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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
24/01/2023 |
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Data da última atualização: |
14/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; JOSE, J.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; MUKHERJEE, S.; HUNTEMANN, M.; KYRPIDES, N. C.; CARAZZOLLE, M. F.; ARRUDA, P. |
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Afiliação: |
ANTONIO P. CAMARGO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; RAFAEL S. C. DE SOUZA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS, SYMBIOMICS MICROBIOME SOLUTIONS; JULIANA JOSE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; ISABEL RODRIGUES GERHARDT, CNPTIA; RICARDO AUGUSTO DANTE, CNPTIA; SUPRATIM MUKHERJEE, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; MARCEL HUNTEMANN, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; NIKOS C. KYRPIDES, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; MARCELO F. CARAZZOLLE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; PAULO ARRUDA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS. |
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Título: |
Plant microbiomes harbor potential to promote nutrient turnover in impoverished substrates of a Brazilian biodiversity hotspot. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
The ISME Journal, v. 17, n. 3, p. 354-370, Mar. 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41396-022-01345-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The substrates of the Brazilian campos rupestres, a grassland ecosystem, have extremely low concentrations of phosphorus and nitrogen, imposing restrictions to plant growth. Despite that, this ecosystem harbors almost 15% of the Brazilian plant diversity, raising the question of how plants acquire nutrients in such a harsh environment. Here, we set out to uncover the taxonomic profile, the compositional and functional differences and similarities, and the nutrient turnover potential of microbial communities associated with two plant species of the campos rupestres-dominant family Velloziaceae that grow over distinct substrates (soil and rock). Using amplicon sequencing data, we show that, despite the pronounced composition differentiation, the plant-associated soil and rock communities share a core of highly efficient colonizers that tend to be highly abundant and is enriched in 21 bacterial families. Functional investigation of metagenomes and 522 metagenome-assembled genomes revealed that the microorganisms found associated to plant roots are enriched in genes involved in organic compound intake, and phosphorus and nitrogen turnover. We show that potential for phosphorus transport, mineralization, and solubilization are mostly found within bacterial families of the shared microbiome, such as Xanthobacteraceae and Bryobacteraceae. We also detected the full repertoire of nitrogen cycle-related genes and discovered a lineage of Isosphaeraceae that acquired nitrogen-fixing potential via horizontal gene transfer and might be also involved in nitrification via a metabolic handoff association with Binataceae. We highlight that plant-associated microbial populations in the campos rupestres harbor a genetic repertoire with potential to increase nutrient availability and that the microbiomes of biodiversity hotspots can reveal novel mechanisms of nutrient turnover. MenosThe substrates of the Brazilian campos rupestres, a grassland ecosystem, have extremely low concentrations of phosphorus and nitrogen, imposing restrictions to plant growth. Despite that, this ecosystem harbors almost 15% of the Brazilian plant diversity, raising the question of how plants acquire nutrients in such a harsh environment. Here, we set out to uncover the taxonomic profile, the compositional and functional differences and similarities, and the nutrient turnover potential of microbial communities associated with two plant species of the campos rupestres-dominant family Velloziaceae that grow over distinct substrates (soil and rock). Using amplicon sequencing data, we show that, despite the pronounced composition differentiation, the plant-associated soil and rock communities share a core of highly efficient colonizers that tend to be highly abundant and is enriched in 21 bacterial families. Functional investigation of metagenomes and 522 metagenome-assembled genomes revealed that the microorganisms found associated to plant roots are enriched in genes involved in organic compound intake, and phosphorus and nitrogen turnover. We show that potential for phosphorus transport, mineralization, and solubilization are mostly found within bacterial families of the shared microbiome, such as Xanthobacteraceae and Bryobacteraceae. We also detected the full repertoire of nitrogen cycle-related genes and discovered a lineage of Isosphaeraceae that acquired nitrogen-fixing pot... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Campos rupestres; Data sequencing; Ecossistema de pastagens; Microbioma vegetal; Plant microbiomes; Sequenciamento de dados; Soil microbes. |
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Thesagro: |
Bactéria; Genoma; Nitrogênio. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Nitrogen; Velloziaceae. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151181/1/AP-Plant-microbiomes-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 338 | |
| 61. |  | PRIMAVESI, O. M. A. S. P. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; NOVAES, N. J. Espécies vegetais para produção de cobertura morta de solo, em plantio no outono, sem irrigação, na região de São Carlos, SP. II. Período 1994. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 25., 1995, Viçosa. Resumos... Viçosa: UFV-DS, 1995. p.2002-2004.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 62. | | PRIMAVESI, O. M. A. S. P. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; NOVAES, N. J. Espécies vegetais para produção de cobertura morta de solo, em plantio no outono, sem irrigação, na região de São Carlos, SP. São Carlos, SP: EMBRAPA-CPPSE, 1996. 11 p. (Embrapa-CPPSE. Comunicado técnico, 16).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 63. | | PRIMAVESI, O. M. A. S. P. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A. Espécies vegetais para produção outonal de cobertura morta de solo, sem irrigação, na região tropical de São Carlos, SP, Brasil. Revista de Agricultura, v.76, n.2, p.227-244, 2001.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 65. | | GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C.; SOUZA, F. H. D. de; BATISTA, L. A. R. Ensaio brasileiro de cultivares recomendadas de aveia - São Carlos, 2002. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 23., 2003, Gramado, RS. Anais... Gramado: UFRGS, 2003. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 68. | | GODOY, R.; BATISTA, L. A. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A. Ensaio brasileiro de cultivares recomendadas de aveia. São Carlos, SP, 1999. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 20., 2000, Pelotas, RS: Anais... Pelotas: EMBRAPA/UFPEL, 2000. p.397-400.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 69. | | GODOY, R.; BATISTA, L. A. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A. Ensaio brasileiro de cultivares recomendadas de aveia, São Carlos, SP, 2000. In: REUNIAO DA COMISSAO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 21., 2001, Lages, SC. Resultados experimentais... Lages: UDESC, 2001. p. 345-346.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 70. | | GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C.; SOUZA, F. H. D. de; BATISTA, L. A. R. Ensaio brasileiro de linhagens de aveia - São Carlos, 2002. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 23., 2003, Gramado, RS. Anais... Gramado: UFRGS, 2003. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 73. | | GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; BATISTA, L. A. R. Ensaio brasileiro de linhagens de aveia. São Carlos, SP, 1998. In: REUNIAO DA COMISSAO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 19., 1999, Porto Alegre, RS. Anais... Porto Alegre: UFRGS, 1999. p.272-273.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 74. | | GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; BATISTA, L. A. R. Ensaio brasileiro de linhagens de aveia. São Carlos, SP, 1999. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 20., 2000, Pelotas, RS. Anais... Pelotas: EMBRAPA/UFPEL, 2000. p.343-345.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 75. | | GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; BATISTA, L. A. R. Ensaio brasileiro de linhagens de aveia. São Carlos, SP, 2000. In: REUNIAO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 21., 2001, Lages, SC. Resultados experimentais... Lages: UDESC, 2001. p.304-305.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 77. | | NOVAES, N. J.; GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; NEGREIROS, G. de F. Ensaio multilocacional de Centrosema spp, em São Carlos, SP-Brasil. In: REUNION INTERNACIONAL DE EVALUACION DE PASTOS TROPICALES (RIEPT), REUNION SABANAS, 1., 1992. Cali. Anais... Cali: CIAT, 1992. p.385-394. (Documentos de Trabajo, 117)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 78. | | PRIMAVESI, A. C.; GODOY, R.; PRIMAVESI, O.; SOUZA, F. H. D. de. Ensaio nacional de aveia forrageiras para cobertura de solos. São Carlos, SP, 2005. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 26., 2006, Guarapuava, PR. Resultados experimentais... Guarapuava: Fundação Agrária de Pesquisa Agropecuária, 2006. p. 119.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 79. | | PRIMAVESI, A. C.; GODOY, R.; PRIMAVESI, O.; SOUZA, F. H. D. de. Ensaio nacional de aveia forrageiras. São Carlos, SP, 2005. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 26., 2006, Guarapuava, PR. Resultados experimentais... Guarapuava: Fundação Agrária de Pesquisa Agropecuária, 2006. p. 146-148.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 80. | | PRIMAVESI, A. C. P. de A.; GODOY, R.; PRIMAVESI, O. M. A. S. P. R. Ensaio nacional de aveias forrageiras para cobertura de solos. São Carlos, SP, 1999. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 20., 2000, Pelotas, RS: Anais... Pelotas: EMBRAPA; UFPEL, 2000. p. 237-238.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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