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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
21/12/2022 |
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Data da última atualização: |
21/12/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, T. S. S.; MEIRA, M. R.; VIEIRA, J. G. P.; SANTOS, E. S. L.; JESUS, O. N. de; FALEIRO, F. G.; CERQUEIRA-SILVA, C. B. M. |
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Afiliação: |
THALANA S.S. SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA; MESSULAN R. MEIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA; JOÃO GUILHERME P. VIEIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; ELISA S.L. SANTOS, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA; ONILDO NUNES DE JESUS, CNPMF; FABIO GELAPE FALEIRO, CPAC; CARLOS B.M. CERQUEIRA-SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA. |
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Título: |
Structure and molecular genetic diversity in natural populations and active germplasm banks of Passiflora cincinnata Mast. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Chilean journal of agricultural research, v.82, n.4, Chillán dic., 2022. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4067/S0718-58392022000400628 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT
Passiflora cincinnata Mast. is a wild passion fruit species widely distributed in Brazil, with diverse economic potential and source of resistance to biotic and abiotic stress factors. Despite this, molecular genetic studies on this species are incipient, which limits the definition of priority regions for conservation and identification of accessions to be prospected for germplasm banks and inserted in genetic improvement programs. Thus, this study aimed to characterize the structure and genetic diversity of P. cincinnata accessions using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. The study was carried out using leaf samples from 213 accessions of P. cincinnata, with 158 accessions from six natural populations (collectively considered in this study as a hypothetical metapopulation) in the state of Bahia, Brazil, and the other 55 accessions from two collections of Embrapa Cerrados and Embrapa Cassava & Fruits active germplasm banks (AGBs). Genetic estimates were based on an analysis of the amplification profile of 12 ISSR primers. Descriptive statistics analysis and the polymorphic information content (PIC) and expected heterozygosity (He) estimates were carried out using the GENES software. Approaches based on the Bayesian model, principal coordinate analysis (PCoA), and analysis of molecular variance (AMOVA) were used to assess the genetic structure. Passiflora cincinnata populations/collections showed high polymorphism rates. The metapopulation showed 25.3% of private markers/alleles. The metapopulation is structured in at least three genetic groups, while AGBs in two genetic groups. AMOVA indicated higher diversity within populations, with low differentiation between them. MenosABSTRACT
Passiflora cincinnata Mast. is a wild passion fruit species widely distributed in Brazil, with diverse economic potential and source of resistance to biotic and abiotic stress factors. Despite this, molecular genetic studies on this species are incipient, which limits the definition of priority regions for conservation and identification of accessions to be prospected for germplasm banks and inserted in genetic improvement programs. Thus, this study aimed to characterize the structure and genetic diversity of P. cincinnata accessions using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. The study was carried out using leaf samples from 213 accessions of P. cincinnata, with 158 accessions from six natural populations (collectively considered in this study as a hypothetical metapopulation) in the state of Bahia, Brazil, and the other 55 accessions from two collections of Embrapa Cerrados and Embrapa Cassava & Fruits active germplasm banks (AGBs). Genetic estimates were based on an analysis of the amplification profile of 12 ISSR primers. Descriptive statistics analysis and the polymorphic information content (PIC) and expected heterozygosity (He) estimates were carried out using the GENES software. Approaches based on the Bayesian model, principal coordinate analysis (PCoA), and analysis of molecular variance (AMOVA) were used to assess the genetic structure. Passiflora cincinnata populations/collections showed high polymorphism rates. The metapopulation showed 25.3% of... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genética Vegetal; Maracujá. |
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Thesaurus Nal: |
Passion fruits. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1150221/1/0718-5839-chiljar-82-04-628.pdf
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Marc: |
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005 2022-12-21
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024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4067/S0718-58392022000400628$2DOI
100 1 $aSILVA, T. S. S.
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260 $c2022
520 $aABSTRACT Passiflora cincinnata Mast. is a wild passion fruit species widely distributed in Brazil, with diverse economic potential and source of resistance to biotic and abiotic stress factors. Despite this, molecular genetic studies on this species are incipient, which limits the definition of priority regions for conservation and identification of accessions to be prospected for germplasm banks and inserted in genetic improvement programs. Thus, this study aimed to characterize the structure and genetic diversity of P. cincinnata accessions using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. The study was carried out using leaf samples from 213 accessions of P. cincinnata, with 158 accessions from six natural populations (collectively considered in this study as a hypothetical metapopulation) in the state of Bahia, Brazil, and the other 55 accessions from two collections of Embrapa Cerrados and Embrapa Cassava & Fruits active germplasm banks (AGBs). Genetic estimates were based on an analysis of the amplification profile of 12 ISSR primers. Descriptive statistics analysis and the polymorphic information content (PIC) and expected heterozygosity (He) estimates were carried out using the GENES software. Approaches based on the Bayesian model, principal coordinate analysis (PCoA), and analysis of molecular variance (AMOVA) were used to assess the genetic structure. Passiflora cincinnata populations/collections showed high polymorphism rates. The metapopulation showed 25.3% of private markers/alleles. The metapopulation is structured in at least three genetic groups, while AGBs in two genetic groups. AMOVA indicated higher diversity within populations, with low differentiation between them.
650 $aPassion fruits
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773 $tChilean journal of agricultural research$gv.82, n.4, Chillán dic., 2022.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 5 | |
| 1. |  | LEHALLE, A. L. de C.; CUNHA. B. S.; MACIEL, L. P.; LIMA, C. L. S. de; ABREU, L. F. Caracterização físico-química de diferentes variedades de folha de Manihot utilizadas na produção de maniva cozida. Higiene Alimentar, v. 33, n. 288/289, p. 1339-1343, abr./maio 2019. Edição dos Anais do IX Congresso Latino Americano, XV Congresso Brasileiro de Higienistas de Alimentos e VII Encontro do Sistema Brasileiro de Inspeção de Produtos de Origem Animal, Maceió, abr./maio 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | RIBEIRO, M. do S. S.; CUNHA, B. S.; ABREU, L. F.; FREITAS-SILVA, O.; LIMA, C. L. S. de. Técnicas de descontaminação de castanhas-do-brasil intencionalmente contaminadas com Aspergillus nomius. Higiene Alimentar, v. 33, n. 288/289, p. 2842-2845, abr./maio 2019. Edição digital dos trabalhos apresentados no IX Congresso Latino-Americano e XV Congresso Brasileiro de Higienistas de Alimentos, VII Encontro do Sistema Brasileiro de Inspeção de Produtos de Origem Animal, Maceió, 30 de abril a e 3 de...| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | MOREIRA, L. A. do C.; LEHALLE, A. L. de C.; CUNHA, B. S.; MORAES, A. C. S. S. de; ABREU, L. F.; LIMA, C. L. S. de. Avaliação dos processos utilizados na produção de maniva cozida na região Norte do Brasil. In: ENCONTRO DE PROFISSIONAIS DA QUÍMICA DA AMAZÔNIA, 16., 2019, Belém, PA. [Trabalhos]. [S.l.]: Galoa, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | MOREIRA, L. A. do C.; LEHALLE, A. L. de C.; CUNHA, B. S.; ABREU, L. F.; LIMA, C. L. S. de. Avaliação das boas práticas de fabricação em indústrias processadoras de maniva cozida localizadas no nordeste paraense. Higiene Alimentar, v. 33, n. 288/289, p. 2159-2163, abr./maio 2019. Edição dos Anais do IX Congresso Latino Americano, XV Congresso Brasileiro de Higienistas de Alimentos e VII Encontro do Sistema Brasileiro de Inspeção de Produtos de Origem Animal, Maceió, abr./maio 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | CUNHA, B. S.; LEHALLE, A. L. de C.; MOREIRA, L. A. do C.; LIMA, C. L. S. de; ABREU, L. F. Boas práticas de fabricação e qualidade microbiológica de uma agroindústria processadora de maniva cozida situada no Nordeste paraense. In: ENCONTRO NACIONAL, 21.; CONGRESSO LATINO AMERICANO DE ANALISTAS DE ALIMENTOS, 7., 2019, Florianópolis. Cadeia produtiva e segurança alimentar: desafios e estratégias. São Paulo: SBAAL, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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