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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
07/11/2022 |
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Data da última atualização: |
07/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MATOS, M. K. da S.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BEZERRA-NETO, J. P.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; WANG, Y.; LIU, H.; PANDOLFI, V.; AMORIM, L. L. B.; WILLADINO, L.; AMORIM, T. C. do V.; KIDO, E. A.; VIANELLO, R. P.; TIMKO, M. P.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. |
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Afiliação: |
MITALLE KAREN DA SILVA MATOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ANA MARIA BENKO-ISEPPON, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOAO PACIFICO BEZERRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOSE RIBAMAR COSTA FERREIRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; YU WANG, UNIVERSITY OF VIRGINA; HAI LIU, UNIVERSITY OF VIRGINIA; VALESCA PANDOLFI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LIDIANE LINDINALVA BARBOSA AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LILIA WILLADINO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; THIALISSON CAACI DO VALE AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; EDERSON AKIO KIDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; MICHAEL P. TIMKO, UNIVERSITY OF VIRGINIA; ANA CHRISTINA BRASILEIRO-VIDAL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO. |
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Título: |
The WRKY transcription factor family in cowpea: Genomic characterization and transcriptomic profiling under root dehydration. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Gene, v. 823, 146377, May 2022. |
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ISSN: |
0378-1119 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146377 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress response, the data provide a foundation for the targeted modification of specific VuWRKY family members to improve drought tolerance in this important climate-resilient legume in the developing world and beyond. MenosCowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
QPCR; RNA-Seq. |
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Thesagro: |
Seca; Vigna Unguiculata. |
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Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Cowpeas; Drought tolerance; Gene expression. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02849naa a2200397 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 51 | |
| 1. |  | MEDEIROS, C. D.; OLIVEIRA, M. T.; RIVAS, R.; BALDANI, J. I.; KIDO, E. A.; SANTOS, M. G. Gas exchange, growth, and antioxidant activity in sugarcane under biological nitrogen fixation. Photosynthetica online, 14 september, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 2. | | SILVA, K. J. D. e; CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; ROCHA, M. de M.; KIDO, E. A. Seleção de genitores e diversidade genética entre linhagens de feijão-caupi de porte ereto e prostrado via marcadores moleculares EST-SSR. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 187. Na publicação: KAESEL JACKSON DAMASCENO-SILVA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 3. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Bulked segregant analysis for identification of DAF markers linked to resistance to CPSMV in cowpea. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S162, ago. 2009. Suplemento. Ref. 562. Edição dos Resumos do 42° Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 4. | | KIDO, E. A.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; BINNECK, E.; SILVA, M. da; SILVA JUNIOR, W. da; BENKO-ISEPPON, A. M. Explore the RNA-sequencing and the next-generation sequencing in crops responding to abiotic stress. In: SHARMA, P.; YADAV, D.; GAUR, R. K. (ed.). Bioinformatics in Agriculture: Next Generation Sequencing Era. [S. l.]: Elsevier Academic Press, c2022. CHAP. 10, p. 161-175.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 5. | | FERREIRA-NETO, J. R. C.; SILVA, M. D. da; BENKO-ISEPPON, A. M.; PANDOLFI, V.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; KIDO, E. A. Inositol phosphates and Raffinose family oligosaccharides pathways: Structural genomics and transcriptomics in soybean under root dehydration Plant Gene, v. 20, 100202, 2019. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; OLIVEIRA, I. C. de; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; KIDO, E. A. Diversidade genética em feijão-caupi de porte ereto e prostrado para seleção de genitores via marcadores moleculares EST-SSR. In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 62., 2010, Natal. Ciências do mar: herança para o futuro: anais/resumos. [s.l.]: SBPC, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 7. | | KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; HOULLOU-KIDO, L. M.; ANDRADE, F. C.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BURNQUIST, W. L.; BENKO-ISEPPON, A. M. Plant antimicrobial peptides: an overview of superSAGE transcriptional profile and a functional review. Current Protein & Peptide Science, v. 11, n. 3, p. 220-230, May 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 8. | | SOARES-CAVALCANTI, N. M.; BELARMINO, L. C.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; RODRIGUES, F. A.; PEREIRA, G. A. G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Overall picture of expressed Heat Shock Factors in Glycine max, Lotus japonicus and Medicago truncatula. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 247-259, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 9. | | MEDEIROS, C. D.; FERREIRA NETO, M. J.; OLIVEIRA, M. T.; RIVAS, R.; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; BALDANI, J. I.; SANTOS, M. G. Photosynthesis, antioxidant activities and trasncriptional responses in two sugarcane (Saccharum officinarum L.) cultivars under salts stress. Acta Physiologiae Plantarum Online, octubre, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 10. | | LIMA, A. T. B.; DAMASCENO-SILVA, K. J.; ROCHA, M. M.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A.; AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C. Seleção de primers visando identificação de marcas DAF associados a QTL'S em feijão-caupi. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 2., 2009, Belém, PA. Da agricultura de subsistência ao agronegócio: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. p. 831-835. 1 CD-ROM. Autoria: DAMASCENO-SILVA, K. J. [i.e. SILVA, K. J. D. e]| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 11. | | SOUZA, M. C. P. de; SILVA, M. D. da; BINNECK, E.; CABRAL, G. A. de L.; ISEPPON, A. M. B.; POMPELLI, M. F.; ENDRES, L.; KIDO, E. A. RNA-Seq transcriptome analysis of Jatropha curcas L. accessions after salt stimulus and unigene-derived microsatellite mining. Industrial Crops & Products, v. 147, 112168, 2020. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | NASCIMENTO, A. T. B. do; SILVA, C. B.; COSTA, M. M. R.; FERREIRA NETO, J. R. C.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; KIDO, E. A. Análise de diversidade em genótipos de feijão-caupi do programa de melhoramento da Embrapa Meio-Norte. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/248a.pdf. Acesso em: 08 ago. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 13. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Análise de bulks segregantes (BSA) para detecção de marcadores DAF e microssatélite ligados ao gene de resistência ao vírus do mosaico severo em feijão-caupi. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 98| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 14. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. M.; FREIRE FILHO, F. R.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; ISEPPON, A. M. B. Análise de segregantes na identificação de marcadores ligados a genes de resistência a virose em feijão-caupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para a produção de alimentos e bioenergia: livro de resumos. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. p. 27-28. Resumo 69.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 15. | | BARBOSA, P. K. A; CALSA JUNIOR, T; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; ROCHA, M. de M.; SITTOLIN, I. M; ANDRADE, G. P; PIO-RIBEIRO, G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Análise transcricional de Vigna unguiculata infectada por potyvírus (CABMV) através de LongSAGE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 246| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 16. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A brazilian soybean database. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts book... Ouro Preto: AB3C, 2010. p. 120. X-Meeting 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 17. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; VIDAL, R. O.; MEYER, L.; BINNECK, E.; KIDO, E. A.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. Bioinformatics analysis applied to genosoja project. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book ... Rio de Janeiro: AB3C, 2009. p. 22. X-Meeting 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 18. | | AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Fenotipagem e seleção de marcadores em população de mapeamento de feijão-caupi segregante para resistência ao vírus do mosaico severo do caupi (CPSMV). In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 222| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 19. | | CABRAL, G. A. de L.; BINNECK, E.; SOUZA, M. C. P. de; SILVA, M. D. da; FERREIRA NETO, J. R. C.; POMPELLI, M. F.; ENDRES, L.; KIDO, E. A. First expressed tfome of physic nut ( Jatropha curcas L.) after salt stimulus. Plant Molecular Biology Reporter, v. 38, p. 189-208, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, É. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Identificação de marcas moleculares associadas à resistência ao vírus do mosaido severo do feijão-caupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 4 p. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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