| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
|
Data corrente: |
01/07/2008 |
|
Data da última atualização: |
18/02/2016 |
|
Autoria: |
FUGANTI, R. |
|
Título: |
Análise da região promotora do gene Gmhsp17.6-L em genótipos de soja resistentes e suscetíveis ao nematóide de galhas, Meloidogyne javanica. |
|
Ano de publicação: |
2007 |
|
Fonte/Imprenta: |
2007. |
|
Páginas: |
124 f. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Tese (Doutorado) Universidade Estadual de Maringá, Maringá. |
|
Conteúdo: |
As espécies de nematóide do gênero Meloidogyne provocam sérias perdas na produção de soja mundial, levando, devido a este parasitismo, a prejuízos estimados em 11%. O marcador molecular microssatélite 176 Soy HSP mostrou alta correlação com o número de galhas em raízes de soja inoculadas com o patógeno. Uma análise de QTL revelou a presença de pelo menos um gene localizado próximo ao marcador 176 Soy HSP, com valor de LOD score de 27.5. O fragmento amplificado, presente inicialmente apenas em amostras suscetíveis, mostrou 100% de similaridade com a região promotora do gene que codifica uma proteína de choque térmico de baixo peso molecular, presente na soja, Gmhsp 17.6-L (Número de acesso no GenBank: M11317). Primers foram desenhados para amplificar a região em ambos os genótipos resistente e suscetível. Todos os fragmentos também mostraram 100% de similaridade com a região promotora do gene Gmhsp 17.6-L. Dentro da região promotora, uma inserção de microssatélite correspondente a repetições AT(n) foi observada em todas as amostras. No entanto, o número de reptições AT era diferente em cada genótipo testado, com amostras resistentes apresentando maior número de repetições AT(n), quando comparadas com amostras suscetíveis e também com a sequência do gene Gmhsp 17.6-L disponível no GenBank. Na sequência de DNA correspondente á região codante da proteína, nenhuma diferença significativa na sequência nucleotídeos e aminoácidos foi encontrada entre todas as amostras e a sequência do GenBank. Para confirmar se a diferença no tamanho da inserção AT, dentro da região promotora do gene Gmhsp 17.6-L , refletia em diferentes níveis de expressão deste gene, um ensaio de proteção de ribonucleases foi realizado, mas nenhuma diferença foi detectada nos indivíduos parentais. Finalmente, uma quantificação relativa por PCR em tempo real foi executada. Os resultados indicaram que entre todas as amostras testadas, os indivíduos resistentes,JF7002, JF7027 e JF7056, inoculados com o nematóide, mostraram maior nível de expressão gênica quando comparados com todas as amostras restantes. Embriões de soja foram transformados em cassetes de expressão construídos com diferentes tamanhos de inserção AT(n) na região promotora. Depois de submetidos a estresses abióticos e biótico, a cultivar BRS 133 mostrou melhor resultado no ensaio histoquímico para detectar expressão do gene Gus. As plantas transformadas estão sendo mantidas em câmera para período de aclimatação, até que amostras possam ser coletadas para confirmação de eventos positivos, via PCR, com primers específicos.
Nematode species of the genus Meloidogyne causes severe yield losses in soybean production. It is estimated that 11 % of the annual losses in world production result from this parasitism. The microsatellite molecular marker 176 Soy HSP showed high correlation with the number of galls in soybean roots inoculated with the pathogen. The QTL analysis revealed the presence of at least one gene located next to the 176 Soy HSP marker, with a LOD score of 27.5. The amplified fragment, present at first only in susceptible samples showed 100% similarity with a promoter region of a small heat-shock protein (sHSP) gene found in soybean, Gmhsp17.6-L (GenBank accession number M11317). Primers were designed to amplify this region in both resistant and susceptible genotypes. All fragments also showed 100% similarity with promoter region of Gmhsp17.6-L gene. Inside the promoter region a microsatellite insertion, corresponding to a AT(n) repetitions was observed in all samples. However the number of AT repetitions was different in each genotype tested, with resistant samples presenting a higher number of AT(n) repetitions when compared to susceptible samples and also to the sequence from gene Gmhsp17.6-L available in GenBank. In heat shock protein coding region no significant mismatch was found in nucleotide and aminoacid sequence between sequences from all samples and sequence from GenBank. To confirm if this difference in the length of AT insertion in the Gmhsp17.6-L promoter region reflect in different levels of protein expression, a ribonuclease protection assay was performed but no difference was detected in the parental individuals. Finally, a real time polymerase chain reaction relative quantification was performed. Results indicated that among all samples, resistant individuals JF7002, JF7027 and JF7056 inoculated with the nematode showed higher gene expression level, when compared all remaining samples. Soybean embryos were transformed with expression cassettes built with different sizes of AT(n) repetitions inside promoter region. After submitted to diverse stresses, BRS133 cultivar showed better results in the histochimic assay done to detect Gus gene expression. Transformed plants are being kept in chamber for acclimatization until collection of samples to confirm positive events, through PCR with primers specific. MenosAs espécies de nematóide do gênero Meloidogyne provocam sérias perdas na produção de soja mundial, levando, devido a este parasitismo, a prejuízos estimados em 11%. O marcador molecular microssatélite 176 Soy HSP mostrou alta correlação com o número de galhas em raízes de soja inoculadas com o patógeno. Uma análise de QTL revelou a presença de pelo menos um gene localizado próximo ao marcador 176 Soy HSP, com valor de LOD score de 27.5. O fragmento amplificado, presente inicialmente apenas em amostras suscetíveis, mostrou 100% de similaridade com a região promotora do gene que codifica uma proteína de choque térmico de baixo peso molecular, presente na soja, Gmhsp 17.6-L (Número de acesso no GenBank: M11317). Primers foram desenhados para amplificar a região em ambos os genótipos resistente e suscetível. Todos os fragmentos também mostraram 100% de similaridade com a região promotora do gene Gmhsp 17.6-L. Dentro da região promotora, uma inserção de microssatélite correspondente a repetições AT(n) foi observada em todas as amostras. No entanto, o número de reptições AT era diferente em cada genótipo testado, com amostras resistentes apresentando maior número de repetições AT(n), quando comparadas com amostras suscetíveis e também com a sequência do gene Gmhsp 17.6-L disponível no GenBank. Na sequência de DNA correspondente á região codante da proteína, nenhuma diferença significativa na sequência nucleotídeos e aminoácidos foi encontrada entre todas as amostras e a sequência... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Nematóide; Soja. |
|
Thesaurus Nal: |
Nematoda; Soybeans. |
|
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
|
Marc: |
LEADER 05588nam a2200181 a 4500
001 1470973
005 2016-02-18
008 2007 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aFUGANTI, R.
245 $aAnálise da região promotora do gene Gmhsp17.6-L em genótipos de soja resistentes e suscetíveis ao nematóide de galhas, Meloidogyne javanica.
260 $a2007.$c2007
300 $a124 f.
500 $aTese (Doutorado) Universidade Estadual de Maringá, Maringá.
520 $aAs espécies de nematóide do gênero Meloidogyne provocam sérias perdas na produção de soja mundial, levando, devido a este parasitismo, a prejuízos estimados em 11%. O marcador molecular microssatélite 176 Soy HSP mostrou alta correlação com o número de galhas em raízes de soja inoculadas com o patógeno. Uma análise de QTL revelou a presença de pelo menos um gene localizado próximo ao marcador 176 Soy HSP, com valor de LOD score de 27.5. O fragmento amplificado, presente inicialmente apenas em amostras suscetíveis, mostrou 100% de similaridade com a região promotora do gene que codifica uma proteína de choque térmico de baixo peso molecular, presente na soja, Gmhsp 17.6-L (Número de acesso no GenBank: M11317). Primers foram desenhados para amplificar a região em ambos os genótipos resistente e suscetível. Todos os fragmentos também mostraram 100% de similaridade com a região promotora do gene Gmhsp 17.6-L. Dentro da região promotora, uma inserção de microssatélite correspondente a repetições AT(n) foi observada em todas as amostras. No entanto, o número de reptições AT era diferente em cada genótipo testado, com amostras resistentes apresentando maior número de repetições AT(n), quando comparadas com amostras suscetíveis e também com a sequência do gene Gmhsp 17.6-L disponível no GenBank. Na sequência de DNA correspondente á região codante da proteína, nenhuma diferença significativa na sequência nucleotídeos e aminoácidos foi encontrada entre todas as amostras e a sequência do GenBank. Para confirmar se a diferença no tamanho da inserção AT, dentro da região promotora do gene Gmhsp 17.6-L , refletia em diferentes níveis de expressão deste gene, um ensaio de proteção de ribonucleases foi realizado, mas nenhuma diferença foi detectada nos indivíduos parentais. Finalmente, uma quantificação relativa por PCR em tempo real foi executada. Os resultados indicaram que entre todas as amostras testadas, os indivíduos resistentes,JF7002, JF7027 e JF7056, inoculados com o nematóide, mostraram maior nível de expressão gênica quando comparados com todas as amostras restantes. Embriões de soja foram transformados em cassetes de expressão construídos com diferentes tamanhos de inserção AT(n) na região promotora. Depois de submetidos a estresses abióticos e biótico, a cultivar BRS 133 mostrou melhor resultado no ensaio histoquímico para detectar expressão do gene Gus. As plantas transformadas estão sendo mantidas em câmera para período de aclimatação, até que amostras possam ser coletadas para confirmação de eventos positivos, via PCR, com primers específicos. Nematode species of the genus Meloidogyne causes severe yield losses in soybean production. It is estimated that 11 % of the annual losses in world production result from this parasitism. The microsatellite molecular marker 176 Soy HSP showed high correlation with the number of galls in soybean roots inoculated with the pathogen. The QTL analysis revealed the presence of at least one gene located next to the 176 Soy HSP marker, with a LOD score of 27.5. The amplified fragment, present at first only in susceptible samples showed 100% similarity with a promoter region of a small heat-shock protein (sHSP) gene found in soybean, Gmhsp17.6-L (GenBank accession number M11317). Primers were designed to amplify this region in both resistant and susceptible genotypes. All fragments also showed 100% similarity with promoter region of Gmhsp17.6-L gene. Inside the promoter region a microsatellite insertion, corresponding to a AT(n) repetitions was observed in all samples. However the number of AT repetitions was different in each genotype tested, with resistant samples presenting a higher number of AT(n) repetitions when compared to susceptible samples and also to the sequence from gene Gmhsp17.6-L available in GenBank. In heat shock protein coding region no significant mismatch was found in nucleotide and aminoacid sequence between sequences from all samples and sequence from GenBank. To confirm if this difference in the length of AT insertion in the Gmhsp17.6-L promoter region reflect in different levels of protein expression, a ribonuclease protection assay was performed but no difference was detected in the parental individuals. Finally, a real time polymerase chain reaction relative quantification was performed. Results indicated that among all samples, resistant individuals JF7002, JF7027 and JF7056 inoculated with the nematode showed higher gene expression level, when compared all remaining samples. Soybean embryos were transformed with expression cassettes built with different sizes of AT(n) repetitions inside promoter region. After submitted to diverse stresses, BRS133 cultivar showed better results in the histochimic assay done to detect Gus gene expression. Transformed plants are being kept in chamber for acclimatization until collection of samples to confirm positive events, through PCR with primers specific.
650 $aNematoda
650 $aSoybeans
650 $aNematóide
650 $aSoja
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 58 | |
| 2. |  | KANAMORI, N.; FUGANTI, R.; ENGELS, C.; GIROTTO, L.; MARUYAMA, K.; SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Molecular markers for drought stress response of soybean. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 106, trab. 179. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|   |
| 4. | | FUGANTI, R.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. Desenvovimento de marcadores moleculares de microssatélite para seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 24., 2002, São Pedro, SP. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 158-159. (Embrapa Soja. Documentos, 185).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 5. | | FUGANTI, R.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. SSR markers associated with resistance to Meloidogyne javanica in soybean. Nematology, Boston, v. 4, n. 2, p. 231, 2002. Presented in Fourth International Congress of Nematology. Programme and abstracts. 8-13 June 2002, Tenbel, La Galletas, Arona, Tenerife, Canary Islands, Spain.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|  |
| 6. | | NEPOMUCENO, A. L.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; KANAMORI, N.; MARCELINO, F. C. Estratégias moleculares para tolerância à seca em plantas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para produção de alimentos e bioenergia: [anais...]. Fortaleza: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. Seção Palestra, 30.pdf. 1 CD-ROM. CBFV 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 7. | | BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; NEPOMUCENO, A. L. Seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica assistida por marcadores moleculares. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 059.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 8. | | SILVA, J. F. V.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; ARIAS, C. A. A.; MARINS, S. R.; NEPOMUCENO, A. L. Seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica assistida por marcadores moleculares. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIFIL, 11., 2003, Londrina. Resumos... Londrina: UniFil, 2003. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 9. | | FUGANTI, R.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Desenvolvimento de marcadores moleculares de microssatélite para seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 48., 2002, Águas de Lindóia. A genética na inclusão social: resumos. Águas de Lindóia: SBG, 2002. 1 CD-ROM. Resumo Área MG pdf.025.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 10. | | NEPOMUCENO, A. L.; FUGANTI, R.; PEREIRA, S. S.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C. Plantas geneticamente modificadas para tolerância a estresses abióticos. In: BORÉM, A.; ALMEIDA, G. D. de. Plantas geneticamente modificadas: desafios e oportunidades para regiões tropicais. Visconde de Rio Branco: Suprema, 2011. p. 119-138.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 11. | | MORALES, A. M. R.; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; NEPOMUCENO, A. L.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E. Análise dos genes expressos em raízes de soja submetidas a déficit hídrico. In: SIMPOSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIFIL, 12., 2004, Londrina. Resumos... Londrina: UniFil, 2004. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 12. | | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da expressão de fatores de transcrição relacionados com tolerância à seca, em soja, através da técnica de PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 245.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 13. | | FUGANTI, R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Inserção de microssatélite na região promotora da proteína de choque térmico (GMHSP17.6-L) em plantas de soja resistentes e suscetíveis a Meloidogyne javanica. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 058.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 14. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Method validation for quantification of transgene copy number in soybean genome using qPCR relative quantification by 2 -^^ Ct or 2 ^ Ct formule. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 233, ref. P581. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 15. | | NEPOMUCENO, A. L.; FUGANTI, R.; KANAMORI, N.; PEREIRA, S. dos S.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C. Estratégias de engenharia genética para tolerância à seca em plantas através da expressão de fatores de transcrição. In: SIMPÓSIO SOBRE TOLERÂNCIA À DEFICIÊNCIA HÍDRICA EM PLANTAS: ADAPTANDO AS CULTURAS AO CLIMA DO FUTURO, 2010, Goiânia. Trabalhos apresentados... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. p. 103-109. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 265). p. 103-109.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|  |
| 16. | | MORALES, A. M. A. P.; LEMOS, E. G. M.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; MARCELINO, F. C.; SILVA, J. F. V.; PEREIRA, A. A.; NEPOMUCENO, A. L. Expressão de genes envolvidos na resistência da soja a Meloidogyne javanica. Nematologia Brasileira, Piracicaba, v. 33, n. 3, p. 226-234, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 17. | | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Expression analysis of transcription factors involved in drought tolerance in soybean roots. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 160.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 18. | | LOPES, V. S.; FUGANTI, R.; BARBOSA, J. F.; DE CARVALHO, M. C. C. G.; MARIN, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Estudos in vivo do papel de inserções AT(n) da região promotora do gene Gmhsp17.6-L na regulação de genes em soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 169-174. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 19. | | FUGANTI, R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Identificação de marcadores moleculares de microssatélites para seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica. Nematologia Brasileira, Brasília, DF, v. 28, n. 2, p. 125-130, dez. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 20. | | SILVA, J. F. V.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; NEPOMUCENO, A. L.; LIMA, C. G. Seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica e Heterodera glycines assistida por marcadores moleculares. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 25., 2003, Uberaba. Resumos... Londrina: Embrapa Soja: EPAMIG: Fundação Triângulo, 2003. p. 212-213. (Embrapa Soja. Documentos, 209). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Boas de Campos Leite.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| Registros recuperados : 58 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
