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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
19/06/2012 |
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Data da última atualização: |
19/08/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOARES-CAVALCANTI, N. N.; BELARMINO, L. C.; KIDO, E. A.; WANDERLEY-NOGUEIRA, A. C.; BEZERRA-NETO, J. P.; CAVALCANTI-LIRA, R.; PANDOLFI, V.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; BENKO-ISEPPON, A. M. |
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Afiliação: |
NINA M. SOARES CAVALCANTI, UFPE; LUIS C. BELARMINO, UFPE; EDERSON A. KIDO, UFPE; ANA C. WANDERLEY NOGUEIRA, UFPE; JOÃO P. BEZERRA NETO, UFPE; RAFAELA CAVALCANTI LIRA, UFPE; VALESCA PANDOLFI, UFPE; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; LEANDRO C. NASCIMENTO, UNICAMP; ANA M. BENKO-ISEPPON, UFPE. |
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Título: |
In silico identification of known osmotic stress responsive genes from Arabidopsis in soybean and Medicago. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 315-321, May 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Plants experience various environmental stresses, but tolerance to these adverse conditions is a very complex phenomenon. The present research aimed to evaluate a set of genes involved in osmotic response, comparing soybean and medicago with the well-described Arabidopsis thaliana model plant. Based on 103 Arabidopsis proteins from 27 categories of osmotic stress response, comparative analyses against Genosoja and Medicago truncatula databases allowed the identification of 1,088 soybean and 1,210 Medicago sequences. The analysis showed a high number of sequences and high diversity, comprising genes from all categories in both organisms. Genes with unknown function were among the most representative, followed by transcription factors, ion transport proteins, water channel, plant defense, protein degradation, cellular structure, organization & biogenesis and senescence. An analysis of sequences with unknown function allowed the annotation of 174 soybean and 217 Medicago sequences, most of them concerning transcription factors. However, for about 30% of the sequences no function could be attributed using in silico procedures. The establishment of a gene set involved in osmotic stress responses in soybean and barrel medic will help to better understand the survival mechanisms for this type of stress condition in legumes. |
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Palavras-Chave: |
Stress-responsive genes. |
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Thesagro: |
Gene; Genoma; Soja; Stress. |
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Thesaurus Nal: |
Genes; osmotic stress; Plant stress; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61132/1/gmb.silico.v35n1s.315-321.2012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 51 | |
| 1. |  | MEDEIROS, C. D.; OLIVEIRA, M. T.; RIVAS, R.; BALDANI, J. I.; KIDO, E. A.; SANTOS, M. G. Gas exchange, growth, and antioxidant activity in sugarcane under biological nitrogen fixation. Photosynthetica online, 14 september, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 2. | | SILVA, K. J. D. e; CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; ROCHA, M. de M.; KIDO, E. A. Seleção de genitores e diversidade genética entre linhagens de feijão-caupi de porte ereto e prostrado via marcadores moleculares EST-SSR. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 187. Na publicação: KAESEL JACKSON DAMASCENO-SILVA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 3. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Bulked segregant analysis for identification of DAF markers linked to resistance to CPSMV in cowpea. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S162, ago. 2009. Suplemento. Ref. 562. Edição dos Resumos do 42° Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 4. | | KIDO, E. A.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; BINNECK, E.; SILVA, M. da; SILVA JUNIOR, W. da; BENKO-ISEPPON, A. M. Explore the RNA-sequencing and the next-generation sequencing in crops responding to abiotic stress. In: SHARMA, P.; YADAV, D.; GAUR, R. K. (ed.). Bioinformatics in Agriculture: Next Generation Sequencing Era. [S. l.]: Elsevier Academic Press, c2022. CHAP. 10, p. 161-175.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 5. | | FERREIRA-NETO, J. R. C.; SILVA, M. D. da; BENKO-ISEPPON, A. M.; PANDOLFI, V.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; KIDO, E. A. Inositol phosphates and Raffinose family oligosaccharides pathways: Structural genomics and transcriptomics in soybean under root dehydration Plant Gene, v. 20, 100202, 2019. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; OLIVEIRA, I. C. de; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; KIDO, E. A. Diversidade genética em feijão-caupi de porte ereto e prostrado para seleção de genitores via marcadores moleculares EST-SSR. In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 62., 2010, Natal. Ciências do mar: herança para o futuro: anais/resumos. [s.l.]: SBPC, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 7. | | KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; HOULLOU-KIDO, L. M.; ANDRADE, F. C.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BURNQUIST, W. L.; BENKO-ISEPPON, A. M. Plant antimicrobial peptides: an overview of superSAGE transcriptional profile and a functional review. Current Protein & Peptide Science, v. 11, n. 3, p. 220-230, May 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 8. | | SOARES-CAVALCANTI, N. M.; BELARMINO, L. C.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; RODRIGUES, F. A.; PEREIRA, G. A. G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Overall picture of expressed Heat Shock Factors in Glycine max, Lotus japonicus and Medicago truncatula. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 247-259, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 9. | | MEDEIROS, C. D.; FERREIRA NETO, M. J.; OLIVEIRA, M. T.; RIVAS, R.; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; BALDANI, J. I.; SANTOS, M. G. Photosynthesis, antioxidant activities and trasncriptional responses in two sugarcane (Saccharum officinarum L.) cultivars under salts stress. Acta Physiologiae Plantarum Online, octubre, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 10. | | LIMA, A. T. B.; DAMASCENO-SILVA, K. J.; ROCHA, M. M.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A.; AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C. Seleção de primers visando identificação de marcas DAF associados a QTL'S em feijão-caupi. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 2., 2009, Belém, PA. Da agricultura de subsistência ao agronegócio: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. p. 831-835. 1 CD-ROM. Autoria: DAMASCENO-SILVA, K. J. [i.e. SILVA, K. J. D. e]| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 11. | | SOUZA, M. C. P. de; SILVA, M. D. da; BINNECK, E.; CABRAL, G. A. de L.; ISEPPON, A. M. B.; POMPELLI, M. F.; ENDRES, L.; KIDO, E. A. RNA-Seq transcriptome analysis of Jatropha curcas L. accessions after salt stimulus and unigene-derived microsatellite mining. Industrial Crops & Products, v. 147, 112168, 2020. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | NASCIMENTO, A. T. B. do; SILVA, C. B.; COSTA, M. M. R.; FERREIRA NETO, J. R. C.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; KIDO, E. A. Análise de diversidade em genótipos de feijão-caupi do programa de melhoramento da Embrapa Meio-Norte. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/248a.pdf. Acesso em: 08 ago. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 14. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. M.; FREIRE FILHO, F. R.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; ISEPPON, A. M. B. Análise de segregantes na identificação de marcadores ligados a genes de resistência a virose em feijão-caupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para a produção de alimentos e bioenergia: livro de resumos. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. p. 27-28. Resumo 69.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | BARBOSA, P. K. A; CALSA JUNIOR, T; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; ROCHA, M. de M.; SITTOLIN, I. M; ANDRADE, G. P; PIO-RIBEIRO, G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Análise transcricional de Vigna unguiculata infectada por potyvírus (CABMV) através de LongSAGE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 246| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A brazilian soybean database. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts book... Ouro Preto: AB3C, 2010. p. 120. X-Meeting 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 17. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; VIDAL, R. O.; MEYER, L.; BINNECK, E.; KIDO, E. A.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. Bioinformatics analysis applied to genosoja project. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book ... Rio de Janeiro: AB3C, 2009. p. 22. X-Meeting 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Fenotipagem e seleção de marcadores em população de mapeamento de feijão-caupi segregante para resistência ao vírus do mosaico severo do caupi (CPSMV). In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 222| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, É. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Identificação de marcas moleculares associadas à resistência ao vírus do mosaido severo do feijão-caupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 4 p. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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