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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
23/10/2019 |
Data da última atualização: |
23/10/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P. |
Afiliação: |
Paula de Sousa Guimarães, Bolsista do Consórcio Pesquisa Café; Juliana Camargo Martinati Schenk, Instituto Agronômico de Campinas - IAC. Bolsista INCT/CNPq; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LILIAN PADILHA, CNPCa; Maria Bernadete Silvarolla, Instituto Agronômico de Campinas - IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa. |
Título: |
Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Título em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression. |
Conteúdo: |
A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN. |
Palavras-Chave: |
Assisted-selection; Melhoramento molecular; Molecular breeding; RNAseq; Seleção-assistida. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02424nam a2200241 a 4500 001 2113384 005 2019-10-23 008 2019 bl uuuu u01u1 u #d 100 1 $aGUIMARÃES, P. de S. 245 $aValidação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.$h[electronic resource] 260 $aIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café$c2019 500 $aTítulo em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression. 520 $aA identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN. 653 $aAssisted-selection 653 $aMelhoramento molecular 653 $aMolecular breeding 653 $aRNAseq 653 $aSeleção-assistida 700 1 $aSCHENK, J. C. M. 700 1 $aGIACHETTO, P. F. 700 1 $aPADILHA, L. 700 1 $aSILVAROLLA, M. B. 700 1 $aMALUF, M. P.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Registros recuperados : 125 | |
1. | | GIACHETTO, P. F. Transcriptoma do carrapato dos bovinos. In: ANDREOTI, R.; GARCIA, M. V.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos na cadeia produtiva de bovinos. Brasília, DF: Embrapa, 2019. cap. 16, p. 205-222.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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4. | | ANDREOTTI, R.; GIACHETTO, P. F. Phylogenetic of phylogeographic relations of Rhipicephalus microplus ( Acari: ixodidae) in Brazil. In: AMERICAN ASSOCIATION OF VETERINARY PARASITOLOGISTS ANNUAL MEETING, 60.; LIVESTOCK INSECT WORKERS CON-FERENCE, 59.; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ECTOPARASITES OF PETS, 13.,2015, Boston, MA. Parasitic Evolution Scientific Revolu-tion: Proceedings... Boston, MA: American Association of Veterinary Parasitologists, 2015. Resumo 146. 1 p.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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8. | | GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformática aplicada à agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 4. p. 67-83.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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9. | | GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformatics applied to agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Information and communication technologies and their relations with agriculture. Brasília, DF: Embrapa, 2016. ch. 4, p. 67-86.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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Registros recuperados : 125 | |
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