| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
|
Data corrente: |
02/08/2023 |
|
Data da última atualização: |
26/10/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
GOMES, T. G.; FONSECA, F. C. de A.; ALVES, G. S. C.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. |
|
Afiliação: |
TAÍSA GODOY GOMES, Universidade de Brasília; FERNANDO CAMPOS DE ASSIS FONSECA, Universidade de Brasília; GABRIEL SERGIO COSTA ALVES, Universidade de Brasília; FELIX GONCALVES DE SIQUEIRA, CNPAE; ROBERT NEIL GERARD MILLER, Universidade de Brasília. |
|
Título: |
Development of reference genes for RT-qPCR analysis of gene expression in Pleurotus pulmonarius for biotechnological applications. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, n. 12296, 2023. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39115-4 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Jatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as analysis of target genes for application in biorefinery models. MenosJatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Jatropha Curcas; Refinaria. |
|
Thesaurus Nal: |
Oilseed crops. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1155580/1/Development-of-reference.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02270naa a2200217 a 4500
001 2155580
005 2023-10-26
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-023-39115-4$2DOI
100 1 $aGOMES, T. G.
245 $aDevelopment of reference genes for RT-qPCR analysis of gene expression in Pleurotus pulmonarius for biotechnological applications.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aJatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as analysis of target genes for application in biorefinery models.
650 $aOilseed crops
650 $aJatropha Curcas
650 $aRefinaria
700 1 $aFONSECA, F. C. de A.
700 1 $aALVES, G. S. C.
700 1 $aSIQUEIRA, F. G. de
700 1 $aMILLER, R. N. G.
773 $tScientific Reports$gv. 13, n. 12296, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
|
Data corrente: |
02/04/2018 |
|
Data da última atualização: |
02/04/2018 |
|
Autoria: |
BUSO, R. R.; CAMPOS, C. C.; SANTOS, T. R.; SAUT, J. P. E.; SANTOS, R. M. |
|
Afiliação: |
Rodrigo R. Buso, Mestrando em Medicina Veterinária/FMV/Universidade Federal de Uberlândia - UFU; Carla C. Campos, Doutorando em Ciências Veterinárias/FMV-UFU; Thaísa R. Santos, Doutorando em Ciências Veterinárias/FMV-UFU; João Paulo E. Saut, Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias/FMV-UFU; Ricarda M. Santos, Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias/FMV-UFU. |
|
Título: |
Retenção de placenta e endometrite subclínica: prevalência e relação com o desempenho reprodutivo de vacas leiteiras mestiças. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 1, p. 1-5, janeiro 2018. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Título em inglês: Retained placenta and subclinical endometritis: prevalence and relation with reproductive performance of crossbred dairy cows. |
|
Conteúdo: |
Objetivou-se avaliar os efeitos do tipo de parto (eutócico vs. distócico) e do período do ano (chuvoso vs. seco) sobre a prevalência de retenção de placenta (RP) e de endometrite subclínica (ES), verificar a relação entre as duas patologias, e os efeitos dessas sobre a taxa de descarte, o período de serviço (PS) e número de IA/concepção. A RP foi avaliada no primeiro dia pós-parto (DPP). A citologia endometrial foi realizada entre 30 e 80 DPP, considerando positivos casos contendo acima de 5% de neutrófilos. Os dados foram analisados por regressão logística e análise de variância no programa Minitab (P<0,05). A prevalência de RP foi de 14,93% (69/462) e de ES de 27,49% (127/462). Foi detectada tendência de efeito (P=0,10) da RP sobre a prevalência da ES. Partos distócicos aumentaram a prevalência de RP e vacas que pariram nos meses chuvosos tiveram maior prevalência de ES (P<0,05). A RP elevou a taxa de descarte (P<0,05), a duração do período de serviço (P<0,05) e o número de IA por concepção (P<0,05), enquanto a ES não afetou essas variáveis (P>0,05). Conclui-se que a retenção de placenta tende a ser um fator de risco para endometrite subclínica, distocia predispõe à retenção de placenta e partos ocorridos no período chuvoso aumentam os casos de endometrite subclínica. Há um impacto negativo na eficiência reprodutiva de vacas leiteiras mestiças acometidas por retenção de placenta. |
|
Palavras-Chave: |
Postpartum. |
|
Thesagro: |
Bovino; Endometrite; Placenta; Pós-parto; Reprodução; Vaca leiteira. |
|
Thesaurus NAL: |
Cattle; Dairy cows; Endometritis; Reproduction. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/174822/1/Retencao-de-placenta-e-endometrite-subclinica.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02508naa a2200313 a 4500
001 2090046
005 2018-04-02
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aBUSO, R. R.
245 $aRetenção de placenta e endometrite subclínica$bprevalência e relação com o desempenho reprodutivo de vacas leiteiras mestiças.$h[electronic resource]
260 $c2018
500 $aTítulo em inglês: Retained placenta and subclinical endometritis: prevalence and relation with reproductive performance of crossbred dairy cows.
520 $aObjetivou-se avaliar os efeitos do tipo de parto (eutócico vs. distócico) e do período do ano (chuvoso vs. seco) sobre a prevalência de retenção de placenta (RP) e de endometrite subclínica (ES), verificar a relação entre as duas patologias, e os efeitos dessas sobre a taxa de descarte, o período de serviço (PS) e número de IA/concepção. A RP foi avaliada no primeiro dia pós-parto (DPP). A citologia endometrial foi realizada entre 30 e 80 DPP, considerando positivos casos contendo acima de 5% de neutrófilos. Os dados foram analisados por regressão logística e análise de variância no programa Minitab (P<0,05). A prevalência de RP foi de 14,93% (69/462) e de ES de 27,49% (127/462). Foi detectada tendência de efeito (P=0,10) da RP sobre a prevalência da ES. Partos distócicos aumentaram a prevalência de RP e vacas que pariram nos meses chuvosos tiveram maior prevalência de ES (P<0,05). A RP elevou a taxa de descarte (P<0,05), a duração do período de serviço (P<0,05) e o número de IA por concepção (P<0,05), enquanto a ES não afetou essas variáveis (P>0,05). Conclui-se que a retenção de placenta tende a ser um fator de risco para endometrite subclínica, distocia predispõe à retenção de placenta e partos ocorridos no período chuvoso aumentam os casos de endometrite subclínica. Há um impacto negativo na eficiência reprodutiva de vacas leiteiras mestiças acometidas por retenção de placenta.
650 $aCattle
650 $aDairy cows
650 $aEndometritis
650 $aReproduction
650 $aBovino
650 $aEndometrite
650 $aPlacenta
650 $aPós-parto
650 $aReprodução
650 $aVaca leiteira
653 $aPostpartum
700 1 $aCAMPOS, C. C.
700 1 $aSANTOS, T. R.
700 1 $aSAUT, J. P. E.
700 1 $aSANTOS, R. M.
773 $tPesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro$gv. 38, n. 1, p. 1-5, janeiro 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
