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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
21/03/2012 |
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Data da última atualização: |
22/03/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Software |
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Autoria: |
GIACHETTO, P. F.; OKURA, V. K. |
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Afiliação: |
POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; VAGNER KATSUMI OKURA, Unicamp. |
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Título: |
Código na linguagem estatística R que automatiza o processo de construção e análise de redes gênicas para dados de microarranjos da plataforma Affymetrix, utilizando a metodologia WGCNA. Versão 1.0. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O presente software tem por objetivo aplicar a metodologia WGCNA, desenvolvida na linguagem estatística R (http://www.r-project.org/), para a análise de dados de microarranjos da plataforma Affymetrix. O código apresentado automatiza o processo de análise e é parametrizável, possibilitando a construção de redes gênicas a partir de dois conjuntos de dados de microarranjos distintos. Uma vez construídas as redes, os módulos (grupos de genes altamente correlacionados) identificados em cada uma delas são comparados. Os módulos não conservados entre as duas redes representam vias biológicas alteradas entre os dois conjuntos de dados. Essa informação é importante para a tomada de decisão a respeito de análises subsequentes, visando a prospecção de genes de interesse econômico em animais, vegetais e microorganismos. |
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Palavras-Chave: |
Análise de dados de microarranjos; Redes gênicas; Software. |
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Thesaurus Nal: |
Microarray technology. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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005 2012-03-22
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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| Registros recuperados : 7 | |
| 2. |  | KRZYZANOWSKI, F. C.; COSTA, N. P.; MIRANDA, Z. F. S.; KIIHL, R. A. S.; KASTER, M.; SOUZA, P. I. M. Caracterizacao de genotipos de soja de ciclos precoce e medio quanto a qualidade fisiologica e suas inter-relacoes com aspectos morfologicos. In: EMBRAPA. Centro Nacional de Pesquisa de Soja (Londrina, PR). Resultados de pesquisa de soja 1988/89. Londrina, 1989. p.315,319-324. (EMBRAPA-CNPSo. Documentos, 43).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | ARIAS, C. A. A.; MIRANDA, Z. F. S.; TRILLER, C.; OLIVEIRA, M. F. de; TOLEDO, J. F. F. de. Estudo genético do teor de óleo em grãos de soja. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 41., 1995, Caxambu. Programa e resumos... Revista Brasileira de Genética, v. 18, n. 3, p. 100, set. 1995. Suplemento. A.30.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 7. | | TOLEDO, J. F. F. de; OLIVEIRA, M. F. de; ARIAS, C. A. A.; TRILLER, C.; MIRANDA, Z. F. S.; SOUZA, R. F. de. Variabilidade no florescimento em linhas avançadas de soja sob diversos fotoperíodos. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 41., 1995, Caxambu. Programa e resumos... Revista Brasileira de Genética, v. 18, n. 3, p. 100, set. 1995. Suplemento. A.31; A.32.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
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