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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
10/02/2014 |
Data da última atualização: |
08/01/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MOURÃO, M. de M.; BITAR, M.; LOBO, F. P.; PECONICK, A. P.; GRYNBERG, P.; PROSDOCIMI, F.; WAISBERG, M.; CERQUEIRA, G. C.; MACEDO, A. M.; MACHADO, C. R.; YOSHINO, T.; FRANCO, G. R. |
Afiliação: |
MARINA DE MORAES MOURÃO, Centro de Pesquisas René Rachou-Fiocruz; MAINÁ BITAR, UFMG; FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; ANA PAULA PECONICK, Ufla; PRISCILA GRYNBERG, UFMG; FRANCISCO PROSDOCIMI, UFRJ; MICHAEL WAISBERG, University of Virginia; GUSTAVO COUTINHO CERQUEIRA, Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard; ANDRÉA MARA MACEDO, UFMG; CARLOS RENATO MACHADO, UFMG; TIMOTHY YOSHINO, University of Wisconsin; GLÓRIA REGINA FRANCO, UFMG. |
Título: |
A directed approach for the identification of transcripts harbouring the spliced leader sequence and the effect of trans-splicing knockdown in Schistosoma mansoni. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 108, n. 6, p. 707-717, Sept. 2013. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Schistosomiasis is a major neglected tropical disease caused by trematodes from the genus Schistosoma. Because schistosomes exhibit a complex life cycle and numerous mechanisms for regulating gene expression, it is believed that spliced leader (SL) trans-splicing could play an important role in the biology of these parasites. The purpose of this study was to investigate the function of trans-splicing in Schistosoma mansoni through analysis of genes that may be regulated by this mechanism and via silencing SL-containing transcripts through RNA interference. Here, we report our analysis of SL transcript-enriched cDNA libraries from different S. mansoni life stages. Our results show that the trans-splicing mechanism is apparently not associated with specific genes, subcellular localisations or life stages. In cross-species comparisons, even though the sets of genes that are subject to SL trans-splicing regulation appear to differ between organisms, several commonly shared orthologues were observed. Knockdown of trans-spliced transcripts in sporocysts resulted in a systemic reduction of the expression levels of all tested trans-spliced transcripts; however, the only phenotypic effect observed was diminished larval size. Further studies involving the findings from this work will provide new insights into the role of trans-splicing in the biology of S. mansoni and other organisms. All Expressed Sequence Tags generated in this study were submitted to dbEST as five different libraries. The accessions for each library and for the individual sequences are as follows: (i) adult worms of mixed sexes (LIBEST_027999: JZ139310 - JZ139779), (ii) female adult worms (LIBEST_028000: JZ139780 - JZ140379), (iii) male adult worms (LIBEST_028001: JZ140380 - JZ141002), (iv) eggs (LIBEST_028002: JZ141003 - JZ141497) and (v) schistosomula (LIBEST_028003: JZ141498 - JZ141974). MenosSchistosomiasis is a major neglected tropical disease caused by trematodes from the genus Schistosoma. Because schistosomes exhibit a complex life cycle and numerous mechanisms for regulating gene expression, it is believed that spliced leader (SL) trans-splicing could play an important role in the biology of these parasites. The purpose of this study was to investigate the function of trans-splicing in Schistosoma mansoni through analysis of genes that may be regulated by this mechanism and via silencing SL-containing transcripts through RNA interference. Here, we report our analysis of SL transcript-enriched cDNA libraries from different S. mansoni life stages. Our results show that the trans-splicing mechanism is apparently not associated with specific genes, subcellular localisations or life stages. In cross-species comparisons, even though the sets of genes that are subject to SL trans-splicing regulation appear to differ between organisms, several commonly shared orthologues were observed. Knockdown of trans-spliced transcripts in sporocysts resulted in a systemic reduction of the expression levels of all tested trans-spliced transcripts; however, the only phenotypic effect observed was diminished larval size. Further studies involving the findings from this work will provide new insights into the role of trans-splicing in the biology of S. mansoni and other organisms. All Expressed Sequence Tags generated in this study were submitted to dbEST as five different librari... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Interferência de RNA. |
Thesagro: |
Schistosoma Mansoni. |
Thesaurus Nal: |
RNA interference; Trans-splicing. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Registros recuperados : 81 | |
61. | | RIBEIRO, D. G.; BEZERRA, A. C. M.; SANTOS, I. R.; GRYNBERG, P.; FONTES, W.; CASTRO, M. de S.; SOUSA, M. V. de; LISEI-DE-SÁ, M. E.; SA, M. F. G. de; FRANCO, O. L.; REIS, A. M. dos. Proteomic insights of Cowpea response to combined biotic and abiotic stresses. Plants, v. 12, n. 9, 1900, 2023. Na publicação: Maria Fatima Grossi-de-Sá; Angela Mehta.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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62. | | MICHEREFF, M. F. F.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; LAUMANN, R. A.; ZHOU, J.-J.; SCHIMMELPFENG, P. H. C.; BORGES, M.; PICKETT, J. A.; BIRKETT, M. A.; MORAES, M. C. B. Priming of indirect defence responses in maize is shown to be genotype-specific. Arthropod-Plant Interactions, v. 15, p. 313-328, 2021. Na publicação: Marcos M. C. Costa; Maria Carolina Blassioli-Moraes.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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63. | | SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V, N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Prediction and identification of miRNAS in Elaeis Guinensis Jacq and analysis of their expression in oil palm plants under salinity drought stress. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal, RN. p. 275Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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64. | | SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V, N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Prediction and identification of miRNAS in Elaeis Guinensis Jacq and analysis of their expression in oil palm plants under salinity drought stress. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal, RN. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 275Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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65. | | SALGADO, F. F.; VIEIRA, L. R.; SILVA, V, N. B.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Prediction and identification of miRNAS in Elaeis Guinensis Jacq and analysis of their expression in oil palm plants under salinity drought stress. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal, RN. p. 275Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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66. | | NORIEGA, D. D.; ARRAES, F. B. M.; ANTONINO, J. D.; MACEDO, L. L. P.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; SILVA, M. C. M.; NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; GROSSI-DE-SA, M. F. Transcriptome analysis and knockdown of the juvenile hormone esterase gene reveal abnormal feeding behavior in the sugarcane giant borer. Frontiers in Physiology, v. 11, article 588450, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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67. | | NORIEGA, D. D.; ARRAES, F. B. M.; ANTONINO, J. D.; MACEDO, L. L. P. de; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; SILVA, M. C. M. da; NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; SA, M. F. G. de. Transcriptome Analysis and Knockdown of the Juvenile Hormone Esterase Gene Reveal Abnormal Feeding Behavior in the Sugarcane Giant Borer. Frontiers in Physiology, v. 11, 588450, jul. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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68. | | FARIAS, L. R.; SCHIMMELPFENG, P. H. C.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, N. F.; BORGES, M.; MORAES, M. C. B.; LAUMANN, R. A.; BÁO, S. N.; PAULA, D. P. Transcriptome-based identification of highly similar odorant-binding proteins among neotropical stink bugs and their egg parasitoid. Plos One, jul., 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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69. | | CORRÊA, C. L.; MIDORIKAWA, G. E. O.; FERREIRA FILHO, E. X.; NORONHA, E. F.; ALVES, G. S. C.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G. Transcriptome profiling-based analysis of carbohydrate-active enzymes in Aspergillus terreus involved in plant Bbomass degradation. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, v. 8, article 564527, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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70. | | NOCHI, A. R. F.; VARGAS, L. N.; SARTORI, R.; GUIMARAES JUNIOR, R.; ARAÚJO, D. B.; FIGUEIREDO, R. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MENDONÇA, A. S.; KUSSANO, N. R.; PIVATO, I.; SILVA, B. D. M.; SPRICIGO, J. F. W.; LEME, L. O.; SILVA, J. P. da; CAETANO, A. R.; DODE, M. A. N.; FRANCO, M. M. Low levels of sulfur and cobalt during the pre- and periconceptional periods affect the oocyte yield of donors and the DNA methylome of preimplantation bovine embryos. Journal of Developmental Origins of Health and Disease, v. 13, p. 231-243, 2022. Na publicação: Marcos M. C. Costa.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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71. | | NOCHI, A. R. F.; VARGAS, L. N.; SARTORI, R.; GUIMARAES JUNIOR, R.; ARAÚJO, D. B.; FIGUEIREDO, R. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; GRYNBERG, P.; MENDONÇA, A. S.; KUSSANO, N. R.; PIVATO, I.; SILVA, B. D. M.; SPRICIGO, J. F. W.; LEME, L. O.; SILVA, J. P. da; CAETANO, A. R.; DODE, M. A. N.; FRANCO, M. M. Low levels of sulfur and cobalt during the pre- and periconceptional periods affect the oocyte yield of donors and the DNA methylome of preimplantation bovine embryos. Journal of Developmental Origins of Health and Disease, 2021. 13 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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72. | | REGO, E. C. S.; PINHEIRO, T. D. M.; FONSECA, F. C. de A.; GOMES, T. G.; COSTA, E. de C.; BASTOS, L. S.; ALVES, G. S. C.; COTTA, M. G.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G. Characterization of microRNAs and Target Genes in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4 during Interaction with Pseudocercospora musae. Plants, v. 12, 1473, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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73. | | MOTA, A. P. Z.; FERNANDEZ, D.; ARRAES, F. B. M.; PETITOT, A.-S.; MELO, B. P. de; SA, M. E. L. de; GRYNBERG, P.; SARAIVA, M. A. P.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; DANCHIN, E. G. J.; GROSSI-DE-SA, M. F. Evolutionarily conserved plant genes responsive to root-knot nematodes identified by comparative genomics. Molecular Genetics and Genomics, v. 295, p. 1063-1078, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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74. | | RIBEIRO, D. G.; MOTA, A. P. Z.; SANTOS, I. R.; ARRAES. F. B. M.; GRYNBERG, P.; FONTES, W.; CASTRO, M. de S.; SOUSA, M. V. de; LISEI-DE-SÁ, M. E.; SA, M. F. G. de; FRANCO, O. L.; REIS, A. M. dos. NBS-LRR-WRKY genes and protease inhibitors (PIs) seem essential for cowpea resistance to root-knot nematode. Journal of Proteomics, v. 261, 2022. 104575. Na publicação: Maria Fatima Grossi-de-Sá; Angela Mehta.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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75. | | MOREIRA, V. J. V.; PINHEIRO, D. H.; LOURENCO, I. T.; BASSO, M. F.; LISEI-DE-SA, M. E.; SILVA, M. C. M. da; DANCHIN, E. G. J.; GUIMARAES, P. M.; GRYNBERG, P.; BRASILEIRO, A. C. M.; MACEDO, L. L. P. de; MORGANTE, C. V.; ENGLER, J. de A.; SA, M. F. G. de. In planta RNAi targeting Meloidogyne incognita Minc16803 gene perturbs nematode parasitism and reduces plant susceptibility. Journal of Pest Science, v. 97, p. 411-427, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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76. | | NORIEGA, D. D.; ARIAS, P. L.; BARBOSA, H. R.; ARRAES, F. B. M.; OSSA, G. A.; VILLEGAS, B.; COELHO, R. R.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; WANG, H.; VÉLEZ, A. M.; ARBOLEDA, J. W.; GROSSI-DE-SA, M. F.; SILVA, M. C. M.; VALENCIA-JIMÉNEZ, A. Transcriptome and gene expression analysis of three developmental stages of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei. Scientific Reports, v.9, n. 1, article 12804, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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77. | | SANTOS, A. S.; ANDRADE, E. M. de; SOUSA, A. R. de O.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; PIROVANI, C. P.; OLIVEIRA, S. A. S.; SOARES FILHO, W. dos S.; COELHO FILHO, M. A.; GESTEIRA, A. da S.; FERREIRA, C. F. Transcriptome profile of drought responsive candidate genes in varieties of citrus rootstocks with different tolerance strategies. Scientia Horticulturae, v. 277, 109838, 2021. Na publicação: Roberto Togawa.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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78. | | PINHEIRO, T. D. M.; REGO, E. C. S.; ALVES, G. S. C.; FONSECA, F. C. de A.; COTTA, M. G.; ANTONINO, J. D.; GOMES, T. G.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; MILLER, R. N. G. Transcriptome profiling of the resistance response of Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4 to Pseudocercospora musae. International Journal of Molecular Sciences, v. 23, 2022. 13589.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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79. | | MIOTTO, Y. E.; TESSELE, C.; CZERMAINSKI, A. B. C.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. da S.; SARTOR, T.; CATTANI, A. M.; DELATORRE, C. A.; ALENCAR, S. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRYNBERG, P.; OLIVEIRA, P. R. D. de; KVITSCHAL, M. V.; DENARDI, F.; BUFFON, V.; REVERS, L. F. Spring is coming: genetic analyses of the bud break date locus reveal candidate genes from the cold perception pathway to dormancy release in apple (Malus x domestica Borkh.) Frontiers in Plant Science, v. 10, article 33, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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80. | | ARRAES, F. B. M.; VASQUEZ, D. D. N.; TAHIR, M.; PINHEIRO, D. H.; FAHEEM, M.; FREITAS-ALVES, N. S.; MOREIRA-PINTO, C. E.; MOREIRA, V. J. V.; PAES-DE-MELO, B.; LISEI-DE-SA, M. E.; MORGANTE, C. V.; MOTA, A. P. Z.; LOURENCO, I. T.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; FRAGOSO, R. da R.; ALMEIDA-ENGLER, J. de; LARSEN, M. R.; GROSSI-DE-SA, M. F. Integrated omic approaches reveal molecular mechanisms of tolerance during soybean and meloidogyne incognita interactions. Plants, v. 11, 2744, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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