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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
Data corrente: |
11/04/2003 |
Data da última atualização: |
11/04/2003 |
Autoria: |
CIAMPI, A. Y.; BRONDANI, R. P. V.; GRATTAPAGLIA, D. |
Afiliação: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Título: |
Otimização de sistemas fluorescentes de genotipagem mltiloco e desenvolvimento de marcadores microssatélites para Copaifera Langsdorffii Desf. (Copaíba) Leguminosae - Caesalpinoideae. |
Ano de publicação: |
2000 |
Fonte/Imprenta: |
Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2000. |
Páginas: |
40 p. |
Série: |
(Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa, 16). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Microssatelites contituem marcadores genéticos altamente informativos para estudos de genética de populações pela sua natureza co-dominante, multialélica e pela ampla distribuição no genoma. Marcadores microssatélites foram desenvolvidos para Copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para seqüências simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridização de colônia e seqüenciados. Para 34% dos clones seqüenciados foi possível desenhar pares de primers específicos (de 17 a 20 bases) complementares às seqüências únicas que flanqueiam o microssatélite. Utilizando-se um único programa de PCR, 26 locos microssatélites foram verificados a partir dos 45 pares de primers desenhados. Uma resolução e identificação robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com detecção a laser de fluorescências multi coloridas em seqüenciador automatico. Oito locos resolvidos em três sistemas "multiplex" foram caracterizados para conteúdo informativo a partir de genótipos obtidos para 96 indivíduos adultos das populações de matas de galeria. Verificou-se uma média de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteúdo informativo com heterozigosidade média observada (Ho) de 0,89 e heterozigosidade média esperada (He) de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de copaíba, foram estimados a probabilidade de identidade (I) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11 x 10 -15 e o poder de exclusão (Q) de 0,7093 a 0,88536, com valor combinado de 99,999993%. Marcadores SSR para copaíba abrem uma ampla perspectiva para a geração de dados precisos sobre estrutura genética, fluxo gênico e paternidade em populações naturais. Estas informações serão fundamentais para dar suporte a programas de coleta e conservação in situ e ex situ desta espécie. MenosMicrossatelites contituem marcadores genéticos altamente informativos para estudos de genética de populações pela sua natureza co-dominante, multialélica e pela ampla distribuição no genoma. Marcadores microssatélites foram desenvolvidos para Copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para seqüências simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridização de colônia e seqüenciados. Para 34% dos clones seqüenciados foi possível desenhar pares de primers específicos (de 17 a 20 bases) complementares às seqüências únicas que flanqueiam o microssatélite. Utilizando-se um único programa de PCR, 26 locos microssatélites foram verificados a partir dos 45 pares de primers desenhados. Uma resolução e identificação robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com detecção a laser de fluorescências multi coloridas em seqüenciador automatico. Oito locos resolvidos em três sistemas "multiplex" foram caracterizados para conteúdo informativo a partir de genótipos obtidos para 96 indivíduos adultos das populações de matas de galeria. Verificou-se uma média de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteúdo informativo com heterozigosidade média observada (Ho) de 0,89 e heterozigosidade média esperada (He) de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de copaíba, foram estimados a probabilidade de identidade (I) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11 x 10 -15 e o poder de exclusão (Q) de 0,7093 a 0,... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Microsatelite. |
Thesagro: |
Copaíba; Copaifera Langsdorffii; Marcador Genético. |
Thesaurus Nal: |
genetic markers. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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Registros recuperados : 383 | |
104. | | CIAMPI, A. Y.; GAIOTTO, F. A.; MARQUES, C. M.; WALTER, B. M. T.; GRATTAPAGLIA, D. A. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) for population genetics studies of tropical trees. Brazilian Journal of Genetics, Ribeirao Preto, v.19, n.3, p.284, 1996. Supplement.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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105. | | LOURENÇO, R. T.; CUNHA, A. F.; TSUKUMO, F.; PEREIRA, G. A. G.; GRATTAPAGLIA, D. Análise da composição e organização do genoma de Eucalyptus grandis com base em sequenciamento "shotgun" por amostragem ("sample sequencing"). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 30.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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106. | | SANSALONI, C. P.; MAMANI, E. M.; PAPPAS, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Análise populacional e mapeamento genético de microssatélites tetra e pentanucleotídeos em espécies de Eucalyptus. In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 158.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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107. | | NEVES, L. G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PAQUALI, G.; KIRST, M.; GRATTAPAGLIA, D. Advancing to a high density gene-rich map based on single feature polymorphisms in tropical eucalyptus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. W185Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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108. | | SILVA, A. G.; GAIOTTO, F. A.; CIAMPI, A. Y.; GRATTAPAGLIA, D. Análise de genética populacional de duas espécies de palmito (Euterpe edulis E Euterpe oleracea) utilizando microssatélites. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 5., 2000, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2000. p. 42.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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109. | | VAZ, A. R. C.; BRONDANI, R. P. V.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; GRATTAPAGLIA, D. Ancoragem do mapa genético no mapa físico utilizando marcadores microssatélites a partir de uma biblioteca de BACs de Eucalyptus grandis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1167.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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113. | | AZEVEDO, V. C. R.; KANASHIRO, M.; GRATTAPAGLIA, D.; CIAMPI, A. Y. Caracterização genética molecular de maçaranduba - anilkara huberi (Ducke) A.Chev. (Sapotaceae): potencial implicação na definição de um programa de manejo sustentável. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 159.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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116. | | LAVIOLA, B. G.; ALVES, A. A.; ROSADO, T. B.; GRATTAPAGLIA, D.; BHERING, L. L. Breeding jatropha by genomic selection: a pilot assessment of accuracy of predictive models. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. P707.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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117. | | LAVIOLA, B. G.; ALVES, A. A.; ROSADO, T. B.; GRATTAPAGLIA, D.; BHERING, L. L. Breeding jatropha by genomic selection: a pilot assessment of accuracy of predictive models. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. Abstracts... California: Quartzy, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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119. | | LAU, E. Y.; SOARES, B. L.; MELO, J. O.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; GRATTAPAGLIA, D. Caracterização estrutural de uma região genômica de Eucalyptus grandis que contém uma família gênica que codifica xiloglucana endotransglicosilases/hidrolases. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1235.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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120. | | CUPERTINO, F. B.; LEAL, J. B.; GRATTAPAGLIA, D.; GAIOTTO, F. A. Certificação de paternidade e maternidade em famílias de Eucalyptus spp por meio de marcadores microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 937.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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