| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
|
Data corrente: |
18/12/2023 |
|
Data da última atualização: |
29/01/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
VENKATARAMAN, M.; YÑIGEZ-GUTIERREZ, A.; INFANTE, V.; MACINTYRE, A.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ANÉ, J.-M.; PFLEGER, B. |
|
Afiliação: |
MAYA VENKATARAMAN; AUDREY YÑIGEZ-GUTIERREZ; VALENTINA INFANTE; APRIL MACINTYRE; PAULO IVAN FERNANDES JUNIOR, CPATSA; JEAN-MICHEL ANÉ; BRIAN PFLEGER. |
|
Título: |
Synthetic biology toolbox for nitrogen-fixing soil microbes. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
ACS Synthetic Biology, v. 12, n. 12, p. 3623-3634, 2023. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1021/acssynbio.3c00414 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The soil environment adjacent to plant roots, termed the rhizosphere, is home to a wide variety of microorganisms that can significantly affect the physiology of nearby plants. Microbes in the rhizosphere can provide nutrients, secrete signaling compounds, and inhibit pathogens. These processes could be manipulated with synthetic biology to enhance the agricultural performance of crops grown for food, energy, or environmental remediation, if methods can be implemented in these nonmodel microbes. A common first step for domesticating nonmodel organisms is the development of a set of genetic engineering tools, termed a synthetic biology toolbox. A toolbox comprises transformation protocols, replicating vectors, genome engineering (e.g., CRISPR/Cas9), constitutive and inducible promoter systems, and other gene expression control elements. This work validated synthetic biology toolboxes in three nitrogen-fixing soil bacteria: Azotobacter vinelandii, Stutzerimonas stutzeri (Pseudomonas stutzeri), and a new isolate of Klebsiella variicola. All three organisms were amenable to transformation and reporter protein expression, with several functional inducible systems available for each organism. S. stutzeri and K. variicola showed more reliable plasmid-based expression, resulting in successful Cas9 recombineering to create scarless deletions and insertions. Using these tools, we generated mutants with inducible nitrogenase activity and introduced heterologous genes to produce resorcinol products with relevant biological activity in the rhizosphere. MenosThe soil environment adjacent to plant roots, termed the rhizosphere, is home to a wide variety of microorganisms that can significantly affect the physiology of nearby plants. Microbes in the rhizosphere can provide nutrients, secrete signaling compounds, and inhibit pathogens. These processes could be manipulated with synthetic biology to enhance the agricultural performance of crops grown for food, energy, or environmental remediation, if methods can be implemented in these nonmodel microbes. A common first step for domesticating nonmodel organisms is the development of a set of genetic engineering tools, termed a synthetic biology toolbox. A toolbox comprises transformation protocols, replicating vectors, genome engineering (e.g., CRISPR/Cas9), constitutive and inducible promoter systems, and other gene expression control elements. This work validated synthetic biology toolboxes in three nitrogen-fixing soil bacteria: Azotobacter vinelandii, Stutzerimonas stutzeri (Pseudomonas stutzeri), and a new isolate of Klebsiella variicola. All three organisms were amenable to transformation and reporter protein expression, with several functional inducible systems available for each organism. S. stutzeri and K. variicola showed more reliable plasmid-based expression, resulting in successful Cas9 recombineering to create scarless deletions and insertions. Using these tools, we generated mutants with inducible nitrogenase activity and introduced heterologous genes to produce resorci... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Biologia sintética; Caixa de ferramentas; Cas9; CRISPR; Edição de genoma. |
|
Thesagro: |
Nitrogenase; Solo. |
|
Thesaurus Nal: |
Genome; Synthetic biology. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159849/1/SyntheticBiologyToolboxfor-Nitrogen-FixingSoil-Microbes-2023.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02445naa a2200313 a 4500
001 2159849
005 2024-01-29
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1021/acssynbio.3c00414$2DOI
100 1 $aVENKATARAMAN, M.
245 $aSynthetic biology toolbox for nitrogen-fixing soil microbes.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aThe soil environment adjacent to plant roots, termed the rhizosphere, is home to a wide variety of microorganisms that can significantly affect the physiology of nearby plants. Microbes in the rhizosphere can provide nutrients, secrete signaling compounds, and inhibit pathogens. These processes could be manipulated with synthetic biology to enhance the agricultural performance of crops grown for food, energy, or environmental remediation, if methods can be implemented in these nonmodel microbes. A common first step for domesticating nonmodel organisms is the development of a set of genetic engineering tools, termed a synthetic biology toolbox. A toolbox comprises transformation protocols, replicating vectors, genome engineering (e.g., CRISPR/Cas9), constitutive and inducible promoter systems, and other gene expression control elements. This work validated synthetic biology toolboxes in three nitrogen-fixing soil bacteria: Azotobacter vinelandii, Stutzerimonas stutzeri (Pseudomonas stutzeri), and a new isolate of Klebsiella variicola. All three organisms were amenable to transformation and reporter protein expression, with several functional inducible systems available for each organism. S. stutzeri and K. variicola showed more reliable plasmid-based expression, resulting in successful Cas9 recombineering to create scarless deletions and insertions. Using these tools, we generated mutants with inducible nitrogenase activity and introduced heterologous genes to produce resorcinol products with relevant biological activity in the rhizosphere.
650 $aGenome
650 $aSynthetic biology
650 $aNitrogenase
650 $aSolo
653 $aBiologia sintética
653 $aCaixa de ferramentas
653 $aCas9
653 $aCRISPR
653 $aEdição de genoma
700 1 $aYÑIGEZ-GUTIERREZ, A.
700 1 $aINFANTE, V.
700 1 $aMACINTYRE, A.
700 1 $aFERNANDES JUNIOR, P. I.
700 1 $aANÉ, J.-M.
700 1 $aPFLEGER, B.
773 $tACS Synthetic Biology$gv. 12, n. 12, p. 3623-3634, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 219 | |
| 61. |  | CARVALHO, A. P.; ALVES, I. L.; FREITAS, T.; PEREIRA, C. A.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; GAVA, C. A. T. Reduzindo o efeito da radiação ultravioleta sobre leveduras para o controle de podridões pós-colheita de frutas. In: SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 4., 2015, Petrolina. Experiências e oportunidades para o desenvolvimento. Petrolina: Embrapa Semiárido, 2015. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 262).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
|    |
| 62. | | NASCIMENTO, T. R. do; SENA, P. T. S.; SILVA, T. R.; MARTINS, L. M. V.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Produção de auxinas in vitro por rizóbios de feijão--caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp.] nativos do Semiárido. In: JORNADA DE INTEGRAÇÃO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 3., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2018. p. 207-211. (Embrapa Semiárido. Documentos, 284).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 63. | | SILVA, T. R. da; SOUZA, P. S. S.; SANTOS, J. M. R. dos; CARVALHO, B. R.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Produção in vitro de auxinas por bactérias não rizobianas isoladas de nódulos de feijão-caupi no Semiárido. In: SIMPÓSIO DO BIOMA CAATINGA, 2., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2019. p. 510. (Embrapa Semiárido. Documentos, 287).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 64. | | CONCEIÇÃO, G. C. da; GONÇALVES, J. S.; BASTOS, D. C.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; GAVA, C. A. T. Nitrogênio mineral e orgânico em solos de áreas com mangueiras sob diferentes manejos no Semiárido. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 67. | | XAVIER, G. R.; SILVA JÚNIOR, E. B.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; OLIVEIRA, P. J.; RUMJANEK, N. G.; BODDEY, R. M. Mistura polimérica como veículo na formulação de inoculante rizobiano para feijão-caupi. In: IBEMPA CONFERENCE, 2.; NATIONAL MEETING OF THE SPANISH SOCIETY OF NITROGEN FIXATION (SEFIN), 14; LATIN AMERICAN MEETING ON RHIZOBIOLOGY (ALAR), 26.; SPANISH-PORTUGUESE CONGRESS ON NITROGEN FIXATION, 3., 2013, Sevilla. Microorganisms for future agriculture: [works and papers...]. Sevilla: Universidad Sevilla, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 68. | | CAVALCANTI, M. I. P.; RODRIGUES, D. R.; NASCIMENTO, R. de C.; ESCOBAR, I. E. C.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Seleção de bactérias associativas de milho de um Vertissolo no Semiárido baiano com ação antagônica a fusarium veticillioides in vitro. In: REUNIÃO NORDESTINA DE CIÊNCIA DO SOLO, 4.; SIMPÓSIO PIAUIENSE DE CIÊNCIA DO SOLO, 1., 2017, Teresina. Uso sustentável do solo e segurança alimentar no nordeste brasileiro - Anais. Teresina: Embrapa Meio-Norte: UFPI: UESPI: IFPI, 2018. Np.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 69. | | VENKATARAMAN, M.; YÑIGEZ-GUTIERREZ, A.; INFANTE, V.; MACINTYRE, A.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ANÉ, J.-M.; PFLEGER, B. Synthetic biology toolbox for nitrogen-fixing soil microbes. ACS Synthetic Biology, v. 12, n. 12, p. 3623-3634, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 70. | | ANTUNES, G. dos R.; SANTANA, S. R. A.; ESCOBAR, I. E. C.; BRASIL, M. da S.; ARAUJO, G. G. L. de; VOLTOLINI, T. V.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Associative diazotrophic bacteria from forage grasses in theBrazilian semi-arid region are effective plant growth promoters. Crop & Pasture Science, v. 70, p. 899-907, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 71. | | ESCOBAR, I. E. C.; MEDEIROS, L. R. de A.; DIAS, K. S.; SILVA, P. T. de S. e; GAVA, C. A. T.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Atributos biológicos do solo em áreas de cultivo de cebola no município de Casa Nova, Bahia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 72. | | NUNES, G. F. de O.; MENEZES, K. A. S.; SAMPAIO, A. A.; SANTOS, A. B. dos; FERNANDES JUNIOR, P. I.; MARTINS, L. M. V. Atividade enzimática de isolados de rizóbio obtidos de nódulos de leguminosas forrageiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIAS DO SOLO, 34., 2013. Florianópolis. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 73. | | NASCIMENTO, T. R. do; NASCIMENTO, R. de C.; OLIVEIRA, K. G.; CAVALCANTI, M. I. P.; ESCOBAR, I. E. C.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Avaliação de dois mecanismos de promoção do crescimento vegetal in vitro por bactérias diazotróficas endofíticas de milho. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 10., 2015, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2015. p. 241-245. (Embrapa Semiárido. Documentos, 264).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 74. | | FEITOSA, L. H. R.; OLIVEIRA, A. C. de; VOGADO, R. F.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; LEITE, L. F. C.; SOUZA, H. A. de. Azospirillum brasilense e adubação nitrogenada na biomassa do milho cultivado em condições de casa de vegetação. In: REUNIÃO NORDESTINA DE CIÊNCIA DO SOLO, 4.; SIMPÓSIO PIAUIENSE DE CIÊNCIA DO SOLO, 1., 2017, Teresina. Uso sustentável do solo e segurança alimentar no nordeste brasileiro - Anais. Teresina: Embrapa Meio-Norte: UFPI: UESPI: IFPI, 2018. Np.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido. |
| |
| 75. | | SILVA, A. F. da; SAMPAIO, A. A.; MENEZES, K. A. S.; SANTOS, A. B. dos; MARTINS, L. M. V.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Azospirillum sp e Herbaspirillum seropedicae inoculados em plantas de milho (Zea mays) com aplicação de diferentes doses de nitrogênio mineral. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA PARA O PROGRESSO DA CIÊNCIA, 65., 2013, Recife. Ciência para um novo Brasil. Recife: UFPE: SBPC, 2013. 2 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 76. | | FEITOSA, L. H. R.; OLIVEIRA NETO, A. C. de; VOGADO, R. F.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; LEITE, L. F. C.; SOUZA, H. A. de. Adubação nitrogenada e Azospirillum brasilense na cultura do milho nas condições edafoclimáticas de Teresina. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 3., 2017, Teresina. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2017. p. 20.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido. |
| |
| 77. | | SIZENANDO, C. I. T.; RAMOS, J. P. C.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; LIMA, L. M. de; FREIRE, R. M. M.; SANTOS, R. C. dos. Agronomic efficiency of Bradyrhizobium in peanut under different environments in Brazilian Northeast. African Journal of Agricultural Research, v. 11, n. 37, p. 3482-3487, sept. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 78. | | OLIVEIRA, K. G.; RODRIGUES, D. R.; NASCIMENTO, T. R. do; NASCIMENTO, R. de C.; ESCOBAR, I. E. C.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Amplificação de genes simbióticos e produção de ácido indolacético in vitro por bactérias isoladas de nódulos de mulungu e angico. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 10., 2015, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2015. p. 235-240. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 264).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 80. | | KIILL, L. H. P.; ARAÚJO, F. P. de; ANJOS, J. B. dos; FERNANDES JUNIOR, P. I.; AIDAR, S. de T.; SOUZA, A. V. de. Biodiversidade da Caatinga como potencialidade para a agricultura familiar. In: MELO, R. F. de; VOLTOLINI, T. V. (Ed.). Agricultura familiar dependente de chuva no Semiárido. Brasília, DF, Embrapa, 2019. cap. 1, p. 15-43.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| Registros recuperados : 219 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
