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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
24/01/2015 |
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
O'BRIEN, A. M. P.; UTSUNOMIYA, Y. T.; MÉSZÁROS, G.; BICKHART, D. M.; LIU, G. E.; TASSEL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J. |
Afiliação: |
ANA M. PÉREZ O'BRIEN, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; YURI T. UTSUNOMIYA, UNESP; GÁBOR MÉSZÁROS, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; DEREK M BICKHART, ARS-USDA, USA; GEORGE E. LIU, ARS-USDA, USA; CURTIS P. VAN TASSEL, ARS-USDA, USA; TAD S. SONSTEGARD, ARS-USDA, USA; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; JOSÉ F. GARCIA, UNESP; JOHANN SÖLKNER, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna. |
Título: |
Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics Selection Evolution, v. 46, n. 19, 2014. |
Páginas: |
14 p. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Signatures of selection are regions in the genome that have been preferentially increased in frequency and fixed in a population because of their functional importance in specific processes. These regions can be detected because of their lower genetic variability and specific regional linkage disequilibrium (LD) patterns. By comparing the differences in regional LD variation between dairy and beef cattle types, and between indicine and taurine subspecies, we aim at finding signatures of selection for production and adaptation in cattle breeds. The VarLD method was applied to compare the LD variation in the autosomal genome between breeds, including Angus and Brown Swiss, representing taurine breeds, and Nelore and Gir, representing indicine breeds. The conclusions are that VarLD method is a powerful tool to identify differences in linkage disequilibrium between cattle populations and putative signatures of selection with potential adaptive and productive importance. |
Palavras-Chave: |
Indicine; Minor allele frequency. |
Thesaurus Nal: |
Genetic improvement; Linkage disequilibrium; Taurine. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/116426/1/Cnpgl-2014-Genetics-Selection-Evolution-Assessing-signatures-of-selection.pdf
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Marc: |
LEADER 01864naa a2200301 a 4500 001 2006605 005 2024-02-05 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aO'BRIEN, A. M. P. 245 $aAssessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle.$h[electronic resource] 260 $c2014 300 $a14 p. 520 $aSignatures of selection are regions in the genome that have been preferentially increased in frequency and fixed in a population because of their functional importance in specific processes. These regions can be detected because of their lower genetic variability and specific regional linkage disequilibrium (LD) patterns. By comparing the differences in regional LD variation between dairy and beef cattle types, and between indicine and taurine subspecies, we aim at finding signatures of selection for production and adaptation in cattle breeds. The VarLD method was applied to compare the LD variation in the autosomal genome between breeds, including Angus and Brown Swiss, representing taurine breeds, and Nelore and Gir, representing indicine breeds. The conclusions are that VarLD method is a powerful tool to identify differences in linkage disequilibrium between cattle populations and putative signatures of selection with potential adaptive and productive importance. 650 $aGenetic improvement 650 $aLinkage disequilibrium 650 $aTaurine 653 $aIndicine 653 $aMinor allele frequency 700 1 $aUTSUNOMIYA, Y. T. 700 1 $aMÉSZÁROS, G. 700 1 $aBICKHART, D. M. 700 1 $aLIU, G. E. 700 1 $aTASSEL, C. P. V. 700 1 $aSONSTEGARD, T. S. 700 1 $aSILVA, M. V. G. B. 700 1 $aGARCIA, J. F. 700 1 $aSÖLKNER, J. 773 $tGenetics Selection Evolution$gv. 46, n. 19, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registros recuperados : 43 | |
2. | | GARCIA, J. F.; MARTINS, I. M.; BRASIL, L. V.; PEREZ, N. B.; LAMEGO, F. P. Descrição e evolução da infestação do capim-annoni utilizando o método de interceptação na linha. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 6., 2016, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2016. p. 22. Claudia Cristina Gulias Gomes, editora técnica.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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4. | | MAZZOCATO, A. C.; DEWES, I. S. L.; GARCIA, J. F.; LEITE, L. G.; ARTICO, L. L. Levantamento de espécies forrageiras, daninhas, medicinais e tóxicas do herbário CNPO. Revista Científica Rural, v. 20, n. 2, p. 159-169, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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6. | | GRISOLIA, A. B.; D´ANGELO, G. T.; PORTO NETO, L. R.; SIQUEIRA, F.; GARCIA, J. F. Myostatin (GDF8) single nucleotide polymorphisms in Nellore cattle. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 8, n. 3, p. 822-830, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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7. | | BRASIL, L. V.; GARCIA, J. F.; MARTINS, I. M.; PEREZ, N. B.; LAMEGO, F. P.; SISTI, R. N. Dessecação na linha: implicações no estabelecimento de plantas forrageiras no Método Integrado para Recuperação de Pastagens - Mirapasto. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 6., 2016, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2016. p. 25. Claudia Cristina Gulias Gomes, editora técnica.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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8. | | MARTINS, I. M.; BRASIL, L. V.; GARCIA, J. F.; PEREZ, N. B.; LAMEGO, F. P.; SISTI, R. N. Dessecação na linha: implicações na produção de sorgo forrageiro no Método Integrado para Recuperação de Pastagens - Mirapasto. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 6., 2016, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2016. p. 24. Claudia Cristina Gulias Gomes, editora técnica.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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9. | | DEWES, I. S. L.; ARTICO, L. L.; GARCIA, J. F.; LEITE, L. G.; MAZZOCATO, A. C.; FERREIRA, J. L. Avaliação da germinação de quatro acessos de diferentes lotes de sementes de Bromus auleticus - ABZ. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Anais eletrônicos... Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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10. | | ULRICH, A. M.; GARCIA, J. F.; DEWES, I. S. L.; MAZZOCATO, A. C.; MARQUES, J. B. B. Levantamento de espécies em área experimental para a recuperação do campo nativo. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 68.; JORNADA FLUMINENSE DE BOTÂNICA, 36., 2017, Rio de Janeiro. Anais... [Brasília, DF]: Sociedade Botânica do Brasil, 2017. p. 352.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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11. | | DEWES, I. S. L.; GARCIA, J. F.; ARTICO, L. L.; LEITE, L. G.; FERRONATO, J.; ARTICO, E.; FERREIRA, J. L.; MAZZOCATO, A. C. Avaliação da diferenciação dentro e entre genótipos de trevo-branco. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 7., 2017, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2017. p. 13. Claudia Cristina Gulias Gomes, editora técnica.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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12. | | CARMO, A. S. do; KOLLING, G. J.; EGITO, A. A. do; MARIANTE, A. da S.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; GARCIA, J. F.; SILVA, M. V. G. B. Divergência genômica entre as raças bovinas Brasileiras localmente adaptadas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 25., 2015, Fortaleza. Dimensões tecnológicas e sociais da zootecnia: anais. Fortaleza: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2015. 3 p. ZOOTEC.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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13. | | BOISON, S. A.; NEVES, H. H. R.; O'BRIEN, A. M. P.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; SILVA, M. V. G. B.; SÖLKNER, J.; GARCIA, J. F. Imputation of non-genotyped individuals using genotyped progeny in Nellore, a Bos indicus cattle breed. Livestock Science, v. 166, p. 176-189, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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14. | | MÉSZÁROS, G.; BOISON, S. A.; O'BRIEN, A. M. P.; FERENCAKOVIC, M.; CURIK, I.; SILVA, M. V. G. B.; UTSONOMIYA, Y. T.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J. Genomic analysis for managing small and endangered populations: a case study in Tyrol Grey cattle. Frontiers in Genetics, v. 6, p. 192-203, 2015. Article 173.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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15. | | UTSUNOMIYA, Y. T.; MILANESI, M.; FORTES, M. R. S.; PORTO?NETO, L. R.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; AJMONE-MARSAN, P. Genomic clues of the evolutionary history of Bos indicus cattle. Animal Genetics, v. 50, n. 6, p. 557-568, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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16. | | PORTO NETO, L. R.; SONSTEGARD, T. S.; LIU, G.; BICKHART, D.; GONDRO, C.; SILVA, M. V. G. B.; UTSUNOMIYA, Y. T.; GARCIA, J. F.; VAN TASSELL, C. P. Genomic divergence of indicine and taurine cattle identified through high-density SNP gebotyping. In: ADSA-ASAS ANNUAL MEETINGS, 2013, Indianápolis, Indiana. Abstracts... Indianápolis: [s.n.], 2013.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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17. | | BOISON, S. A.; SANTOS, D. J. A. dos; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SILVA, M. V. G. B. Genomic Evaluation Using 50K and Imputed HD Genotypes in Guzera (Bos indicus) Breed. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: American Society of Animal Science, 2014. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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18. | | GARCIA, J. F.; CARMO, A. S. DO; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. DE R.; CARVALHEIRO, R.; TASSELL, C. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B. How bioinformatics enables livestock applied sciences in the genomic era. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFORMATICS, 2012, Heidelberg. Proceedings... Porto Alegre: Sociedade Brasileira e Computação, 2012.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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19. | | O'BRIEN, A. M. P.; MÉSZÁROS, G.; UTSUNOMIYA, Y. T.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F.; TASSEL, C. P. V.; CARVALHEIRO, R.; SILVA, M. V. G. B.; SÖLKNER, J. Linkage disequilibrium levels in Bos indicus and Bos taurus cattle using medium and high density SNP chip data and different minor allele frequency distributions. Livestock Science, v. 166, p. 121-132, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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20. | | BOTARO, B. G.; LIMA, Y. V. R. de; AQUINO, A. A; FERNANDES, R. H. R.; GARCIA, J. F.; SANTOS, M. V. dos. Polimorfismo da beta-lactoglobulina não afeta as características físico-químicas e a estabilidade do leite bovino Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 5, p. 747-753, maio 2007 Título em inglês: Beta-lactoglobulin polymorphism does not affect physico-chemical characteristics and milk stability.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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