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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
02/09/2021 |
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Data da última atualização: |
02/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, C. E. R.; CAMPOS, G. S.; SCHMIDT, P. I.; SOLLERO, B. P.; GOULARTE, K. L.; CORCINI, C. D.; GASPERIN, B. G.; LUCIA JUNIOR, T.; BOLIGON, A. A.; CARDOSO, F. F. |
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Afiliação: |
CARLOS E. R. FERREIRA, UFPEL; GABRIEL S. CAMPOS, UFPEL; PATRICIA I. SCHMIDT, UNESP; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; KARINA L. GOULARTE, UFPEL; CARINE D. CORCINI, UFPEL; BERNARDO G. GASPERIN, UFPEL; THOMAZ LUCIA JUNIOR, UFPEL; ARIONE A. BOLIGON, UFPEL; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
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Título: |
Genome-wide association and genomic prediction for scrotal circumference in Hereford and Braford bulls. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Theriogenology, v. 172, p. 268-280, Sept. 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.theriogenology.2021.07.007 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Scrotal circumference (SC) is widely used as a selection criterion for bulls in breeding programs, since it is easily assessed and correlated with several desirable reproductive traits. The objectives of this study were: to perform a genome-wide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with SC adjusted for age (SCa) and for both age and weight (SCaw); to select Tag SNPs from GWAS to construct low-density panel for genomic prediction; and to compare the prediction accuracy of the SC through different methods for Braford and Hereford bulls from the same genetic breeding program. Data of SC from 18,172 bulls (30.4 ± 3.7 cm) and of genotypes from 131 sires and 3,545 animals were used. From GWAS, the top 1% of 1-Mb windows were observed on chromosome (BTA) 2, 20, 7, 8, 15, 3, 16, 27, 6 and 8 for SCa and on BTA 8, 15, 16, 21, 19, 2, 6, 5 and 10 for SCaw, representing 17.4% and 18.8% of the additive genetic variance of SCa and SCaw, respectively. The MeSH analysis was able to translate genomic information providing biological meanings of more specific gene functions related to the SCa and SCaw. The genomic enhancement methods, especially single step GBLUP, that combined phenotype and pedigree data with direct genomic values generated gains in accuracy in relation to pedigree BLUP, suggesting that genomic predictions should be applied to improve genetic gain and to narrow the generation interval compared to traditional methods. The proposed Tag-SNP panels may be useful for lower-cost commercial genomic prediction applications in the future, when the number of bulls in the reference population increases for SC in Hereford and Braford breeds. MenosScrotal circumference (SC) is widely used as a selection criterion for bulls in breeding programs, since it is easily assessed and correlated with several desirable reproductive traits. The objectives of this study were: to perform a genome-wide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with SC adjusted for age (SCa) and for both age and weight (SCaw); to select Tag SNPs from GWAS to construct low-density panel for genomic prediction; and to compare the prediction accuracy of the SC through different methods for Braford and Hereford bulls from the same genetic breeding program. Data of SC from 18,172 bulls (30.4 ± 3.7 cm) and of genotypes from 131 sires and 3,545 animals were used. From GWAS, the top 1% of 1-Mb windows were observed on chromosome (BTA) 2, 20, 7, 8, 15, 3, 16, 27, 6 and 8 for SCa and on BTA 8, 15, 16, 21, 19, 2, 6, 5 and 10 for SCaw, representing 17.4% and 18.8% of the additive genetic variance of SCa and SCaw, respectively. The MeSH analysis was able to translate genomic information providing biological meanings of more specific gene functions related to the SCa and SCaw. The genomic enhancement methods, especially single step GBLUP, that combined phenotype and pedigree data with direct genomic values generated gains in accuracy in relation to pedigree BLUP, suggesting that genomic predictions should be applied to improve genetic gain and to narrow the generation interval compared to traditional methods. The proposed Tag-SNP panels may ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Desempenho reprodutivo; Predição genômica. |
|
Thesagro: |
Bovino; Gado de Corte; Performance. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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| Registros recuperados : 194 | |
| 21. |  | SCORIZA, R. N.; CORREIA, M. E. F.; ESPINDOLA, J. A. A.; ARAUJO, E. da S. Efeito do cultivo de plantas de cobertura sobre a fauna do solo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2012. FERTBIO 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 23. | | ARAÚJO, E. da S.; ANDRADE, A. G. de; SILVA, C. A.; MACHADO, P.; GUIMARÃES, C. M. Estado de agregação de latossolo vermelho epieutrófico sob plantio direto, plantio convencional e mata nativa em Goiânia, GO. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 28., 2001, Londrina. Ciência do solo: fator de produtividade competitiva com sustentabilidade. Londrina: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2001. p. 13.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Solos. |
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| 28. | | DALLA CHIEZA, E.; GUERRA, J. G. M.; ARAUJO, E. da S. Relações morfofisiológicas do milho em cultivo consorciado ou não com crotalária juncea sob manejo orgânico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 7., 2011, Fortaleza. Ética na Ciência: agroecologia como paradigma para o desenvolvimento rural: resumos...Fortaleza: Associação Brasileira de Agroecologia, 2011. 7 p 7 p. Publicado no Cadernos de Agroecologia, v. 6, n. 2, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 30. | | GOULART, J. M.; ESPINDOLA, J. A. A.; ARAUJO, E. da S.; GUERRA, J. G. M. Produtividade de minimilho em cultivo solteiro ou consorciado com leguminosas, sob manejo orgânico. Cadernos de Agroecologia, v. 13, n. 1, p. 1-7, Jul. 2018. ANAIS CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE AGROECOLOGIA, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 10.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DO DISTRITO FEDERAL E ENTORNO, 5., 2017, Brasília, DF. Agroecologia na transformação dos sistemas agroalimentares...| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
|  |
| 31. | | DALLA CHIEZA, E.; MENDES, B. P.; ARAUJO, E. da S.; GUERRA, J. G. M. Produção de milho verde em consórcio com Crotalaria juncea, sob manejo orgânico Production of sweet corn cobs in an intercropping with Crotalaria juncea, under organic management. Cadernos de Agroecologia, v. 13, n. 1, p. 1-7, Jul. 2018. ANAIS CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE AGROECOLOGIA, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 10.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DO DISTRITO FEDERAL E ENTORNO, 5., 2017, Brasília, DF. Agroecologia na transformação dos sistemas agroalimentares...| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 40. | | SILVA, C.; SANTOS, S. da S.; SOUZA, D.; GUERRA, J. G. M.; ESPINDOLA, J. A. A.; ARAUJO, E. da S. Avaliação de diferentes manejos do solo sobre a produtividade do milho (Zea mays) em sistema orgânico de produção Cadernos de Agroecologia, v. 13, n. 1, p. 1-7, Jul. 2018. ANAIS CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE AGROECOLOGIA, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 10.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DO DISTRITO FEDERAL E ENTORNO, 5., 2017, Brasília, DF. Agroecologia na transformação dos sistemas agroalimentares...| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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