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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
15/01/2014 |
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Data da última atualização: |
15/01/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GLENN, T. C.; LANCE, S. L.; MCKEE, A. M.; WEBSTER, B. L.; EMERY, A. M.; ZERLOTINI, A.; OLIVEIRA, G.; ROLLINSON, D.; FAIRCLOTH, B. C. |
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Afiliação: |
TRAVIS C. GLENN, University of Georgia; STACEY L. LANCE, University of Georgia; ANNA M. MCKEE, University of Georgia; BONNIE L. WEBSTER, Wolfson Wellcome Biomedical Laboratories, Imperial College Faculty of Medicine (St Mary’s Campus); AIDAN M. EMERY, Wolfson Wellcome Biomedical Laboratories; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, Oswaldo Cruz Foundation, CNPTIA; GUILHERME OLIVEIRA, Oswaldo Cruz Foundation; DAVID ROLLINSON, Wolfson Wellcome Biomedical Laboratories; BRANT C. FAIRCLOTH, University of California. |
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Título: |
Significant variance in genetic diversity among populations of Schistosoma haematobium detected using microsatellite DNA loci from a genome-wide database. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Parasites & Vectors, v. 6, p. 1-12, 2013. |
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DOI: |
10.1186/1756-3305-6-300 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Urogenital schistosomiasis caused by Schistosoma haematobium is widely distributed across Africa and is increasingly being targeted for control. Genome sequences and population genetic parameters can give nsight into the potential for population- or species-level drug resistance. Microsatellite DNA loci are genetic markers in wide use by Schistosoma researchers, but there are few primers available for S. haematobium. Methods: We sequenced 1,058,114 random DNA fragments from clonal cercariae collected from a snail infected with a single Schistosoma haematobium miracidium. We assembled and aligned the S. haematobium sequences to the genomes of S. mansoni and S. japonicum, identifying microsatellite DNA loci across all three species and designing primers to amplify the loci in S. haematobium. To validate our primers, we screened 32 randomly selected primer pairs with population samples of S. haematobium. Results: We designed >13,790 primer pairs to amplify unique microsatellite loci in S. haematobium, (available at http://www.cebio.org/projetos/schistosoma-haematobium-genome). The three Schistosoma genomes contained similar overall frequencies of microsatellites, but the frequency and length distributions of specific motifs differed among species. We identified 15 primer pairs that amplified consistently and were easily scored. We genotyped these 15 loci in S. haematobium individuals from six locations: Zanzibar had the highest levels of diversity; Malawi, Mauritius, Nigeria, and Senegal were nearly as diverse; but the sample from South Africa was much less diverse. Conclusions: About half of the primers in the database of Schistosoma haematobium microsatellite DNA loci should yield amplifiable and easily scored polymorphic markers, thus providing thousands of potential markers. Sequence conservation among S. haematobium, S. japonicum, and S. mansoni is relatively high, thus it should now be possible to identify markers that are universal among Schistosoma species (i.e., using DNA sequences conserved among species), as well as other markers that are specific to species or species-groups (i.e., using DNA sequences that differ among species). Full genome-sequencing of additional species and specimens of S. haematobium, S. aponicum, and S. mansoni is desirable to better characterize differences within and among these species, to develop additional genetic markers, and to examine genes as well as conserved non-coding elements associated with drug resistance. MenosBackground: Urogenital schistosomiasis caused by Schistosoma haematobium is widely distributed across Africa and is increasingly being targeted for control. Genome sequences and population genetic parameters can give nsight into the potential for population- or species-level drug resistance. Microsatellite DNA loci are genetic markers in wide use by Schistosoma researchers, but there are few primers available for S. haematobium. Methods: We sequenced 1,058,114 random DNA fragments from clonal cercariae collected from a snail infected with a single Schistosoma haematobium miracidium. We assembled and aligned the S. haematobium sequences to the genomes of S. mansoni and S. japonicum, identifying microsatellite DNA loci across all three species and designing primers to amplify the loci in S. haematobium. To validate our primers, we screened 32 randomly selected primer pairs with population samples of S. haematobium. Results: We designed >13,790 primer pairs to amplify unique microsatellite loci in S. haematobium, (available at http://www.cebio.org/projetos/schistosoma-haematobium-genome). The three Schistosoma genomes contained similar overall frequencies of microsatellites, but the frequency and length distributions of specific motifs differed among species. We identified 15 primer pairs that amplified consistently and were easily scored. We genotyped these 15 loci in S. haematobium individuals from six locations: Zanzibar had the highest levels of diversity; Malawi, Mauritius... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Esquistossomose urogenital; Microssatélites. |
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Thesagro: |
Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Genetics; Microsatellite repeats; Schistosoma haematobium; Schistosomiasis. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/95291/1/Significant.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
18/09/2007 |
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Data da última atualização: |
13/07/2018 |
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Autoria: |
MAYER, N. A.; PEREIRA, F. M.; BARBOSA, J. C.; KOBA, V. Y. |
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Afiliação: |
Newton Alex Mayer, Universidade Estadual Paulista -Unesp/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias -Fcav/Departamento de Produção Vegetal; Fernando Mendes Pereira, Universidade Estadual Paulista -Unesp/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias -Fcav/Departamento de Produção Vegetal; José Carlos Barbosa, Universidade Estadual Paulista - Unesp/Fcav/Departamento de Ciências Exatas; Valter Yoshio Koba, Fazenda São Benedito. |
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Título: |
Distribuição do sistema radicular de porta-enxertos de umezeiro enxertados com o pessegueiro 'Aurora-1' |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 7, p. 965-973, jul. 2007 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Root distribution of mume rootstocks budded with 'Aurora-1' peach. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi estudar a distribuição do sistema radicular de três porta-enxertos de umezeiro (Prunus mume Siebold et Zucc.), Clone 05, Clone 15 e a cultivar Rigitano, propagados por estacas herbáceas, em condições de campo. As plantas, enxertadas com o pessegueiro 'Aurora-1' [Prunus persica (L.) Batsch], foram conduzidas no espaçamento de 6x1 m em Argissolo Vermelho-Amarelo eutrófico de textura arenosa média. Aos 34 meses após o transplantio, foram avaliadas duas plantas de cada porta-enxerto, tendo-se demarcado 36 monólitos (0,5x0,5x0,4 m) ao redor de cada planta, com barras de ferro (0,6 m) e fitas de plástico. O solo foi removido com jatos de água até a profundidade de 0,4 m. Não houve diferença entre os porta-enxertos, na massa de matéria fresca e seca de raízes, e na distribuição das raízes finas e grossas ao redor da planta. Mesmo sem a formação de uma raiz pivotante típica, as raízes grossas apresentaram crescimento vertical, além dos 0,4 m avaliados, e concentraram-se a 0,5 m ao redor do tronco da planta. As raízes finas apresentaram crescimento horizontal, além da projeção da copa, e também além dos 1,5 m avaliados, no sentido transversal à linha de plantio. Os Clones 05, 15 e a cultivar Rigitano de umezeiro, usados como porta-enxerto de pessegueiro, apresentam ancoragem satisfatória de plantas. |
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Palavras-Chave: |
Frutas de caroço; Porta-enxerto; Umê. |
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Thesagro: |
Fruticultura; Pêssego; Propagação vegetativa; Prunus Persica; Raiz. |
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Thesaurus NAL: |
Prunus mume; stone fruits; vegetative propagation. |
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Categoria do assunto: |
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F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/106867/1/Distribuicao.pdf
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Marc: |
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245 $aDistribuição do sistema radicular de porta-enxertos de umezeiro enxertados com o pessegueiro 'Aurora-1'
260 $c2007
500 $aTítulo em inglês: Root distribution of mume rootstocks budded with 'Aurora-1' peach.
520 $aO objetivo deste trabalho foi estudar a distribuição do sistema radicular de três porta-enxertos de umezeiro (Prunus mume Siebold et Zucc.), Clone 05, Clone 15 e a cultivar Rigitano, propagados por estacas herbáceas, em condições de campo. As plantas, enxertadas com o pessegueiro 'Aurora-1' [Prunus persica (L.) Batsch], foram conduzidas no espaçamento de 6x1 m em Argissolo Vermelho-Amarelo eutrófico de textura arenosa média. Aos 34 meses após o transplantio, foram avaliadas duas plantas de cada porta-enxerto, tendo-se demarcado 36 monólitos (0,5x0,5x0,4 m) ao redor de cada planta, com barras de ferro (0,6 m) e fitas de plástico. O solo foi removido com jatos de água até a profundidade de 0,4 m. Não houve diferença entre os porta-enxertos, na massa de matéria fresca e seca de raízes, e na distribuição das raízes finas e grossas ao redor da planta. Mesmo sem a formação de uma raiz pivotante típica, as raízes grossas apresentaram crescimento vertical, além dos 0,4 m avaliados, e concentraram-se a 0,5 m ao redor do tronco da planta. As raízes finas apresentaram crescimento horizontal, além da projeção da copa, e também além dos 1,5 m avaliados, no sentido transversal à linha de plantio. Os Clones 05, 15 e a cultivar Rigitano de umezeiro, usados como porta-enxerto de pessegueiro, apresentam ancoragem satisfatória de plantas.
650 $aPrunus mume
650 $astone fruits
650 $avegetative propagation
650 $aFruticultura
650 $aPêssego
650 $aPropagação vegetativa
650 $aPrunus Persica
650 $aRaiz
653 $aFrutas de caroço
653 $aPorta-enxerto
653 $aUmê
700 1 $aPEREIRA, F. M.
700 1 $aBARBOSA, J. C.
700 1 $aKOBA, V. Y.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 42, n. 7, p. 965-973, jul. 2007
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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