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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
01/11/2012 |
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Data da última atualização: |
26/05/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CUNHA, I. S.; BARRETO, C. C.; COSTA, O. Y. A.; BOMFIM, M. A. D.; CASTRO, A. P. de; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. |
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Afiliação: |
ISABEL de SOUZA da CUNHA, Universidade Católica de Brasília (UCB) - Brasília, DF.; CRISTINE CHAVES BARRETO, UCB - Brasília, DF.; OHANA Y. A. COSTA, UCB - Brasília, DF.; MARCO AURELIO DELMONDES BOMFIM, CNPC; Alinne Pereira de Castro, University of Brasilia (UNB) - Brasilia, DF.; Ricardo Henrique Kruger, UNB - Brasília, DF.; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE. |
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Título: |
Bacteria and Archaea community structure in the rumen microbiome of goats (Capra hircus) from the semiarid region of Brazil. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Anaerobe, London, v. 17, n. 3, p. 118-124, Jul. 2011. |
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DOI: |
doi:10.1016/j.anaerobe.2011.04.018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Most studies present in the literature about the rumen microbiome have focused on cattle and sheep. This is the first report of the characterization of the bacterial and archaeal communities present in the liquid and solid-associated fractions of the rumen from free ranging Moxotó breed goats using 16S rRNA gene libraries. PCR was used to amplify the 16S rRNA gene with bacterial and archaeal universal primers and sequences from each library constructed were obtained. Sequences of Bacteria from the phyla Bacteroidetes and Firmicutes were predominant. The overall dominant classes in the rumen were Clostridia and Bacteroidia, which are known to play a role in plant fiber degradation in other ruminants. Unclassified Bacteria accounted for 4.7% of the liquid fraction sequences and 16.4% of the solid fraction sequences. From the archaeal libraries only sequences from the phylum Euryarcheota were identified and were assigned to the class Methanobacteria of the genera Methanobrevibacter and Methanosphaera. A group of Archaea not previously known to be associated with the rumen was identified: uncultured methanogens belonging to the ?uncultured marine bacteria? groups II and III. The local water contained high salt concentrations and this may explain the presence of these groups in the Moxotó goat rumen. |
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Palavras-Chave: |
16S rRNA gene; Brasil; Diversidade genética; DNA sequence; Gene ribossomal 16S; Genetic diversity as resource; Northeastern; Raça Moxotó; Rumen microbiome. |
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Thesagro: |
Bactéria; Caatinga; Caprino; Rúmen. |
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Thesaurus Nal: |
Archaea; biodiversity; Brazil; Goats; Rumen bacteria; sequence analysis. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02552naa a2200433 a 4500
001 1938714
005 2015-05-26
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $adoi:10.1016/j.anaerobe.2011.04.018$2DOI
100 1 $aCUNHA, I. S.
245 $aBacteria and Archaea community structure in the rumen microbiome of goats (Capra hircus) from the semiarid region of Brazil.$h[electronic resource]
260 $c2011
520 $aAbstract: Most studies present in the literature about the rumen microbiome have focused on cattle and sheep. This is the first report of the characterization of the bacterial and archaeal communities present in the liquid and solid-associated fractions of the rumen from free ranging Moxotó breed goats using 16S rRNA gene libraries. PCR was used to amplify the 16S rRNA gene with bacterial and archaeal universal primers and sequences from each library constructed were obtained. Sequences of Bacteria from the phyla Bacteroidetes and Firmicutes were predominant. The overall dominant classes in the rumen were Clostridia and Bacteroidia, which are known to play a role in plant fiber degradation in other ruminants. Unclassified Bacteria accounted for 4.7% of the liquid fraction sequences and 16.4% of the solid fraction sequences. From the archaeal libraries only sequences from the phylum Euryarcheota were identified and were assigned to the class Methanobacteria of the genera Methanobrevibacter and Methanosphaera. A group of Archaea not previously known to be associated with the rumen was identified: uncultured methanogens belonging to the ?uncultured marine bacteria? groups II and III. The local water contained high salt concentrations and this may explain the presence of these groups in the Moxotó goat rumen.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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| 21. |  | DOMENECH, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B. J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 22.; CONGRESSO BOLIVIANO DE MICROBIOLOGIA, 4., 2014, Cartagena. Memórias: Clínica- Bioanálisis - Industrial - Ambiental. Cartagena: Universidad de Antioquia; Associação Colombiana de Microbiologia, 2014. p. 87. Publicado em: Hechos Microbiológicos, v. 5. n. 2, suplemento 2, p. 62, noviembre, 2014. p. 87. ALAM 2014; CCM 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 22. | | GARCIA, M. B.; MENDES, I. V.; SANTANA, R. H.; KRUGER, R. H.; GLADDEN, J.; QUIRINO, B. F. Diversidade microbiana e degradação de lignina em cultura enriquecida. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 42.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 24. | | CORREIA, V. A. B.; ALMEIDA, A. S. S. A.; LEMOS, T.; QUIRINO, B. F.; KRÜGER, R. H.; NORONHA, E. F. Seleção e caracterização molecular de uma lipase a partir do metagenoma de solo do Cerrado. In: WORKSHOP EM CIÊNCIAS GENÔMICAS E BIOTECNOLOGIA, 1., 2009, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: [UCB], 2009. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 25. | | CORREIA, V. A. B.; ALMEIDA, A. S. S. A.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E. F. Screening and molecular characterization of a lipase metagenome soil-derived. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR – SBBq, 39.; LATIN AMERICAN SYMPOSIUM ON THE MOLECULAR MECHANISMS OF SKELETAL MINERALIZATION, 1., 2010, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... São Paulo: SBBq, 2010. Não paginado. Disponível em: < http://www.sbbq.org.br/2010/cdrom/busca.htm?query=quirino%2C+b.+f. >. Acesso em: 16 ago. 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 27. | | GOMES, P. H. M.; CUNHA, I. S.; SILVA, R. B.; CAMPOS, P. F.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Otimização de bioensaios e obtenção de controles para identificação de enzimas úteis para a indústrias sucro-alcooleira. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 567.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 28. | | CÂNDIDO, E. S.; PEREIRA, J. L.; QUEZADO-DUVAL, A. M.; NORONHA, E. F.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Xanthomonas gardneri exoenzymatic activity towards plant tissue. World Journal of Microbiology & Technology, Oxford, v. 24, p. 163-170, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 29. | | SANTOS, D. F. K. dos; CASTRO, A. P. de; CARVALHO, L. S.; ARAÚJO JÚNIOR, S. D.; PALUAN, S. de F.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Antibiotic resistance elements isolated from metagenomic libraries constructed with Cerrado soil samples. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu, PR. Anais... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 30. | | CÂNDIDO, E. S.; SILVA, R. B.; AQUINO, E. N.; NORONHA, E. F.; FRANCO, O. L.; KRÜGER, R. H.; FONTES, W.; QUIRINO, B. F. Analysis of the Arabidopsis thaliana - Xanthomonas campestris pv. campestris pathosystem using proteomics tools. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., 2008; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR: UEL, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 31. | | TUPINAMBÁ, D. D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y. A.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Archaeal community changes associated with cultivation of amazon forest soil with oil palm. Archaea, Cairo, v. 2016, article ID 3762159, 14 p., 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 32. | | CUNHA, I. S.; BARRETO, C. C.; COSTA, O. Y. A.; BOMFIM, M. A. D.; CASTRO, A. P. de; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Bacteria and Archaea community structure in the rumen microbiome of goats (Capra hircus) from the semiarid region of Brazil. Anaerobe, London, v. 17, n. 3, p. 118-124, Jul. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 33. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBA, D. D.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Avaliação da diversidade microbiana do processo de produção de etanol de cana-de-açúcar por meio de abordagem independente de cultivo. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. 111 - 112| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 34. | | CUNHA, I. S.; MÁXIMO, R. M.; CAMPOS, P. F.; NORONHA, E. F.; BOMFIM, M. A. D.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construção e screening de uma biblioteca metagenômica de rúmen de caprinos. In: WORKSHOP EM CIÊNCIAS GENÔMICAS E BIOTECNOLOGIA, 1., 2009, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: [UCB], 2009. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 35. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; RAMOS, N. S. P. L.; FURTADO, R. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construction of metagenomic libraries with large inserts of DNA from the Amazonian soil microbiota and screening for enzymes with biotechnological potential. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programas e resumos... [Brasília, DF]: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 64-65.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 36. | | CÃNDIDO, E. S.; CAMPOS, P. F.; PEREIRA, J. L.; SANTANA, B. G.; SILVA, R. B.; QUEZADO-DURVAL, A. M.; NORONHA, E. F.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Caracterização e análise da atividade exoenzimática de Xanthomonas gardneri na presença de tecido vegetal. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 32, ago. 2007. s 263. Suplemento. Trabalho apresentado no 49. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2007, Maringá, PR. Resumo n. 769.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 37. | | QUIRINO, B. F.; BERGMANN, J. C.; RAMOS, N. S. P. L.; PALUAN, S. de F.; SOUTO, B. de M.; RODRIGUES, L. P.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H. Colocando a biodiversidade microbiana brasileira a serviço da indústria de biocombustíveis. In: SIMPÓSIO MICRORGANISMOS EM AGROENERGIAS, 2012, Brasília, DF. Da prospecção aos bioprocessos: anais. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2013. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 15). p. 23-30.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 38. | | ASSIS, O. Y. de; SOUTO, B. de M.; DOMENECH, D.; CARVALHO B. J.; KRUGER, R. H.; KYAM, C. M.; CHAVES B. C.; QUIRINO, B. F. Culture-independent assessment of the microbial diversity in the sugarcane-ethanol production process. Hechos Microbiológicos, v. 5, n. 2, suplemento 2, p. 87, 2014. p. 134. Trabalho apresentado no XXII Congresso Latinoamericano de Microbiología - ALAM 2014 e 4 Congresso Colombiano de Microbiología - 4 CCM 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 39. | | SILVA, M. R. S. S. da; BRESOLIN, J. D.; KRUGER, R. H.; BUSTAMANTE, M. M. da C.; REIS JÚNIOR, F. B. dos. Efeito do fogo sobre a comunidade bacteriana de solos de Cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 23., 2005, Santos, SP. Resumos. Santos: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2005. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 40. | | PALUAN, S. F.; SILVA, R. B.; BITENCOURT, A. C. A.; SANTOS, D. F. K.; SOUTO, B. de M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Characterization of hydrolytic enzymes isolated from an Amazon soil environmental DNA library. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programas e resumos... [Brasília, DF]: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 68.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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