Data/hora: 11/06/2024 22:57:51

Biblioteca(s): | Embrapa Café.
Data corrente: | 08/01/2014
Data da última atualização: | 08/01/2014
Autoria: | IVAMOTO, S. T.; REIS JUNIOR, O.; CARAZZOLLE, M. F.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P.
Afiliação: | SUZANA TIEMI IVAMOTO, UEL; OSVALDO REIS JUNIOR, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.
Título: | Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial.
Ano de publicação: | 2013
Fonte/Imprenta: | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.
Idioma: | Português
Conteúdo: | Neste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o indutor de metabolismo secundário metiljasmonato. Foram gerados no total 84.798.835 sequências (Illumina, HiSeq2000), que foram montadas em 127.600 contigs com tamanho médio de 1264bp, dos quais 65480 foram considerados como variantes de splicing únicos (unigenes). Neste trabalho, reportamos a montagem de novo do transcriptoma realizada com as sequências destas bibliotecas e os dados preliminares de anotação funcional e categorização. Trata-se do primeiro trabalho de sequenciamento Illumina com frutos de cafeeiro, que pode trazer importantes informações sobre genes candidatos relacionados a produção de compostos-chave envolvidos na qualidade do café e maturação de frutos.
Palavras-Chave: | Illumina; RNA-Seq; Transcriptoma.
Thesagro: | Coffea arabica.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94858/1/Transcriptoma-de-frutos.pdf
Registro original: | Embrapa Café (CNPCa)
Exemplares: | CNPCa - (833-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS