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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
12/11/2020 |
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Data da última atualização: |
12/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SOUZA, M. R.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO D. E. P.; TREMEA, M.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
LUDMILA MUDRI HUL, UNICENTRO; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MAYLA REGINA SOUZA, UDESC/Chapecó; IGOR RICARDO SAVOLDI, UDESC/Chapecó; DÉBORA ESTER PETRY MARCELINO, FACC; MATEUS TREMEA, UFSM; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Reference genes for proximal femoral epiphysiolysis expression studies in broilers cartilage. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 15, n.8, Ed. e0238189, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0238189 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The use of reference genes is required for relative quantification in gene expression analysis and the stability of these genes can be variable depending on the experimental design. Therefore, it is indispensable to test the reliability of endogenous genes previously to their use. This study evaluated nine candidate reference genes to select the most stable genes to be used as reference in gene expression studies with the femoral cartilage of normal and epiphysiolysis-affected broilers. The femur articular cartilage of 29 male broilers with 35 days of age was collected, frozen and further submitted to RNA extraction and quantitative PCR (qPCR) analysis. The candidate reference genes evaluated were GAPDH, HMBS, HPRT1, MRPS27, MRPS30, RPL30, RPL4, RPL5, and RPLP1. For the gene stability evaluation, three software were used: GeNorm, BestKeeper and NormFinder, and a global ranking was generated using the function RankAggreg. In this study, the RPLP1 and RPL5 were the most reliable endogenous genes being recommended for expression studies with femur cartilage in broilers with epiphysiolysis and possible other femur anomalies. |
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Palavras-Chave: |
Epifisiólise femoral. |
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Thesagro: |
Cartilagem; Fêmur; Frango de Corte; Genética Animal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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100 1 $aHUL, L. M.
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520 $aAbstract: The use of reference genes is required for relative quantification in gene expression analysis and the stability of these genes can be variable depending on the experimental design. Therefore, it is indispensable to test the reliability of endogenous genes previously to their use. This study evaluated nine candidate reference genes to select the most stable genes to be used as reference in gene expression studies with the femoral cartilage of normal and epiphysiolysis-affected broilers. The femur articular cartilage of 29 male broilers with 35 days of age was collected, frozen and further submitted to RNA extraction and quantitative PCR (qPCR) analysis. The candidate reference genes evaluated were GAPDH, HMBS, HPRT1, MRPS27, MRPS30, RPL30, RPL4, RPL5, and RPLP1. For the gene stability evaluation, three software were used: GeNorm, BestKeeper and NormFinder, and a global ranking was generated using the function RankAggreg. In this study, the RPLP1 and RPL5 were the most reliable endogenous genes being recommended for expression studies with femur cartilage in broilers with epiphysiolysis and possible other femur anomalies.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 8 | |
| 2. |  | GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Análise comparativa de transcriptoma de frangos normais e afetados com necrose da cabeça do fêmur. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 23., 2021, Petrolina. Da produção de alimentos à saúde única: anais. Natal: UFRN: Sociedade Brasileira de Genética Regional Nordeste, 2021. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
|    |
| 4. | | FERNANDES, L. T.; GOLDONI, I.; HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Comparação de transcriptomas evidencia vias de diferenciação de condrócitos e desenvolvimento da cartilagem envolvidas na manifestação da necrose da cabeça do fêmur em frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; GOUVEIA, J. J. de S.; LEDUR, M. C. Comprehensive analyses of bone and cartilage transcriptomes evince ion transport, inflammation and cartilage development-related genes involved in chickens femoral head separation. Animals, v. 12, n. 788, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | TREMEA, M.; HUL, L. M.; SAVOLDI, I. R.; ESTER, D.; AULER, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão diferencial do gene GAL1 entre frangos de corte normais e afetados com condronecrose bacteriana com osteomelite. Avicultura Industrial, Itu, ed. 1301, ano 111, n. 07, p. 42-44, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SOUZA, M. R.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO D. E. P.; TREMEA, M.; LEDUR, M. C. Reference genes for proximal femoral epiphysiolysis expression studies in broilers cartilage. Plos One, v. 15, n.8, Ed. e0238189, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 8. | | HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO, D. E. P.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. O.; CANTAO, M. E.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Differentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 1, p. 1-13. 2021. Article number: 17965.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
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