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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
16/09/1999 |
Data da última atualização: |
16/09/1999 |
Autoria: |
CHAVARRIAGA-Aguirre, P.; MAYA, M. M.; BONIERBALE, M. W.; KRESOVICH, S.; FREGENE, M. A.; TOHME, J.; KOCHERT, G. |
Afiliação: |
Department of Botany, University of Georgia, Athens GA 30605, USA; Cassava Program, CIAT, A.A. 6713, Cali, Colombia; Merideth Bonierbale, International Potato Center (CIP), Apartado 1558, Lima 12, Peru. |
Título: |
Microsatellites in Cassava (Manihot esculenta Crantz): discovery, inheritance and variability |
Ano de publicação: |
1998 |
Fonte/Imprenta: |
Theor Appl Genet, v.97, p.493-501, 1998 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Fourteen microsatellites containing GA-repeats were isolated and characterized in cassava (Manihot esculenta Crantz, Euphorbiaceae). Microsatellite heterozygosity (h) was estimated in 48 accessions using (32P)-end-labeled primers and in more than 500 accessions using fluorescence-based genotyping. Heterozygosity values ranged from 0.00 to 0.88 and the number of alleles detected varied from 1 to 15. The reproducibility of allele sizing was also assessed using fluorescence-based genotyping. The average inter-gel size difference was 1.03 nucleotides. Chi-square tests (%2) were performed to analyse segregation distortion and the linkage between alleles segregating from either or both parents in an F1 mapping population. |
Palavras-Chave: |
Fluorescence-based genotyping; Linkage; Microsatellites. |
Thesaurus Nal: |
cassava; heterozygosity. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01425naa a2200253 a 4500 001 1648293 005 1999-09-16 008 1998 bl --- 0-- u #d 100 1 $aCHAVARRIAGA-Aguirre, P. 245 $aMicrosatellites in Cassava (Manihot esculenta Crantz)$bdiscovery, inheritance and variability 260 $c1998 520 $aFourteen microsatellites containing GA-repeats were isolated and characterized in cassava (Manihot esculenta Crantz, Euphorbiaceae). Microsatellite heterozygosity (h) was estimated in 48 accessions using (32P)-end-labeled primers and in more than 500 accessions using fluorescence-based genotyping. Heterozygosity values ranged from 0.00 to 0.88 and the number of alleles detected varied from 1 to 15. The reproducibility of allele sizing was also assessed using fluorescence-based genotyping. The average inter-gel size difference was 1.03 nucleotides. Chi-square tests (%2) were performed to analyse segregation distortion and the linkage between alleles segregating from either or both parents in an F1 mapping population. 650 $acassava 650 $aheterozygosity 653 $aFluorescence-based genotyping 653 $aLinkage 653 $aMicrosatellites 700 1 $aMAYA, M. M. 700 1 $aBONIERBALE, M. W. 700 1 $aKRESOVICH, S. 700 1 $aFREGENE, M. A. 700 1 $aTOHME, J. 700 1 $aKOCHERT, G. 773 $tTheor Appl Genet$gv.97, p.493-501, 1998
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
11/03/2008 |
Data da última atualização: |
21/07/2011 |
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Autoria: |
SILVA, K. J. D. e; FREIRE, C. N. de S.; SOUZA, E. A. de; SARTORATO, A. |
Título: |
Caracterização de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores RAPD. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2007. |
Páginas: |
34 p. |
Série: |
(Embrapa Meio-Norte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 71). |
ISSN: |
1413-1655 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A mancha-angular do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.), causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola (Sacc.) Ferraris, é uma das mais importantes doenças dessa cultura no Brasil. O desenvolvimento de uma estratégia para controlar e/ou reduzir o impacto do fungo P. griseola requer um conhecimento prévio da estrutura populacional do patógeno. Portanto, o objetivo deste estudo foi investigar a diversidade genética e a estrutura genética de populações entre isolados de P. griseola coletados nos estudos, de Minas Gerais e Goiás. Para este trabalho, foram selecionados 70 isolados de P. griseola, os quais foram caracterizados por meio de marcadores RAPD. Para análise com os dados de marcadores moleculares, foram utilizados 19 primers de RAPD. Os primers amplificaram um total de 76 bandas polimórficas, totalizando, em média, quatro bandas polimórficas por primer. A similaridade genética entre os isolados variou de 0,301 a 0,993, com média de 0,746. As análises descritivas revelaram uma tendência de diferenciação dos isolados por local de origem. A estimativa do índice de diversidade de Shannon revelou que, na cidade de Viçosa, MG, foi encontrada maior diversidade, enquanto em Ijaci, MG, a menor diversidade. A diversidade genética de Nei foi decomposta e verificou-se Ht = 0,3535. A diferenciação genética entre as populações estudadas foi de 0,1979 (GSt). Portanto, 80,21% da variação deve-se à variação dentro das populações. A AMOVA demonstrou que 77,51% da variação está contida dentro de cidades e 22,49% entre cidades. Realizou-se uma comparação par a par dos 76 locos polimórficos estudados. Foram obtidos valores de desequilíbrio gamético significativamente diferentes de zero para as populações estudadas (teste de Fisher, P < 0,05), mostrando que P. griseola mantém uma estrutura genética consistente com a reprodução assexual. MenosA mancha-angular do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.), causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola (Sacc.) Ferraris, é uma das mais importantes doenças dessa cultura no Brasil. O desenvolvimento de uma estratégia para controlar e/ou reduzir o impacto do fungo P. griseola requer um conhecimento prévio da estrutura populacional do patógeno. Portanto, o objetivo deste estudo foi investigar a diversidade genética e a estrutura genética de populações entre isolados de P. griseola coletados nos estudos, de Minas Gerais e Goiás. Para este trabalho, foram selecionados 70 isolados de P. griseola, os quais foram caracterizados por meio de marcadores RAPD. Para análise com os dados de marcadores moleculares, foram utilizados 19 primers de RAPD. Os primers amplificaram um total de 76 bandas polimórficas, totalizando, em média, quatro bandas polimórficas por primer. A similaridade genética entre os isolados variou de 0,301 a 0,993, com média de 0,746. As análises descritivas revelaram uma tendência de diferenciação dos isolados por local de origem. A estimativa do índice de diversidade de Shannon revelou que, na cidade de Viçosa, MG, foi encontrada maior diversidade, enquanto em Ijaci, MG, a menor diversidade. A diversidade genética de Nei foi decomposta e verificou-se Ht = 0,3535. A diferenciação genética entre as populações estudadas foi de 0,1979 (GSt). Portanto, 80,21% da variação deve-se à variação dentro das populações. A AMOVA demonstrou que 77,51% da variação está contida dentro ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Marcadores moleculares; RAPD; Variabilidade. |
Thesagro: |
Feijão; Fungo; Mancha Angular; Marcador Molecular; Phaseolus Vulgaris; Variação Genética. |
Thesaurus NAL: |
Phaeoisariopsis griseola. |
Categoria do assunto: |
-- H Saúde e Patologia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38288/1/BOLP71.pdf
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Marc: |
LEADER 02765nam a2200301 a 4500 001 1069171 005 2011-07-21 008 2007 bl uuuu u0uu1 u #d 022 $a1413-1655 100 1 $aSILVA, K. J. D. e 245 $aCaracterização de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores RAPD. 260 $aTeresina: Embrapa Meio-Norte$c2007 300 $a34 p. 490 $a(Embrapa Meio-Norte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 71). 520 $aA mancha-angular do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.), causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola (Sacc.) Ferraris, é uma das mais importantes doenças dessa cultura no Brasil. O desenvolvimento de uma estratégia para controlar e/ou reduzir o impacto do fungo P. griseola requer um conhecimento prévio da estrutura populacional do patógeno. Portanto, o objetivo deste estudo foi investigar a diversidade genética e a estrutura genética de populações entre isolados de P. griseola coletados nos estudos, de Minas Gerais e Goiás. Para este trabalho, foram selecionados 70 isolados de P. griseola, os quais foram caracterizados por meio de marcadores RAPD. Para análise com os dados de marcadores moleculares, foram utilizados 19 primers de RAPD. Os primers amplificaram um total de 76 bandas polimórficas, totalizando, em média, quatro bandas polimórficas por primer. A similaridade genética entre os isolados variou de 0,301 a 0,993, com média de 0,746. As análises descritivas revelaram uma tendência de diferenciação dos isolados por local de origem. A estimativa do índice de diversidade de Shannon revelou que, na cidade de Viçosa, MG, foi encontrada maior diversidade, enquanto em Ijaci, MG, a menor diversidade. A diversidade genética de Nei foi decomposta e verificou-se Ht = 0,3535. A diferenciação genética entre as populações estudadas foi de 0,1979 (GSt). Portanto, 80,21% da variação deve-se à variação dentro das populações. A AMOVA demonstrou que 77,51% da variação está contida dentro de cidades e 22,49% entre cidades. Realizou-se uma comparação par a par dos 76 locos polimórficos estudados. Foram obtidos valores de desequilíbrio gamético significativamente diferentes de zero para as populações estudadas (teste de Fisher, P < 0,05), mostrando que P. griseola mantém uma estrutura genética consistente com a reprodução assexual. 650 $aPhaeoisariopsis griseola 650 $aFeijão 650 $aFungo 650 $aMancha Angular 650 $aMarcador Molecular 650 $aPhaseolus Vulgaris 650 $aVariação Genética 653 $aMarcadores moleculares 653 $aRAPD 653 $aVariabilidade 700 1 $aFREIRE, C. N. de S. 700 1 $aSOUZA, E. A. de 700 1 $aSARTORATO, A.
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