Data/hora: 06/06/2024 02:27:33

Biblioteca(s): 	Embrapa Agricultura Digital.	
Data corrente: 	15/03/2010	
Data da última atualização: 	19/10/2010	
Autoria: 	HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.	
Afiliação: 	ROBERTO H. HERAI, Doutorando em Genética e Biologia Molecular/UNICAMP; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA.	
Título: 	Uma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas.	
Ano de publicação: 	2009	
Fonte/Imprenta: 	Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009.	
Idioma: 	Português	
Notas: 	Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.	
Conteúdo: 	Sequências repetitivas (SR) em lócus gênico de animais e plantas podem estar envolvidas em diversos fenômenos biológicos, como interferência por RNAi (Fire et al., 1998) e trans-splicing (Di Segni et al., 2008). A maioria das SR localiza-se em regiões de introns e, usualmente, seus estudos envolvem apenas sequências de mRNA, sendo necessário a estrutura intron-exon dos genes. Desta forma, é preciso realizar um mapeamento dos genes em seu respectivo genoma de referência para identificação de quatro tipos de SR: repetição reversa e complementar, repetição direta e complementar, repetição reversa e repetição direta. Este trabalho apresenta uma ferramenta WEB, chamada RepGraph, a qual integra algoritmos e ferramentas de bioinformática para identificar os pares que formam cada tipo de SR e uma representação gráfica para ilustrar sua relação em dois lócus gênicos.	
Palavras-Chave: 	Bioinformática; Ferramenta Web; Genômica; RepGraph; Sequências repetitivas em lócus gênico; Web tool.	
Thesaurus Nal: 	Bioinformatics; Genomics.	
Categoria do assunto: 	X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia	
URL: 	http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/17608/1/39.pdf	
Registro original: 	Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)	
Exemplares: 	CNPTIA - (14772-1) - UPC - RA - DD -  -  -  - DIS