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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
28/04/2004 |
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Data da última atualização: |
05/06/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, E. A.; JARDIM, S. N.; GUIMARAES, C. T.; SOUZA, I. R. P. de; OLIVEIRA, E. de. |
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Afiliação: |
ELIANE APARECIDA GOMES, CNPMS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; ISABEL REGINA PRAZERES DE SOUZA, CNPMS; ELIZABETH DE OLIVEIRA SABATO, CNPMS. |
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Título: |
Genetic variability of Brazilian phytoplasma and spiroplasma isolated from maize plants. |
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Ano de publicação: |
2004 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 39, n. 1, p. 61-65, jan. 2004. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to characterize the genetic variability of phytoplasma and Spiroplasma kunkelii isolated from maize plants showing symptoms of stunt collected from different Brazilian geographic regions. A DNA fragment of 500 base pairs (bp) was amplified from the spiralin gene in S. kunkelii and one fragment of 1,200 bp was generated from 16S rDNA gene in phytoplasma. The partial sequences of the spiralin gene showed similarity of 98% among the isolates of S. kunkelii analyzed. These sequences were compared with the sequence of the spiralin gene from other Spiroplasma species deposited in the GenBank, resulting in a similarity varying from 76.9% to 88.1%. The 16S rDNA sequence from the phytoplasma were completely similar within the Brazilian isolates and showed up to 98% of the similarity with sequences already found from other phytoplasmas. A very narrow genetic variability was detected by these gene fragments within phytoplasma and Spiroplasma analyzed. However, other genomic regions with higher polymorphic levels shall be identified in order to better evaluate the genetic diversity within these microorganisms population. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi caracterizar a variabilidade genética de isolados de fitoplasma e de Spiroplasma kunkelii obtidos de plantas de milho, apresentando sintomas de enfezamento, coletados em diferentes regiões do Brasil. Um fragmento de 500 pares de bases (pb) do gene que codifica a espiralina de S. kunkelii foi amplificado e um produto de amplificação de 1.200 pb foi gerado a partir do gene l6S rDNA de fitoplasma. As seqüências parciais do gene da espiralina mostraram similaridade de 98% entre os isolados de S. kunkelii analisados. Essas seqüências foram comparadas com a seqüência do gene da espiralina de outras espécies de Spiroplasma depositadas no GenBank, resultando em similaridade variável entre 76,9% e 88,1 %. As seqüências do gene l6S rDNA dos isolados de fitoplasma foram completamente similares entre todos os isolados brasileiros e apresentaram até 98% de similaridade com seqüências do mesmo gene de outros fitoplasmas já publicadas. Uma variabilidade genética muito estreita foi detectada para esses genes entre os isolados de fitoplasma e Spiroplasma analisados. No entanto, outras regiões genômicas, que apresentem um maior polimorfismo precisam ser identificadas para melhor avaliar a diversidade genética dentro da população desses microrganismos. MenosABSTRACT - The objective of this work was to characterize the genetic variability of phytoplasma and Spiroplasma kunkelii isolated from maize plants showing symptoms of stunt collected from different Brazilian geographic regions. A DNA fragment of 500 base pairs (bp) was amplified from the spiralin gene in S. kunkelii and one fragment of 1,200 bp was generated from 16S rDNA gene in phytoplasma. The partial sequences of the spiralin gene showed similarity of 98% among the isolates of S. kunkelii analyzed. These sequences were compared with the sequence of the spiralin gene from other Spiroplasma species deposited in the GenBank, resulting in a similarity varying from 76.9% to 88.1%. The 16S rDNA sequence from the phytoplasma were completely similar within the Brazilian isolates and showed up to 98% of the similarity with sequences already found from other phytoplasmas. A very narrow genetic variability was detected by these gene fragments within phytoplasma and Spiroplasma analyzed. However, other genomic regions with higher polymorphic levels shall be identified in order to better evaluate the genetic diversity within these microorganisms population. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi caracterizar a variabilidade genética de isolados de fitoplasma e de Spiroplasma kunkelii obtidos de plantas de milho, apresentando sintomas de enfezamento, coletados em diferentes regiões do Brasil. Um fragmento de 500 pares de bases (pb) do gene que codifica a espiralina de S. kunkelii fo... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Sequência genética. |
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Thesagro: |
Microrganismo; Polimorfismo Genético. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160710/1/Genetic-variability.pdf
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Marc: |
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520 $aABSTRACT - The objective of this work was to characterize the genetic variability of phytoplasma and Spiroplasma kunkelii isolated from maize plants showing symptoms of stunt collected from different Brazilian geographic regions. A DNA fragment of 500 base pairs (bp) was amplified from the spiralin gene in S. kunkelii and one fragment of 1,200 bp was generated from 16S rDNA gene in phytoplasma. The partial sequences of the spiralin gene showed similarity of 98% among the isolates of S. kunkelii analyzed. These sequences were compared with the sequence of the spiralin gene from other Spiroplasma species deposited in the GenBank, resulting in a similarity varying from 76.9% to 88.1%. The 16S rDNA sequence from the phytoplasma were completely similar within the Brazilian isolates and showed up to 98% of the similarity with sequences already found from other phytoplasmas. A very narrow genetic variability was detected by these gene fragments within phytoplasma and Spiroplasma analyzed. However, other genomic regions with higher polymorphic levels shall be identified in order to better evaluate the genetic diversity within these microorganisms population. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi caracterizar a variabilidade genética de isolados de fitoplasma e de Spiroplasma kunkelii obtidos de plantas de milho, apresentando sintomas de enfezamento, coletados em diferentes regiões do Brasil. Um fragmento de 500 pares de bases (pb) do gene que codifica a espiralina de S. kunkelii foi amplificado e um produto de amplificação de 1.200 pb foi gerado a partir do gene l6S rDNA de fitoplasma. As seqüências parciais do gene da espiralina mostraram similaridade de 98% entre os isolados de S. kunkelii analisados. Essas seqüências foram comparadas com a seqüência do gene da espiralina de outras espécies de Spiroplasma depositadas no GenBank, resultando em similaridade variável entre 76,9% e 88,1 %. As seqüências do gene l6S rDNA dos isolados de fitoplasma foram completamente similares entre todos os isolados brasileiros e apresentaram até 98% de similaridade com seqüências do mesmo gene de outros fitoplasmas já publicadas. Uma variabilidade genética muito estreita foi detectada para esses genes entre os isolados de fitoplasma e Spiroplasma analisados. No entanto, outras regiões genômicas, que apresentem um maior polimorfismo precisam ser identificadas para melhor avaliar a diversidade genética dentro da população desses microrganismos.
650 $aMicrorganismo
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653 $aSequência genética
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| Registros recuperados : 306 | |
| 41. |  | SILVA, L. F.; LANA, U. G. P.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; SOUZA, F. A.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A. Bacterial communities in the rhizosphere of sorghum (Sorghum bicolor) lines contrasting for aluminum tolerance cultivated in unlimed and limed soil. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 1., 2012, Viçosa, MG. Annals... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2012. p. 54.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 42. | | MARRIEL, I. E.; MELO, I.; RODRIGUES, J. A.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; GOMES, E. A.; SOUZA, F. A. Inoculation with selected strains of Azospirillum spp. replaces nitrogen in pearl millet (Pennisetum glaucum (L.)) in Brazilian cerrado soil. In: RHIZOSPHERE, 4., 2015, Maastricht, The Netherlands. Stretching the interface of life. Wageningen: Center for Soil Ecology, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 43. | | GIARETTA, D. R.; BOGO, A.; COELHO, C. M. M.; GUIDOLIN, A. F.; DANTAS, A. C. de M.; GOMES, E. A. ITS-rDNA phylogeny of Colletotrichum spp. causal agent of apple glomerella leaf spot. Ciência Rural, Santa Maria, v. 40, n. 4, p. 806-812, abr. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 44. | | GOMES, E. A.; LANA, U. G. de P.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; NODA, R. W.; ZHANG, B.; TIEDJE, J. Metagenoma das comunidades microbianas presentes na rizosfera e raízes de genótipos de milho contrastantes para eficiência no uso de P. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 47. | | CARNEIRO, A. A.; GOMES, E. A.; GUIMARAES, C. T.; FERNANDES, F. T.; CARNEIRO, N. P.; CRUZ, I. Molecular characterization and pathogenicity of isolates of Beauveria spp. to fall armyworm. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 43, n. 4, p. 513-520, abr. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 48. | | CARNEIRO, A. A.; GOMES, E. A.; GUIMARÃES, C. T.; FERNANDES, F. T.; CARNEIRO, N. P.; CRUZ, I.; CRUZ, I. Molecular characterization and pathogenicity of isolates of Beauveria spp. to fall armyworm. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 4, p. 513-520, abr. 2008 Título em português: Caracterização molecular e virulência de isolados de Beauveria spp. contra a lagarta-do-cartucho.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 49. | | COTTA, S. R.; DIAS, A. C. F.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; ELSAS, J. D. van; SELDIN, L. Temporal dynamics of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystems. Antonie van Leeuwenhoek, Dordrecht, v. 103, n. 3, p. 589-601, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 50. | | HUNGRIA, M.; NICOLAS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. R. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 3, n. 1, p. 102-116, 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 51. | | HUNGRIA, M.; NICOLÁS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. T. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, v. 3, n. 1, p. 102-116, Mar. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 53. | | GOMES, E. A.; BELICUAS, S. N. J.; GUIMARÃES, C. T.; SOUZA, I. R. P. de; SABATO, E. de O. Genetic variability of Brazilian phytoplasma and spiroplasma isolated from maize plants. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 1, p. 61-65, jan. 2004 Título em português: Variabilidade genética de fitoplasma e espiroplasma isolados de plantas de milho no Brasil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 54. | | GOMES, E. A.; JARDIM, S. N.; GUIMARAES, C. T.; SOUZA, I. R. P. de; OLIVEIRA, E. de. Genetic variability of Brazilian phytoplasma and spiroplasma isolated from maize plants. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 39, n. 1, p. 61-65, jan. 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 55. | | RODRIGUES, L. B.; CARNEIRO, N. P.; ALVES, V. M. C.; GOMES, E. A.; JARDIM, S. N.; PURCINO, A. A. C. Genes induzidos por alumínio em ápices de raízes de uma cultivar de arroz tolerante a toxidez deste mineral. Brazilian Journal of Plant Physiology, Campinas, v. 15, p. 77, 2003. Suplemento.
Edição dos resumos do IX Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, 2003, Atibaia, SP.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 57. | | SILVA, U. de C.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; SANTOS, V. L. dos. Growth promotion features of the maize microbiome: from an agriculture perspective. In: CHOUDHARY, D. K.; VARMA, A.; TUTEJA, N. (Ed.). Plant-microbe interaction: an approach to sustainable agriculture. Singapore: Springer, 2016. cap. 16, p. 345-374.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 58. | | GONÇALVES, A. B. da S.; GOMES, E. A.; LANA, U. G. de P.; SOUSA, S. M. de; GUIMARAES, C. T. Estabelecimento de metodologia para análise e quantificação da colonização por fungo micorrízico arbuscular em milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 59. | | SANTOS, V. L.; SILVA, U. C.; MEDEIROS, J. D.; ORELLANA, S. C.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; GOMES, E. A. Effect of phosphorus fertilization on bacterial microbiome in microsites Zea mays rhizosphere and endosphere. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 23.; CONGRESO ARGENTINO DE MICROBIOLOGIA, 14., 2016, Rosário. Resúmenes. Buenos Aires: Asociación Argentina de Microbiología, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 60. | | SOUZA, I. R. P.; LENARDON, S.; GIOLITTI, F. J.; OLIVEIRA, E.; CARNEIRO, N. P.; GOMES, E. A. Sequenciamento do gene da capa protéica da SCMV causando sintomas de mosaico em milho, sorgo e cana de açúcar no Brasil. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 31, p. S 374, ago. 2006. Suplemento.
Edição dos Resumos do XXXIX Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Salvador, BA, ago. 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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