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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
11/01/2024 |
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Data da última atualização: |
12/01/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVEIRA, L. A.; SILVA, T. S. S.; MEIRA, M. R.; JESUS, O. N. de; FALEIRO, F. G.; CERQUEIRA-SILVA, C. B. M.; SANTOS, E. S. L. DOS. |
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Afiliação: |
LUCAS AMORIM SILVEIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA; THALANA SOUZA SANTOS SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA; MESSULAN RODRIGUES MEIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA; ONILDO NUNES DE JESUS, CNPMF; FABIO GELAPE FALEIRO, CPAC; CARLOS BERNARD MORENO CERQUEIRA-SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA; ELISA SUSILENE LISBOA DOS SANTOS, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA. |
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Título: |
Variabilidade e estrutura genética molecular em acessos de Passiflora edulis Sims. com base em marcadores análogos a genes de resistência. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Biotemas, v. 36, n. 1, p. 1-11, jan. 2023. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.5007/2175-7925.2023.e91095 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
RESUMO - O Brasil é um centro de diversidade de espécies do maracujazeiro, sendo a Passiflora edulis Sims. a mais cultivada. Devido à sua importância comercial e à suscetibilidade às doenças, objetivou-se avaliar a diversidade genética e a estruturação de acessos de Passiflora edulis. dos bancos ativos de germoplasma da Embrapa Cerrados e Mandioca e Fruticultura utilizando marcadores moleculares análogo a genes de resistência (RGAs). A diversidade genética de 163 plantas, totalizando 71 variedades não melhoradas e cinco cultivares foram avaliadas. Foram utilizadas nove combinações de iniciadores, totalizando 157 marcadores, com média de 17,4 marcadores/combinação. A heterozigosidade esperada média foi 0,18. O conteúdo de informação polimórfica foi 0,15. A variância molecular apresentou 82% de diversidade existente dentro dos Bancos Ativos de Germoplasma (BAG). Os genótipos estruturaram-se em três pools gênicos, com subgrupo heterogêneo com acessos de ambos os bancos, um homogêneo com acessos do BAG Cerrados e o último predominando cultivares também do BAG Cerrados. A análise de Coordenadas Principais demonstrou que os bancos possuem genótipos semelhantes. Os resultados enfatizaram existência de material genômico passivo para desenvolvimento de novas cultivares. Os marcadores certificaram como estas coleções podem contribuir nos programas de melhoramento. Existem alelos compartilhados entre as variedades não melhoradas dos dois BAGs, porém, respectivas variedades não possuem relação com as cultivares. ABSTRACT - Variability and molecular genetic structure in Passiflora edulis Sims. accessions based on markers analogous to resistance genes. Brazil is a center of diversity of passion fruit vine species, with Passiflora edulis Sims. being the most cultivated one. Due to their commercial importance and susceptibility to diseases, the objective of this study was to evaluate the genetic diversity and structuring of Passiflora edulis Sims. accessions from the Cerrados and Mandioca & Fruticultura active germplasm banks of Embrapa using Resistance Gene Analog (RGA) molecular markers. The genetic diversity of 163 plants, totaling 71 unimproved varieties and five cultivars, was evaluated. Nine combinations of primers were used, totaling 157 markers, with an average of 17.4 markers/combination. The mean expected heterozygosity was 0.18. The polymorphic information content was 0.15. The molecular variance showed 82% diversity existing within the Active Germplasm Banks (AGBs). The genotypes were structured in three gene pools, with a heterogeneous subgroup containing accessions from both banks, a homogeneous one with accessions from the Cerrados ABG and the last one containing mainly cultivars from the same. Principal Coordinate Analysis (PCoA) demonstrated the banks have similar genotypes. The results obtained emphasized the existence of passive genomic material for the development of new cultivars. The markers certify that these collections can contribute to breeding programs. There are shared alleles between unimproved varieties of the two ABGs; however, these varieties are not related to the cultivars. MenosRESUMO - O Brasil é um centro de diversidade de espécies do maracujazeiro, sendo a Passiflora edulis Sims. a mais cultivada. Devido à sua importância comercial e à suscetibilidade às doenças, objetivou-se avaliar a diversidade genética e a estruturação de acessos de Passiflora edulis. dos bancos ativos de germoplasma da Embrapa Cerrados e Mandioca e Fruticultura utilizando marcadores moleculares análogo a genes de resistência (RGAs). A diversidade genética de 163 plantas, totalizando 71 variedades não melhoradas e cinco cultivares foram avaliadas. Foram utilizadas nove combinações de iniciadores, totalizando 157 marcadores, com média de 17,4 marcadores/combinação. A heterozigosidade esperada média foi 0,18. O conteúdo de informação polimórfica foi 0,15. A variância molecular apresentou 82% de diversidade existente dentro dos Bancos Ativos de Germoplasma (BAG). Os genótipos estruturaram-se em três pools gênicos, com subgrupo heterogêneo com acessos de ambos os bancos, um homogêneo com acessos do BAG Cerrados e o último predominando cultivares também do BAG Cerrados. A análise de Coordenadas Principais demonstrou que os bancos possuem genótipos semelhantes. Os resultados enfatizaram existência de material genômico passivo para desenvolvimento de novas cultivares. Os marcadores certificaram como estas coleções podem contribuir nos programas de melhoramento. Existem alelos compartilhados entre as variedades não melhoradas dos dois BAGs, porém, respectivas variedades não possuem ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Genética Molecular; Maracujá; Marcador Molecular; Passiflora Edulis; Recurso Genético. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic resources; Germplasm; Passion fruits. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1160731/1/Variabilidade-estrutura-genetica-molecular-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
02/03/2010 |
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Data da última atualização: |
19/10/2010 |
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Tipo da produção científica: |
Software |
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Autoria: |
MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LIMA, H. P. de; RICCIOTTI, R. F. |
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Afiliação: |
SILVIA MARIA FONSECA S MASSRUHÁ, CNPTIA; HELANO POVOAS DE LIMA, CNPTIA; RAPHAEL FUINI RICCIOTTI, Estagiário CNPTIA. |
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Título: |
DiagText. Versão 2.0. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
DiagText é uma ferramenta que teve como objetivo inicial auxiliar o processo de extração de informações de documentos textuais que descrevem doenças de culturas agrícolas para formação de uma árvore de decisão baseada nos sintomas das doenças avaliadas. Para isso, foram utilizadas técnicas de mineração de textos. Para executar a ferramenta: O DiagText foi desenvolvido sob a plataforma Java versão 1.6. Portanto, para executá-lo, é preciso instalar e configurar a máquina virtual Java (JRE) da mesma versão ou posterior. Faça a descompactação do conteúdo (sem alterar o mesmo ou sua estrutura de pastas) em um diretório que não possua 'espaços' no caminho total. No Windows- Dentro da pasta na qual o arquivo foi descompactado, clique sobre o ícone verde de nome "DiagText". No Linux- Via linha de comando, dentro do diretório no qual o arquivo foi descompactado, execute o comando "sh.diagText.sh" Certifique-se de que o arquivo "diagText.sh" tem permissão de execução. Caso não possua permissão, execute o comando abaixo: "chmod ugo+x diagText.sh" Observação: Para mais informações sobre a ferramenta de como instalar e utilizar insira o CD e leia o manual. |
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Palavras-Chave: |
Árvore de decisão; Data mining; DiagText; Extração de informações; Mineração de textos; Sintomas de doenças. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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520 $aDiagText é uma ferramenta que teve como objetivo inicial auxiliar o processo de extração de informações de documentos textuais que descrevem doenças de culturas agrícolas para formação de uma árvore de decisão baseada nos sintomas das doenças avaliadas. Para isso, foram utilizadas técnicas de mineração de textos. Para executar a ferramenta: O DiagText foi desenvolvido sob a plataforma Java versão 1.6. Portanto, para executá-lo, é preciso instalar e configurar a máquina virtual Java (JRE) da mesma versão ou posterior. Faça a descompactação do conteúdo (sem alterar o mesmo ou sua estrutura de pastas) em um diretório que não possua 'espaços' no caminho total. No Windows- Dentro da pasta na qual o arquivo foi descompactado, clique sobre o ícone verde de nome "DiagText". No Linux- Via linha de comando, dentro do diretório no qual o arquivo foi descompactado, execute o comando "sh.diagText.sh" Certifique-se de que o arquivo "diagText.sh" tem permissão de execução. Caso não possua permissão, execute o comando abaixo: "chmod ugo+x diagText.sh" Observação: Para mais informações sobre a ferramenta de como instalar e utilizar insira o CD e leia o manual.
653 $aÁrvore de decisão
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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