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Biblioteca(s):  Embrapa Florestas.
Data corrente:  28/09/2017
Data da última atualização:  21/12/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  CONRADO, A. C.; ARRUDA, H.; STANTON, D. W. S.; JAMES, S. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; DUPONT, E.; TAHERI, S.; MORGAN, A. J.; SIMÕES, N.; RODRIGUES, A.; MONTIEL, R.; CUNHA, L.
Afiliação:  Ana C. Conrado, UFPR; Hugo Arruda, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal; David W.G. Stanton, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; Samuel W. James, University of Management, Sustainable Living Dept., Fairfield; Peter Kille, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; GEORGE GARDNER BROWN, CNPF; Elodie da Silva, Bolsista da Embrapa Florestas; Lise Dupont, Université Paris Est Créteil, Institut d’écologie et des sciences; Shabnam Taheri, Université Paris Est Créteil, Institut d’écologie et des sciences; Andrew J. Morgan, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; Nelson Simões, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal; Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal. (CVARG); Rafael Montiel, Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Unidad de Genómica Avanzada, México; Luis Cunha, Bolsista da Embrapa Florestas.
Título:  The complete mitochondrial DNA sequence of the pantropical earthworm Pontoscolex corethrurus (Rhinodrilidae, Clitellata): mitogenome characterization and phylogenetic positioning.
Ano de publicação:  2017
Fonte/Imprenta:  ZooKeys, v. 688, Aug. 2017.
Páginas:  13 p.
DOI:  10.3897/zookeys.688.13721.suppl1
Idioma:  Inglês
Notas:  Publicado na PeerJ Preprints em 3 mar. 2017.
Conteúdo:  Pontoscolex corethrurus (Müller, 1857) plays an important role in tropical soil ecosystems and has been widely used as an animal model for a large variety of ecological studies, in particular due to its common presence and generally high abundance in human-disturbed tropical soils. In this study we describe the complete mitochondrial genome of the peregrine earthworm P. corethrurus. This is the first record of a mitochondrial genome within the Rhinodrilidae family. Its mitochondrial genome is 14 835 bp in length containing 37 genes (13 protein-coding genes (PCG), 2 rRNA genes and 22 tRNA genes). It has the same gene content and structure as in other sequenced earthworms, but unusual among invertebrates it has several overlapping open reading frames. All genes are encoded on the same strand. Most of the PCGs use ATG as the start codon except for ND3, which uses GTG as the start codon. The A+T content of the mitochondrial genome is 59.9% (31.8% A, 28.1% T, 14.6% G, and 25.6% for C). The annotated genome sequence has been deposited in GenBank under the accession number KT988053.
Palavras-Chave:  Açores; Earthworm; Peregrine species; Rhinodrilidae.
Thesagro:  Genoma; Minhoca; Mitocôndria.
Thesaurus Nal:  Azores; Mitochondria; Mitochondrial genome; Pontoscolex corethrurus.
Categoria do assunto:  S Ciências Biológicas
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/164497/1/2017-G.Brown-Zookeys-The-Complete.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Florestas (CNPF)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPF55975 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoJAMES, S. W. Earthworm biodiversity and phylogeny in Latin America: present and future trends. In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE ECOLOGIA E TAXONOMIA DE OLIGOQUETAS, 4., 2010, Curitiba. Minhocas como bioindicadoras ambientais: princípios e práticas: anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Florestas. Documentos, 199). 1 CD-ROM.
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2.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W. Atlantic Forest earthworms: biodiversity and conservation priorities. In: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON SOIL ZOOLOGY, 15; INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON APTERYGOTA, 12., 2008, Curitiba. Biodiversity, conservation and sustainabele management of soil animal: abstracts. Colombo: Embrapa Florestas. Editors: George Gardner Brown; Klaus Dieter Sautter; Renato Marques; Amarildo Pasini. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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3.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W. Biodiversidade e biogeografia das minhocas no Estado de São Paulo, Brasil. In: BROWN, G. G.; FRAGOSO, C. (Ed.) Minhocas na América Latina: biodiversidade e ecologia. Londrina: Embrapa Soja, 2007. p. 397-405
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-CientíficoCirculação/Nível: -- - --
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Soja.
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4.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W. Biodiversidade de minhocas. In: LOPES, M. I. M. S.; KIRIZAWA, M.; MELO, M. M. da R. F. de (Org.). Patrimônio da Reserva Biológica do Alto da Serra de Paranapiacaba: a antiga Estação Biológica do Alto da Serra. São Paulo: Instituto de Botânica, 2009. p. 571-578.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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5.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W. Biodiversity and conservation of earthworms (and their ecosystem services) in Brazil. In: ANNUAL MEETING OF THE SOCIETY FOR CONSERVATION BIOLOGY, 19., 2005, Brasília, DF. Conservation biology capacity building and practice in a globalized world: book of abstracts. Brasília, DF: SCB: UnB, 2005. p. 28. Resumo 118.
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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6.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W. Earthworm biodiversity in São Paulo state, Brazil. European Journal of Soil Biology, v. 42, Nov. 2006. Suplemento. p. S146-S149 International Colloquium on Soil Animals and Ecosystem Services, 14., 2004, Mont Saint Aignan.
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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7.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W. Earthworm biodiversity in São Paulo state, Brazil. European Journal of Soil Biology, v. 42, p. S145-S149, Nov. 2006. Supplement 1.
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8.Imagem marcado/desmarcadoJAMES, S. W.; BROWN, G. G. Earthworm ecology and diversity in Brazil. In: MOREIRA, F. M. S.; SIQUEIRA, J. O.; BRUSSAARD, L. (Ed.). Soil biodiversity in Amazonian and other brazilian ecosystems. Wallingford: CABI Publishing, 2006. p. 56-116.
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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9.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W. Ecologia, biodiversidade e biogeografia das minhocas no Brasil. In: BROWN, G. G.; FRAGOSO, C. (Ed.) Minhocas na América Latina: biodiversidade e ecologia. Londrina: Embrapa Soja, 2007. p. 297- 381
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-CientíficoCirculação/Nível: -- - --
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Soja.
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10.Imagem marcado/desmarcadoJAMES, S. W.; BROWN, G. G. Ecologia e diversidade de minhocas no Brasil. In: MOREIRA, F. M.S.; SIQUEIRA, J. O.; BRUSSAARD, L. (Ed.). Biodiversidade do solo em ecossistemas brasileiros. Lavras: Ed. UFLA, 2008. p. 193-276.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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11.Imagem marcado/desmarcadoJAMES, S. W.; BROWN, G. G. Rediscovery of Fimoscolex sporadochaetus Michaelsen 1918 (Clitellata: Glossoscolecidae), and considerations on endangered earthworm species and their diversity in Brazil. In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE ECOLOGIA E TAXONOMIA DE OLIGOQUETAS, 3., 2007, Curitiba. Minhocas como bioindicadoras ambientais: princípios e práticas: anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2008. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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12.Imagem marcado/desmarcadoJAMES, S. W.; BROWN, G. G. Rediscovery oif fimoscolex sporadochaetus Michaelsen 1918 (Clitellata: Glossoscolecidae), and considerations onthe endemism and diversity of brazilian earthworms. Acta Zoológica Mexicana, nesp. 2, p. 47-58, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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13.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; FRAGOSO, C.; JAMES, S. W. Earthworm biodiversity in Latin America: present state of the art. In: International Symposium on Earthworm Ecology, 8., 2006, Kraków. Abstracts... Kraków: Jagiellonian University, 2006. p. 9.
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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14.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W.; MARINI-FILHO, O. J. Avaliação do risco de extinção da minhoca: Fimoscolex sporadochaetus Michaelsen, 1918. Biodiversidade Brasileira, v. 2, n. 2, p. 145-149, 2012. Seção: Avaliação do Estado de Conservação das Espécies da Fauna Brasileira.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
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15.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W.; MARINI-FILHO, O. J. Avaliação do risco de extinção do minhocuçu: Rhinodrilus fafner Michaelsen, 1918. Biodiversidade Brasileira, v. 2, n. 2, p. 140-144, 2012. 2236-2886 Seção: Avaliação do estado de conservação das espécies da fauna brasileira.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
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16.Imagem marcado/desmarcadoBROWN, G. G.; JAMES, S. W.; MARINI-FILHO, O. J. Fimoscolex sporadochaetus Michaelsen, 1918. In: INSTITUTO CHICO MENDES DE CONSERVAÇÃO DA BIODIVERSIDADE. Livro vermelho da fauna brasileira ameaçada de extinção: volume VII - invertebrados. Brasília, DF, 2018. p. 646-649.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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17.Imagem marcado/desmarcadoJAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G. New Ocnerodrilidae genera, species and records from Brazil (Annelida: Crassiclitellata). Zootaxa, v. 5255, n. 1, p. 235-269, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 4
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18.Imagem marcado/desmarcadoFEIJOO M. A.; BROWN, G. G.; JAMES, S. W. New species of Andiorrhinus Cognetti, 1908 (Oligochaeta: Rhinodrilidae) from Venezuela and Brazil. Zootaxa, v. 4363, n. 1, p. 55-78, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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19.Imagem marcado/desmarcadoLOCATELLI, M.; JAMES, S. W.; BROWN, G. G.; BARETTA, D.; BARTZ, M. L. C.; FORBES, A. AFLP markers and DNA barcodes indicate diverse cryptic species lineages withn Urobenus brasiliensis (Clitellata: Rhinodrilidae). In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 6., 2013, Palmeira de Faro, Portugal. Book of abstracts. [Braga]: University of Minho, CBMA, 2013. p. 33.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoBUSSINGUER, A. P.; NIVA, C. C.; MARCHAO, R. L.; PULROLNIK, K.; GATTO, A.; JAMES, S. W. Caracterização de oligochaeta em diferentes sistemas silvipastoris no Cerrado. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 32.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 16.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 14.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 11., 2016, Goiânia. Rumo aos novos desafios: [anais]. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2016. FertBio 2016. p. 1171.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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