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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
05/11/2020 |
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Data da última atualização: |
06/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LIMA, R. A. T.; OLIVEIRA, G. d.; SOUZA, A. A.; LOPES, F. A. C.; SANTANA, R. H.; ISTVAN, P.; QUIRINO, B. F.; BARBOSA, J.; FREITAS, S. d.; GARAY, A. V.; KRUGER, R. H. |
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Afiliação: |
Raul Alcântara Teixeira Lima, Universidade de Brasília; Gideane de Oliveira, Universidade de Brasília; Amanda Araújo Souza, Universidade de Brasília; Fabyano Alvares Cardoso Lopes, Universidade Federal do Tocantins; Renata Henrique Santana, Instituto Federal de Brasília; Paula Istvan, Universidade de Brasília; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; João Barbosa, Universidade de Brasília; Sônia de Freitas, Universidade de Brasília; Aisel Valle Garay, Universidade de Brasília; Ricardo Henrique Kruger, Universidade de Brasília. |
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Título: |
Functional and structural characterization of a novel GH3 Beta-glucosidase from the gut metagenome of the Brazilian Cerrado termite Syntermes wheeleri. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
International Journal of Biological Macromolecules, v. 165, Part A, p. 822-834, Dec. 2020. |
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Volume: |
165 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.09.236 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In this study, a GH3 family Beta-glucosidase (Bgl7226) from metagenomic sequences of the Syntermes wheeleri gut, a Brazilian Cerrado termite, was expressed, purified and characterized. The enzyme showed two optimum pHs (pH 7 and pH 10), and a maximum optimum temperature of about 40 °C using 4-Nitrophenyl ?-D-glucopyranoside (pNPG) as substrate. Bgl7226 showed higher enzymatic activity at basic pH, but higher affinity (Km) at neutral pH. However, at neutral pH the Bgl7226 enzyme showed higher catalytic efficiency (kcat/Km) for pNPG substrate. Predictive analysis about the enzyme structure-function relationship by sequence alignment suggested the presence of multi-domains and conserved catalytic sites. Circular dichroism results showed that the secondary structure composition of the enzyme is pH-dependent. Small conformational changes occurred close to the optimum temperature of 40 o C, and seem important for the highest activity of Bgl7226 observed at pH 7 and 10. In addition, the small transition in the unfolding curves close to 40 o C is typical of intermediates associated with proteins structured in several domains. Bgl7226 has significant Beta-glucosidase activity which could be attractive for biotechnological applications, such as plant roots detoxification; specifically, our group is interested in cassava roots (Manihot esculenta) detoxification. |
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Palavras-Chave: |
Genômica ambiental. |
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Thesagro: |
Cerrado; Enzima; RNA. |
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Thesaurus Nal: |
Beta-glucosidase; Metagenomics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 64 | |
| 41. |  | SILVA, M. R. S. S. da; BRESOLIN, J. D.; KRUGER, R. H.; BUSTAMANTE, M. M. C.; REIS JUNIOR, F. B. dos. Effects of land use changes on soil microbial communities in the Cerrado region. In: CONFERÊNCIA CIENTÍFICA DO LBA, 3., 2004, Brasília, DF. Anais de trabalhos completos. Brasília, DF: LBA, 2004. 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 42. | | ASSIS, O. Y. de; SOUTO, B. de M.; DOMENECH, D.; CARVALHO B. J.; KRUGER, R. H.; KYAM, C. M.; CHAVES B. C.; QUIRINO, B. F. Culture-independent assessment of the microbial diversity in the sugarcane-ethanol production process. Hechos Microbiológicos, v. 5, n. 2, suplemento 2, p. 87, 2014. p. 134. Trabalho apresentado no XXII Congresso Latinoamericano de Microbiología - ALAM 2014 e 4 Congresso Colombiano de Microbiología - 4 CCM 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 43. | | SILVA, M. R. S. S. da; BRESOLIN, J. D.; KRUGER, R. H.; BUSTAMANTE, M. M. da C.; REIS JÚNIOR, F. B. dos. Efeito do fogo sobre a comunidade bacteriana de solos de Cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 23., 2005, Santos, SP. Resumos. Santos: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2005. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 44. | | GUIMARÃES, H. I. P.; SANTANA, R. H.; SILVEIRA, R.; PINTO, O. H. B.; QUIRINO, B. F.; BARRETO, C. C.; BUSTAMANTE, M. M. da C.; KRÜGER, R. H. Seasonal Variations in Soil Microbiota Profile of Termite (Syntermes wheeleri) Mounds in the Brazilian Tropical Savanna. Microorganisms, v. 8, 1482, 2020. 8 Special Issue: Soil Microbiome: Biotic and Abiotic Interactions.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 45. | | CATÃO, E.; LOPES, F. A. C.; ARAÚJO, J. F.; CASTRO, A. C. de; BARRETO, C. C.; BUSTAMANTE, M.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Soil Acidobacterial 16S rRNA Gene Sequences Reveal Subgroup Level Differences between Savanna-Like Cerrado and Atlantic Forest Brazilian Biomes. International Journal of Microbiology, article 156341, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 46. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, M. M. do C.; JUNIOR, P. G. J.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Soil bacterial community structure associated with oil palm (Elaeis guineensis) fatal yellowing disease. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 36., 2014, Flórida. Abstracts... Fairfax: Society for Industrial Microbiology and Biotechnology, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 47. | | SOUTO, B. de M.; CARVALHO, L. S.; LOPIES, N. S. P. R.; CUNHA, I. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Identification of clones with Beta-Glucosidase and cellobiohydrolase activities from a goat rumen metagenomic library. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 48. | | QUIRINO, B. F.; BERGMAN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; PALUAN, S. G.; RAMOS, N. S. P. L.; SOUTO, B. de M.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H. Identification of glycosyl hydrolases in the microbial biodiversity of Brazil using a metagenomic approach. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 34., 2012, New Orleans. [Anais...]. Fairfax, VA: Society for Industrial Microbiology & Biotechnology, 2012. Não paginado. Poster Session 1: 7-44.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 49. | | ARAUJO, A. C. B.; CARVALHO, L. S.; TUPINAMBA, D. D.; ALMEIDA, J. M.; FAVARO, L. C. de L.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Isolamento e Caracterização de Microrganismos Isolados a Partir de Solo de Cerrado para a Produção de Etanol de Segunda Geração. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2012, Santos, SP. [Anais...]. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia: Asociación Latinoamericana de Microbiologia, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 50. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 51. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES, P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 53. | | QUIRINO, B. F.; BARRETO, C.; COSTA, O. Y.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBA, D.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. Microbial diversity in different stages of the ethanol production process using culture-independent techniques. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 37., 2015, San Diego, California. [Resumos ...] Fairfax: Society for Industrial Microbiology and Biotechnology, 2015. Resumo T45| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 54. | | GOMES, P. H. M.; CÂNDIDO, E. S.; AQUINO, E. N.; NORONHA, E. F.; FRANCO, O. L.; FONTES, W.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Xanthomonas campestris pv. campestris secretome toward susceptible and resistant Arabidopsis thaliana ecotypes. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., 2008; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR: UEL, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 55. | | CASTRO, A. P. de; ARAÚJO JÚNIOR, S. D.; REIS, A. M. M.; MOURA, R. L.; FRANCINI FILHO, R. B.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RODRIGUES, T. B.; THOMPSON, F. L.; KRÜGER, R. H. Bacterial community associated with healthy and diseased reef coral Mussismilia hispida from Eastern Brazil. Microbial Ecology, v. 59, p. 658-667, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 57. | | ARAÚJO, J. F.; CASTRO, A. R. de; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F.; BUSTAMANTE, M. M. C.; WILLIAMSON, L.; HANDELSMAN, J.; KRUGER, R. H. Characterization of soil bacterial assemblies in Brazilian Savanna-Like vegetation reveals acidobacteria dominance. Microbial Ecology, v. 64, p. 760-770, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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| 58. | | PALUAN, S. P.; SILVA, R. B.; CARVALHO, L. S.; SANTOS, D. F. K.; RAMOS, N. S. P. L.; BERGMAN, J. C.; NORONHA, E. F.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Enzymes of biotechnological interest prospected from a small insert metagenomic library constructed with Amazon soil microbial DNA. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR – SBBq, 39.; LATIN AMERICAN SYMPOSIUM ON THE MOLECULAR MECHANISMS OF SKELETAL MINERALIZATION, 1., 2010, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... São Paulo: SBBq, 2010. Não paginado. Disponível em: < http://www.sbbq.org.br/2010/cdrom/busca.htm?query=quirino%2C+b.+f. >. Acesso em: 16 ago. 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 59. | | SOUTO, B. de M.; ARAÚJO, A. C. B. de; HAMANN, P. R. V.; BASTOS, A. de R.; CUNHA, I. de S.; PEIXOTO, J.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F. Functional screening of a Caatinga goat (Capra hircus) rumen metagenomic library reveals a novel GH3 beta-xylosidase. PLoS ONE, v. 16, n. 1, e024511, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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