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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
15/03/2021 |
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Data da última atualização: |
10/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BOARI, A. de J.; QUADROS, A. F. F.; KAUFFMANN, C. M.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; CORDOVIL, G. A.; GAVINHO, B. E. S.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
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Afiliação: |
ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; AYANE F. F. QUADROS, UFRA; CATERYNNE M. KAUFFMANN, UFRA; KÉSSIA F. C. PANTOJA, Univesidade Estadual de São Paulo; RUI ALBERTO GOMES JUNIOR, CPATU; FRANCISCO RODRIGUES FREIRE FILHO, CPATU; RAIMUNDO PARENTE DE OLIVEIRA, CPATU; GABRIELE A. CORDOVIL, UFRA; BRENDA E. S. GAVINHO, UFRA; ELLIOT W. KITAJIMA, ESALQ/USP; ROSANA BLAWID, Universidade Federal Rural de Pernambuco; TATSUYA NAGATA, UNB. |
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Título: |
Near-complete genome sequence of cowpea severe mosaic virusin South America and reduced yardlong bean production dueto the viral infection. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 46, n. 4, p. 487-491, Aug. 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s40858-021-00420-w |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% in the total number of grains, regardless of the yardlong bean cultivar evaluated. The reduction of total weight of the grains by CpSMV infection was dependent on the cultivar and was higher in cv. De metro (66.2%) than in cv. Slin (38.9%). MenosThe sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Feijão; Genoma; Vigna Unguiculata; Vírus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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| Registros recuperados : 111 | |
| 101. |  | HOMMA, A. K. O.; MENEZES, A. J. E. A. de; MONTEIRO, K. F. G.; SANTOS, J. C. dos; REBELLO, F. K.; COSTA, D. H. M.; GOMES JUNIOR, R. A.; SENA, A. L. dos S.; MOTA JUNIOR, K. J. A. da. Integração grande empresa e pequenos produtores de dendezeiro: o caso da comunidade de Arauaí, município de Moju, Pará. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2014. 40 p. (Embrapa Amazônia Oriental. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 92).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 102. | | CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; GOMES JÚNIOR, R. A.; RODRIGUES, M. do R. L.; TEIXEIRA, P. C.; ROCHA, R. N. C. da; LIMA, W. A. A. de. Material genético utilizado para a produção sustentável da cultura da palma de óleo na Amazônia. In: RAMALHO FILHO, A.; MOTTA, P. M. F. DA; FREITAS, P. L. DE; TEIXEIRA, W. G. (Ed.). Zoneamento agroecológico, produção e manejo para a cultura da palma de óleo na Amazônia. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010. p. 93-100.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 103. | | GOMES JUNIOR, R. A.; SILVA, M. P. da; SANTOS, R. F. S. dos; PINA, A. J. de A.; QUARESMA, C. E.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; RESENDE, M. D. V. de. Parâmetros genéticos e ganho na seleção em população de híbridos interespecíficos entre caiaué e dendê. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: SBMP: UFG, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 104. | | GOMES JUNIOR, R. A.; SILVA, M. P. da; SANTOS, R. F. S. dos; PINA, A. J. de A.; QUARESMA, C. E.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; RESENDE, M. D. V. de. Parâmetros genéticos e ganho na seleção em população de híbridos interespecíficos entre caiaué e dendê. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: SBMP: UFG, 2015. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas. |
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| 105. | | SOUZA, S. R. L. de; ROSÁRIO, R. G. A. do; PEQUENO, C. W. P.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; RODRIGUES, J. E. L. F.; BENCHIMOL, R. L. Podridão cinzenta do caule em linhagens de feijão- caupi, em Belém, PA. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 25., 2022, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2023. p. 50-51. (Embrapa Amazônia Oriental. Eventos técnicos & científicos, 1).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 106. | | ANTONIASSI, R.; LOPES, R.; GODOY, R. L. de O.; PACHECO, S.; DOMINGUES, A. F. N.; GOMES JUNIOR, R. A.; WILHELM, A. E.; MACHADO, A. F. de F.; GUEDES, A. M. M.; BIZZO, H. R. Valor nutricional de óleo de híbridos de palma quanto ao teor de carotenoides, tocoferóis e tocotrienóis. In: ENCONTRO NACIONAL, 20.; CONGRESSO LATINO AMERICANO DE ANALISTAS DE ALIMENTOS, 6., 2017. Belém. Segurança e qualidade de alimentos. Belém, PA: LACEN: UFPA, 2017. p. 1-5. 1 CD-ROM ENAAL. Seção Trabalhos. Ref. 2582. Promoção: SBAAL. 13 a 16 de agosto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 107. | | RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; BARCELOS, E.; LIMA, W. A. A. de; RODRIGUES, M. do R. L.; KRUG, C.; BITTENCOURT, D. M. de C.; QUISEN, R. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; ROCHA, R. N. C. da. Caiaué. In: LOPES, R.; OLIVEIRA, M. do S. P. de; CAVALLARI, M. M.; BARBIERI, R. L.; CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. da. (Ed.). Palmeiras nativas do Brasil. Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 211-245.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 108. | | MENEZES, A. J. E. A. de; HOMMA, A. K. O.; SANTOS, J. C. dos; REBELLO, F. K.; COSTA, D. H. M.; SENA, A. L. dos S.; GOMES JUNIOR, R. A.; MONTEIRO, K. F. G.; MATOS, G. B. de; MOTA JÚNIOR, K. J. A. da. Caracterização socioeconômica de pequenos produtores de dendezeiro: o caso da comunidade de Arauaí, município de Moju, Pará. Amazônia: Ciência e Desenvolvimento, Belém, PA, v. 11, n. 21, jul./dez. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 109. | | FREIRE FILHO, F. R.; RODRIGUES, J. E. L. F.; GOMES JUNIOR, R. A.; RIBEIRO, V. Q.; BOARI, A. de J.; AZEVEDO, R. de; BENCHIMOL, R. L.; EL-HUSNY, J. C.; CARVALHO, A. V.; RODRIGUES, M. C. S. F.; AMARAL, T.; MESCOUTO, L. F. de L.; SILVA, R. C. da; SOARES, A. S. Melhoramento genético do feijão-caupi na Embrapa Amazônia Oriental: período de 2013 a 2022. Brasília, DF: Embrapa, 2023. 113 p.| Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Meio-Norte. |
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| 110. | | BOARI, A. de J.; QUADROS, A. F. F.; KAUFFMANN, C. M.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; CORDOVIL, G. A.; GAVINHO, B. E. S.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, T. Near-complete genome sequence of cowpea severe mosaic virusin South America and reduced yardlong bean production dueto the viral infection. Tropical Plant Pathology, v. 46, n. 4, p. 487-491, Aug. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 111. | | SILVA, M. B. de S. W.; RODRIGUES, M. do R. L.; ROCHA, R. N. C. da; CRAVO, M. da S.; CORDEIRO, A. C. C.; BOARI, A. de J.; MENEZES, A. J. E. A. de; ARAGAO, D. V.; SILVA, E. S. A.; SANTOS, J. C. dos; MAUES, M. M.; OLIVEIRA, M. E. C.; MODESTO JUNIOR, M. de S.; ALVES, R. N. B.; FRANZINI, V. I.; GOMES JUNIOR, R. A. Cultivo intercalar de culturas alimentares com palma de óleo na fase pré-produtiva. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2016. 30 p. (Embrapa Amazônia Oriental. Documentos, 422).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental. |
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