| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
|
Data corrente: |
13/08/2021 |
|
Data da última atualização: |
29/12/2021 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
RIBEIRO, V. M. P.; GOUVEIA, G. C.; MORAES, M. M. de; ARAÚJO, A. E. M. de; RAIDAN, F. S. S.; FONSECA, P. A. de S.; CARDOSO, E. P.; SILVA, M. V. G. B.; TORAL, F. L. B. |
|
Afiliação: |
VIRGÍNIA MARA PEREIRA RIBEIRO, Universidade Federal de Minas Gerais; GABRIELA CANABRAVA GOUVEIA, Universidade Federal de Minas Gerais; MARIANA MAMEDES DE MORAES, Universidade Federal de Minas Gerais; ANDRESA EVA MELO DE ARAÚJO, Universidade Federal de Minas Gerais; FERNANDA SANTOS SILVA RAIDAN, CSIRO Tasmania, Australia; PABLO AUGUSTO DE SOUZA FONSECA, University of Guelph; EDUARDO PENTEADO CARDOSO; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; FABIO LUIZ BURANELO TORAL, Universidade Federal de Minas Gerais. |
|
Título: |
Genes underlying genetic correlation between growth, reproductive and parasite burden traits in beef cattle. |
|
Ano de publicação: |
2021 |
|
Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 244, 104332, 2021. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.livsci.2020.104332 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Genetic correlation is the outcome of linkage disequilibrium and/or pleiotropic genes. As such, identifying which genes take part in the genetic control of genetically correlated traits can help us better understand the relationship between economic traits and promote more efficient breeding programs. We aim to estimate the genetic correlations between growth, reproduction and parasite burden traits and to identify functional candidate genes (FCG) underlying these correlations. Six traits were evaluated, comprising two of growth (body weight - BW and average daily gain - ADG), one reproductive trait (scrotal circumference - SC) and three related to parasite burden (tick count - TICK, gastrointestinal nematode eggs per gram of feaces - GIN, and Eimeria spp. oocysts per gram of faeces - EIM). The genetic correlations were estimated using a multiple-trait model. A total of 21,667 SNP markers were used to perform a single-step GWAS and to identify genomic windows explaining at least 1% of the genetic variance for the studied traits. The posterior means and highest posterior density intervals of the genetic correlations were positive and of moderate magnitudes for the pairs of traits BW-ADG (0.64; 0.52, 0.76), BW-SC (0.38; 0.26, 0.50), BW-TICK (0.39; 0.25, 0.76), ADG-SC (0.27; 0.11, 0.43), and TICK-EIM (0.33; 0.12, 0.53). Only the pair ADG-EIM presented a negative correlation (-0.22; -0.39, -0.05). All the other pairs showed genetic correlations close to zero. Additionally, functional analyses were performed and FCGs were selected based on their roles in biological processes for each of the traits. The effects of the SNPs were calculated as a proportion of the genetic standard deviation. Seven FCGs (SLC16A4, KCNA2, LAMTOR5, DUSP10, MAP3K1, TPMT, and KIF13A) were identified for more than one trait. Regardless of the genetic correlation values (lowmoderate), there were FCGs which could influence both correlated traits. There were SNPs mapped in FCGs that might be used to promote genetic improvement in multiple traits. There are common FCGs that might control production, reproduction and parasite burden traits in beef cattle and contribute to genetic correlation values. MenosGenetic correlation is the outcome of linkage disequilibrium and/or pleiotropic genes. As such, identifying which genes take part in the genetic control of genetically correlated traits can help us better understand the relationship between economic traits and promote more efficient breeding programs. We aim to estimate the genetic correlations between growth, reproduction and parasite burden traits and to identify functional candidate genes (FCG) underlying these correlations. Six traits were evaluated, comprising two of growth (body weight - BW and average daily gain - ADG), one reproductive trait (scrotal circumference - SC) and three related to parasite burden (tick count - TICK, gastrointestinal nematode eggs per gram of feaces - GIN, and Eimeria spp. oocysts per gram of faeces - EIM). The genetic correlations were estimated using a multiple-trait model. A total of 21,667 SNP markers were used to perform a single-step GWAS and to identify genomic windows explaining at least 1% of the genetic variance for the studied traits. The posterior means and highest posterior density intervals of the genetic correlations were positive and of moderate magnitudes for the pairs of traits BW-ADG (0.64; 0.52, 0.76), BW-SC (0.38; 0.26, 0.50), BW-TICK (0.39; 0.25, 0.76), ADG-SC (0.27; 0.11, 0.43), and TICK-EIM (0.33; 0.12, 0.53). Only the pair ADG-EIM presented a negative correlation (-0.22; -0.39, -0.05). All the other pairs showed genetic correlations close to zero. Additionally, funct... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Correlação genética. |
|
Thesagro: |
Bovino; Gado de Corte; Gado Nelore; Gene; Genética Animal; Melhoramento Genético Animal. |
|
Thesaurus Nal: |
Body weight; Parasites; Pleiotropy. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
Marc: |
LEADER 03235naa a2200349 a 4500
001 2133525
005 2021-12-29
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.livsci.2020.104332$2DOI
100 1 $aRIBEIRO, V. M. P.
245 $aGenes underlying genetic correlation between growth, reproductive and parasite burden traits in beef cattle.$h[electronic resource]
260 $c2021
520 $aGenetic correlation is the outcome of linkage disequilibrium and/or pleiotropic genes. As such, identifying which genes take part in the genetic control of genetically correlated traits can help us better understand the relationship between economic traits and promote more efficient breeding programs. We aim to estimate the genetic correlations between growth, reproduction and parasite burden traits and to identify functional candidate genes (FCG) underlying these correlations. Six traits were evaluated, comprising two of growth (body weight - BW and average daily gain - ADG), one reproductive trait (scrotal circumference - SC) and three related to parasite burden (tick count - TICK, gastrointestinal nematode eggs per gram of feaces - GIN, and Eimeria spp. oocysts per gram of faeces - EIM). The genetic correlations were estimated using a multiple-trait model. A total of 21,667 SNP markers were used to perform a single-step GWAS and to identify genomic windows explaining at least 1% of the genetic variance for the studied traits. The posterior means and highest posterior density intervals of the genetic correlations were positive and of moderate magnitudes for the pairs of traits BW-ADG (0.64; 0.52, 0.76), BW-SC (0.38; 0.26, 0.50), BW-TICK (0.39; 0.25, 0.76), ADG-SC (0.27; 0.11, 0.43), and TICK-EIM (0.33; 0.12, 0.53). Only the pair ADG-EIM presented a negative correlation (-0.22; -0.39, -0.05). All the other pairs showed genetic correlations close to zero. Additionally, functional analyses were performed and FCGs were selected based on their roles in biological processes for each of the traits. The effects of the SNPs were calculated as a proportion of the genetic standard deviation. Seven FCGs (SLC16A4, KCNA2, LAMTOR5, DUSP10, MAP3K1, TPMT, and KIF13A) were identified for more than one trait. Regardless of the genetic correlation values (lowmoderate), there were FCGs which could influence both correlated traits. There were SNPs mapped in FCGs that might be used to promote genetic improvement in multiple traits. There are common FCGs that might control production, reproduction and parasite burden traits in beef cattle and contribute to genetic correlation values.
650 $aBody weight
650 $aParasites
650 $aPleiotropy
650 $aBovino
650 $aGado de Corte
650 $aGado Nelore
650 $aGene
650 $aGenética Animal
650 $aMelhoramento Genético Animal
653 $aCorrelação genética
700 1 $aGOUVEIA, G. C.
700 1 $aMORAES, M. M. de
700 1 $aARAÚJO, A. E. M. de
700 1 $aRAIDAN, F. S. S.
700 1 $aFONSECA, P. A. de S.
700 1 $aCARDOSO, E. P.
700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
700 1 $aTORAL, F. L. B.
773 $tLivestock Science$gv. 244, 104332, 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
|
Data corrente: |
01/12/2023 |
|
Data da última atualização: |
01/12/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SILVA, T. E. de M.; MORAIS, R. B.; SOARES, A. A. V.; PROTÁSSIO, T. de P.; GONÇALVES, D. de A.; ARRIEL, D. A. A. |
|
Afiliação: |
TAYLLOR EDUARDO DE MACÊDO SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA; ROBERTA BARBOSA MORAIS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA; ALVARO AUGUSTO VIEIRA SOARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA; THIAGO DE PAULA PROTÁSSIO, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DA AMAZÔNIA; DELMAN DE ALMEIDA GONCALVES, CPATU; DANIELE APARECIDA ALVARENGA ARRIEL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA. |
|
Título: |
Modelagem da relação hipsométrica em testes de procedências e progênies de Tachigali vulgaris. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS AGRÁRIAS E AMBIENTAIS, 10., 2023, Monte Carmelo. Anais... [Uberlândia: UFU], 2023. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Tachigali vulgaris (tachi-branco) é uma espécie nativa que vem ganhando espaço entre espécies potenciais da silvicultura. Pesquisas têm mostrado sua adequabilidade ao estabelecimento de plantios puros em especial para fins de energia da biomassa. Dentre a demanda de informação para o manejo desta espécie está a construção de modelos preditivos acurados, que estimem variáveis de difícil medição em função das de fácil medição. Neste estudo, avaliou-se um grupo de modelos estatísticos para a estimação da altura total (ht) das árvores em função de seu diâmetro a 1,30 m de altura (dap) em três testes de procedência e progênies de tachi-branco instalados nos estados do Pará e Amapá. Por volta dos 10 anos de idade, mediu-se a ht e o dap de todas as árvores. Na análise, 70% dos dados foram utilizados para o ajuste dos modelos e 30% para validação. As estatísticas de qualidade (EQ) utilizadas para avaliar e comparar a acurácia dos modelos tanto para a partição do ajuste quanto da validação foram: raiz quadrada do erro quadrático médio (RQEM), média das diferenças absolutas (MDA) e coeficiente de correlação de Pearson entre valores observados e estimados (ryy). Os modelos apresentaram valores de EQ similares a de espécies florestais silviculturais, como o eucalipto. Ao comparar as EQ do ajuste, o modelo de Gompertz apresentou-se como mais acurado, muito embora não tenha havida diferença marcante entre os demais. Tampouco houve grande diferença entre as EQ da validação sendo Chapman & Richards e Campos & Leite 1, ligeiramente mais acurados. MenosTachigali vulgaris (tachi-branco) é uma espécie nativa que vem ganhando espaço entre espécies potenciais da silvicultura. Pesquisas têm mostrado sua adequabilidade ao estabelecimento de plantios puros em especial para fins de energia da biomassa. Dentre a demanda de informação para o manejo desta espécie está a construção de modelos preditivos acurados, que estimem variáveis de difícil medição em função das de fácil medição. Neste estudo, avaliou-se um grupo de modelos estatísticos para a estimação da altura total (ht) das árvores em função de seu diâmetro a 1,30 m de altura (dap) em três testes de procedência e progênies de tachi-branco instalados nos estados do Pará e Amapá. Por volta dos 10 anos de idade, mediu-se a ht e o dap de todas as árvores. Na análise, 70% dos dados foram utilizados para o ajuste dos modelos e 30% para validação. As estatísticas de qualidade (EQ) utilizadas para avaliar e comparar a acurácia dos modelos tanto para a partição do ajuste quanto da validação foram: raiz quadrada do erro quadrático médio (RQEM), média das diferenças absolutas (MDA) e coeficiente de correlação de Pearson entre valores observados e estimados (ryy). Os modelos apresentaram valores de EQ similares a de espécies florestais silviculturais, como o eucalipto. Ao comparar as EQ do ajuste, o modelo de Gompertz apresentou-se como mais acurado, muito embora não tenha havida diferença marcante entre os demais. Tampouco houve grande diferença entre as EQ da validação sendo Chapman & ... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Mensuração florestal; Modelos preditivos; Tachi-branco. |
|
Thesagro: |
Biomassa; Energia; Manejo; Taxi Branco. |
|
Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159023/1/MODELAGEM-DA-RELACAO.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02422nam a2200253 a 4500
001 2159023
005 2023-12-01
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, T. E. de M.
245 $aModelagem da relação hipsométrica em testes de procedências e progênies de Tachigali vulgaris.$h[electronic resource]
260 $aIn: SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS AGRÁRIAS E AMBIENTAIS, 10., 2023, Monte Carmelo. Anais... [Uberlândia: UFU]$c2023
520 $aTachigali vulgaris (tachi-branco) é uma espécie nativa que vem ganhando espaço entre espécies potenciais da silvicultura. Pesquisas têm mostrado sua adequabilidade ao estabelecimento de plantios puros em especial para fins de energia da biomassa. Dentre a demanda de informação para o manejo desta espécie está a construção de modelos preditivos acurados, que estimem variáveis de difícil medição em função das de fácil medição. Neste estudo, avaliou-se um grupo de modelos estatísticos para a estimação da altura total (ht) das árvores em função de seu diâmetro a 1,30 m de altura (dap) em três testes de procedência e progênies de tachi-branco instalados nos estados do Pará e Amapá. Por volta dos 10 anos de idade, mediu-se a ht e o dap de todas as árvores. Na análise, 70% dos dados foram utilizados para o ajuste dos modelos e 30% para validação. As estatísticas de qualidade (EQ) utilizadas para avaliar e comparar a acurácia dos modelos tanto para a partição do ajuste quanto da validação foram: raiz quadrada do erro quadrático médio (RQEM), média das diferenças absolutas (MDA) e coeficiente de correlação de Pearson entre valores observados e estimados (ryy). Os modelos apresentaram valores de EQ similares a de espécies florestais silviculturais, como o eucalipto. Ao comparar as EQ do ajuste, o modelo de Gompertz apresentou-se como mais acurado, muito embora não tenha havida diferença marcante entre os demais. Tampouco houve grande diferença entre as EQ da validação sendo Chapman & Richards e Campos & Leite 1, ligeiramente mais acurados.
650 $aBiomassa
650 $aEnergia
650 $aManejo
650 $aTaxi Branco
653 $aMensuração florestal
653 $aModelos preditivos
653 $aTachi-branco
700 1 $aMORAIS, R. B.
700 1 $aSOARES, A. A. V.
700 1 $aPROTÁSSIO, T. de P.
700 1 $aGONÇALVES, D. de A.
700 1 $aARRIEL, D. A. A.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
