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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
31/08/2021 |
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Data da última atualização: |
31/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SERIBELLI, A. A.; SILVA, P. da; FRAZÃO, M. R.; KICH, J. D.; ALLARD, M. W.; FALCÃO, J. P. |
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Afiliação: |
AMANDA APARECIDA SERIBELLI, USP; PATRICK DA SILVA, UNESP; MILIANE RODRIGUES FRAZÃO, USP; JALUSA DEON KICH, CNPSA; MARC W. ALLARD, Food and Drug Administration; JULIANA PFRIMER FALCÃO, USP. |
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Título: |
Phylogenetic relationship and genomic characterization of Salmonella Typhimurium strains isolated from swine in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Infection, Genetics and Evolution, v. 92, n. 104977, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.meegid.2021.104977 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Salmonella Typhimurium has been transmitted between humans and animals. Although, Brazil has been one of the largest pork meat exporters worldwide, there are few studies that characterized epidemiologically S. Typhimurium strains from swine. The aims of this work were to study the phylogenetic relationship of S. Typhimurium genomes isolated from swine in Brazil among themselves and with other genomes isolated from several sources and countries using wgMLST and cgMLST and to perform the search of Salmonella pathogenicity islands (SPIs). In addition, for S. Typhimurium strains from swine to compare the virulence and antimicrobial resistance genes by VFDB and ResFinder, genetic content by BLAST Atlas and orthologous proteins clusters by OrthoVenn. The constructed phylogenetic trees by wgMLST and cgMLST grouped the majority (92.3% and 80.7%, respectively) of the strains isolated from swine in Brazil into the same group. All the isolates contained important SPIs (SPI-1, SPI-2, SPI-3, SPI-5 and SPI-9). A total of 100 and 31 virulence and resistance genes were detected in the S. Typhimurium strains isolated from swine, respectively. The BLAST Atlas and orthologous proteins analysis found regions of phages and differences in metabolic, regulatory and cellular processes among S. Typhimurium LT2 and S. Typhimurium isolates from swine. In conclusion, molecular typing based in the wgMLST and cgMLST suggested that the S. Typhimurium isolates from swine studied were genetically related. The pathogenic potential of the strains studied was corroborated by the presence of important SPIs and virulence genes. The high number of antimicrobial resistance genes detected is worrying and reinforced their potential risk in swine in Brazil. The comparison by BLAST Atlas suggested differences in mobile genetic elements among S. Typhimurium LT2 and S. Typhimurium isolates from swine in Brazil. The orthologous proteins analysis revealed unique genes related to important cellular processes in the strains from swine. MenosAbstract: Salmonella Typhimurium has been transmitted between humans and animals. Although, Brazil has been one of the largest pork meat exporters worldwide, there are few studies that characterized epidemiologically S. Typhimurium strains from swine. The aims of this work were to study the phylogenetic relationship of S. Typhimurium genomes isolated from swine in Brazil among themselves and with other genomes isolated from several sources and countries using wgMLST and cgMLST and to perform the search of Salmonella pathogenicity islands (SPIs). In addition, for S. Typhimurium strains from swine to compare the virulence and antimicrobial resistance genes by VFDB and ResFinder, genetic content by BLAST Atlas and orthologous proteins clusters by OrthoVenn. The constructed phylogenetic trees by wgMLST and cgMLST grouped the majority (92.3% and 80.7%, respectively) of the strains isolated from swine in Brazil into the same group. All the isolates contained important SPIs (SPI-1, SPI-2, SPI-3, SPI-5 and SPI-9). A total of 100 and 31 virulence and resistance genes were detected in the S. Typhimurium strains isolated from swine, respectively. The BLAST Atlas and orthologous proteins analysis found regions of phages and differences in metabolic, regulatory and cellular processes among S. Typhimurium LT2 and S. Typhimurium isolates from swine. In conclusion, molecular typing based in the wgMLST and cgMLST suggested that the S. Typhimurium isolates from swine studied were genetically ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análises filogenéticas; BLAST Atlas; Genes de virulência e resistência; Orthologous proteins; Phylogenetic analyses; Proteínas ortólogas; Relação filogenética; SPIs; Virulence and resistance genes. |
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Thesagro: |
Salmonella Typhimurium; Suíno. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 227 | |
| 121. |  | GUGEL, L. A.; BIESUS, L. L.; KICH, J. D.; BESSA, M. C.; PALHARES, J. C. P.; CURIOLETTI; COLDEBELLA, A. Presença de salmonella no solo e nas fezes de suínos e bovinos de leite em propriedades rurais da microbacia do rio Pinhal. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA EMBRAPA/UNC, 4., 2010, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2010. 1 CD-ROM. 4 JINC. Projeto/Plano de Ação: 02.06.60.400-02.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 123. | | KICH, J. D.; COLDEBELLA, A.; ALBUQUERQUE, E. R.; CARDOSO, M. R. de I.; CORBELLINI, L. G.; COSTA, E. de F. Modernização da inspeção sanitária em abatedouros suínos: inspeção baseada em risco. In: CONGRESSO NACIONAL, 19.; CONGRESSO INTERNACIONAL, 1., 2019, Toledo. O futuro mercado de suínos, fundamentado pela ciência e pelo conhecimento: anais. Toledo: ABRAVES, 2019. Revista Acadêmica de Ciência Animal, v. 17, supl. 1, p. 63-65, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 127. | | KICH, J. D.; NOGUEIRA, M.; MORÉS, N.; LOCATELLI, C.; TRIQUES, N. J.; KLEIN, C. S.; FELÍCIO, R. P. Pasteurella multocida tipo a como agente primário: diagnóstico e reprodução experimental da doença. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VETERINÁRIOS ESPECIALISTAS EM SUÍNOS, 13., 2007, Florianópolis. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2007. 1 CD-ROM. Projeto n. 02.06.06.004-02.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 128. | | KUCHIISHI, S. S.; CARVALHO, L. F. O. S.; PIFFER, I. A.; KICH, J. D.; RAMENZONI, M. L. F. Padronização de três ELISAs polivalentes com lipopolissacarídeos de cadeia longa dos sorotipos 1 e 5, 2, 3 e 7 ou 10 e 12 de Actinobacillus pleuropneumoniae. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 60. n. 2, p. 377-383, 2008. Projeto n..02.06.604.00-03| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 129. | | SERIBELLI, A. A.; SILVA, P. da; FRAZÃO, M. R.; KICH, J. D.; ALLARD, M. W.; FALCÃO, J. P. Phylogenetic relationship and genomic characterization of Salmonella Typhimurium strains isolated from swine in Brazil. Infection, Genetics and Evolution, v. 92, n. 104977, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 130. | | PELLEGRINI, D. C. P.; LIMA, G. J. M. M. de; KICH, J. D.; CARDOSO, M. R. de I. Ocorrência de Salmonella nas fábricas de ração. Suinocultura Industrial, Itu, ed. 251, ano 35, n. 2, p. 18-26, 2013.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
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| 131. | | BIESUS, L. L.; GUGEL, L. A.; CALVEYRA, J. C.; NOGUEIRA, M.; KICH, J. D.; BESSA, M. C. Distribuição de Salmonella typhimurium em órgãos de suínos após inoculação oral. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA EMBRAPA/UNC, 4., 2010, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2010. 1 CD-ROM 4 JINC. Projeto/Plano de Ação: 02.06.60.400-02.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 132. | | ROCHA, N.; MORES, M. A. Z.; DEZEN, D.; MORÉS, N.; COLDEBELLA, A.; REBELATTO, R.; KICH, J. D. Economic impact of chronic pleural lesions and consequent disqualification of carcasses for export during inspection in swine slaughterhouses. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 42, n. e07118, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 133. | | NOGUEIRA, M. G.; CALVEYRA, J. C.; KICH, J. D.; COLDEBELLA, A.; MORES, N.; CARDOSO, M. R. de I. Efeito de probiótico na infecção e excreção fecal de Salmonella em suínos. Ciência Rural, Santa Maria, v. 42, n. 3, p. 514-519, 2012| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 135. | | WERLANG, G. O.; PAIM, D. S; VIEIRA, T. R.; PISSETTI, C.; KICH, J. D.; CARDOSO, M. R. de I. Detection of salmonella heidelberg resistant to colistin in the intestinal content of pigs at slaughter. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON THE EPIDEMIOLOGY AND CONTROL OF BIOLOGICAL, CHEMICAL AND PHYSICAL HAZARDS IN PIG AND PORK, 12., 2017, Foz do Iguaçu. Proceedings Book. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2017. p. 175-179. SafePork 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 137. | | KICH, J. D.; SCHWARZ, P.; SILVA, L. E.; COLDEBELLA, A.; PIFFER, I. A.; VIZZOTO, R.; CARDOSO, M. Development and application of an enzyme-linked immunosorbent assay to detect antibodies against prevalent Salmonella serovars in swine in southern Brazil. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation, v.19, n.5, p.510-517, 2007. Projeto n. 02.06.06.004-02.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 138. | | BERNO, L. G.; PALHARES, J. C. P.; KICH, J. D.; GUIDONI, A. L.; KLEIN, J. B.; MULINARI, M. R. Estações climáticas e presença de Salmonella sp. na água do rio pinhal, Concórdia/SC In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 3., 2009, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves/UNC, 2009. 1 CD-ROM Projeto/Plano de Ação: 02.06.60.400-08| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 139. | | REBELATTO, R.; KLEIN, C. S.; SURIAN, C. R.; KICH, J. D.; CARON, L.; MORES, M. A. Z. Experimental model: reproduction of erysipelas in pigs. In: INTERNATIONAL PIG VETERINARY SOCIETY CONGRESS, 26., 2022, Rio de Janeiro. Proceedings... Rio de Janeiro, RJ: IPVS: Abraves, 2022. p. 318.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 140. | | SCHWARZ, P.; CALVEYRA, J. C.; KICH, J. D.; BOROWSKY, L. M.; HIROSE, F.; KOLB, J.; BARCELLOS, D. E.; CARDOSO, M. Estudo longitudinal da infecção por Salmonella enterica em rebanho suíno no sul do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VETERINÁRIOS ESPECIALISTAS EM SUÍNOS, 13., 2007, Florianópolis. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2007. 1 CD-ROM. Projeto n. 02.06.06.004-04| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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