| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
|
Data corrente: |
01/08/2023 |
|
Data da última atualização: |
03/08/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
KOLTUN, A.; SILVA, N. V. e; ANGELOTTI-MENDONÇA, J.; MARIN, S. R. R.; GONÇALVES, L. S. A.; NEPOMUCENO, A. L.; MERTZ-HENNING, L. M. |
|
Afiliação: |
ALESSANDRA KOLTUN, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ; NATHALIA VOLPI E SILVA, EMBRAPA SOJA; JÉSSIKA ANGELOTTI-MENDONÇA, EMBRAPA SOJA; SILVANA REGINA ROCKENBACH MARIN, CNPSO; LEANDRO SIMÕES AZEREDO GONÇALVES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; LILIANE MARCIA MERTZ HENNING, CNPSO. |
|
Título: |
CRISPR-transient expression in soybean for simplified gRNA screening in planta. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03000, 2023. |
|
DOI: |
https://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03000 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Título em português: Expressão transiente de CRISPR em soja para triagem simplificada de gRNA na planta. |
|
Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to develop a method to create and validate CRISPR-Cas systems and different gRNAs in soybean (Glycine max) embryos. Two model genes were used for simple mutation with one gRNA or partial gene deletion with two guides. The gRNAs were inserted into the CRISPR transformation vectors by a type IIS restriction enzyme or by subcloning and inserting the promoter + gRNA2 in the final transformation vector using the classic restriction enzyme cloning method. The vectors were successfully constructed for one and two gRNAs. Agrobacterium-mediated transient transformation in soybean was carried out to test the quality of gRNAs and of the system itself (expression cassette). Simple mutation and gene deletion were detected in the embryos transformed after DNA enrichment by enzyme digestion followed by polymerase chain reaction and sequencing, which indicates that the CRISPR-Cas system and guides were working. This protocol can be used to accelerate CRISPR-based genome editing strategies for genetic transformation in soybean. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi desenvolver um método para criar e validar sistemas CRISPR-Cas e diferentes gRNAs em embriões de soja (Glycine max). Dois genes modelo foram usados para mutação simples com um gRNA ou deleção parcial do gene com dois guias. Os gRNAs foram inseridos nos vetores de transformação CRISPR por uma enzima de restrição do tipo IIS ou por subclonagem e inserção do promotor + gRNA2 no vetor de transformação final, com uso do método clássico de clonagem por enzimas de restrição. Os vetores foram construídos com sucesso para um e dois gRNAs. A transformação transiente de soja por Agrobacterium foi realizada para testar a qualidade dos gRNAs e do próprio sistema (cassete de expressão). Detectaram-se mutação simples e deleção gênica nos embriões transformados após o enriquecimento do DNA por digestão seguida de reação em cadeia da polimerase e sequenciamento, o que indica que o sistema CRISPR-Cas e os guias estavam funcionando. Este protocolo pode ser usado para acelerar as estratégias de edição de genoma baseadas em CRISPR, para transformação genética em soja. MenosABSTRACT - The objective of this work was to develop a method to create and validate CRISPR-Cas systems and different gRNAs in soybean (Glycine max) embryos. Two model genes were used for simple mutation with one gRNA or partial gene deletion with two guides. The gRNAs were inserted into the CRISPR transformation vectors by a type IIS restriction enzyme or by subcloning and inserting the promoter + gRNA2 in the final transformation vector using the classic restriction enzyme cloning method. The vectors were successfully constructed for one and two gRNAs. Agrobacterium-mediated transient transformation in soybean was carried out to test the quality of gRNAs and of the system itself (expression cassette). Simple mutation and gene deletion were detected in the embryos transformed after DNA enrichment by enzyme digestion followed by polymerase chain reaction and sequencing, which indicates that the CRISPR-Cas system and guides were working. This protocol can be used to accelerate CRISPR-based genome editing strategies for genetic transformation in soybean. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi desenvolver um método para criar e validar sistemas CRISPR-Cas e diferentes gRNAs em embriões de soja (Glycine max). Dois genes modelo foram usados para mutação simples com um gRNA ou deleção parcial do gene com dois guias. Os gRNAs foram inseridos nos vetores de transformação CRISPR por uma enzima de restrição do tipo IIS ou por subclonagem e inserção do promotor + gRNA2 no vetor de tran... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Genoma; Glycine Max; RNA; Soja; Vetor. |
|
Thesaurus Nal: |
Genetic vectors; Genome; Mutation; Polymerase chain reaction; RNA editing; Soybeans. |
|
Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1155549/1/CRISPR-transient-expression-2023.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03287naa a2200349 a 4500
001 2155606
005 2023-08-03
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03000$2DOI
100 1 $aKOLTUN, A.
245 $aCRISPR-transient expression in soybean for simplified gRNA screening in planta.$h[electronic resource]
260 $c2023
500 $aTítulo em português: Expressão transiente de CRISPR em soja para triagem simplificada de gRNA na planta.
520 $aABSTRACT - The objective of this work was to develop a method to create and validate CRISPR-Cas systems and different gRNAs in soybean (Glycine max) embryos. Two model genes were used for simple mutation with one gRNA or partial gene deletion with two guides. The gRNAs were inserted into the CRISPR transformation vectors by a type IIS restriction enzyme or by subcloning and inserting the promoter + gRNA2 in the final transformation vector using the classic restriction enzyme cloning method. The vectors were successfully constructed for one and two gRNAs. Agrobacterium-mediated transient transformation in soybean was carried out to test the quality of gRNAs and of the system itself (expression cassette). Simple mutation and gene deletion were detected in the embryos transformed after DNA enrichment by enzyme digestion followed by polymerase chain reaction and sequencing, which indicates that the CRISPR-Cas system and guides were working. This protocol can be used to accelerate CRISPR-based genome editing strategies for genetic transformation in soybean. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi desenvolver um método para criar e validar sistemas CRISPR-Cas e diferentes gRNAs em embriões de soja (Glycine max). Dois genes modelo foram usados para mutação simples com um gRNA ou deleção parcial do gene com dois guias. Os gRNAs foram inseridos nos vetores de transformação CRISPR por uma enzima de restrição do tipo IIS ou por subclonagem e inserção do promotor + gRNA2 no vetor de transformação final, com uso do método clássico de clonagem por enzimas de restrição. Os vetores foram construídos com sucesso para um e dois gRNAs. A transformação transiente de soja por Agrobacterium foi realizada para testar a qualidade dos gRNAs e do próprio sistema (cassete de expressão). Detectaram-se mutação simples e deleção gênica nos embriões transformados após o enriquecimento do DNA por digestão seguida de reação em cadeia da polimerase e sequenciamento, o que indica que o sistema CRISPR-Cas e os guias estavam funcionando. Este protocolo pode ser usado para acelerar as estratégias de edição de genoma baseadas em CRISPR, para transformação genética em soja.
650 $aGenetic vectors
650 $aGenome
650 $aMutation
650 $aPolymerase chain reaction
650 $aRNA editing
650 $aSoybeans
650 $aGenoma
650 $aGlycine Max
650 $aRNA
650 $aSoja
650 $aVetor
700 1 $aSILVA, N. V. e
700 1 $aANGELOTTI-MENDONÇA, J.
700 1 $aMARIN, S. R. R.
700 1 $aGONÇALVES, L. S. A.
700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
700 1 $aMERTZ-HENNING, L. M.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira$gv. 58, e03000, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 42 | |
| 21. |  | TAVARES FILHO, L. F. de Q.; LEDO, C. A. da S.; ALVES, A. A. C.; SANTOS, A. S.; GONÇALVES, L. S. A. Diversidade genética entre cultivares de mandioca e espécies silvestres de Manihot mediante caracterização morfológica. Revista Raízes e Amidos Tropicais, Botucatu, v. 5, p. 697-701, jul. 2009. 1 CD-ROM. Edição dos Anais do XIII Congresso Brasileiro de Mandioca; VII Workshop sobre Tecnologia em Agroindústrias de Tuberosas Tropicais. Botucatu, jul. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|   |
| 22. | | KOLTUN, A.; SILVA, N. V. e; ANGELOTTI-MENDONÇA, J.; MARIN, S. R. R.; GONÇALVES, L. S. A.; NEPOMUCENO, A. L.; MERTZ-HENNING, L. M. CRISPR-transient expression in soybean for simplified gRNA screening in planta. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03000, 2023. Título em português: Expressão transiente de CRISPR em soja para triagem simplificada de gRNA na planta.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
|  |
| 23. | | XAVIER, G. R.; TEBBE, C. C.; GONÇALVES, L. S. A.; GUEDES, R. E.; RANGEL, F. W.; RIBEIRO, R. de L. D.; MARTINS, C. M.; RUMJANEK, N. G. PCR-SSCP analysis of the bacterial community associated to bean cultivar roots in an organic farm system. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2004. 4 p. Trabalho apresentado no 10th International Symposium on Microbial Ecology-ISME, Cancun-México, 22 a 27 de agosto de 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 25. | | XAVIER, G. R.; TEBBE, C. C.; GONÇALVES, L. S. A.; DE-POLLI, H.; GUERRA, J. G. M.; MARTINS, C. M.; RANGEL, F. W.; RUMJANEK, N. G. Molecular profiles of non-culturable bacteria associated to lettuce and carrot roots: a strategy to understand intercropping in an organic farm system. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2004. 4 p. Trabalho apresentado no 10th International Symposium on Microbial Ecology-ISME, Cancun-México, de 22 a 27 de agosto de 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 26. | | LIMA, R. S. N. de; DAHER, R. F.; GONÇALVES, L. S. A.; ROSSI, D. A.; AMARAL JÚNIOR, A. T. do; PEREIRA, M. G.; LEDO, F. J. da S. RAPD and ISSR markers in the evaluation of genetic divergence among accessions of elephant grass. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 3, p. 1214-1223, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 27. | | CABRAL, P. D. S.; SOARES, T. C. B.; GONÇALVES, L. S. A.; AMARAL JUNIOR A. T. do; LIMA, A. B. P.; RODRIGUES, R.; MATTA, F. de P. Quantification of the diversity among common bean accessions using Ward-MLM strategy. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 45, n. 10, p. 1124-1132, nov. 2010 Título em português: Quantificação da diversidade entre acessos de feijoeiro?comum com uso da estratégia Ward?MLM.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 28. | | FREIRIA, G. H.; GONÇALVES, L. S. A.; LIMA, W. F.; MANDARINO, J. M. G.; ROBAINA, R. R.; SILVA, J. B. da; PRETE, C. E. C. Protein, lipid and isoflavone contents of food-type soybean lines at two sowing dates. Bioscience Journal, v. 34, n. 6, p. 1540-1550, Nov./Dec. 2018. Título em português: teores de proteína, óleo e isoflavonas de linhagens de soja tipo alimento em duas épocas de semeadura.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 29. | | SANTOS, O. J. A. P.; GONÇALVES, L. S. A.; SCAPIM, C. A.; SOUSA, S. M. de; CASTRO, C. R.; BABA, V. Y.; OLIVEIRA, A. L. M. de. Screening of inbred popcorn lines for tolerance to low phosphorus. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 15, n. 2, p. 1-9, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 30. | | OLIVEIRA, M. M. de; LEDO, C. A. da S.; TAVARES FILHO, L. F. de Q.; SILVEIRA, T. C. da; ALVES, A. A. C.; GONÇALVES, L. S. A. Uso do algoritmo de Gower no estudo da diversidade genética em híbridos interespecíficos de mandioca. Revista Raízes e Amidos Tropicais, Botucatu, v. 5, p. 967-968, jul. 2009. 1 CD-ROM. Edição dos Anais do XIII Congresso Brasileiro de Mandioca; VII Workshop sobre Tecnologia em Agroindústrias de Tuberosas Tropicais. Botucatu, jul. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 32. | | OLIVEIRA, E. J. de; LIMA, D. S. de; COSTA, J. L.; SANTOS, L. F. dos; MACHADO, M. D.; LUCENA, R. S.; MOTTA, T. B. N.; DANTAS, J. L. L.; LEDO, C. A. da S.; GONÇALVES, L. S. A. Análise de agrupamento em genótipos de mamoeiro utilizando caracteres morfo-agronômicos e moleculares simultaneamente. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. pdf 2825| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 33. | | LEDO, C. A. da S.; TAVARES FILHO, L. F. de Q.; OLIVEIRA, M. M. de; SILVEIRA, T. C. da; SANTOS, A. S.; ALVES, A. A. C.; GONÇALVES, L. S. A. Análise de agrupamento utilizando variáveis quantitativas e qualitativas para o estudo da diversidade genética em genótipos de mandioca silvestre. Revista Raízes e Amidos Tropicais, Botucatu, v. 5, p. 591-595, jul. 2009. 1 CD-ROM. Edição dos Anais do XIII Congresso Brasileiro de Mandioca; VII Workshop sobre Tecnologia em Agroindústrias de Tuberosas Tropicais. Botucatu, jul. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 34. | | BABA, V. Y.; POWEL, A. F.; PEREIRA, L. F. P.; VANZELA, A. L. L.; GIACOMIN, R. M.; STRICKLER, S. R.; MUELLER, L. A.; RODRIGUES, R.; GONÇALVES, L. S. A. Capsidiol-related genes are highly expressed in response to Colletotrichum scovillei during Capsicum annuum fruit development stages. Scientific Reports, v. 10, 12048, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 35. | | GIORDANI, W.; GONÇALVES, L. S. A.; MORAES, L. A. C.; FERREIRA, L. C.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L.; OLIVEIRA, M. C. N. de; MERTZ-HENNING, L. M. Identification of agronomical and morphological traits contributing to drought stress tolerance in soybean. Australian Journal of Crop Science, v. 13, 1, p. 35-44, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 36. | | TEIXEIRA, G. M.; MOSELA, M.; NICOLETTO, M. L. A.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M.; YOUSSEF, K.; HIGASHI, A. Y.; MIAN, S.; FERREIRA, A. S.; GONÇALVES, L. S. A.; PEREIRA, U. de P.; OLIVEIRA, A. G. de. Genomic insights into the antifungal activity and plant growth-promoting ability in Bacillus velezensis CMRP 4490. Frontiers in Microbiology, v. 11, article 618415, 2021. 14 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|  |
| 37. | | REIS, R. R.; MERTZ-HENNING, L. M.; MARCOLINO-GOMES, J.; RODRIGUES, F. A.; MARIN, S. R. R.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; KOLTUN, A.; GONÇALVES, L. S. A.; NEPOMUCENO, A. L. Differential gene expression in response to water deficit in leaf and root tissues of soybean genotypes with contrasting tolerance profiles. Genetics and molecular biology, v. 43, e20180290, 2020. 17 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 38. | | BRAGA, P.; CRUSIOL, L. G. T.; CARANHATO, A. L. H.; FUHRMANN, M. B.; KOLTUN, A.; NANNI, M. R.; NEPOMUCENO, A. L.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; GONÇALVES, L. S. A.; MERTZ-HENNING, L. M. A phenotyping tool for water status determination in soybean by vegetation indexes and NIR-SWIR spectral bands. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 10., 2019, Águas de Lindóia, SP. Pesquisa e inovação para o desenvolvimento da sociedade: [resumos]. [Piracicaba: SBMP], 2019. p. 74. 10º CBMP, 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 39. | | BRAGA, P.; CRUSIOL, L. G. T.; NANNI, M. R.; CARANHATO, A. L. H.; FUHRMANN, M. B.; NEPOMUCENO, A. L.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; KOLTUN, A.; GONÇALVES, L. S. A.; MERTZ-HENNING, L. M. Vegetation indices and NIR-SWIR spectral bandsas a phenotyping tool for water status determination in soybean Precison agriculture, v. 1, 2020. 18 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 40. | | COLOMBO, R. C.; ROBERTO, S. R.; NIXDORF, S. L.; PÉREZ-NAVARRO, J.; GÓMEZ-ALONSO, S.; MENA-MORALES, A.; GARCIA-ROMERO, E.; GONÇALVES, L. S. A.; CRUZ, M. A. da; CARVALHO, D. U. de; MADEIRA, T. B.; WATANABE, L. S.; SOUZA, R. T. de; GUTIÉRREZ-HERMOSÍN, I. Analysis of the phenolic composition and yield of 'BRSVitoria' seedless table grape under different bunch densities using HPLC-DAD-ESI-MS/MS. Food Research International, v. 130, n. 108955, [online] 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
| |
| Registros recuperados : 42 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
