.; CARVALHO, I. R.; PEREIRA, I. dos S.; ROSA, T. C. da; HÖHN, D.; SZARESKI, V. J.; REISSER JUNIOR, C.; ANTUNES, L. E. C. Yield and quality of primocane-fruiting raspberry grown under plastic cover in southern Brazil. Scientia Agricola, v. 76, p. 481-486, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 13. | | CARVALHO, I. R.; SZARESKI, V. J.; SILVA, J. A. G. da; NUNES, A. C. P.; ROSA, T. C. da; BARBOSA, M. H.; MAGANO, D. A.; CONTE, G. G.; CRON, B. O.; SOUZA, V. Q. de. Multivariate best linear unbiased predictor as a tool to improve multi-trait selection in sugarcane. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e00518, 2020. Título em português: Melhor preditor multivariado linear não viesado como ferramenta para a seleção multicaracterísticas em cana-de-açúcar.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 14. | | PELEGRIN, A. J. de; CARVALHO, I. R.; NUNES, A. C. P.; DEMARI, G. H.; SZARESKI, V. J.; BARBOSA, M. H.; ROSA, T. C. da; FERRARI, M.; NARDINO, M.; SANTOS, O. P. dos; RESENDE, M. D. V. de; SOUZA, V. Q. de; OLIVEIRA, A. C. de; MAIA, L. C. da. Adaptability, stability and multivariate selection by mixed models. American Journal of Plant Sciences, v. 8, p. 3324-3337, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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