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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  11/03/2010
Data da última atualização:  19/10/2010
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  CAMINHA, I. P.; FALCAO, P. R. K.
Afiliação:  ISABEL P. CAMINHA, Mestranda em Genética e Biologia Molecular/UNICAMP; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA.
Título:  Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria G. Diazotrophicus utilizando métodos computacionais.
Ano de publicação:  2009
Fonte/Imprenta:  Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009.
Idioma:  Português
Notas:  Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
Conteúdo:  Ga5DH é uma enzima que exerce um papel fundamental na regulação do fluxo das fontes de carbono e energia nas bactérias, e na produção de Ácidos Orgânicos, entre eles o 5-Ceto-D-Gluconato (5KGA) [1,2]. Devido à importância deste ácido na indústria química [3], há um grande interesse em sua estrutura. Isto nos leva a apresentar a estrutura teórica de Ga5DH de Gluconacetobacter diazotrophicus, obtida com Modelagem por Homologia. Dez modelos foram gerados no programa MODELLER [4], baseados na estrutura de Gluconate 5- dehydrogenase de Streptococcus suis (PDB 3cxr), a única proteína Ga5DH resolvida experimentalmente até então.
Palavras-Chave:  Estrutura teórica de Ga5DH; Métodos computacionais; Modelagem por homologia; Modelling; Produção de ácidos orgânicos.
Thesaurus Nal:  Gluconacetobacter diazotrophicus.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/17574/1/20.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA14753 - 1UPCRA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoCAMINHA, I. P.; FALCAO, P. R. K. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria G. Diazotrophicus utilizando métodos computacionais. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009. Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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2.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. FOC-Control. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. Foc-Web. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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4.Imagem marcado/desmarcadoMORETTI, L.; FALCÃO, P. R. K. Incorporação do Redmine como ferramenta de gestão dos processos do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 10., 2014, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 13-16.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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5.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Multilab bioinformática: laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 folder.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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6.Imagem marcado/desmarcadoFALCAO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos. Evaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. Não paginado. X-Meeting 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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7.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Evaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus. X-MEETING INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C , 4., 14 a 16 de setembro de 2008, Salvado, BA. Resumos... Salvador, BA, 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO, C.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; SANTORO, M. Serine proteases analysis based on phylogenetic trees constructed from the sequence and structure alignments. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-48. Na publicação: Paula Kuser.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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9.Imagem marcado/desmarcadoBRANDÃO, M. M.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Structural parameters to filter crucial catalytic site aminoacids from fructose 1,6-bisphosphate aldolase. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-21. Na publicação: Paula R. Kuser.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, E. H. dos; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. VPRO - um identificador de padrões de seqüências. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. 6 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 81). Na publicação: Goran Neshich.
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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11.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B. An approach based on gene co-expression in searching for genes involved in bovine tick-resistance. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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12.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; BAUDET, C.; FALCAO, P. R. K.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Apresentação gráfica de parâmetros protéicos utilizando o Java Protein Dossier. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 9 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 40).
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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13.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Análise do grau de conservação de resíduos em proteínas com estrutura 3D resolvida utilizando o SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 5 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 37). Na publicação: Paula Kuser Falcão.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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14.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Cálculo de área acessível por solvente utilizando SURFV - definição de interface intramolecular pelo SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 36). Na publicação: Paula Kuser Falcão.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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15.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G. Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003. 8 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 59).
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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16.Imagem marcado/desmarcadoBAMBINI, M. D.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, F. S. de. Emerging biotechnologies: bioinformatics services applied to agriculture. In: CONGRESSO LATINO-IBEROAMERICANO DE GESTÃO DA TECNOLOGIA, 16., 2015, Porto Alegre. Inovação para além da tecnologia: anais. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2015. Não paginado. Altec 2015.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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17.Imagem marcado/desmarcadoFALCAO, P. R. K.; BAUDET, C.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Incorporação das propriedades rotâmeros e ocupância em métodos de análise estrutural de proteínas. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 6 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 34). Na publicação: Paula Kuser Falcão.
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18.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; VIEIRA, F. D.; HERAI, R. H. An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. Proceedings... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 58. X-Meeting 2007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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19.Imagem marcado/desmarcadoFALCAO, P. R. K.; BAUDET, C.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Curvatura da superfície de proteínas no Java Protein Dossier. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 5 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 38). Na publicação: Paula Kuser Falcão.
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20.Imagem marcado/desmarcadoJESUS, K. R. E. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. The Cry 1Ac protein from Bacillus thuringiensis and its structure stability centers. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. Na publicação: Paula Kuser. Poster I-47. ISMB, X-MEETING 2006.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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