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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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Data corrente: |
21/09/2020 |
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Data da última atualização: |
17/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
McMANUS, C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JUNIOR, O. A.; BRAGA, R.; CARNEIRO, P. L. S.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; SANTOS, S. A.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; FAÇANHA, D. A. E.; IANELLA, P. |
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Afiliação: |
CONCEPTA McMANUS, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; POTIRA HERMUCHE, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; RENATO FONTES GUIMARÃES, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; OSMAR ABILIO CARVALHO JUNIOR, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; RAMAYANA BRAGA; PAULO LUIZ SOUZA CARNEIRO, Universidade Estadual Do Sudoeste da Bahia (UESB) - Vitória da Conquista - BA, Brazil; JOSE CARLOS FERRUGEM MORAES, CPPSUL; CARLOS JOSE HOFF DE SOUZA; OLIVARDO FACO, CNPC; SANDRA APARECIDA SANTOS; HYMERSON COSTA AZEVEDO, CPATC; ADRIANA MELLO DE ARAUJO, CPAMN; DEBORA ANDRÉA E. FAÇANHA, Federal Rural University of the Semi-arid Region (UFERSA) - Mossoró, RN, Brazil; PATRICIA IANELLA, Cenargen. |
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Título: |
Landscape genetics of sheep in Brazil using SNP markers. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Small Ruminant Research, v. 192, e106239, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2020.106239 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The aim of this study was to explore spatial patterns of genetic structure in sheep breeds sampled in Brazil using Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in order to evaluate whether or not the genetic and geographic dis-tances are interrelated in this species. Samples genotyped using the 50KSheepSNPChip (Illumina) included 215 animals from eight different sheep breeds. All collection sites were georeferenced and data analyzed to determine geographic patterns from genetic data. To evaluate the correlation between genetic and geographic distances Mantel tests, Allelic Aggregation Index Analyses (AAIA), and spatial autocorrelation were performed. Genetic Landscape Shape procedure and Monmonier?s Algorithm were used to generate graphical visualization of the genetic distances across the landscape. The observed correlation observed between genetic and geographical distances was 0.552 (P <0.00099). Observed AAIA results (Rave =0.16, P <0.001) indicated a non-random distribution of genotypes across the landscape. High genetic differentiation was observed in the Southern re-gions of Brazil, separating wool and hair sheep. Low genetic distances were observed between flocks and breeds from north and center-west regions, and may be the result of unrecorded introgressions resulting from past unknown crossbreeding events. Observed Spatial Autocorrelation Analyses results indicate a minimum distance of 400 km should be used between collection sites to maximize genetic variability in future germplasm samplings for conservation of genetic resources. MenosAbstract: The aim of this study was to explore spatial patterns of genetic structure in sheep breeds sampled in Brazil using Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in order to evaluate whether or not the genetic and geographic dis-tances are interrelated in this species. Samples genotyped using the 50KSheepSNPChip (Illumina) included 215 animals from eight different sheep breeds. All collection sites were georeferenced and data analyzed to determine geographic patterns from genetic data. To evaluate the correlation between genetic and geographic distances Mantel tests, Allelic Aggregation Index Analyses (AAIA), and spatial autocorrelation were performed. Genetic Landscape Shape procedure and Monmonier?s Algorithm were used to generate graphical visualization of the genetic distances across the landscape. The observed correlation observed between genetic and geographical distances was 0.552 (P <0.00099). Observed AAIA results (Rave =0.16, P <0.001) indicated a non-random distribution of genotypes across the landscape. High genetic differentiation was observed in the Southern re-gions of Brazil, separating wool and hair sheep. Low genetic distances were observed between flocks and breeds from north and center-west regions, and may be the result of unrecorded introgressions resulting from past unknown crossbreeding events. Observed Spatial Autocorrelation Analyses results indicate a minimum distance of 400 km should be used between collection sites to maximize genetic variabili... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Delaunay triangulation; Genetic landscape shape; Mantel. |
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Thesagro: |
Ovelha; Polimorfismo Genético. |
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Thesaurus Nal: |
Brazil; Genetic polymorphism; Germplasm conservation; Sampling; Sheep; Sheep breeds; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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005 2020-11-17
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
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520 $aAbstract: The aim of this study was to explore spatial patterns of genetic structure in sheep breeds sampled in Brazil using Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in order to evaluate whether or not the genetic and geographic dis-tances are interrelated in this species. Samples genotyped using the 50KSheepSNPChip (Illumina) included 215 animals from eight different sheep breeds. All collection sites were georeferenced and data analyzed to determine geographic patterns from genetic data. To evaluate the correlation between genetic and geographic distances Mantel tests, Allelic Aggregation Index Analyses (AAIA), and spatial autocorrelation were performed. Genetic Landscape Shape procedure and Monmonier?s Algorithm were used to generate graphical visualization of the genetic distances across the landscape. The observed correlation observed between genetic and geographical distances was 0.552 (P <0.00099). Observed AAIA results (Rave =0.16, P <0.001) indicated a non-random distribution of genotypes across the landscape. High genetic differentiation was observed in the Southern re-gions of Brazil, separating wool and hair sheep. Low genetic distances were observed between flocks and breeds from north and center-west regions, and may be the result of unrecorded introgressions resulting from past unknown crossbreeding events. Observed Spatial Autocorrelation Analyses results indicate a minimum distance of 400 km should be used between collection sites to maximize genetic variability in future germplasm samplings for conservation of genetic resources.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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| 281. |  | McMANUS, C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JUNIOR, O. A.; BRAGA, R.; CARNEIRO, P. L. S.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; SANTOS, S. A.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; FAÇANHA, D. A. E.; IANELLA, P. Landscape genetics of sheep in Brazil using SNP markers. Small Ruminant Research, v. 192, e106239, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 282. | | McMANUS, C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JUNIOR, O. A.; BRAGA, R. M.; CARNEIRO, P. L. S.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; SANTOS, S. A.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; FAÇANHA, D. A. E.; IANELLA, P. Landscape genetics of sheep in Brazil using SNP markers. Small Ruminant Research, v. 192, e106239, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 284. | | BIAZIO, G. R. de; MCMANUS, C. M.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A.; SILVA, N. C. DA.; DALLAGO, B. S. L.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; ARAUJO, A. M. de; AZEVEDO, H. C.; CARNEIRO, P. L. S.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R. Integração de dados de georeferenciamento e dados genéticos para o manejo da biodiversidade de recursos genéticos de ovinos no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 285. | | BIAZIO, G. R. de; MCMANUS, C. M.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; SILVA, N. C. da; DALLAGO, B. S. L.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; ARAUJO, A. M.; AZEVEDO, H. C.; CARNEIRO, P. L. S.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R. Integração de dados de georeferenciamento e dados genéticos para o manejo da biodiversidade de recursos genéticos de ovinos no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 286. | | MCMANUS, C. M.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; DALLAGO, B. S. L.; VIEIRA, R. A.; FARIA, D. A. de; BLACKBURN, H.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. H.; FACO, O.; ARAUJO, A. M. de; AZEVEDO, H. C.; CARNEIRO, P. L. S.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; PAIVA, S. R. Integration of georeferenced and genetic data for the management of biodiversity in sheep genetic resources in Brazil. Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 126, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 287. | | MCMANUS, C. M.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; DALLAGO, B. S. L.; VIEIRA, R. A.; FARIA, D. A. de; BLACKBURN, H.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; ARAUJO, A. M. de; AZEVEDO, H. C.; CARNEIRO, P. L. S.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; PAIVA, S. R. Integration of georeferenced and genetic data for the management of biodiversity in sheep genetic resources in Brazil. Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 1, 126, Mar. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 288. | | PAIM, T. do P.; FARIA, D. A.; HAY, E. H.; McMANUS, C.; CHAVERRI ESQUIVEL, L.; ISABEL CASCANTE, M.; JIMENEZ ALFARO, E.; MENDEZ, A.; FACO, O.; SILVA, K. de M.; ALBERTO MEZZADRA, C.; MARIANTE, A. da S.; PAIVA, S. R.; BLACKBURN, H. D. New world goat populations are a genetically diverse reservoir for future use. Scientific Reports, v. 9, p. 1-12, 2019. Article 1476.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 289. | | SIDER, L. H.; VIEIRA, L. da S.; REGITANO, L. C. de A.; ZAROS, L. G.; NEVES, M. R. M. das; BENVENUTI, C. L.; NAVARRO, A. M. do C.; VILLELA, L. C. V.; CAVALCANTE, A. C. R.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; NICIURA, S. C. M.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; BENAVIDES, M. V.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, L. F.; CUNHA, R. M. S da; PINHEIRO, R. R. Identificação de genes candidatos associados a resistência genética à verminose gastrintestinal em caprinos por meio de ferramentas moleculares e genômicas. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1., 2009, Campo Grande, MS. [Resumos...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 290. | | ALBUQUERQUE, M. S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; MARQUES, J. R. F.; FACO, O.; CARNEIRO, P. C. F.; EGITO, A. A. do; VILLELA, L. C. V.; CASTRO, S. T. R.; MOREIRA, J. R. A.; COSTA, H.; COSTA, M. R. T.; JULIANO, R. S.; SANTOS, S. A.; ARAUJO, A. M.; CARVALHO, G. M. C.; PEREIRA, F. M.; ALMEIDA, M. J. O.; LEAL, T. M.; SOUZA, C. J. H.; SERENO, J. R. B.; MATOS, P. S. R.; LEDUR, M. C.; MARIANTE, A. S. Red Brasileña de Recursos Genéticos Animales. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 8., 2011, Quito. [Proceedings...] Quito: INIAP, 2011. SIRGEALC| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 291. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; MARQUES, J. R. F.; FACO, O.; CARNEIRO, P. C. F.; EGITO, A. A. do; VILLELA, L. C. V.; CASTRO, S. T. R.; MOREIRA, J. R. de A.; AZEVEDO, H. C.; COSTA, M. R. T. da R.; JULIANO, R. S.; SANTOS, S. A.; ARAUJO, A. M. de; CARVALHO, G. M. C.; PEREIRA, F. de M.; ALMEIDA, M. J. de O.; LEAL, T. M.; SOUZA, C. J. H. de; SERENO, J. R. B.; MATOS, P. S. R.; MARIANTE, A. da S. Red Brasileña de recursos genéticos animales. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 8., 2011, Quito. [Proceedings...] Quito: INIAP, 2011. 1-2 SIRGEALC| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 292. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; MARQUES, J. R. F.; FACO, O.; CARNEIRO, P. C. F.; EGITO, A. A. do; VILLELA, L. C. V.; CASTRO, S. T. R.; MOREIRA, J. R. de A.; AZEVEDO, H. C.; COSTA, M. R. T. da R.; JULIANO, R. S.; SANTOS, S. A.; ARAUJO, A. M. de; CARVALHO, G. M. C.; PEREIRA, F. de M.; ALMEIDA, M. J. de O.; LEAL, T. M.; SOUZA, C. J. H. de; SERENO, J. R. B.; MATOS, P. S. R.; MARIANTE, A. da S. Red Brasileña de recursos genéticos animales. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 8., 2011, Quito. [Proceedings...] Quito: INIAP, 2011. 1-2 SIRGEALC| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Meio-Norte. |
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| 293. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; MARQUES, J. R. F.; FACO, O.; CARNEIRO, P. C. F.; EGITO, A. A. do; VILLELA, L. C. V.; CASTRO, S. T. R.; MOREIRA, J. R. de A.; COSTA, H.; COSTA, M. R. T. da R.; JULIANO, R. S.; SANTOS, S. A.; ARAUJO, A. M. de; CARVALHO, G. M. C.; PEREIRA, F. de M.; ALMEIDA, M. J. de O.; LEAL, T. M.; SOUZA, C. J. H. de; SERENO, J. R. B.; MATOS, P. S. R.; LEDUR, M. C.; MARIANTE, A. da S. Red Brasileña de recursos genéticos animales. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 8., 2011, Quito. [Proceedings...] Quito: INIAP, 2011. SIRGEALC| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 294. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; MARQUES, J. R. F.; FACO, O.; CARNEIRO, P. C. F.; EGITO, A. A. do; VILLELA, L. C. V.; CASTRO, S. T. R.; MOREIRA, J. R. A.; COSTA, H.; COSTA, M. R. T. da R.; JULIANO, R. S.; SANTOS, S. A.; ARAUJO, A. M. de; CARVALHO, G. M. C.; PEREIRA, F. de M.; ALMEIDA, M. J. de O.; LEAL, T. M.; SOUZA, C. J. H. de; SERENO, J. R. B.; MATTOS, P. S. R. de; LEDUR, M. C.; MARIANTE, A. da S. Red Brasileña de Recursos Genéticos Animales. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 8., 2011, Quito. [Proceedings...] Quito: INIAP, 2011. SIRGEALC.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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