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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
20/02/2014 |
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Data da última atualização: |
05/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NAKAYAMA, T. J.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; FARIAS, J. R. B.; OLIVEIRA, M. C. N. de; BORÉM, A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; EMYGDIO, B. M.; NEPOMUCENO, A. L. |
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Afiliação: |
UEL; CNPSo; NORMAN NEUMAIER, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO; JOSE RENATO BOUCAS FARIAS, CNPSO; MARIA CRISTINA NEVES DE OLIVEIRA, CNPSO; UFV; ANA CLAUDIA BARNECHE DE OLIVEIRA, CPACT; BEATRIZ MARTI EMYGDIO, CPACT; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI. |
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Título: |
Reference genes for quantitative real-time polymerase chain reaction studies in soybean plants under hypoxic conditions. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 1, p. 860-871, 2014. |
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DOI: |
DOI: 10.4238/2014.February.13.4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) is a powerful tool used to measure gene expression. However, because of its high sensitivity, the method is strongly influenced by the quality and concentration of the template cDNA and by the amplification efficiency. Relative quantification is an effective strategy for correcting random and systematic errors by using the expression level of reference gene(s) to normalize the expression level of the genes of interest. To identify soybean reference genes for use in studies of flooding stress, we compared 5 candidate reference genes (CRGs) with the NormFinder and GeNorm programs to select the best internal control. The expression stability of the CRGs was evaluated in root tissues from soybean plants subjected to hypoxic conditions. Elongation factor 1-beta and actin-11 were identified as the most appropriate genes for RT-qPCR normalization by both the NormFinder and GeNorm analyses. The expression profiles of the genes for alcohol dehydrogenase 1, sucrose synthase 4, and ascorbate peroxidase 2 were analyzed by comparing different normalizing combinations (including no normalization) of the selected reference genes. Here, we have identified potential genes for use as references for RT-qPCR normalization in experiments with soybean roots growing in O2-depleted environments, such as flooding-stressed plants. |
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Palavras-Chave: |
Endogenous genes; Flooding; Housekeeping genes; Internal control genes. |
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Thesaurus Nal: |
gene expression. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/97888/1/nakayama.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/97827/1/Ana-Claudia.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112937/1/Reference-genes-soybean-..hypoxic-conditions-Incluido.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 372 | |
| 341. |  | EMYGDIO, B. M.; PORTO, M. P.; TEIXEIRA, M. C.; MEIRELLES, W. F.; KONFLANZ, V.; PEREIRA, F. R.; TRENTIN, R.; ACOSTA, A.; MACHADO, J. R. A.; RIGO, F.; HESS, J. Rede Embrapa Sul de híbridos de milho na região de clima temperado - safra 2008/09. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 54.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 37., 2009, Pelotas. Atas e Resumos...Veranópolis: FEPAGRO, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 342. | | EMYGDIO, B. M.; PORTO, M.; TEIXEIRA, M. C.; MEIRELLES, W. F.; KONFLANZ, V.; PEREIRA, F. R.; TRENTIN, R.; ACOSTA, A. da S.; MACHADO, J. R. de A.; RIGO, F.; HESS, J. Rede Embrapa Sul de híbridos de milho na região de clima temperado - safra 2008/09. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 54.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 37., 2009, Veranópolis. Resumos... Porto Alegre: EMATER: FEPAGRO, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 343. | | NAKAYAMA, T. J.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; FARIAS, J. R. B.; OLIVEIRA, M. C. N. de; BORÉM, A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; EMYGDIO, B. M.; NEPOMUCENO, A. L. Reference genes for quantitative real-time polymerase chain reaction studies in soybean plants under hypoxic conditions. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 1, p. 860-871, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Soja. |
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| 344. | | EMYGDIO, B. M.; MACHADO, J. R. de A.; MEIRELLES, W. F.; VIEIRA, L. C.; PEREIRA, F. R.; GUADAGNIN, J. P.; OLIVEIRA, A. C. B. de; FACCHINELLO, P. H. K.; BARROS, L. M. Recomendação de variedades de milho para o Sul do Brasil - Safra 2012/13. Pelotas:Embrapa Clima Temperado, 2013. 23 p. (Embrapa Clima Temperado. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 181).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 345. | | SILVA, G. O. da; BORTOLETTO, A. C.; FELDBERG, N. P.; PEREIRA, A. da S.; CARVALHO, A. D. F. de; AZEVEDO, F. Q.; EMYGDIO, B. M.; RAGASSI, C. F.; LOPES, C. A.; CASTRO, C. M. Seleção de clones chilenos de Batata para rendimento de tubérculos e qualidade de fritura em Canoinhas-SC, Ano 2. Batata Show, ano 23, v. 66, p. 24-26, jul. 2023.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
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| 346. | | SILVA, G. O. da; BORTOLETTO, A. C.; FELDBERG, N. P.; PEREIRA, A. da S.; CARVALHO, A. D. F. de; AZEVEDO, F. Q.; EMYGDIO, B. M.; RAGASSI, C. F.; LOPES, C. A.; CASTRO, C. M. Seleção de clones chilenos de Batata para rendimento de tubérculos e qualidade de fritura em Canoinhas-SC. Batata Show, Ano 23, n. 65, p. 56-58, mar. 2023.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
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| 348. | | EMYGDIO, B. M.; SILVA, S. D. dos A. e; PORTO, M.; ACOSTA, A. da S.; TEIXEIRA, M. C. C.; KONFLANZ, V.; ÁVILA, T. T.; SILVA, A. V.; SILVA, R. P. Unidades de observação de híbridos de milho na região de clima temperado - safra 2006/07. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE MILHO, 52.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE SORGO, 35., 2007. Pelotas. Atas e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 349. | | ANTUNES, I. F.; SILVEIRA, E. P.; BEVILAQUA, G. A. P.; EMYGDIO, B. M.; GREHS, R. C.; CHOLLET, C. B.; MASTRANTONIO, J. J. da S.; RODRIGUES, L da S.; SILVEIRA, N. T.; EICHHOLZ, C. J. Vinte anos de integração pesquisa-extensão-agricultor com feijão no Rio Grande do Sul. Disponivel em: http://www.infobibos.com/| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 350. | | GUADAGNIN, J. P.; RODRIGUES, L. R.; BUZZETTI, D.; PORTO, M. P.; SOUZA.; MONTAGNER, D.; WINKLER, L.; ROMAN, P.; TRENTIN, R.; POSSA, M. A.; FONTOURA, C. A.; EMYGDIO, B. M.; SILVA, S. D. dos A. e; DORNELLES, M. A.; STORCK, L.; ZANOTTELI, V. Avaliação de cultivares de milho de ciclo precoce para indicação no Estado do Rio Grande do Sul - 2006/2007. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE MILHO, 52., REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE SORGO, 35., 2007. Santo Angelo. Atas e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 351. | | GUADAGNIN, J. P.; CARGNELUTTI FILHO, A.; EMYGDIO, B. M.; AMES, C. G.; BUZZETTI, D.; POSSA, F.; SANTOS, F. M. dos; MACHADO, J.; BEGNINI, J. C.; WINKLER, L.; GARRAFA, M.; ROMAN, P.; CARBONERA, R.; TRENTIN, R.; CASTRO, R. L. de; RODRIGUES, L. R. Avaliação de cultivares de milho de ciclo precoce para indicação no Estado do Rio Grande do Sul na safra 2009-2010. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 55.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 38., 2010, Vacaria. Atas e Resumos... Vacaria: FEPAGRO/ASAV/Emater, 2010. p. 66-72.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 354. | | GUADAGNIN, J. P.; CARGNELUTTI FILHO, A.; EMYGDIO, B. M.; AMES, C. G.; BUZZETTI, D.; POSSA, F.; SANTOS, F. M. dos; MACHADO, J.; BEGNINI, J. C.; WINKLER, L.; GARRAFA, M.; ROMAN, P.; CARBONERA, R.; TRENTIN, R.; CASTRO, R. L. de; RODRIGUES, L. R. Avaliação de cultivares de milho de ciclo superprecoce para indicação no Estado do Rio Grande do Sul na safra 2009-2010. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 55.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 38., 2010, Vacaria. Atas e Resumos... Vacaria: FEPAGRO/ASAV/Emater, 2010. p. 55-58.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 356. | | GUADAGNIN, J. P.; RODRIGUES, L. R.; CARGNELUTTI FILHO, A.; EMYGDIO, B. M.; BUZZETTI, D.; SANTOS, F. M. dos S.; MACHADO, J. R. de A.; MIGON, L.; BONESSO, M. A.; CARAFFA, M.; LIMA, M. da G. de S.; ROMAN, P.; TRENTIN, R. Avaliação de cultivares transgênicas de milho para indicação no estado do RS - safra 2011/2012. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 57.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 40., 2012, Porto Alegre. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2012. p. 32.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 357. | | CASTRO, C. M.; PEREIRA, A. da S.; BRITO, G. G. de; REISSER JUNIOR, C.; EMYGDIO, B. M.; HEIDEN, G.; DUTRA, L. F.; SILVA, G. O. da; CARVALHO, A. D. F. de; LOPES, C. A.; PEREIRA, G. da S.; HAERTER, J. A.; OLIVEIRA, J. F. de; AZEVEDO, F. Q.; CORADIN, J. H.; KNEIB, R.; WOLTER, D.; GUZMÁN, R. Advances of the Embrapa potato breeding program aiming tolerance to heat stress. In: WORLD POTATO CONGRESS, 11., 2022, Dublin, Ireland.Presentation Summaries and Speaker Biographies. Disponível online: https://wpc2022ireland.com/wp-content/uploads/2022/07/Abstract-Book-WPC-2022_01.07.pdf p. 201. WPC 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 358. | | WINKLER, L.; ROSS, S.; GUADAGNIN, J. P.; RODRIGUES, L. R.; BUZZETTI, D.; PORTO, M. P.; SOUZA, V. da S. DE; MONTAGNER, D.; ROMAN, P.; TRENTIN, R.; POSSA, M. A.; FONTOURA, C. A.; EMYGDIO, B. M.; SILVA, S. D. dos A. e.; DORNELLES, M. A.; STORCK, L.; ZANOTTELI, V. Desempenho do híbrido Fundacep pioneiro no RS e PR nas safras 2005/06, 2006/07 e 2007/08. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE MILHO, 53., REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE SORGO, 36., 2008. Pelotas. Atas e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 359. | | ANTUNES, I. F.; BEVILAQUA, G. A. P.; BARBIERI, R. L.; SILVA, S. D. dos A. e.; EMYGDIO, B. M.; LEITE, D. L.; CAMPOS, A. D.; SCHWENGBER, J. E.; GOMES, J. F.; UENO, B.; CASTRO, C. M.; PILLON, C. N.; VIZZOTTO, M.; MITTELMAN, A.; MAIA, M. de S.; CARDOSO, E. T.; FERREIRA, M. A. J. F.; DIAS, R. de C. S.; COSTA, C. A. da. Coleta, caracterização e uso de germoplasma crioulo na Embrapa Clima Temperado. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.277.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 360. | | ANTUNES, I. F.; BEVILAQUA, G. A. P.; BARBIERI, R. L.; SILVA, S. D. A.; EMYGDIO, B. M.; LEITE, D. L.; CAMPOS, A. D.; SCHWENGBER, J. E.; GOMES, J. F.; UENO, B.; CASTRO, C. M.; PILLON, C. N.; VIZZOTTO, M.; MITTELMANN, A.; MAIA, M. S.; CARDOSO, E. T.; FERREIRA, M. A. J. F.; DIAS, R. C. S.; COSTA, C. A. Coleta, caracterização e uso de germoplasma crioulo na Embrapa Clima Temperado. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS. 2. 2008, Anais. Brasília. Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 277| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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