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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
17/07/2023 |
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Data da última atualização: |
22/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. |
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Afiliação: |
RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MATEUS GUIMARÃES DOS SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-coding genes ARNT, EGR1, HIF1A, AHR, and PAX2 are good markers for the production of oocytes and embryos in Gir cattle. MenosGenome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Associação genômica. |
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Thesagro: |
Bovino; Embrião Animal; Gado Gir; Genética Animal. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02508naa a2200289 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
02/08/1993 |
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Data da última atualização: |
26/01/2017 |
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Autoria: |
CAPALBO, D. M. F.; SADI, C. V. S.; CANDIDO, A. C. C.; CONTIERI, R. C.; CONTI, H. H.; SOARES, C. N. |
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Afiliação: |
DEISE MARIA FONTANA CAPALBO, CNPMA; C. V. S. SADI; A. C. C. CANDIDO; R. C. CONTIERI; H. H. CONTI; C. N. SOARES. |
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Título: |
Atividade de Bacillus thuringiensis no desenvolvimento de fungos fitopatogênicos. |
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Ano de publicação: |
1991 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DO INSTITUTO BIOLÓGICO, 4., 1991, São Paulo. Resumos. São Paulo: Instituto Biológico, [1991?]. |
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Páginas: |
p.17 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Bacillus thuringiensis e uma bactéria com atividade inseticida. Sua produção industrial baseia-se no processo fermentativo, ao final do qual apenas a fração sólida do caldo de fermentação tem interesse comercial. Esse estudo teve por objetivo detectar a possibilidade de uso da fração liquida do caldo fermentado de Bacillus thuringiensis contra alguns fitopatogênicos. As fermentações foram realizadas sob condições controladas de agitação e temperatura. Após 24 e 48 horas, uma alíquota do caldo foi armazenada e o restante foi submetido a centrifugação (3000 rpm/7 min), sendo que a fração sobrenadante foi então denominada SN e, o precipitado, PPT. As frações NC, SN e PPT foram padronizadas em termos de volume e concentração de células e, a seguir, utilizadas em testes de inibição contra Fusarium solani e Colletotrichum sp. "in vitro". Os resultados obtidos demonstram o potencial de alguns dos caldos testados no controle dos fungos fitopatogênicos. A utilizacao da fração SN, entretanto, devera ser objeto de novos estudos para ser confirmada em vasos e casa-de-vegetação. |
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Palavras-Chave: |
Bioinseticida; Colletotrichum sp; Desenvolvimento; Inseticida biológico. |
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Thesagro: |
Bacillus Thuringiensis; Bactéria; Fungo; Fusarium Solani; Inseticida Bacteriano; Inseto; Praga. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/154105/1/1991SP003-Capalbo-Atividade-1361.PDF
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Marc: |
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245 $aAtividade de Bacillus thuringiensis no desenvolvimento de fungos fitopatogênicos.$h[electronic resource]
260 $aIn: REUNIÃO ANUAL DO INSTITUTO BIOLÓGICO, 4., 1991, São Paulo. Resumos. São Paulo: Instituto Biológico, [1991?].$c1991
300 $ap.17
520 $aBacillus thuringiensis e uma bactéria com atividade inseticida. Sua produção industrial baseia-se no processo fermentativo, ao final do qual apenas a fração sólida do caldo de fermentação tem interesse comercial. Esse estudo teve por objetivo detectar a possibilidade de uso da fração liquida do caldo fermentado de Bacillus thuringiensis contra alguns fitopatogênicos. As fermentações foram realizadas sob condições controladas de agitação e temperatura. Após 24 e 48 horas, uma alíquota do caldo foi armazenada e o restante foi submetido a centrifugação (3000 rpm/7 min), sendo que a fração sobrenadante foi então denominada SN e, o precipitado, PPT. As frações NC, SN e PPT foram padronizadas em termos de volume e concentração de células e, a seguir, utilizadas em testes de inibição contra Fusarium solani e Colletotrichum sp. "in vitro". Os resultados obtidos demonstram o potencial de alguns dos caldos testados no controle dos fungos fitopatogênicos. A utilizacao da fração SN, entretanto, devera ser objeto de novos estudos para ser confirmada em vasos e casa-de-vegetação.
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650 $aFungo
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650 $aInseto
650 $aPraga
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653 $aColletotrichum sp
653 $aDesenvolvimento
653 $aInseticida biológico
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700 1 $aCANDIDO, A. C. C.
700 1 $aCONTIERI, R. C.
700 1 $aCONTI, H. H.
700 1 $aSOARES, C. N.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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