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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
Data corrente: |
03/07/2017 |
Data da última atualização: |
03/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
FAORO, H.; MENEGAZZO, R. R.; BATTISTONI, F.; GYANESHWAR, P.; AMARAL, F. P. do; TAULÉ, C.; RAUSCH, S.; GALVÃO, P. G.; de los SANTOS, C.; MITRA, S.; HEIJO G.; SHEU, S. Y.; CHEN, W. M.; MAREQUE, C.; SFEIR, M. Z. T.; BALDANI, J. I.; MALUK M.; GUIMARÃES, A. P.; STACEY, G.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O.; CRUZ, L. M; JAMES, E. K. |
Afiliação: |
UFPR; UFPR; IIBCE, URUGUAI; UNIVERSITY OF WISCONSIN, USA; UNIVESITY OF MISSOURI, USA; IIBCE, URUGUAI; UNIVERSITY OF WISCONSIN, USA; BOLSISTA DA EMBRAPA AGROBIOLOGIA; IIBCE, URUGUAI; UNIVERSITY OF WISCONSIN; IIBCE, URUGUAI; NATIONAL KAOHSIUNG MARINE UNIVERSITY, TAIWAN; NATIONAL KAOHSIUNG MARINE UNIVERSITY, TAIWAN; IIBCE, URUGUAI; UFPR; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; JAMES HUTTON INSTITUTE, UK; BOLSISTA DA EMBRAPA AGROBIOLOGIA; UNIVERSITY OF MISSOURI, USA; UFPR; UFPR; UFPR; JAMES HUTTON INSTITUTE, UK. |
Título: |
The oil-contaminated soil diazotroph Azoarcus olearius DQS-4T is genetically and phenotypically similar to the model grass endophyte Azoarcus sp. BH72. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Environmental Microbiology Reports, v. 9, n. 3, p. 223-238, jun. 2017. |
DOI: |
10.1111/1758-2229.12502 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The genome of Azoarcus olearius DQS-4T , a N2 -fixing Betaproteobacterium isolated from oil-contaminated soil in Taiwan, was sequenced and compared with other Azoarcus strains. The genome sequence showed high synteny with Azoarcus sp. BH72, a model endophytic diazotroph, but low synteny with five non-plant-associated strains (Azoarcus CIB, Azoarcus EBN1, Azoarcus KH32C, A. toluclasticus MF63T and Azoarcus PA01). Average Nucleotide Identity (ANI) revealed that DQS-4T shares 98.98% identity with Azoarcus BH72, which should now be included in the species A. olearius. The genome of DQS-4T contained several genes related to plant colonization and plant growth promotion, such as nitrogen fixation, plant adhesion and root surface colonization. In accordance with the presence of these genes, DQS-4T colonized rice (Oryza sativa) and Setaria viridis, where it was observed within the intercellular spaces and aerenchyma mainly of the roots. Although they promote the growth of grasses, the mechanism(s) of plant growth promotion by A. olearius strains is unknown, as the genomes of DQS-4T and BH72 do not contain genes for indole acetic acid (IAA) synthesis nor phosphate solubilization. In spite of its original source, both the genome and behaviour of DQS-4T suggest that it has the capacity to be an endophytic, nitrogen-fixing plant growth-promoting bacterium. |
Palavras-Chave: |
Azoarcus olearius; Diazotrophic bacteria; DNA sequence; Taxonomi. |
Thesagro: |
Taxonomia. |
Thesaurus Nal: |
genome. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02700naa a2200469 a 4500 001 2071895 005 2018-01-03 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1111/1758-2229.12502$2DOI 100 1 $aFAORO, H. 245 $aThe oil-contaminated soil diazotroph Azoarcus olearius DQS-4T is genetically and phenotypically similar to the model grass endophyte Azoarcus sp. BH72.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aThe genome of Azoarcus olearius DQS-4T , a N2 -fixing Betaproteobacterium isolated from oil-contaminated soil in Taiwan, was sequenced and compared with other Azoarcus strains. The genome sequence showed high synteny with Azoarcus sp. BH72, a model endophytic diazotroph, but low synteny with five non-plant-associated strains (Azoarcus CIB, Azoarcus EBN1, Azoarcus KH32C, A. toluclasticus MF63T and Azoarcus PA01). Average Nucleotide Identity (ANI) revealed that DQS-4T shares 98.98% identity with Azoarcus BH72, which should now be included in the species A. olearius. The genome of DQS-4T contained several genes related to plant colonization and plant growth promotion, such as nitrogen fixation, plant adhesion and root surface colonization. In accordance with the presence of these genes, DQS-4T colonized rice (Oryza sativa) and Setaria viridis, where it was observed within the intercellular spaces and aerenchyma mainly of the roots. Although they promote the growth of grasses, the mechanism(s) of plant growth promotion by A. olearius strains is unknown, as the genomes of DQS-4T and BH72 do not contain genes for indole acetic acid (IAA) synthesis nor phosphate solubilization. In spite of its original source, both the genome and behaviour of DQS-4T suggest that it has the capacity to be an endophytic, nitrogen-fixing plant growth-promoting bacterium. 650 $agenome 650 $aTaxonomia 653 $aAzoarcus olearius 653 $aDiazotrophic bacteria 653 $aDNA sequence 653 $aTaxonomi 700 1 $aMENEGAZZO, R. R. 700 1 $aBATTISTONI, F. 700 1 $aGYANESHWAR, P. 700 1 $aAMARAL, F. P. do 700 1 $aTAULÉ, C. 700 1 $aRAUSCH, S. 700 1 $aGALVÃO, P. G. 700 1 $ade los SANTOS, C. 700 1 $aMITRA, S. 700 1 $aHEIJO G. 700 1 $aSHEU, S. Y. 700 1 $aCHEN, W. M. 700 1 $aMAREQUE, C. 700 1 $aSFEIR, M. Z. T. 700 1 $aBALDANI, J. I. 700 1 $aMALUK M. 700 1 $aGUIMARÃES, A. P. 700 1 $aSTACEY, G. 700 1 $aSOUZA, E. M. de 700 1 $aPEDROSA, F. O. 700 1 $aCRUZ, L. M 700 1 $aJAMES, E. K. 773 $tEnvironmental Microbiology Reports$gv. 9, n. 3, p. 223-238, jun. 2017.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Registros recuperados : 66 | |
4. | | JAMES, E. K.; REIS, V. M.; OLIVARES, F. L.; BALDANI, J. I.; DOBEREINER, Johanna. Infection of sugar cane by the nitrogen-fixing bacterium Acetobacter diazotrophicus. Journal of Experimental Botany, Oxford, v. 45, n. 275, p. 757-766, 1994.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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6. | | JAMES, E. K.; OLIVARES, F. L.; BALDANI, J. I.; DOBEREINER, Johanna. Herbaspirillum, an endophytic diazotroph colonizing vascular tissue in leaves of Sorghum bicolor L. Moench. Journal of Experimental Botany, Oxford, v. 48, n. 308, p. 785-797, 1997.Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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7. | | RAMOS, M. L. G.; PARSONS, R.; SPRENT, J. I.; JAMES, E. K. Effect of water stress on nitrogen fixation and nodule structure of common bean. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 38, n. 3, p. 339-347, mar. 2003 Título em português: Efeito do estresse hídrico na fixação biológica de nitrogênio e estrutura de nódulos de feijão.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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8. | | OLIVARES, F. L.; JAMES, E. K.; BALDANI, J. I.; DOBEREINER, Johanna. Microscopia otica e eletronica da interacao entre variedades de cana-de-acucar com diferentes graus de suscetibilidade e estria mosqueada e Herbaspirillum rubrisubalbicans sin. Pseudomonas rubrisubalbicans. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 29., Campo Grande, MS, ago. 1996. Fitopatologia Brasileira, Brasilia, v.21, p.344, 1996. Resumo n.59.Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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9. | | MOULIN, L.; JAMES, E. K.; KLONOWSKA, A.; FARIA, S. M. de; SIMON, M. F. Phylogeny, diversity, geographical distribution, and host range of legume-nodulation betaproteobacteria: what is the role of plant taxonomy? In: BRUIJN, F. J. de. Biological nitrogen fixation. New Jersey: Wiley&sons, 2015. p. 177-190Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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10. | | MOULIN, L.; JAMES, E. K.; KLONOWSKA, A.; FARIA, S. M. de; SIMON, M. F. Phylogeny, diversity, geographical distribution, and host range of legume-nodulation betaproteobacteria: what is the role of plant taxonomy? In: BRUIJN, F. J. de. Biological nitrogen fixation. New Jersey: Wiley&sons, 2015. p. 177-190Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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11. | | HARTMANN, A.; JAMES, E. K.; BRUIJN, F. J. de; SCHWAB, S.; ROTHBALLER, M.; SCHMID, M. In situ localization and strain-specific quantification of Azospirillum and other dizotrophic plant plant growth promoting bacteria using antibodies and molecular probes. In: CASSÁN, F. D.; OKON, Y.; CREUS, C. M. (Ed.) Handbook for Azospirillum: techinical issues and protocols. Heidelberg: Springer, 2015 p. 45-64Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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14. | | PIRES, R. de C.; REIS JUNIOR, F. B. dos; ZILLI, J. E.; JAMES, E. K.; SIMON, M. F. Associação simbiótica entre seis espécies do gênero mimosa e bactérias diazotróficas em solos com diferentes características. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CERRADOS. Jovens talentos 2016: resumos. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2016. 99 p. p. 41 (Embrapa Cerrados. Documentos, 334). Comissão organizadora: SOUZA, K. W. de; FALEIRO, A. S. G.; SALGUES, A. L. M.; ALONSO, A. M.; CARVALHO, A. M. de; LOBATO, B. R.; CRUZ, C. V.; SOUSA, E. dos S.; PELEGRINELLI, F.; SOARES, J. P. G.; LIMA, J. E. F. W.; ARBUES, J. F. de O.;...Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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15. | | PIRES, R. C.; REIS JUNIOR, F. B. dos; ZILLI, J. E.; JAMES, E. K.; SIMON, M. F. Influência das características do solo na presença de bactérias diazotróficas em simbiose com diferentes espécies de Mimosa In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. 308 p. Editado por Mariangle Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho. RELAR 2016. p.159Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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16. | | ANDREWS, M.; DE MEYER, M.; JAMES, E. K.; ST. EPKOWSKI, T.; HODGE, S.; SIMON, M. F.; YOUNG, J. P. W. Horizontal transfer of symbiosis genes within and between rhizobial genera: occurrence and importance. Genes, v. 9, n. 7, article 321, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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17. | | CRUZ, L. M. V. da; GOI, S. R.; JAMES, E. K.; PITARD, R. M.; OLIVEIRA, L. D. Nodulação de Mimosa pudica por beta-rizóbio isolados de diferentes ecossistemas no Brasil. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4 p. 1 CD-ROM. Parceria: UFRRJ.
Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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18. | | ANDREWS, M.; JAMES, E. K.; SPRENT, J. I.; BODDEY, R. M.; GROSS, E.; REIS JUNIOR, F. B. dos. Nitrogen fixation in legumes and actinorhizal plants in natural ecosystems: values obtained using ¹5N natural abundance. Plant ecology & Diversity, v. 4, n. 2-3, p. 131-140, june-sept., 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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19. | | COSTA, E. S. P.; NOVAIS, C. B. de; GOI, S. R.; MARTINS, C. M.; JAMES, E. K.; BARAÚNA A.; REIS, V. M.; ROUWS, L. F. M. Leguminosas arbóreas associadas a bactérias fixadoras de nitrogênio: seria essa uma estratégia para o estabelecimento em áreas da Caatinga? In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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20. | | RHEM, M. F. K.; SILVA, V. C.; SANTOS, J. M. F. dos; ZILLI, J. E.; JAMES, E. K.; SIMON, M. F.; GROSS, E. The large mimosoid genus Inga Mill. (tribe Ingeae, Caesalpinioideae) is nodulated by diverse Bradyrhizobium strains in its main centers of diversity in Brazil Systematic and Applied Microbiology, v. 44, n. 6, 126268, November 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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