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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  25/07/2022
Data da última atualização:  25/07/2022
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  SANTOS, C. G. dos; SOUSA, M. F.; VIEIRA, J. I. G.; MORAIS, L. R. de; FERNANDES, A. A. S.; LITTIERE, T. de O.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; BONAFÉ, C. M.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L.
Afiliação:  CASSIANE GOMES DOS SANTOS, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; MARIELE FREITAS SOUSA, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; JOÃO INÁCIO GOMES VIEIRA, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; LUANA RAFAELA DE MORAIS, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; ALINE AUXILIADORA SILVA FERNANDES, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; THAYSSA DE OLIVEIRA LITTIERE, Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho"; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; CRISTINA MOREIRA BONAFÉ, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; ANA FABRÍCIA BRAGA MAGALHÃES, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; LUCAS LIMA VERARDO, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri.
Título:  Candidate genes for tick resistance in cattle: a systematic review combining post-GWAS analyses with sequencing data.
Ano de publicação:  2022
Fonte/Imprenta:  Journal of Applied Animal Research, v. 50, n. 1, p. 460-470, 2022.
DOI:  https://doi.org/10.1080/09712119.2022.2096035
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Rhipicephalus microplus causes huge losses in cattle. Host genetic background greatly affects the immune efficiency in resistance or susceptibility to tick infestation, which is one of the many factors that play a role on that trait. We performed a systematic review of genome-wide association studies (GWAS) for tick resistance in cattle resulting in 1353 candidate genes for post-GWAS analyses. From those, genes showing possible structural variants from the bovine genome were classified by the Variant Effect Predictor from Ensembl. Ninety-two candidate genes showed potential structural variants in 5' UTR and coding region and were used for functional annotation. Enriched biological processes (e.g. regulation of eosinophil chemotaxis, RIG-I signalling pathway and monocyte differentiation) and candidate genes (e.g. DAPK2, PUM1, ACIN1, INPP5D) linked with immune system function were identified and thus associated with tick resistance. Besides, gene-transcription factors (TFs) networks were obtained from TFs associated with immune system (FOXO3, PPARG, STAT3, NFKB1, GATA3 and ARNT) and the candidate genes associated with tick resistance in cattle highlighted (e.g. OR4L1, PNP, LRRIQ1, GIMAP8, MYO6, MEP1A and LRFN2). Thus, promising candidate genes with a possible functional role for tick resistance in cattle are presented for further in vitro and/or in vivo analyses.
Palavras-Chave:  Ectoparasita; Sistema imunológico.
Thesagro:  Bovino; Carne; Carrapato; Genoma; Hospedeiro Animal.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144893/1/Candidate-genes-for-tick-resistance-in-cattle.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL25730 - 1UPCAP - DD
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Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Milho e Sorgo. Para informações adicionais entre em contato com cnpms.biblioteca@embrapa.br.

Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Milho e Sorgo.
Data corrente:  03/08/2004
Data da última atualização:  05/06/2018
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  MOTA, F. F. da; GOMES, E. A.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L.
Afiliação:  ELIANE APARECIDA GOMES, CNPMS; EMBRAPA-CNPMS.
Título:  Use of rpoB gene analysis for identification of nitrogen-fixing Paenibacillus species as an alternative to the 16S rRNA gene.
Ano de publicação:  2004
Fonte/Imprenta:  Letters in Applied Microbiology, Oxford, v. 39, n. 1, p. 34-40, 2004.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Aim: To avoid the limitations of 16S rRNA-based phylogenetic analysis for Paenibacillus species, the usefulness of the RNA polymerase beta-subunit encoding gene (rpoB) was investigated as an alternative to the 16S rRNA gene for taxonomic studies. Methods and Results: Partial rpoB sequences were generated for the type strains of eight nitrogen-fixing Paenibacillus species. The presence of only one copy of rpoB in the genome of P. graminis strain RSA19T was demonstrated by denaturing gradient gel electrophoresis and hybridization assays. A comparative analysis of the sequences of the 16S rRNA and rpoB genes was performed and the eight species showed between 91·6-99·1% (16S rRNA) and 77·9-97·3% (rpoB) similarity, allowing a more accurate discrimination between the different species using the rpoB gene. Finally, 24 isolates from the rhizosphere of different cultivars of maize previously identified as Paenibacillus spp. were assigned correctly to one of the nitrogen-fixing species. Conclusions, Significance and Impact of the Study: The data obtained in this study indicate that rpoB is a powerful identification tool, which can be used for the correct discrimination of the nitrogen-fixing species of agricultural and industrial importance within the genus Paenibacillus.
Thesagro:  Gene.
Categoria do assunto:  S Ciências Biológicas
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPMS16544 - 1UPCAP - DD
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