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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
03/01/2020 |
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Data da última atualização: |
03/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MORÉ, D. D.; CARDOSO, F. F.; MUDADU, M. de A.; MALAGO JUNIOR, W.; GULIAS GOMES, C. C.; SOLLERO, B. P.; IBELLI, A. M. G.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
Daniela D. Moré, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; CLAUDIA CRISTINA GULIAS GOMES, CPPSUL; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; Luiz L. Coutinho, USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Network analysis uncovers putative genes affecting resistance to tick infestation in Braford cattle skin. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 20, n. 998, 2019. |
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DOI: |
10.1186/s12864-019-6360-3 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Genetic resistance in cattle is considered a suitable way to control tick burden and its consequent losses for livestock production. Exploring tick-resistant (R) and tick-susceptible (S) hosts, we investigated the genetic mechanisms underlying the variation of Braford resistance to tick infestation. Skin biopsies from four-times-artificially infested R (n = 20) and S (n = 19) hosts, obtained before the first and 24 h after the fourth tick infestation were submitted to RNA-Sequencing. Differential gene expression, functional enrichment, and network analysis were performed to identify genetic pathways and transcription factors (TFs) affecting host resistance. Results: Intergroup comparisons of hosts before (Rpre vs. Spre) and after (Rpost vs. Spost) tick infestation found 51 differentially expressed genes (DEGs), of which almost all presented high variation (TopDEGs), and 38 were redundant genes. Gene expression was consistently different between R and S hosts, suggesting the existence of specific anti-tick mechanisms. In the intragroup comparisons, Rpost vs. Rpre and Spost vs. Spre, we found more than two thousand DEGs in response to tick infestation in both resistance groups. Redundant and non-redundant TopDEGs with potential anti-tick functions suggested a role in the development of different levels of resistance within the same breed. Leukocyte chemotaxis was over-represented in both hosts, whereas skin degradation and remodeling were only found in TopDEGs from R hosts. Also, these genes indicated the participation of cytokines, such as IL6 and IL22, and the activation of Wingless (WNT)-signaling pathway. A central gene of this pathway, WNT7A, was consistently modulated when hosts were compared. Moreover, the findings based on a genome-wide association study (GWAS) corroborate the prediction of the WNT-signaling pathway as a candidate mechanism of resistance. The regulation of immune response was the most relevant pathway predicted for S hosts. Members of Ap1 and NF-kB families were the most relevant TFs predicted for R and S, respectively. Conclusion: This work provides indications of genetic mechanisms presented by Braford cattle with different levels of resistance in response to tick infestation, contributing to the search of candidate genes for tick resistance in bovine. MenosBackground: Genetic resistance in cattle is considered a suitable way to control tick burden and its consequent losses for livestock production. Exploring tick-resistant (R) and tick-susceptible (S) hosts, we investigated the genetic mechanisms underlying the variation of Braford resistance to tick infestation. Skin biopsies from four-times-artificially infested R (n = 20) and S (n = 19) hosts, obtained before the first and 24 h after the fourth tick infestation were submitted to RNA-Sequencing. Differential gene expression, functional enrichment, and network analysis were performed to identify genetic pathways and transcription factors (TFs) affecting host resistance. Results: Intergroup comparisons of hosts before (Rpre vs. Spre) and after (Rpost vs. Spost) tick infestation found 51 differentially expressed genes (DEGs), of which almost all presented high variation (TopDEGs), and 38 were redundant genes. Gene expression was consistently different between R and S hosts, suggesting the existence of specific anti-tick mechanisms. In the intragroup comparisons, Rpost vs. Rpre and Spost vs. Spre, we found more than two thousand DEGs in response to tick infestation in both resistance groups. Redundant and non-redundant TopDEGs with potential anti-tick functions suggested a role in the development of different levels of resistance within the same breed. Leukocyte chemotaxis was over-represented in both hosts, whereas skin degradation and remodeling were only found in TopDEGs from... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bovine; Braford; Enrichment analysis; Expressão gênica; Gado Braford; Network analysis; RNA-Seq. |
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Thesagro: |
Bovino; Carrapato; Resistência; Resistência Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Cattle; Gene expression; Rhipicephalus microplus; Tick infestations. |
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Categoria do assunto: |
--
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/208137/1/More-et-al-2019.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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| 61. |  | FERNANDES, L. T.; GOLDONI, I.; HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Comparação de transcriptomas evidencia vias de diferenciação de condrócitos e desenvolvimento da cartilagem envolvidas na manifestação da necrose da cabeça do fêmur em frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 62. | | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; ROCHA, M. I. P.; IBELLI, A. M. G.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Comparação de diferentes protocolos para visualização de DNA separado por eletroforese em gel de agarose utilizando-se os corantes fluorescentes brometo de etídeo e GelRedr. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE MÉTODOS DOS LABORATÓRIOS DA EMBRAPA, 15., 2010, Pelotas, RS. Novas perspectivas para os laboratórios da Embrapa. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 63. | | PETRY, B.; ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O. Comparação de métodos de homogeneização celular e congelamento para extração de RNA. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 7., 2013, Concórdia. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 13-14.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 64. | | IBELLI, A. M. G.; PAIVA, S. R.; BOLATITO, O.; AKPERE, L.; CASTRO, S. T. R.; OMITOGUN, O. G.; LEDUR, M. C.; MARIANTE, A. da S. Caracterização molecular de galinhas da Nigéria e do Brasil utilizando uma região do D-Loop do DNA mitocondrial. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA E O CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Aptor Software, 2015. p. 50.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 65. | | IBELLI, A. M. G.; PAIVA, S. R.; BOTATITO, O.; AKPERE, L.; CASTRO, S. T. R.; OMITOGUN, O. G.; LEDUR, M. C.; MARIANTE, A. da S. Caracterização molecular de galinhas da Nigéria e do Brasil utilizando uma região do D-LOOP do DNA mitocondrial. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA A AMÉRICA LATINA E CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Recursos genéticos no século 21: de Vavilov a Svalbard: anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2015. p. 50.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 66. | | GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; GOUVEIA, J. J. de S.; LEDUR, M. C. Comprehensive analyses of bone and cartilage transcriptomes evince ion transport, inflammation and cartilage development-related genes involved in chickens femoral head separation. Animals, v. 12, n. 788, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 67. | | SALMÓRIA, L. A.; IBELLI, A. M. G.; TAVERNARI, F. de C.; PEIXOTO, J. de O.; MARCELINO, D. E. P.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Duodenum transcriptome profile of laying hens submitted to different levels of calcium and phosphorus in the diet. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 66., 2021. E-Book. Ribeirão Preto: SBG, 2021. 66º Congresso Brasileiro de Genética. Genética On-line. p. 228.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 68. | | PAIVA, S. R.; TESSMANN, A. L.; IBELLI, A. M. G.; LEDUR, M. C.; BOLATITO, O.; AKPERE, L.; CASTRO, S. T. R.; OMITOGUN, O. G.; MARIANTE, A. da S. Diversidade genética entre galinhas da Nigéria e do Brasil utilizando marcadores microssatélites: bases para intercâmbio e conservação ex situ. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA E O CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Aptor Software, 2015. p. 44.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 69. | | PAIVA, S. R.; TESSMANN, A. L.; IBELLI, A. M. G.; LEDUR, M. C.; BOLATITO, O.; AKPERE, L.; CASTRO, S. T. R.; OMITUGUM, O. G.; MARIANTE, A. da S. Diversidade genética entre galinhas da Nigéria e do Brasil utilizando marcadores microssatélites: bases para intercâmbio e conservação ex situ. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA A AMÉRICA LATINA E CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Recursos genéticos no século 21: de Vavilov a Svalbard: anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2015. p. 44.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 70. | | ABREU JUNIOR, P. B. de; XAVIER SILVA, J.; ARAUJO, A. C.; LEDUR, M. C.; PAIVA, S. R.; BRITO, L.; IBELLI, A. M. G.; CARNEIRO, P. L. S. Diversidade genética de galinhas comerciais e nativas genotipadas com chip de alta densidade. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020. Recursos genéticos e bioeconomia: inovação para um futuro sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020. Trabalho 672. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 71. | | GIGLIOTI, R.; VERCESI FILHO, A. E.; DOMINGOS, A. G.; SILVA, S. S. DA; CUNHA, R. C.; IBELLI, A. M. G.; OKINO, C. H.; OLIVEIRA, M. C. de S. Detection and quantification of Babesia bovis and Babesia bigemina using different target genes. Research in Veterinary Science, v. 168, 2024, 105122. 7 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 72. | | NICIURA, S. C. M.; BENAVIDES, M. V.; OKINO, C. H.; IBELLI, A. M. G.; MINHO, A. P.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Genome-wide association study for Haemonchus contortus resistance in Morada Nova sheep. Pathogens, v. 11, n. 8, aug. 2022, 939. 12 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 73. | | PEIXOTO, J. de O.; KAWSKI, V. L.; IBELLI, A. M. G.; ZANELLA, R.; MAZZUCO, H.; SOUZA, C. G.; MUNARI, D. P.; JAENISCH, F. R. F.; LEDUR, M. C. Genetic evaluation of body weight and tibia resistance in broilers. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 74. | | VENDRUSCOLO, A.; MARCELINO, D. E. P.; PEIXOTO, J. de O.; TAVERNARI, F. de C.; IBELLI, A. M. G.; LEDUR, M. C. Genes referência para estudos de expressão gênica em íleo de frangos de corte aos 21 dias de idade. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2020, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2020. p. 17-18.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 75. | | IBELLI, A. M. G.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A. Genes e vias metabólicas envolvidos nos mecanismos de resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 74.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 76. | | ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; SILVA, M. V. G. B.; GIACHETTO, P. F.; FREITAS, M.; LOPES, J.; LEDUR, M. C. Genetic associations of farrowing length in two maternal lines of pigs. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 77. | | IBELLI, A. M. G.; CARDOSO, F. F.; GENRO NETO, J. S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; REGITANO, L. C. de A. Identificação de genes diferencialmente expressos em linfonodos de bovinos com diferentes níveis de resistência ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 78. | | SANTOS, E. H. dos; GIACHETTO, P. F.; IBELLI, A. M. G.; OLIVEIRA, M. C. de S.; REGITANO, L. C. de A.; YAMAGISHI, M. E. B. Implementação de um pipeline de análises aplicado a experimentos de expressão em larga escala, para a identificação de redes de co-expressão gênica. In: WORKSHOP EM GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Resumos... Fortaleza: UECE, 2009. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 79. | | TIZIOTO, P. C.; OBREGON, D.; REGITANO, L. C. de A.; IBELLI, A. M. G.; GIGLIOTI, R.; NORDI, E. C. P.; OLIVEIRA, M. C. de S. Identificação de um polimorfismo de única base no gene rap-1 de Babesia bovis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 16., Campo Grande. Anais... Campo Grqande: CBPV, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 80. | | CAMPOS, F. G.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; OLIVEIRA, H. C. de; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; GUIMARÃES, S. E. F. Identification of long non-coding RNAS (LNCRNAS) in swine fetus. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 68., 2023, Ouro Preto. Paleogenomics: sequencing ancient DNA. E-book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2023. p. 319.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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