Data/hora: 17/06/2024 03:35:10

Biblioteca(s): | Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.
Data corrente: | 29/03/2011
Data da última atualização: | 26/02/2024
Autoria: | HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F.
Afiliação: | ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, Bolsista Capes, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL.
Título: | Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.
Ano de publicação: | 2010
Fonte/Imprenta: | Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010.
Páginas: | 11 p.
Série: | (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101).
Idioma: | Português
Conteúdo: | O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Palavras-Chave: | Agrupamento de dados; Análise de componentes principais; Expressão gênica; PCA; Rede Genômica Animal.
Thesagro: | Análise Estatística.
Thesaurus Nal: | Algorithms; Gene expression; Principal component analysis; Statistical analysis.

Categoria do assunto:

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X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia

URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/32433/1/ct101-10-4.pdf
Registro original: | Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)

Exemplares:

CNPTIA - (15640-1) - UMT - FL - DD -  -  -  - DIS
CPPSUL - (12097-1) - UPC - FL - DD -  -  -  - DIS