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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
19/12/2013 |
Data da última atualização: |
26/12/2013 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, F. F.; ROCHA, G. S.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PETERNELLI, L. A.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. |
Afiliação: |
F. F. Silva, Universidade Federal de Viçosa; G. S. Rocha, Aluno de pós-graduação – Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; S. E. F. Guimarães, Universidade Federal de Viçosa; L. A. Peternelli, Universidade Federal de Viçosa; D. A. S. Duarte, Aluno de graduação - Universidade Federal de Viçosa / Bolsista de Iniciação Científica; C. Azevedo, Universidade Federal de Viçosa. |
Título: |
Seleção genômica ampla para curvas de crescimento. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano ? BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Os dados simulados utilizados neste estudo foram constituídos de 2000 indivíduos (1000 na população de treinamento e 1000 na população de validação) contendo 453 marcadores SNPs distribuídos sobre cinco cromossomos. Os resultados indicaram a alta eficiência do método BL em predizer GBVs da população de validação com base na população de treinamento (coeficientes de correlação variaram entre 0,79 e 0,93), bem como a alta eficiência na detecção de QTLs, uma vez que os marcadores com maiores efeitos estimados encontravam-se em posições dos cromossomos próximas àquelas nas quais se encontravam os verdadeiros QTLs postulados na simulação. |
Palavras-Chave: |
Bayesian LASSO; Dados longitudinais; LASSO bayesiano; Longitudinal data; Melhoramento genético; SNP. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94366/1/2013-M.Deon-ABMVZ-Selecao.pdf
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Marc: |
LEADER 02280naa a2200265 a 4500 001 1974473 005 2013-12-26 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, F. F. 245 $aSeleção genômica ampla para curvas de crescimento.$h[electronic resource] 260 $c2013 520 $aFoi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano ? BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Os dados simulados utilizados neste estudo foram constituídos de 2000 indivíduos (1000 na população de treinamento e 1000 na população de validação) contendo 453 marcadores SNPs distribuídos sobre cinco cromossomos. Os resultados indicaram a alta eficiência do método BL em predizer GBVs da população de validação com base na população de treinamento (coeficientes de correlação variaram entre 0,79 e 0,93), bem como a alta eficiência na detecção de QTLs, uma vez que os marcadores com maiores efeitos estimados encontravam-se em posições dos cromossomos próximas àquelas nas quais se encontravam os verdadeiros QTLs postulados na simulação. 653 $aBayesian LASSO 653 $aDados longitudinais 653 $aLASSO bayesiano 653 $aLongitudinal data 653 $aMelhoramento genético 653 $aSNP 700 1 $aROCHA, G. S. 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 700 1 $aPETERNELLI, L. A. 700 1 $aDUARTE, D. A. S. 700 1 $aAZEVEDO, C. 773 $tArquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia$gv. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Registros recuperados : 132 | |
2. | | ARAÚJO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; COLUMBIANO, V. S.; TEIXEIRA, M. R.; LOPES, P. S. Descrição de cinco loci de microsatélite em uma população de caprinos da raça Alpina e sua utilização em testes de confirmação de paternidade em casos onde o genótipo materno é ou não informado. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2003. 5 f. 1 CD ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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3. | | PIRES, A. V.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GUIMARAES, C. T.; PEIXOTO, J. O. Mapeamento de locos de características quantitativas associados à composição de carcaça, no cromossomo seis de suíno Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 60, n. 3, p. 725-732, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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5. | | DANTAS, W. de M. F.; RIBEIRO FILHO, J. D.; GUIMARÃES, J. D.; GUIMARÃES, S. E. F. Perfil metabólico e ponderal de leitões submetidos a dietas com diferentes teores de fósforo em ambientes térmicos distintos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 11, p. 901-910, nov. 2014. Título em inglês: Metabolic profile and body weight of piglets fed with different levels of phosphorus in distinct thermal environments.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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10. | | FONSECA, I.; SILVA, P. V.; MIRANDA, C. L.; GUIMARÃES, M. F. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Expressão diferencial do gene interleucina 6 em células do leite de vacas sadias e com mastite. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 97.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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12. | | SILVA, P. V.; FONSECA, I.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; SERÃO, N. V. L.; LOPES, M. S. Expressão relativa da IL - 10 em células do leite de vacas holandesas saudáveis e com mastite clínica. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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14. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 6, p. 619-626, jun. 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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16. | | DOMINGUES, R.; GASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; REIS, D. R. L.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential expression of CXCL10 in peripheral blood of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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17. | | FONSECA, I.; ANTUNES, G. R.; PAIVA, D. de S.; LANGE, C. C.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F. Differential expression of genes during mastitis in Holstein-Zebu crossbreed dairy cows. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 3, p. 1295-1303, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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18. | | DOMINGUES, R.; PALLA, P. C.; CESTARO, L. S.; CUNHA, A. C. L. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential gene expression profiles in skin of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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19. | | ARAÚJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA C. S.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T.; COLUMBIANO, V. S. Paternidade em rebanhos caprinos por meio de microssatélites de DNA. In: SIMPÓSIO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO ANIMAL, 5., 2004, Pirassunuga, SP. Anais... Pirassunuga: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2004. 4 f. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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