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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
28/11/2011 |
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Data da última atualização: |
23/02/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VIBRANS, A. C.; SEVEGNANI, L.; UHLMANN, A.; SCHORN, L. A.; SOBRAL, M. G.; GASPER, A. L. de; LINGNER, D. V.; BROGNI, E.; KLEMZ, G.; GODOY, M. B.; VERDI, M. |
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Afiliação: |
Alexander C. Vibrans, FURB; Lúcia Sevegnani, FURB; ALEXANDRE UHLMANN, CNPF; Lauri A. Schorn, FURB; Marcos G. Sobral, UFSJ; André L. de Gasper, FURB; Débora V. Lingner, FURB; Eduardo Brogni, FURB; Guilherme Klemz, FURB; Marcela B. Godoy, FURB; Marcio Verdi, FURB. |
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Título: |
Structure of mixed ombrophyllous forests with Araucaria angustifolia (Araucariaceae) under external stress in Southern Brazil. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Biología Tropical, San Jose, CR, v. 59, n. 3, p. 1371-1387, Sept. 2011. |
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ISSN: |
0034-7744 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
This study is part of the Floristic and Forest Inventory of Santa Catarina, conceived to evaluate forest resources, species composition and structure of forest remnants, providing information to update forest conservation and land use policy in Southern Brazilian State of Santa Catarina (95 000km²). In accordance to the Brazilian National Forest Inventory (IFN-BR), the inventory applies systematic sampling, with 440 clusters containing four crosswise 1 000m² plots (20x50m) each, located on a 10x10km grid overlaid to land use map based on classification of SPOT-4 images from 2005. Within the sample units, all woody individuals of the main stratum (DBH?10cm) are measured and collected (fertile and sterile), if not undoubtedly identified in field. Regeneration stratum (height>1.50m; DBH<10cm) is registered in 100m² in each sample unit. Floristic sampling includes collection of all fertile trees, shrubs and herbs within the sample unit and in its surroundings. This study performs analysis based on 92 clusters measured in 2008 within an area of 32 320km² of mixed ombrophyllous forests with Araucaria angustifolia located at the state’s high plateau (500m to 1 560m above sea level at 26º00’-28º30’ S and 49º13’-51º23’ W). Mean density (DBH?10cm) is 578 individuals/ha (ranging from 85/ha to 1 310/ha), mean species richness in measured remnants is 35 (8 to 62), Shannon and Wiener diversity index (H’) varies between 1.05 and 3.48. Despite high total species diversity (364 Magnoliophyta, five Coniferophyta and one tree fern) and relatively high mean basal area (25.75m²/ha, varying from 3.87 to 68.85m²/ ha), the overwhelming majority of forest fragments are considered highly impacted and impoverished, mostly by logging, burning and extensive cattle farming, turning necessary more efficient protection measures. Basal area was considered an appropriate indicator for stand quality and conservation status. MenosThis study is part of the Floristic and Forest Inventory of Santa Catarina, conceived to evaluate forest resources, species composition and structure of forest remnants, providing information to update forest conservation and land use policy in Southern Brazilian State of Santa Catarina (95 000km²). In accordance to the Brazilian National Forest Inventory (IFN-BR), the inventory applies systematic sampling, with 440 clusters containing four crosswise 1 000m² plots (20x50m) each, located on a 10x10km grid overlaid to land use map based on classification of SPOT-4 images from 2005. Within the sample units, all woody individuals of the main stratum (DBH?10cm) are measured and collected (fertile and sterile), if not undoubtedly identified in field. Regeneration stratum (height>1.50m; DBH<10cm) is registered in 100m² in each sample unit. Floristic sampling includes collection of all fertile trees, shrubs and herbs within the sample unit and in its surroundings. This study performs analysis based on 92 clusters measured in 2008 within an area of 32 320km² of mixed ombrophyllous forests with Araucaria angustifolia located at the state’s high plateau (500m to 1 560m above sea level at 26º00’-28º30’ S and 49º13’-51º23’ W). Mean density (DBH?10cm) is 578 individuals/ha (ranging from 85/ha to 1 310/ha), mean species richness in measured remnants is 35 (8 to 62), Shannon and Wiener diversity index (H’) varies between 1.05 and 3.48. Despite high total species diversity (364 Magnoliophyta... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Floresta ombrófila mista; Forest structure; Human imacts on forests; Regional forest inventory; Santa catarina. |
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Thesagro: |
Araucária Angustifólia; Inventário Florestal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/48204/1/35-Vibrans-Araucaria-1.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
27/12/2016 |
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Data da última atualização: |
07/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEZENTI, L. F.; GONÇALVES, K. B.; SOUZA, R. F.; VILAS-BOAS, L. A.; SOSA-GOMEZ, D. R.; ROSA, R. da. |
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Afiliação: |
DANIEL RICARDO SOSA GOMEZ, CNPSO. |
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Título: |
Montagem de novo do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO PARANAENSE DE GENÉTICA, 13., GENÉTICA NAS FÉRIAS, 10., 2016. Tempos modernos: anais. Londrina: UEL, 2016. |
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Páginas: |
p. 43. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Anticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeamento dos transcritos e construção de contigs. Os transcritos de uma das bibliotecas foram anotados e categorizados usando o software Blast2go v3.2.7, logo após a busca por similaridade dos transcritos contra banco de dados. O transcriptoma das doze bibliotecas de A. gemmatalis apresentou 754.280 transcritos, montados a partir de 503.590.692 reads, com uma média de 41.965.891 milhões de reads por biblioteca, e N50 variando de 1146 a 1520. Os dados apresentados são preliminares, porém este estudo nos permite reportar a montagem do transcriptoma de A. gemmatalis e apresentar dados preliminares de anotação funcional. Estes resultados abrem novas perspectivas para o estudo genômico de A. gemmatalis, e possibilitará a posterior identificação de genes candidatos relacionados aos mecanismos de resistência de importantes pragas agrícolas. MenosAnticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeam... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Lagarta-da-soja; Transcriptoma. |
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Thesagro: |
Genética; RNA. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152327/1/Anais.2016.p.43.pdf
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Marc: |
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520 $aAnticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeamento dos transcritos e construção de contigs. Os transcritos de uma das bibliotecas foram anotados e categorizados usando o software Blast2go v3.2.7, logo após a busca por similaridade dos transcritos contra banco de dados. O transcriptoma das doze bibliotecas de A. gemmatalis apresentou 754.280 transcritos, montados a partir de 503.590.692 reads, com uma média de 41.965.891 milhões de reads por biblioteca, e N50 variando de 1146 a 1520. Os dados apresentados são preliminares, porém este estudo nos permite reportar a montagem do transcriptoma de A. gemmatalis e apresentar dados preliminares de anotação funcional. Estes resultados abrem novas perspectivas para o estudo genômico de A. gemmatalis, e possibilitará a posterior identificação de genes candidatos relacionados aos mecanismos de resistência de importantes pragas agrícolas.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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