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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
07/12/2022 |
Data da última atualização: |
06/01/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SANTOS, C. A. F.; COSTA, S. R. da; BOITEUX, L. S.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da. |
Afiliação: |
CARLOS ANTONIO FERNANDES SANTOS, CPATSA; SONIANE RODRIGUES DA COSTA, Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, Bahia; LEONARDO SILVA BOITEUX, CNPH; DARIO GRATTAPAGLIA, Cenargen; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen. |
Título: |
Genetic associations with resistance to Meloidogyne enterolobii in guava (Psidium sp.) using cross-genera SNPs and comparative genomics to Eucalyptus highlight evolutionary conservation across the Myrtaceae. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 17, n. 11, e0273959, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/ 10.1371/journal.pone.0273959 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Tropical fruit tree species constitute a yet untapped supply of outstanding diversity of taste and nutritional value, barely developed from the genetics standpoint, with scarce or no genomic resources to tackle the challenges arising in modern breeding practice. We generated a de novo genome assembly of the Psidium guajava, the super fruit “apple of the tropics”, and successfully transferred 14,268 SNP probesets from Eucalyptus to Psidium at the nucleo- tide level, to detect genomic loci linked to resistance to the root knot nematode (RKN) Meloi- dogyne enterolobii derived from the wild relative P. guineense. Significantly associated loci with resistance across alternative analytical frameworks, were detected at two SNPs on chromosome 3 in a pseudo-assembly of Psidium guajava genome built using a syntenic path approach with the Eucalyptus grandis genome to determine the order and orientation of the contigs. The P. guineense-derived resistance response to RKN and disease onset is conceivably triggered by mineral nutrients and phytohormone homeostasis or signaling with the involvement of the miRNA pathway. Hotspots of mapped resistance quantitative trait loci and functional annotation in the same genomic region of Eucalyptus provide further indirect support to our results, highlighting the evolutionary conservation of genomes across genera of Myrtaceae in the adaptation to pathogens. Marker assisted introgression of the resistance loci mapped should accelerate the development of improved guava cultivars and hybrid rootstocks. MenosTropical fruit tree species constitute a yet untapped supply of outstanding diversity of taste and nutritional value, barely developed from the genetics standpoint, with scarce or no genomic resources to tackle the challenges arising in modern breeding practice. We generated a de novo genome assembly of the Psidium guajava, the super fruit “apple of the tropics”, and successfully transferred 14,268 SNP probesets from Eucalyptus to Psidium at the nucleo- tide level, to detect genomic loci linked to resistance to the root knot nematode (RKN) Meloi- dogyne enterolobii derived from the wild relative P. guineense. Significantly associated loci with resistance across alternative analytical frameworks, were detected at two SNPs on chromosome 3 in a pseudo-assembly of Psidium guajava genome built using a syntenic path approach with the Eucalyptus grandis genome to determine the order and orientation of the contigs. The P. guineense-derived resistance response to RKN and disease onset is conceivably triggered by mineral nutrients and phytohormone homeostasis or signaling with the involvement of the miRNA pathway. Hotspots of mapped resistance quantitative trait loci and functional annotation in the same genomic region of Eucalyptus provide further indirect support to our results, highlighting the evolutionary conservation of genomes across genera of Myrtaceae in the adaptation to pathogens. Marker assisted introgression of the resistance loci mapped should accelerate the development ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Meloidogyne enterolobii. |
Thesagro: |
Goiaba; Melhoramento Genético Vegetal; Myrtaceae; Psidium Guajava. |
Thesaurus Nal: |
Guavas; Psidium. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149297/1/Genetic-associations-with-resistance-to-Meloidogyne-enterolobii-in-guava-2022.pdf
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Marc: |
LEADER 02466naa a2200265 a 4500 001 2149297 005 2023-01-06 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/ 10.1371/journal.pone.0273959$2DOI 100 1 $aSANTOS, C. A. F. 245 $aGenetic associations with resistance to Meloidogyne enterolobii in guava (Psidium sp.) using cross-genera SNPs and comparative genomics to Eucalyptus highlight evolutionary conservation across the Myrtaceae.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aTropical fruit tree species constitute a yet untapped supply of outstanding diversity of taste and nutritional value, barely developed from the genetics standpoint, with scarce or no genomic resources to tackle the challenges arising in modern breeding practice. We generated a de novo genome assembly of the Psidium guajava, the super fruit “apple of the tropics”, and successfully transferred 14,268 SNP probesets from Eucalyptus to Psidium at the nucleo- tide level, to detect genomic loci linked to resistance to the root knot nematode (RKN) Meloi- dogyne enterolobii derived from the wild relative P. guineense. Significantly associated loci with resistance across alternative analytical frameworks, were detected at two SNPs on chromosome 3 in a pseudo-assembly of Psidium guajava genome built using a syntenic path approach with the Eucalyptus grandis genome to determine the order and orientation of the contigs. The P. guineense-derived resistance response to RKN and disease onset is conceivably triggered by mineral nutrients and phytohormone homeostasis or signaling with the involvement of the miRNA pathway. Hotspots of mapped resistance quantitative trait loci and functional annotation in the same genomic region of Eucalyptus provide further indirect support to our results, highlighting the evolutionary conservation of genomes across genera of Myrtaceae in the adaptation to pathogens. Marker assisted introgression of the resistance loci mapped should accelerate the development of improved guava cultivars and hybrid rootstocks. 650 $aGuavas 650 $aPsidium 650 $aGoiaba 650 $aMelhoramento Genético Vegetal 650 $aMyrtaceae 650 $aPsidium Guajava 653 $aMeloidogyne enterolobii 700 1 $aCOSTA, S. R. da 700 1 $aBOITEUX, L. S. 700 1 $aGRATTAPAGLIA, D. 700 1 $aSILVA JUNIOR, O. B. da 773 $tPLoS ONE$gv. 17, n. 11, e0273959, 2022.
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Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Registros recuperados : 47 | |
2. | | TAVARES-DIAS, M.; AFFONSO, E. G.; OLIVEIRA, S. R.; MARCON, J. L.; EGAMI, M. I. Comparative study on hematological parameters of farmed matrinxã, Brycon amazonicus Spix and Agassiz, 1829 (Characidae: Bryconinae) with others Bryconinae species. Acta Amazonica, v. 38, n. 4, p. 799-806, dez. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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3. | | TAVARES-DIAS, M.; SILVA, M. G.; OLIVEIRA, A. T.; OLIVEIRA JÚNIOR, A. A.; MARCON, J. L. Propriedades do sangue de três espécies de quelônios do gênero Podocnemis de vida livre da Reserva Biológica do Abufari, baixo rio Purus, Estado do Amazonas, Brasil. In: SILVA-SOUZA, A. T.; LIZAMA, M. de A. P.; TAKEMOTO, R. M. (Org.). Patologia e sanidade de organismos aquáticos. Maringá: ABRAPOA, 2012. Cap. 9, p. 195-220.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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5. | | OLIVEIRA, A. T. de; SANTOS, M. Q. de C.; LEMOS, J. R. G.; TAVARES-DIAS, M.; MARCON, J. L. Comparison of the effects of anticoagulants used in blood collection to determine blood parameters of free-living stingrays from the Potamotrygon genus (Elasmobranchii: Potamotrygonidae). Biota Amazônia, Macapá, v. 5, n. 3, p. 55-58, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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7. | | DRUMOND, G. V. F.; CAIXEIRO, A. P. de A.; DIAS, M. T.; MARCON, J. L.; AFFONSO, E. G. Características bioquímicas e hematológicas do pirarucu Arapaima gigas Schinz, 1822 (Arapaimidae) de cultivo semi-intensivo na Amazônia. Acta Amazonica, Manaus, v. 40, n. 3, p. 591-596, set. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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8. | | OLIVEIRA, A. T.; LEMOS, J. R. G.; ARAÚJO, M. L. G.; TAVARES-DIAS, M.; MARCON, J. L. Morfometria das células sanguíneas de arraias de água doce do médio Rio Negro, Amazonas. In: ENCONTRO DA SOCIEDADE BRASILEIRA PARA O ESTUDO DE ELASMOBRÂNQUIOS, 7., 2011, Rio Grande. Resumos... Rio Grande: SBEEL, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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9. | | OLIVEIRA, A. T.; SALES, R. S. A.; LEMOS, J. R. G.; SANTOS, M. Q. N.; ARAÚJO, M. L. G.; TAVARES-DIAS, M.; MARCON, J. L. Anticoagulantes provocam alterações nos níveis plasmáticos de glicose e proteínas totais na arraia cururu? In: ENCONTRO DA SOCIEDADE BRASILEIRA PARA O ESTUDO DE ELASMOBRÂNQUIOS, 7., 2011, Rio Grande. Resumos... Rio Grande: SBEEL, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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10. | | SANTOS, M. Q. de C.; OLIVEIRA, A. T. de; BRASIL, E. M.; CARMO, I. B. do; TAVARES-DIAS, M.; AFFONSO, E. G.; MARCON, J. L. Aspectos citoquimicos das células sanguineas de matrinxâ (Brycon amazonicus Spix & Agassiz, 1829) (Characidae: Bryconinae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21., 2011, Maceió. Inovações tecnológicas e mercado consumidor: anais. Maceió: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2011. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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11. | | OLIVEIRA, A. T.; ARAÚJO, M. L. G.; PANTOJA-LIMA, J.; ARIDE, P. H. R.; TAVARES-DIAS, M.; BRINN, R. P.; MARCON, J. L. Cyrilia sp. (Apicomplexa: Haemogregarinidae) in the Amazonian freshwater stingray Potamotrygon wallacei (cururu stingray) in different hydrological phases of the Rio Negro. Brazilian Journal of Biology, v. 77, n. 2, p. 413-416, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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12. | | OLIVEIRA, A. T.; NASCIMENTO, R. B.; PEREIRA, C. N.; SALES, R. S. A.; LEMOS, J. R. G.; SANTOS, M. Q. N.; TAVARES-DIAS, M.; MARCON, J. L. Comparação do uso de três anticoagulantes sobre o eritrograma da arraia Potamotrygon sp. (arraia cururu). In: ENCONTRO DA SOCIEDADE BRASILEIRA PARA O ESTUDO DE ELASMOBRÂNQUIOS, 7., 2011, Rio Grande. Resumos... Rio Grande: SBEEL, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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13. | | SANTOS, M. Q. de C.; OLIVEIRA, A. T. de; LEMOS, J. R. G.; SILVA, M. G. da; DIAS, M. T.; MARCON, J. L. Características hematológicas do jacaré-açu Melanosuchus niger Spix, 1825 (Crocodylia, Alligatoridae) da Bacia do Rio Negro, Amazonas, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 62., 2010, Natal. Ciências do mar: herança para o futuro: anais/resumos. [s.l.]: SBPC, 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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14. | | SANTOS, M. Q. C.; OLIVEIRA, A. T.; SALES, R. S. A.; CARMO, I. B.; TAVARES-DIAS, M.; AFFONSO, E. G.; MARCON, J. L. Caracterização morfológica das células sanguíneas da irapuca (Testudines, Podocnemididae) do Médio Rio Negro, Amazonas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA DE PESCA, 17., 2011, Belém, PA. Engenharia de pesca: construindo o desenvolvimento sustentável do setor pesqueiro nacional: [anais]. Belém, PA: AEP: FAEP, 2011.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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15. | | OLIVEIRA, A. T.; SANTOS, M. Q. C.; LEMOS, J. R. G.; ARAÚJO, M. L. G.; DIAS, M. T.; MARCON, J. L. Eritrograma e bioquímica do plasma da arraia Paratrygon aiereba (Chondrichthyes: Potamotrygonidae) do Arquipélago Mariuá, médio Rio Negro, Amazonas. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE PATOLOGISTAS DE ORGANISMOS AQUÁTICOS, 11., 2010, Campinas. [Anais...]. Maringá: ABRAPOA; Campinas: UNICAMP, 2010. ENBRAPOA. Resumo simples.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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16. | | OLIVEIRA, A. T.; ARAÚJO, M. L. G.; LEMOS. J. R. G.; SANTOS, M. Q. C.; PANTOJA-LIMA, J.; ARIDE, P. H. R.; TAVARES-DIAS, M.; MARCON, J. L. Ecophysiological interactions and water-related physicochemical parameters among freshwater stingrays. Brazilian Journal of Biology, v. 77, n. 3, p. 616-627, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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17. | | OLIVEIRA, A. T. de; ARAÚJO, M. L. G. de; LEMOS, J. R. G. de; ARIDE, P. H. R.; LIMA, J. P.; TAVARES- DIAS, M.; MARCON, J. L. O estado atual sobre o conhecimento de arrais Potamotrygonidae. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINÁRIA, 41.; CONGRESSO DE MEDICINA VETERINÁRIA MILITAR, 14.; CONGRESSO DE AQUICULTURA, 10.; ENCONTRO DE SAÚDE PÚBLICA DO CONESUL, 2; FEIRA DE PRODUTOS E SERVIÇOS, 17., 2014, Gramado. Um mundo, uma saúde: anais. Porto Alegre: Sociedade de Veterinária do Rio Grande do Sul, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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18. | | SANTOS, M. Q. de C.; OLIVEIRA, A. T. de; LEMOS, J. R. G.; TAVARES-DIAS, M.; AFFONSO, E. G.; MARCON, J. L. Morfologia das células sanguíneas do jacaré-tinga Caiman crocodilus crocodilus Linnaeus, 1758 (Crocodylia, Alligatoridae). In: AQUACIÊNCIA, 2010, Recife. Anais... Recife: AQUABIO, UFRPE, 2010. Resumo simples.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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19. | | OLIVEIRA, A. T.; CRUZ, W. R.; PANTOJA- LIMA, J.; ARAÚJO, S. B.; ARAÚJO, M. L. G.; MARCON, J. L.; TAVARES-DIAS, M. Morphological and cytochemical characterization of thrombocytes and leukocytes in hatchlings of three species of Amazonian freshwater turtles. Veterinarski Arhiv, v. 81, n. 5, p. 657-670, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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20. | | OLIVEIRA, A. T.; SANTOS, M. Q. C.; LEMOS, J. R. G.; SALES, R. S. A.; DIAS, M. T.; MARCON, J. L. Parâmetros hematológicos e bioquímicos de Podocnemis erythrocephala (Reptilia: Podocnemididae) do Arquipélago de Mariuá, médio Rio Negro, Amazonas. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE PATOLOGISTAS DE ORGANISMOS AQUÁTICOS, 11., 2010, Campinas. [Anais...]. Maringá: ABRAPOA; Campinas: UNICAMP, 2010. ENBRAPOA. Resumo simples.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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