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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
07/05/2019 |
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Data da última atualização: |
21/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALBUQUERQUE, H. Y. G. de; OLIVEIRA, E. J. de; BRITO, A. C.; ANDRADE, L. R. B. de; CARMO, C. D. do; MORGANTE, C. V.; VIEIRA, E. A.; CUNHA, E. F. M.; FALEIRO, F. G. |
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Afiliação: |
HILÇANA YLKA GONÇALVES DE ALBUQUERQUE, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; ANA CARLA BRITO; LUCIANO ROGÉRIO BRAATZ DE ANDRADE, UFV; CÁTIA DIAS DO CARMO, UFRB; CAROLINA VIANNA MORGANTE, CPATSA; EDUARDO ALANO VIEIRA, CPAC; ELISA FERREIRA MOURA CUNHA, CPATU; FABIO GELAPE FALEIRO, CPAC. |
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Título: |
Identification of duplicates in cassava germplasm banks based on single-nucleotide polymorphisms (SNPs). |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, v. 76, n. 4, p. 328-336, jul./aug., 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genetic redundancy in cassava (Manihot esculenta Crantz) presents a challenge to efficient management of genetic resources. This study aimed to identify and define the ge-netic structure of duplicates in cassava germplasm from various Embrapa research units, using single-nucleotide polymorphism (SNP) markers. We evaluated 2,371 accessions with 20,712 SNPs. The identification of duplicates was performed based on multilocus genotypes (MLG), adopting a maximum genetic distance threshold of 0.05. The population structure was defined based on discriminant analysis of principal components (DAPC). A total of 1,757 unique and 614 duplicate accessions were identified. The redundancy of the collections ranged from 17% (Belém, PA/Brazil) to 39% (Petrolina, PE/Brazil), with an average of 21%. This redundancy between different research units is probably due to the historical sharing of accessions, as well as collections carried out in the same region, or even to the intense germplasm exchange between farmers with different genotype names. In terms of genetic structure, the 250 principal components explained 88 % of the genetic variation of the SNP markers and defined the hierar-chical structure of the duplicate cassava germplasm in 12 groups. Since heterotic groups have not yet been identified for cassava, crosses between accessions of the 12 DAPC groups may be promising. All MLGs were allocated within the same DAPC group, corroborating duplicate analyses yet still revealing high variability between groups that were quite distinct based on the first two discriminant functions. Our results contribute to optimizing the conservation of genetic resources, together with understanding diversity and its use in crop improvement. MenosGenetic redundancy in cassava (Manihot esculenta Crantz) presents a challenge to efficient management of genetic resources. This study aimed to identify and define the ge-netic structure of duplicates in cassava germplasm from various Embrapa research units, using single-nucleotide polymorphism (SNP) markers. We evaluated 2,371 accessions with 20,712 SNPs. The identification of duplicates was performed based on multilocus genotypes (MLG), adopting a maximum genetic distance threshold of 0.05. The population structure was defined based on discriminant analysis of principal components (DAPC). A total of 1,757 unique and 614 duplicate accessions were identified. The redundancy of the collections ranged from 17% (Belém, PA/Brazil) to 39% (Petrolina, PE/Brazil), with an average of 21%. This redundancy between different research units is probably due to the historical sharing of accessions, as well as collections carried out in the same region, or even to the intense germplasm exchange between farmers with different genotype names. In terms of genetic structure, the 250 principal components explained 88 % of the genetic variation of the SNP markers and defined the hierar-chical structure of the duplicate cassava germplasm in 12 groups. Since heterotic groups have not yet been identified for cassava, crosses between accessions of the 12 DAPC groups may be promising. All MLGs were allocated within the same DAPC group, corroborating duplicate analyses yet still revealing high variabi... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cultivo. |
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Thesagro: |
Mandioca; Manihot Esculenta; Melhoramento Vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding; Breeding and Genetic Improvement; Cassava. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/199859/1/Indetification-2019.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
14/07/2010 |
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Data da última atualização: |
12/08/2010 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ALVES, A. A. C.; LEDO, C. A. da S.; COSTA, I. R. S.; MENDES, R. A.; CARVALHO, P. C. L. de; SILVA, A. F. |
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Afiliação: |
ALFREDO AUGUSTO CUNHA ALVES, Labex USA; CARLOS ALBERTO DA SILVA LEDO, CNPMF; IVO ROBERTO SIAS COSTA, CENARGEN; Rui Américo Mendes, UFLA; Paulo César Lmos de Carvalho, UFRB; ALINEAUREA FLORENTINO SILVA, CPATSA. |
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Título: |
Situação atual e utilização do germoplasma de espécies silvestre de manihot da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (CNPMF). |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
pdf 456. |
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Conteúdo: |
No gênero Manihot, com cerca de 98 espécies documentadas, apenas a mandioca (M. esculenta Crantz) é cultivada e considerada uma das principais fontes de alimentos para a dieta humana nos trópicos. O Brasil, que é considerado o principal centro de origem da mandioca, possui a maior diversidade genética do gênero. Com o objetivo de utilizar a diversidade do germoplasma silvestre, a Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (CNPMF), estabeleceu, desde 2005, uma coleção de espécies silvestres de Manihot. Os acessos desta coleção foram obtidos de várias fontes, das quais destacamos: 1) Sementes e manivas de acessos da Embrapa/CENARGEN; 2) Material coletado na Embrapa/CPATSA e na Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB); 3) Expedições de coleta realizadas nas regiões semi-árida (caatinga) e cerrado; e 4) Plantas (seedlings) obtidas das sementes produzidas na coleção, via polinização aberta. Atualmente, a coleção, estabelecida no campo, possui cerca de 560 acessos, com aprox. 20 espécies de Manihot. Um banco de sementes sexuais vem sendo preservado em geladeira (~ 4º C) e conta com aprox. 67.000 sementes. As espécies de Manihot representadas na coleção são: anomala, caerulescens, cecropiaefolia, compositifolia, dichotoma, epruinosa, flabellifolia, glaziovii, irwinii, jacobinensis, janiphoides, maracasensis, peruviana, tomenttosa, tripartita,triphylla, violacea, Manihot spp., ‘mandioca sete anos’ e ‘pornúncia’. Este germoplasma vem sendo utilizado no pré-melhoramento, em vários estudos, dos quais destacamos: 1) Avaliação para resistência a estresses bióticos e abióticos; 2) Compatibilidade de cruzamentos entre M. esculenta e espécies silvestres; 3) Produção e avaliação de híbridos interespecíficos; 4) Caracterização fenotípica e genotípica; 5) Citogenética, produção, caracterização e viabilidade de grãos de pólen. Neste artigo são relatadas as etapas realizadas para o estabelecimento desta coleção e os principais resultados das atividades de pesquisa . MenosNo gênero Manihot, com cerca de 98 espécies documentadas, apenas a mandioca (M. esculenta Crantz) é cultivada e considerada uma das principais fontes de alimentos para a dieta humana nos trópicos. O Brasil, que é considerado o principal centro de origem da mandioca, possui a maior diversidade genética do gênero. Com o objetivo de utilizar a diversidade do germoplasma silvestre, a Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (CNPMF), estabeleceu, desde 2005, uma coleção de espécies silvestres de Manihot. Os acessos desta coleção foram obtidos de várias fontes, das quais destacamos: 1) Sementes e manivas de acessos da Embrapa/CENARGEN; 2) Material coletado na Embrapa/CPATSA e na Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB); 3) Expedições de coleta realizadas nas regiões semi-árida (caatinga) e cerrado; e 4) Plantas (seedlings) obtidas das sementes produzidas na coleção, via polinização aberta. Atualmente, a coleção, estabelecida no campo, possui cerca de 560 acessos, com aprox. 20 espécies de Manihot. Um banco de sementes sexuais vem sendo preservado em geladeira (~ 4º C) e conta com aprox. 67.000 sementes. As espécies de Manihot representadas na coleção são: anomala, caerulescens, cecropiaefolia, compositifolia, dichotoma, epruinosa, flabellifolia, glaziovii, irwinii, jacobinensis, janiphoides, maracasensis, peruviana, tomenttosa, tripartita,triphylla, violacea, Manihot spp., ‘mandioca sete anos’ e ‘pornúncia’. Este germoplasma vem sendo utilizado no pré-melhoramento, em vár... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Germoplasma; Mandioca; Melhoramento Genético Vegetal; Recurso Genético. |
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Thesaurus NAL: |
cassava; Manihot. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 03195naa a2200265 a 4500
001 1857647
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245 $aSituação atual e utilização do germoplasma de espécies silvestre de manihot da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (CNPMF).
260 $c2010
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520 $aNo gênero Manihot, com cerca de 98 espécies documentadas, apenas a mandioca (M. esculenta Crantz) é cultivada e considerada uma das principais fontes de alimentos para a dieta humana nos trópicos. O Brasil, que é considerado o principal centro de origem da mandioca, possui a maior diversidade genética do gênero. Com o objetivo de utilizar a diversidade do germoplasma silvestre, a Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (CNPMF), estabeleceu, desde 2005, uma coleção de espécies silvestres de Manihot. Os acessos desta coleção foram obtidos de várias fontes, das quais destacamos: 1) Sementes e manivas de acessos da Embrapa/CENARGEN; 2) Material coletado na Embrapa/CPATSA e na Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB); 3) Expedições de coleta realizadas nas regiões semi-árida (caatinga) e cerrado; e 4) Plantas (seedlings) obtidas das sementes produzidas na coleção, via polinização aberta. Atualmente, a coleção, estabelecida no campo, possui cerca de 560 acessos, com aprox. 20 espécies de Manihot. Um banco de sementes sexuais vem sendo preservado em geladeira (~ 4º C) e conta com aprox. 67.000 sementes. As espécies de Manihot representadas na coleção são: anomala, caerulescens, cecropiaefolia, compositifolia, dichotoma, epruinosa, flabellifolia, glaziovii, irwinii, jacobinensis, janiphoides, maracasensis, peruviana, tomenttosa, tripartita,triphylla, violacea, Manihot spp., ‘mandioca sete anos’ e ‘pornúncia’. Este germoplasma vem sendo utilizado no pré-melhoramento, em vários estudos, dos quais destacamos: 1) Avaliação para resistência a estresses bióticos e abióticos; 2) Compatibilidade de cruzamentos entre M. esculenta e espécies silvestres; 3) Produção e avaliação de híbridos interespecíficos; 4) Caracterização fenotípica e genotípica; 5) Citogenética, produção, caracterização e viabilidade de grãos de pólen. Neste artigo são relatadas as etapas realizadas para o estabelecimento desta coleção e os principais resultados das atividades de pesquisa .
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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