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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
21/03/2014 |
Data da última atualização: |
18/02/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. |
Afiliação: |
FABIANO FONSECA E SILVA, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; GILSON SILVÉRIO ROCHA, UVF; DARLENE ANA S. DUARTE, UFV; PAULO SÁVIO LOPES, UFV; OTÁVIO J. B. BRUSTOLIN, UFV; SANDER THUS, WAGENINGEN UNIVERSITY; JOSÉ MARCELO S. VIANA, UFV; SIMONE E. F. GUIMARÃES, UFV. |
Título: |
Genomic growth curves of an outbred pig population. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
In the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS methods in relation to the genetic variation explained by each locus. BL yielded more accurate values for all of the phenotypes evaluated and was used to estimate SNP effects and GEBV vectors. The latter allowed the construction of genomic growth curves, which showed substantial genetic discrimination among animals in the final growth phase. The SNP effect estimates allowed identification of the most relevant markers for each phenotype, the positions of which were coincident with reported QTL regions for growth traits. |
Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
Thesagro: |
Curva de Crescimento; Porco. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/99868/1/2013-API-GenomicGrowth.pdf
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Marc: |
LEADER 02003naa a2200253 a 4500 001 1983083 005 2015-02-18 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, F. F. e 245 $aGenomic growth curves of an outbred pig population.$h[electronic resource] 260 $c2013 520 $aIn the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS methods in relation to the genetic variation explained by each locus. BL yielded more accurate values for all of the phenotypes evaluated and was used to estimate SNP effects and GEBV vectors. The latter allowed the construction of genomic growth curves, which showed substantial genetic discrimination among animals in the final growth phase. The SNP effect estimates allowed identification of the most relevant markers for each phenotype, the positions of which were coincident with reported QTL regions for growth traits. 650 $aCurva de Crescimento 650 $aPorco 653 $aMelhoramento genético 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aROCHA, G. S. 700 1 $aDUARTE, D. A. S. 700 1 $aLOPES, P. S. 700 1 $aBRUSTOLIN, O. J. B. 700 1 $aTHUS, S. 700 1 $aVIANA, J. M. S. 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 773 $tGenetics and Molecular Biology$gv. 36, n. 4, p. 520-527, 2013.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Registros recuperados : 132 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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14. | | DOMINGUES, R.; PALLA, P. C.; CESTARO, L. S.; CUNHA, A. C. L. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential gene expression profiles in skin of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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16. | | ARAÚJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA C. S.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T.; COLUMBIANO, V. S. Paternidade em rebanhos caprinos por meio de microssatélites de DNA. In: SIMPÓSIO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO ANIMAL, 5., 2004, Pirassunuga, SP. Anais... Pirassunuga: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2004. 4 f. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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18. | | FONSECA, I.; SILVA, P. V.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S.; LANGE, C. C.; GUIMARÃES, M. F. M. Perfil da expressão dos genes IL-4 e IFN-y em células do leite de vacas da raça Gir Leiteiro saudáveis e com mastite clínica. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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20. | | SILVA, P. V.; FONSECA, I.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; SERÃO, N. V. L.; LOPES, M. S. Expressão relativa da IL - 10 em células do leite de vacas holandesas saudáveis e com mastite clínica. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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