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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
03/02/2016 |
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Data da última atualização: |
08/02/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, L. M. de; LE GUEN, V.; CERQUEIRA-SILVA, C. B. M.; SILVA, C. C.; MANTELLO, C. C.; CONSON, A. R. O.; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FIALHO, J. de F.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, P. de S.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
JOSEFINO DE FREITAS FIALHO, CPAC. |
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Título: |
Genetic diversity strategy for the management and use of rubber genetic resources: more than 1,000 wild and cultivated accessions in a 100-Genotype core collection. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, San Francisco, v. 10, n. 7, e013607, 2015. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0134607. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Abstract - The rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell. Arg.] is the only plant species worldwide that is cultivated for the commercial production of natural rubber. This study describes the genetic diversity of the Hevea spp. complex that is available in the main ex situ collections of South America, including Amazonian populations that have never been previously described. Genetic data were analyzed to determine the genetic structure of the wild populations, quantify the allelic diversity and suggest the composition of a core collection to capture the maximum genetic diversity within a minimal sample size. A total of 1,117 accessions were genotyped with 13 microsatellite markers. We identified a total of 408 alleles, 319 of which were shared between groups and 89 that were private in different groups of accessions. In a population structure and principal component analysis, the level of clustering reflected a primary division into the following two subgroups: cluster 1, which consisted of varieties from the advanced breeding germplasm that originated from the Wickham and Mato Grosso accessions; and cluster 2, which consisted of the wild germplasm from the Acre, Amazonas, Pará and Rondônia populations and Hevea spp. The analyses revealed a high frequency of gene flow between the groups, with the genetic differentiation coefficient (GST) estimated to be 0.018. Additionally, no distinct separation among the H. brasiliensis accessions and the other species from Amazonas was observed. A core collection of 99 accessions was identified that captured the maximum genetic diversity. Rubber tree breeders can effectively utilize this core collection for cultivar improvement. Furthermore, such a core collection could provide resources for forming an association panel to evaluate traits with agronomic and commercial importance. Our study generated a molecular database that should facilitate the management of the Hevea germplasm and its use for subsequent genetic and genomic breeding. MenosAbstract - The rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell. Arg.] is the only plant species worldwide that is cultivated for the commercial production of natural rubber. This study describes the genetic diversity of the Hevea spp. complex that is available in the main ex situ collections of South America, including Amazonian populations that have never been previously described. Genetic data were analyzed to determine the genetic structure of the wild populations, quantify the allelic diversity and suggest the composition of a core collection to capture the maximum genetic diversity within a minimal sample size. A total of 1,117 accessions were genotyped with 13 microsatellite markers. We identified a total of 408 alleles, 319 of which were shared between groups and 89 that were private in different groups of accessions. In a population structure and principal component analysis, the level of clustering reflected a primary division into the following two subgroups: cluster 1, which consisted of varieties from the advanced breeding germplasm that originated from the Wickham and Mato Grosso accessions; and cluster 2, which consisted of the wild germplasm from the Acre, Amazonas, Pará and Rondônia populations and Hevea spp. The analyses revealed a high frequency of gene flow between the groups, with the genetic differentiation coefficient (GST) estimated to be 0.018. Additionally, no distinct separation among the H. brasiliensis accessions and the other spec... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Estrutura genética; Genetic structure; Natural rubber. |
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Thesagro: |
Hevea Brasiliensis. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/138347/1/Josefino-genetic-diversity.pdf
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Marc: |
LEADER 03065naa a2200325 a 4500
001 2035994
005 2017-02-08
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520 $aAbstract - The rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell. Arg.] is the only plant species worldwide that is cultivated for the commercial production of natural rubber. This study describes the genetic diversity of the Hevea spp. complex that is available in the main ex situ collections of South America, including Amazonian populations that have never been previously described. Genetic data were analyzed to determine the genetic structure of the wild populations, quantify the allelic diversity and suggest the composition of a core collection to capture the maximum genetic diversity within a minimal sample size. A total of 1,117 accessions were genotyped with 13 microsatellite markers. We identified a total of 408 alleles, 319 of which were shared between groups and 89 that were private in different groups of accessions. In a population structure and principal component analysis, the level of clustering reflected a primary division into the following two subgroups: cluster 1, which consisted of varieties from the advanced breeding germplasm that originated from the Wickham and Mato Grosso accessions; and cluster 2, which consisted of the wild germplasm from the Acre, Amazonas, Pará and Rondônia populations and Hevea spp. The analyses revealed a high frequency of gene flow between the groups, with the genetic differentiation coefficient (GST) estimated to be 0.018. Additionally, no distinct separation among the H. brasiliensis accessions and the other species from Amazonas was observed. A core collection of 99 accessions was identified that captured the maximum genetic diversity. Rubber tree breeders can effectively utilize this core collection for cultivar improvement. Furthermore, such a core collection could provide resources for forming an association panel to evaluate traits with agronomic and commercial importance. Our study generated a molecular database that should facilitate the management of the Hevea germplasm and its use for subsequent genetic and genomic breeding.
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700 1 $aMORAES, M. L. T. de
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700 1 $aSOUZA, A. P. de
773 $tPlos One, San Francisco$gv. 10, n. 7, e013607, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 112 | |
| 62. |  | SILVEIRA, D. M. de S.; SANTOS, K. C. F. dos; CARVALHO, M. de J. da S. de; SOUZA, A. da S.; OLIVEIRA, E. J. de. Duplicação cromossômica como alternativa para ganhos de produtividade em mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 63. | | SOUZA, A. da S.; SILVEIRA, D. M. de S.; ASSUNÇÃO, V. A. C.; CRUZ, J. L.; SANTOS, K. C. F. dos; CARVALHO, M. de J. da S. de. Efeito do estresse hídrico induzido por polietileno glicol (PEG) em genótipos de mandioca cultivados in vitro. CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA E FRUTICULTURA, 16., CONGRESSO LATINO-AMERICANO E CARIBENHO DE MANDIOCA, 2015, Foz do Iguaçu. Integração: segurança alimentar e geração de renda: anais. Foz do Iguaçu: SBM, 2015. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 64. | | MENDES, M. I. de S.; VILA VERDE, D. dos S.; SOUZA, A. da S.; GESTEIRA, A. da S.; SOARES FILHO, W. dos S.; SANTOS, K. C. F. dos. Efeito do sorbato de potássio no cultivo in vitro de citros. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 17., 2017 Ciência e Empreendedorismo : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2017. 137p. 1p. Biotecnologia| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 66. | | LIMA, M. H. F.; SOUZA, J. R. de; CAMARA, J. V. S.; SANTOS, K. C. dos; COSTA, I. R. M.; BOAVENTURA, H. da S.; COLOMBARI FILHO, J. M. Tipos de resistência e mecanismos envolvidos em genótipos de arroz ao ataque de Sitophilus oryzae Linnaeus (1973) (Coleoptera: Curculionidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 28., 2022, Fortaleza. Anais... Fortaleza: SEB, 2022. p. 600.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 67. | | SANTOS, K. C. F. dos; ASSUNÇÃO, V. A. C.; CARVALHO, M. de J. da S. de; SOUZA, A. da S.; GOMES, V. B.; MENDONÇA, J. de O. Stimulate®: fonte alternativa de reguladores de crescimento para a micropropagação da mandioca (MANIHOT ESCULENTA CRANTZ). CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA E FRUTICULTURA, 16., CONGRESSO LATINO-AMERICANO E CARIBENHO DE MANDIOCA, 2015, Foz do Iguaçu. Integração: segurança alimentar e geração de renda: anais. Foz do Iguaçu: SBM, 2015. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 68. | | SANTOS, K. C. L. dos; NASCIMENTO, E. O.; SANTOS, G. B.; OLIVEIRA, D. R.; SILVA, R. L. S.; CARVALHO, B. C. de; ARBEX, W. A. Visão Computacional Aplicada à Pecuária de Precisão para Determinação da Escore Corporal em Bovinos. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 13., 2015, Porto Alegre. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 71. | | SAMPAIO, E. dos S.; SÁ, J. F. de; SOUZA, A. da S.; SANTOS, K. C. F. dos; ALVES, A. A. C.; LEDO, C. A. da S. Multiplicação in vitro da espécie silvestre de mandioca Manihot tristis Müll. Arg. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 17., 2017 Ciência e Empreendedorismo : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2017. 137p. 1p. Recursos Genéticos| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 72. | | SANTOS, K. C.; MAGALHÃES, A. L. R.; SILVA, D. K. A.; ARAUJO, G. G. L. de; FAGUNDES, G. M.; YBARRA, N. G.; ABDALLA, A. L. Nutritional potential of forage species found in Brazilian Semiarid region. Livestock Science, v. 195, 118-124, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 73. | | HORA, R. L A. C. da; SOUZA, A. da S.; SANTOS, K. C. F. dos; SILVEIRA, H. F. da; ROCHA, H. S. Micropropagação da mandioca (Manihot esculenta Crantz) : uma técnica consolidada para a multiplicação in vitro de variedades. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, BA, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 74. | | SANTIAGO, R. T.; SANTOS, K. C. F. dos; LEDO, C. A. da S.; GESTEIRA, A. da S.; SOARES FILHO, W. dos S.; SOUZA, A. da S. Micropropagation of different citrus rootstocks using WPM medium culture. Journal of Agricultural Science, v. 11, n, 4, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 75. | | GALINDO, G. M.; OLIVEIRA, L. P. de; MAGALHÃES, A. L. R.; TEODORO, A. L.; ANDRADE, A. P. de; ARAUJO, G. G. L. de; SANTOS, K. C. dos; NASCIMENTO, D. B. do. Atributos químico-bromatológicos, cinética de degradação e digestibilidade in vitro da matéria seca da Poincianella bracteosa (Tul) L. P. Queiroz. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 787-789. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 76. | | NOBRE, L. V. C.; MENDES, M. I. DE S.; VILA VERDE, D. dos S.; PINTO, C. R.; SOUZA, A. da S.; SANTOS, K. C. F. dos; SOARES FILHO, W. dos S. Ajuste de fatores do meio de cultura para a micropropagação do porta-enxerto de citros Citrandarin Índio. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 13., 2019. Foco e valor : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura,2019. 119 p. il.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 77. | | Mendonça, J. de O.; LEDO, C. A. da S.; SOUZA, A. da S.; Carvalho, M. de J. da S. de; SANTOS, K. C. F. dos; Mendes, M. I. de S. Ambientes de cultivo in vitro favoráveis ao processo de aclimatização da mandioca. CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA E FRUTICULTURA, 16., CONGRESSO LATINO-AMERICANO E CARIBENHO DE MANDIOCA, 2015, Foz do Iguaçu. Integração: segurança alimentar e geração de renda: anais. Foz do Iguaçu: SBM, 2015. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 78. | | OLIVEIRA JUNIOR, J. S. de; CARDOSO, C. J. T.; SILVA, W. A. L. da; KISCHEL, H.; SOUZA, M. B.; ANDRADE, E. R.; NOGUEIRA, E.; SANTOS, K. C. S.; SENEDA, M. M.; STERZA, F. DE A. M. Antral follicles population in heifers and cows of Nelore and Girolando breeds. Semina, Ciências Agrárias, Londrina, v. 36, n. 6, p. 3741-3750, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 79. | | PINTO, C. R.; NOBRE, L. V. C.; MENDES, M. I. de S.; VILA VERDE, D. dos S.; SANTOS, K. C. F. dos; SOUZA, A. da S.; SOARES FILHO, W. dos S. Avaliação do período de germinação de sementes e desenvolvimento in vitro de genótipos de citros. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 14., 2020. Ciência em tempos de crise: resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2020. 112 p. il.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 80. | | FONTENELLE, M. R.; SANTOS, K. C. B. dos; BOMFIM, C. A.; MENDES, L. S.; VALE, H. M. M. do; LIMA, C. E. P.; REIS JUNIOR, F. B. dos; CARVAL, A. D. F. de. Bacterial characterization in biofertilizer Hortbio®. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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