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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão. |
Data corrente: |
21/11/2008 |
Data da última atualização: |
19/02/2009 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MENEZES, I. P. de; HOFFMANN, L. V.; ALVES, M. F.; MORELLO, C. de L.; BARROSO, P. A. V. |
Afiliação: |
Ivandilson Pessoa Menezes, Estagiário Embrapa Algodão; Lúcia Vieira Hoffmann, Embrapa Algodão; Milena Ferreira Alves, Estagiária Embrapa Algodão; Camilo de Lelis Morello, Embrapa Algodão; Paulo Augusto Vianna Barroso, Embrapa Algodão. |
Título: |
Distância genética entre linhagens avançadas de germoplasma de algodão com uso de marcadores de RAPD e microssatélites. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v.43, n.10, p.1339-1347, out., 2008. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi selecionar coeficientes de similaridade para serem aplicados a conjuntos de genótipos de algodoeiro com baixa diversidade genética. Analisou-se um conjunto de 65 linhagens e 4 cultivares de algodão, com marcadores de RAPD e SSR, e estimou-se a similaridade genética de acordo com sete coeficientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice e Russel & Rao. A adequação dos coeficientes ao conjunto de genótipos foi verificada por correlação entre as matrizes de distância, índice de consenso entre os dendrogramas e otimização de Tocher. As análises mostraram que o coeficiente de Russel e Rao foi divergente em relação aos demais e seu uso não é recomendável. Entre os parâmetros usados para avaliar a qualidade de informação de cada coeficiente, apenas o índice de consenso estabeleceu diferenças e os classificou em dois grupos: aquele em que a ausência simultânea é considerada e aquele em que ela é desconsiderada. Considerando-se a presença de apenas dois alelos microssatélites por loco e os maiores índices de consenso, os coeficientes de Coincidência Simples, Hamman e Rogers & Tanimoto devem ser preferidos, quando em conjuntos de genótipos de algodoeiro melhorados e com baixa diversidade. |
Palavras-Chave: |
diversidade genética; marcadores RAPD; marcadores SSR. |
Thesagro: |
Gossypium Hirsutum. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPA-2009-09/21674/1/43n10a12.pdf
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Marc: |
LEADER 01997naa a2200217 a 4500 001 1277931 005 2009-02-19 008 2008 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMENEZES, I. P. de 245 $aDistância genética entre linhagens avançadas de germoplasma de algodão com uso de marcadores de RAPD e microssatélites. 260 $c2008 520 $aO objetivo deste trabalho foi selecionar coeficientes de similaridade para serem aplicados a conjuntos de genótipos de algodoeiro com baixa diversidade genética. Analisou-se um conjunto de 65 linhagens e 4 cultivares de algodão, com marcadores de RAPD e SSR, e estimou-se a similaridade genética de acordo com sete coeficientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice e Russel & Rao. A adequação dos coeficientes ao conjunto de genótipos foi verificada por correlação entre as matrizes de distância, índice de consenso entre os dendrogramas e otimização de Tocher. As análises mostraram que o coeficiente de Russel e Rao foi divergente em relação aos demais e seu uso não é recomendável. Entre os parâmetros usados para avaliar a qualidade de informação de cada coeficiente, apenas o índice de consenso estabeleceu diferenças e os classificou em dois grupos: aquele em que a ausência simultânea é considerada e aquele em que ela é desconsiderada. Considerando-se a presença de apenas dois alelos microssatélites por loco e os maiores índices de consenso, os coeficientes de Coincidência Simples, Hamman e Rogers & Tanimoto devem ser preferidos, quando em conjuntos de genótipos de algodoeiro melhorados e com baixa diversidade. 650 $aGossypium Hirsutum 653 $adiversidade genética 653 $amarcadores RAPD 653 $amarcadores SSR 700 1 $aHOFFMANN, L. V. 700 1 $aALVES, M. F. 700 1 $aMORELLO, C. de L. 700 1 $aBARROSO, P. A. V. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira$gv.43, n.10, p.1339-1347, out., 2008.
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Registro original: |
Embrapa Algodão (CNPA) |
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Registros recuperados : 193 | |
82. | | MENEZES, I. P. P. de; HOFFMANN, L. V.; GAIOTTO, F. A.; CIAMPI, A. Y.; BARROSO, P. A. V. Genética populacional de Gossypium mustelinum presentes no Rio de Contas, Bahia, Brasil. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 81. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275).Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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83. | | ALVES, M. F.; SILVA, U. C.; FREITAS, R. B. de; HOFFMANN, L. V.; CIAMPI, A. Y.; BARROSO, P. A. V. Estrutura genética de população de gossypium Mustelinum de afluentes da bacia do rio Paraguaçu no estado da Bahia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Sustentabilidade da cotonicultura brasileira e expansão dos mercados: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROMTipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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85. | | HOFFMANN, L. V.; GANDER, E. S.; ALMEIDA, E. R. P. de; SILVA FILHO, M. C.; VIEIRA, M. L. C. Fatores influenciando a regeneracao de plantas e expressao transiente de GUS na tranformacao de Stylosanthes guianensis por Agrobacterium tumefaciens. Brazilian Journal of Genetics, Ribeirao Preto, v.19, n.3, p.375, 1996. Supplement.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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86. | | ALVES, M. F.; SILVA, U. C.; FREITAS, R. B. de; CIAMPI, A. Y.; HOFFMANN, L. V.; BARROSO, P. A. V. Estrutura e variabilidade genética de populações de Gossypium mustelinum no estado da Bahia visando a conservação. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.214.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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87. | | CARDOSO, K. C. M.; BELTRAMI, P. M.; MAGALHAES, F. O. da C.; GIBAND, M.; HOFFMANN, L. V. Presença de marcadores moleculares ligados a genes de resistência a quatro doenças em algodão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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90. | | LUCENA, M. G.; HOFFMANN, L. V.; JAIN, S.; BARROSO, P. A. V.; OLIVEIRA, T. S.; INQUE-NEGATA, A. K. Sintomalogia e desenvolvimento de metodologia molecular de caracterização de Begomovirus em algodão. In: ENCONTRO DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA ALGODÃO - EPC 2009, 4., 2009, Campina Grande. Resumos... Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. p. 11 (Embrapa Algodão. Documentos, 227).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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93. | | LUCENA, M. G.; OLIVEIRA, T. S.; SILVA, R. A.; COUTINHO, W. M.; HOFFMANN, L. V.; GIBAND, M. Uso de marcadores moleculares para avaliação de fontes de resistência à Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum, agente causal da mancha angular do algodoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... São Paulo: [SBG], 2010. p. 147.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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95. | | DANTAS, A. C. A.; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V.; ALVES, M. F.; ANDRADE, F. P. de. SSR markers to detect gene flow from upland to Mocó cotton. Revista Ciência Agronômica, v. 43, n. 1, p. 163-169, jan./mar., 2012. 7 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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96. | | BRANQUINHO, A. A.; OLIVEIRA, T. S.; HOFFMANN, L. V.; GIBAND, M.; MAGALHÃES, F. O. C.; BARROSO, P. A. V. Symptoms on cotton plants inoculated with cotton leaf roll luteovirus in the presence or absence of a SSR marker linked to the resistance gene. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 3., 2011, Ilhéus. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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100. | | OLIVEIRA, T. S.; HOFFMANN, L. V.; ALVES, P. F.; LUCENA, V. S.; SILVA FILHO, J. L. da. Validação de métodos laboratoriais aplicadas a análises com marcadores microssatélites. Revista Ciência Agronômica, v. 41, n. 2, p. 279-284, abr./jun., 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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