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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
28/09/2017 |
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Data da última atualização: |
21/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CONRADO, A. C.; ARRUDA, H.; STANTON, D. W. S.; JAMES, S. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; DUPONT, E.; TAHERI, S.; MORGAN, A. J.; SIMÕES, N.; RODRIGUES, A.; MONTIEL, R.; CUNHA, L. |
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Afiliação: |
Ana C. Conrado, UFPR; Hugo Arruda, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal; David W.G. Stanton, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; Samuel W. James, University of Management, Sustainable Living Dept., Fairfield; Peter Kille, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; GEORGE GARDNER BROWN, CNPF; Elodie da Silva, Bolsista da Embrapa Florestas; Lise Dupont, Université Paris Est Créteil, Institut d’écologie et des sciences; Shabnam Taheri, Université Paris Est Créteil, Institut d’écologie et des sciences; Andrew J. Morgan, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; Nelson Simões, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal; Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal. (CVARG); Rafael Montiel, Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Unidad de Genómica Avanzada, México; Luis Cunha, Bolsista da Embrapa Florestas. |
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Título: |
The complete mitochondrial DNA sequence of the pantropical earthworm Pontoscolex corethrurus (Rhinodrilidae, Clitellata): mitogenome characterization and phylogenetic positioning. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
ZooKeys, v. 688, Aug. 2017. |
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Páginas: |
13 p. |
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DOI: |
10.3897/zookeys.688.13721.suppl1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Publicado na PeerJ Preprints em 3 mar. 2017. |
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Conteúdo: |
Pontoscolex corethrurus (Müller, 1857) plays an important role in tropical soil ecosystems and has been widely used as an animal model for a large variety of ecological studies, in particular due to its common presence and generally high abundance in human-disturbed tropical soils. In this study we describe the complete mitochondrial genome of the peregrine earthworm P. corethrurus. This is the first record of a mitochondrial genome within the Rhinodrilidae family. Its mitochondrial genome is 14 835 bp in length containing 37 genes (13 protein-coding genes (PCG), 2 rRNA genes and 22 tRNA genes). It has the same gene content and structure as in other sequenced earthworms, but unusual among invertebrates it has several overlapping open reading frames. All genes are encoded on the same strand. Most of the PCGs use ATG as the start codon except for ND3, which uses GTG as the start codon. The A+T content of the mitochondrial genome is 59.9% (31.8% A, 28.1% T, 14.6% G, and 25.6% for C). The annotated genome sequence has been deposited in GenBank under the accession number KT988053. |
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Palavras-Chave: |
Açores; Earthworm; Peregrine species; Rhinodrilidae. |
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Thesagro: |
Genoma; Minhoca; Mitocôndria. |
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Thesaurus Nal: |
Azores; Mitochondria; Mitochondrial genome; Pontoscolex corethrurus. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/164497/1/2017-G.Brown-Zookeys-The-Complete.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 85 | |
| 61. |  | BARTZ, M. L. C.; BARTZ, H. A.; CRUZ, L. A. B.; DERPSCH, R. W.; BUNK, A.; BROWN, G. G.; JAMES, S. W. Riqueza de espécies de minhocas em áreas sob sistema plantio direto no Paraguai. In: ENCONTRO NACIONAL DE PLANTIO DIRETO NA PALHA, 14., 2014, Bonito. Sistema plantio direto: produzindo água e alimentando o mundo: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Disponibilizado online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 62. | | BARTZ, M. L. C.; JAMES, S. W.; BROWN, G. G.; WILDNER, L. P.; ROCHA, E.; TESTA, M.; VEIGA, M. da; BARETTA, D. Riqueza de espécies de minhocas em plantio direto no meio-oeste catarinense. In: REUNIÃO PARANAENSE DE CIÊNCIA DO SOLO, 3., 2013, Londrina. Sistemas conservacionistas de produção e sua interação com a ciência do solo: resumos. Londrina: IAPAR, 2013. p. 253.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 63. | | BROWN, G. G.; CALLAHAM JUNIOR, M. A.; NIVA, C. C.; FEIJOO, A.; SAUTTER, K. D.; JAMES, S. W.; FRAGOSO, C.; PASINI, A.; SCHMELZ, R. M. Terrestrial oligochaete research in Latin America: the importance of the Latin American Meetings on Oligochaete Ecology and Taxonomy. Applied Soil Ecology, v. 69, (nesp), p. 2-12, July 2013. Special issue: Progress and Priorities in Latin American Oligochaete Research.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 64. | | BUSCH, E.; SILVA, E. da; CARDOSO, G. B. X.; NADOLNY, H.; SCHUHLI, G.; JAMES, S. W.; FEIJOO, A.; BROWN, G. G. Uso de DNA barcode para a identificação de minhocas encontradas num gradiente altitudinal na Floresta Atlântica - Paraná. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. Resumo. FERTBIO 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 65. | | BROWN, G. G.; MARTINS, P. T.; JAMES, S. W.; RABELLO, L. M.; PASINI, A.; NUNES, D. H.; KORASAKI, V.; SANTOS, A. A. dos. Seleção do melhor método de amostragem para a avaliação de populações de minhocas como bioindicadores. In: SARAIVA, O. F.; LEITE, R. M. V. B. de C. (Ed.). Resultados de Pesquisa da Embrapa Soja 2005. Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 30-38. (Embrapa Soja. Documentos, 296).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 66. | | TAHERI, S.; JAMES, S. W.; DECAËNS, T.; ROY, V.; ROUGERIE, R.; WILLIAMS, B.; ANDERSON, F.; BROWN, G. G.; CUNHA, L.; SILVA, E. da; CHANG, C.; DUPONT, L. Phylogenetic assessment within a complex of tropical peregrine species, Pontoscolex corethrurus. In: ANNUAL MEETING OF THE ASSOCIATION FOR TROPICAL BIOLOGY AND CONSERVATION, 53., 2016, Montpellier. Tropical ecology and society reconciliating conservation and suatainable use of biodiversity: program & abstracts. [S.l.]: ATBC, 2016. p. 98.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 67. | | JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; STANTON, D. W. G.; CONRADO, A. C.; DUPONT, L.; TAHERI, S.; SILVA, E. da; CUNHA, L.; BROWN, G. G. A neotype for Pontoscolex corethrurus (Müller, 1857) (Clitellata). Zootaxa, v. 4545, n. 1, p. 124-132, Jan. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 68. | | SILVA, E. da; JAMES, S. W.; ROSA, M. G. da; SCHUHLI, G. S. e; BARTZ, M. L. C.; NADOLNY, H.; BROWN, G. G. Potencial do DNA barcode para a taxonomia de minhocas: identificação e conservação de espécies brasileiras. In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE ECOLOGIA E TAXONOMIA DE OLIGOQUETAS, 5; SIMPÓSIO ENGENHEIROS EDÁFICOS, FERTILIDADE DO SOLO E TERRA PRETA DE ÍNDIO (TPI), 2015, Curitiba. Anais. [S.l.]: Federação Brasileira de plantio direto de irrigação, 2015. p. 15. Disponível online. Resumo. 5° ELAETAO.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 69. | | SILVA, E. da; ROSA, M. G. da; SCHUHLI, G.; JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; NADOLNY, H.; BUSCH, E.; BROWN, G. G. O potencial do DNA barcode para a taxonomia de minhocas: identificação e conservação de espécies brasileiras. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. Resumo. FERTBIO 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 70. | | SILVA, E. da; ROSA, M. G. da; SCHUHLI, G. S. e; JAMES, S. W.; DECÄENS, T.; BARTZ, M. L. C.; NADOLNY, H.; FEIJOO, A.; BROWN, G. G. O potencial do DNA barcoding para a identificação e conservação de espécies de minhocas brasileiras. In: MOREIRA, F. M. de S.; KASUYA, M. C. M. (Ed.). Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologia para todos. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência de Solo, 2017. v. 2 Palestra 3. FERTBIO 2014.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 71. | | BARETTA, D.; BROWN, G. G.; JAMES, S. W.; NERONI, R. de F.; MESCOLOTTI, D. L. C.; CARDOSO, E. J. B. N. Populações de minhocas amostradas usando diferentes metodos de extração em floresta de Araucaria angustifolia no parque estadual de Campos do Jordão, SP. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 72. | | BROWN, G. G.; JAMES, S. W.; SAUTTER, K. D.; PASINI, A.; BENITO, N. P.; NUNES, D. H.; KORASAKI, V.; SANTOS, E. F. dos; MATSUMURA, C.; MARTINS, P. T.; PAVÃO, A.; SILVA, S. H. da; GARBELIN, G.; TORRES, E. Avaliação das populações e de minhocas como bioindicadores ambientais no Norte e Leste do Estado do Paraná (03.02.5.14.00.02 e 03.02.5.14.00.03). In: SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2003: manejo de solos, plantas daninhas e agricultura de precisão. Londrina: Embrapa Soja, 2004. p. 33-46. (Embrapa Soja. Documentos, 253).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 73. | | BROWN, G. G.; JAMES, S. W.; SAUTTER, K. D.; PASINI, A.; BENITO, N. P.; NUNES, D. H.; KORASAKI, V.; SANTOS, E. F. dos; MATSUMURA, C.; MARTINS, P. T.; PAVAO, A.; SILVA, S. H. da; GARBELINI, L. G.; TORRES, E. Avaliação das populações de minhocas como bioindicadores ambientais no norte e no leste do Estado do Paraná. In: SARAIVA, O. F.; LEITE, R. M. V. B. de C. (Ed.). Resultados de Pesquisa da Embrapa Soja 2005. Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 20-29. (Embrapa Soja. Documentos, 296)| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Soja. |
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| 74. | | BROWN, G. G.; SCHUHLI, G. S. e; JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; BARETTA, D.; LOCATELLI, M.; DECÄENS, T.; BUSCH, E.; STEFFEN, G. P. K.; ANTONIOLLI, Z. I. Barconding facilitates Brazilian earthworm taxonomy. In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 6., 2013, Palmeira de Faro, Portugal. Book of abstracts. [Braga]: University of Minho, CBMA, 2013. p. 17.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 75. | | CONRADO, A. C.; ARRUDA, H.; STANTON, D. W. S.; JAMES, S. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; DUPONT, E.; TAHERI, S.; MORGAN, A. J.; SIMÕES, N.; RODRIGUES, A.; MONTIEL, R.; CUNHA, L. The complete mitochondrial DNA sequence of the pantropical earthworm Pontoscolex corethrurus (Rhinodrilidae, Clitellata): mitogenome characterization and phylogenetic positioning. ZooKeys, v. 688, Aug. 2017. 13 p. Publicado na PeerJ Preprints em 3 mar. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 76. | | MISIRLIOGLU, M.; REYNOLDS, J. W.; STOJANOVIC, M.; TRAKIC, T.; SEKULIC, J.; JAMES, S. W.; CSUZDI, C.; DECAËNS, T.; LAPIED, E.; PHILLIPS, H. R. P.; CAMERON, E. K.; BROWN, G. G. Earthworms (Clitellata, Megadrili) of the world: an updated checklist of valid species and families, with notes on their distribution. Zootaxa, v. 5255, n. 1, p. 417-438, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 77. | | DEMETRIO, w. c.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; NADOLNY, H.; CARDOSO, G. B. X.; TORRES, J. L. M.; DUDAS, R.; OLIVEIRA, V. de; BARRETO, J. O.; JAMES, S. W.; SILVA, E. da; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Earthworm species in various land use systems in the Campos Gerais region of Lapa, Paraná, Brazil. Zootaxa, v. 4496, n. 1, p. 503-516, Oct. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 78. | | BARTZ, M. L. C. B.; SILVA, E. da; SANTOS, A.; NADOLNY, H.; CARDOSO, G.; ZAGATTO, M.; FONSECA, P. da; PEREIRA, J. de M.; BARETTA, D.; DAVIDSON, S.; MARTÍNEZ, A. F.; JAMES, S. W.; DEAËNS, T.; BROWN, G. G. Registro de minhocas em unidades de conservação do Brasil - 12 anos de trabalhos! In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE ECOLOGIA E TAXONOMIA DE OLIGOQUETAS, 5; SIMPÓSIO ENGENHEIROS EDÁFICOS, FERTILIDADE DO SOLO E TERRA PRETA DE ÍNDIO (TPI), 2015, Curitiba. Anais. [S.l.]: Federação Brasileira de plantio direto de irrigação, 2015. p. 22. Disponível online. Resumo. 5° ELAETAO.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 79. | | CUNHA, L.; BROWN, G. G.; STANTON, D. W. G.; SILVA, E. da; HANSEL, F. A.; JORGE, G.; MCKEY, D.; VIDAL-TORRADO, P.; MACEDO, R. S.; VELASQUEZ, E.; JAMES, S. W.; LAVELLE, P.; KILLE, P. Soil animals and pedogenesis: the role of earthworms in anthropogenic soils. Soil Science, v. 181, n. 3/4, p. 110-125, Mar./Apr. 2016. Participação da Terra Preta de Índio Network.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Florestas. |
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