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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
10/11/2020 |
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Data da última atualização: |
10/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, H. C. de; IBELLI, A. M. G.; GUIMARÃES, S. E. F.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO. L. L.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
HANIEL CEDRAZ DE OLIVEIRA, UFL; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, UFL; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, USP; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
RNA-seq reveals downregulated osteochondral genes potentially related totibia bacterial chondronecrosis with osteomyelitis in broilers. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, v. 21, n. 58, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/s12863-020-00862-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Background: Bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO) develops in the growth plate (GP) of the proximal femur and tibia and is initiated by damage to the less mineralized chondrocytes followed by colonization of opportunistic bacteria. This condition affects approximately 1% of all birds housed, being considered one of the major causes of lameness in fast growing broilers. Although several studies have been previously performed aiming to understand its pathogenesis, the molecular mechanisms involved with BCO remains to be elucidated. Therefore, this study aimed to generate a profile of global differential gene expression involved with BCO in the tibia of commercial broilers, through RNA sequencing analysis to identity genes and molecular pathways involved with BCO in chickens. Results: Our data showed 192 differentially expressed (DE) genes: 63 upregulated and 129 downregulated in the GP of the tibia proximal epiphysis of BCO-affected broilers. Using all DE genes, six Biological Processes (BP) were associated with bone development (connective tissue development, cartilage development, skeletal system development, organ morphogenesis, system development and skeletal system morphogenesis). The analyses of the upregulated genes did not indicate any significant BP (FDR < 0.05). However, with the downregulated genes, the same BP were identified when using all DE genes in the analysis, with a total of 26 coding genes explaining BCO in the tibia: ACAN, ALDH1A2, CDH7, CHAD, CHADL, COL11A1, COMP, CSGALNACT1, CYR61, FRZB, GAL3ST1, HAPLN1, IHH, KIF26B, LECT1, LPPR1, PDE6B, RBP4A, SERINC5, SFRP1, SOX8, SOX9, TENM2, THBS1, UCHL1 and WFIKKN2. In addition, seven transcription factors were also associated to BCO: NFATC2, MAFB, HIF1A-ARNT, EWSR1-FLI1, NFIC, TCF3 and NF-KAPPAB. Conclusions: Our data show that osteochondral downregulated genes are potential molecular causes of BCO in broilers, and the bacterial process seems to be, in fact, a secondary condition. Sixteen genes responsible for bone and cartilage formation were downregulated in BCO-affected broilers being strong candidate genes to trigger this disorder. MenosAbstract Background: Bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO) develops in the growth plate (GP) of the proximal femur and tibia and is initiated by damage to the less mineralized chondrocytes followed by colonization of opportunistic bacteria. This condition affects approximately 1% of all birds housed, being considered one of the major causes of lameness in fast growing broilers. Although several studies have been previously performed aiming to understand its pathogenesis, the molecular mechanisms involved with BCO remains to be elucidated. Therefore, this study aimed to generate a profile of global differential gene expression involved with BCO in the tibia of commercial broilers, through RNA sequencing analysis to identity genes and molecular pathways involved with BCO in chickens. Results: Our data showed 192 differentially expressed (DE) genes: 63 upregulated and 129 downregulated in the GP of the tibia proximal epiphysis of BCO-affected broilers. Using all DE genes, six Biological Processes (BP) were associated with bone development (connective tissue development, cartilage development, skeletal system development, organ morphogenesis, system development and skeletal system morphogenesis). The analyses of the upregulated genes did not indicate any significant BP (FDR < 0.05). However, with the downregulated genes, the same BP were identified when using all DE genes in the analysis, with a total of 26 coding genes explaining BCO in the tibia: ACAN, ALDH1A2, CD... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
BCO; RNA-Seq. |
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Thesagro: |
Cartilagem; Claudicação; Frango de Corte; Genética Animal; Osteomielite. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetics; Broiler chickens; Cartilage; Gallus gallus; Lameness. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| 2. |  | ARAÚJO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; COLUMBIANO, V. S.; TEIXEIRA, M. R.; LOPES, P. S. Descrição de cinco loci de microsatélite em uma população de caprinos da raça Alpina e sua utilização em testes de confirmação de paternidade em casos onde o genótipo materno é ou não informado. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2003. 5 f. 1 CD ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | PIRES, A. V.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GUIMARAES, C. T.; PEIXOTO, J. O. Mapeamento de locos de características quantitativas associados à composição de carcaça, no cromossomo seis de suíno Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 60, n. 3, p. 725-732, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 5. | | DANTAS, W. de M. F.; RIBEIRO FILHO, J. D.; GUIMARÃES, J. D.; GUIMARÃES, S. E. F. Perfil metabólico e ponderal de leitões submetidos a dietas com diferentes teores de fósforo em ambientes térmicos distintos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 11, p. 901-910, nov. 2014. Título em inglês: Metabolic profile and body weight of piglets fed with different levels of phosphorus in distinct thermal environments.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | SOLLERO, B. P.; YAMAKI, M.; GUIMARÃES, S. E. F.; CARNEIRO, P. L. S.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S. Análise de componentes principais como ferramenta na avaliação da diversidade genética de suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | PEIXOTO, J. de O.; FARIA, D. A. de; SILVA, P. V.; FONSECA, I.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Association between leptin genes single nucleotide polymorphisms and carcass traits in pigs Revista Brasileira de Zootecnia, v.38, n.2, p.271-276, 2009 Subprojeto: 16.00.30004-00| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 11. | | FONSECA, I.; SILVA, P. V.; MIRANDA, C. L.; GUIMARÃES, M. F. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Expressão diferencial do gene interleucina 6 em células do leite de vacas sadias e com mastite. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 97.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 13. | | SILVA, P. V.; FONSECA, I.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; SERÃO, N. V. L.; LOPES, M. S. Expressão relativa da IL - 10 em células do leite de vacas holandesas saudáveis e com mastite clínica. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 15. | | DOMINGUES, R.; GASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; REIS, D. R. L.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential expression of CXCL10 in peripheral blood of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | FONSECA, I.; ANTUNES, G. R.; PAIVA, D. de S.; LANGE, C. C.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F. Differential expression of genes during mastitis in Holstein-Zebu crossbreed dairy cows. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 3, p. 1295-1303, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 17. | | DOMINGUES, R.; PALLA, P. C.; CESTARO, L. S.; CUNHA, A. C. L. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential gene expression profiles in skin of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 6, p. 619-626, jun. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 19. | | ARAÚJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA C. S.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T.; COLUMBIANO, V. S. Paternidade em rebanhos caprinos por meio de microssatélites de DNA. In: SIMPÓSIO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO ANIMAL, 5., 2004, Pirassunuga, SP. Anais... Pirassunuga: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2004. 4 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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